Родопсин-подобные рецепторы
Семейство белков
Семейство белков
Родопсин-подобные рецепторы
Структура родопсина: рецептор, связанный с белком AG. [1]
Идентификаторы
Символ7тм_1
ПфамПФ00001
Клан ПФАМGPCR_A
ИнтерПроIPR000276
ПРОСИТPDOC00211
СКОП21f88 / SCOPe / SUPFAM
суперсемейство OPM6
белок ОПМ1гзм
CDDcd00637
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ПДБ1U19 2R4R 2R4S 2RH1 1f88 , 1hzx , 1l9h , 2g87 , 2hpy , 2i35 , 2i36 , 2i37 , 2j4y , 2ped

Родопсин-подобные рецепторы — это семейство белков , составляющих самую большую группу рецепторов, сопряженных с G-белком . [2]

Объем

Рецепторы, сопряженные с G-белком, GPCR, представляют собой обширное семейство белков, которое охватывает широкий спектр функций (включая различные аутокринные, паракринные и эндокринные процессы). Они демонстрируют значительное разнообразие на уровне последовательности, на основании чего их можно разделить на отдельные группы. GPCR обычно описываются как «суперсемейство», поскольку они охватывают группу семейств , для которых есть указания на эволюционную связь, но между которыми нет статистически значимого сходства в последовательности. [2] Известные в настоящее время члены суперсемейства включают родопсин-подобные GPCR (это семейство), секретин-подобные GPCR , рецепторы цАМФ , рецепторы грибковых феромонов спаривания и семейство метаботропных рецепторов глутамата . Существует специализированная база данных для GPCR . [3]

Функция

Родопсин-подобные GPCR сами по себе представляют широко распространенное семейство белков, включающее гормональные, нейропептидные, нейротрансмиттерные и световые рецепторы, все из которых передают внеклеточные сигналы посредством взаимодействия с белками, связывающими гуаниновые нуклеотиды (G). Хотя их активирующие лиганды сильно различаются по структуре и характеру, аминокислотные последовательности рецепторов очень похожи и, как полагают, принимают общую структурную структуру, включающую 7 трансмембранных (TM) спиралей. [4] [5] [6]

Классы

Родопсин-подобные GPCR были классифицированы на следующие 19 подгрупп (A1-A19) на основе филогенетического анализа. [7]

Подсемейство А1

Подсемейство А2

Подсемейство A3

Подсемейство А4

Подсемейство А5

Подсемейство А6

Подсемейство A7

Подсемейство A8

Подсемейство A9

Подсемейство A10

Подсемейство A11

Подсемейство A12

Подсемейство A13

Подсемейство A14

Подсемейство A15

Подсемейство A16

Подсемейство A17

Подсемейство A18

Подсемейство A19

Несекретно

Ссылки

  1. ^ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T и др. (август 2000 г.). «Кристаллическая структура родопсина: рецептор, связанный с белком AG». Science . 289 (5480): 739– 45. Bibcode :2000Sci...289..739P. doi :10.1126/science.289.5480.739. PMID  10926528.
  2. ^ ab Attwood TK, Findlay JB (1994). «Динамикография рецепторов, сопряженных с G-белком». Protein Eng . 7 (2): 195–203 . doi :10.1093/protein/7.2.195. PMID  8170923.
  3. ^ "Информационная система для рецепторов, сопряженных с G-белком". GPCRDB . www.gpcr.org. Архивировано из оригинала 2009-04-22 . Получено 2008-12-05 .
  4. ^ Бирнбаумер Л. (1990). «G-белки в передаче сигнала». Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol . 30 : 675– 705. doi :10.1146/annurev.pa.30.040190.003331. PMID  2111655.
  5. ^ Gilman AG, Casey PJ (1988). «Участие G-белка в рецепторно-эффекторном сопряжении». J. Biol. Chem . 263 (6): 2577– 2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID  2830256.
  6. ^ Attwood TK, Findlay JB (1993). «Разработка дискриминационного отпечатка для рецепторов, связанных с G-белком». Protein Eng . 6 (2): 167– 176. doi :10.1093/protein/6.2.167. PMID  8386361.
  7. ^ Joost P, Methner A (2002). «Филогенетический анализ 277 человеческих рецепторов, сопряженных с G-белком, как инструмент для прогнозирования лигандов рецепторов-сирот». Genome Biol . 3 (11): research0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447. PMID  12429062 . 
  8. ^ Теракита А (2005). «Опсины». Genome Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186 /gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937. PMID  15774036. 
  9. ^ ab Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (сентябрь 2011 г.). «Независимый HHsearch, Needleman—Wunsch-based и motif analyses выявляют общую иерархию для большинства семейств рецепторов, сопряженных с G-белком». Molecular Biology and Evolution . 28 (9): 2471– 80. doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID  21402729.
  • Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. "GPCRDB (база данных рецепторов, связанных с G-белком): данные, полученные из последовательностей". Архивировано из оригинала 2007-11-14 . Получено 2007-12-10 .
  • Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). "Информационная система GPCRDB для рецепторов, сопряженных с G-белком". Nucleic Acids Res . 31 (1): 294– 7. doi :10.1093/nar/gkg103. PMC  165550. PMID  12520006 . Эта база данных включает в себя множественные выравнивания последовательностей всех семейств и подсемейств GPCR.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Rhodopsin-like_receptors&oldid=1187402648"