Семейство рецепторов секретина

Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Семейство секретинов из 7 трансмембранных рецепторов
Семейство секретинов из 7 трансмембранных рецепторов
Идентификаторы
Символ	7тм_2
Пфам	ПФ00002
ИнтерПро	IPR000832
ПРОСИТ	PDOC00559
TCDB	9.А.14
суперсемейство OPM	6
белок ОПМ	4к5г
CDD	cd13952
Пфам
Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Семейство белков

Семейство рецепторов секретина ( подсемейство GPCR класса B ^[1] ) состоит из рецепторов секретина , регулируемых пептидными гормонами из семейства гормонов глюкагона . Семейство отличается от рецепторов, связанных с адгезией G-белка . ^[2]

Семейство рецепторов секретина GPCR включает вазоактивные кишечные пептидные рецепторы и рецепторы для секретина , кальцитонина и паратиреоидного гормона /пептидов, связанных с паратиреоидным гормоном. Эти рецепторы активируют аденилатциклазу и путь фосфатидилинозитол-кальций . Рецепторы этого семейства имеют семь трансмембранных спиралей , ^[3]^[4] подобно родопсин-подобным GPCR. Однако между этими двумя семействами GPCR нет значительной идентичности последовательностей, и семейство рецепторов секретина имеет свою собственную характерную сигнатуру 7TM . ^[5]

Семейство рецепторов секретина GPCR существует у многих видов животных. Анализ данных с использованием сигнатуры Pfam выявил членов у грибов, хотя из-за их предполагаемой негормональной функции их чаще называют рецепторами, связанными с белком Adhesion G , что делает подсемейство Adhesion более базальной группой. ^[6] Выделяют три отдельных подсемейства (B1-B3).

Подсемейство B1

Подсемейство B1 содержит классические гормональные рецепторы , такие как рецепторы секретина и глюкагона , которые все участвуют в сигнальных путях, опосредованных цАМФ.

Рецептор полипептида типа 1, активирующего аденилатциклазу гипофиза InterPro : IPR002285
- PACAPR (ADCYAP1R1)
Рецептор кальцитонина InterPro : IPR003287
- КАЛКР
Рецептор, подобный рецептору кальцитонина InterPro : IPR015476
- CALCRL
Рецептор кортиколиберина InterPro : IPR003051
- CRHR1 ; CRHR2
Рецептор инсулинотропного полипептида глюкозы/Рецептор ингибирующего желудочного полипептида InterPro : IPR001749
- ГИПР
Рецептор глюкагона InterPro : IPR003291
- ГКГР
InterPro , связанный с рецептором глюкагона : IPR003290
- ГЛП1Р ; ГЛП2Р ;
Рецептор гормона рилизинг-гормона роста InterPro : IPR003288
- ГХРХР
Рецептор паратиреоидного гормона InterPro : IPR002170
- ПТР1 ; ПТР2
Рецептор секретина InterPro : IPR002144
- СЦТР
Рецептор вазоактивного интестинального пептида InterPro : IPR001571
- ВИПР1 ; ВИПР2

Подсемейство B2

Подсемейство B2 содержит рецепторы с длинными внеклеточными N-концами, такие как лейкоцитарно-клеточный антиген CD97 ; кальций-независимые рецепторы для латротоксина ^[7] и мозгоспецифические рецепторы ингибиторов ангиогенеза ^[8] среди прочих. Они также известны как рецепторы, сопряженные с белком адгезии G.

Ингибитор мозгового ангиогенеза InterPro : IPR008077
- БАЙ1 ; БАЙ2 ; БАЙ3
Антиген CD97 InterPro : IPR003056
- CD97
Рецептор гормона ЭМР InterPro : IPR001740
- CELSR1 ; CELSR2 ; CELSR3 ; EMR1 ; EMR2 ; EMR3 ; EMR4
Сиротский рецептор GPR56 InterPro : IPR003910
- GPR56 ; GPR64 ; GPR97 ; GPR110 ; GPR111 ; GPR112 ; GPR113 ; GPR114 ; GPR115 ; GPR123 ; GPR125 ; GPR126 ; GPR128 ; GPR133 ; GPR144 ; GPR157
Рецептор латрофилина InterPro : IPR003924
- ELTD1 ; ЛПХН1 ; ЛПХН2 ; ЛПХН3
Ig-гепта-рецептор InterPro : IPR008078
- ГПР116

Подсемейство B3

Подсемейство B3 включает Methuselah и другие белки Drosophila . Помимо типичной семи-трансмембранной области, характерные структурные особенности включают аминоконцевой внеклеточный домен, участвующий в связывании лиганда, и внутриклеточную петлю (IC3), необходимую для специфического связывания G-белка.

Рецептор диуретического гормона InterPro : IPR002001

Неклассифицированные члены

HCTR-5; HCTR-6; КПГ 006; КПГ 008

Ссылки

^ Harmar AJ (2001). "Семейство B G-белок-связанных рецепторов". Genome Biology . 2 (12): REVIEWS3013. doi : 10.1186/gb-2001-2-12-reviews3013 . PMC 138994. PMID 11790261 .
^ Хаманн Дж., Ауст Г., Арас Д., Энгель Ф.Б., Формстоун К., Фредрикссон Р. и др. (2015). «Международный союз базовой и клинической фармакологии. XCIV. Рецепторы, сопряженные с белком адгезии G». Фармакологические обзоры . 67 (2): 338– 67. doi :10.1124/pr.114.009647. PMC 4394687. PMID 25713288 .
^ PDB : 4L6R ; Siu FY, He M, de Graaf C, Han GW, Yang D, Zhang Z и др. (июль 2013 г.). «Структура человеческого рецептора глюкагона класса B, связанного с G-белком». Nature . 499 (7459): 444– 9. Bibcode : 2013Natur.499..444S. doi : 10.1038/nature12393. PMC 3820480. PMID 23863937 .
^ PDB : 5VEX ; Song G, Yang D, Wang Y, de Graaf C, Zhou Q, Jiang S и др. (июнь 2017 г.). «Структура трансмембранного домена рецептора человеческого GLP-1 в комплексе с аллостерическими модуляторами». Nature . 546 (7657): 312– 315. Bibcode : 2017Natur.546..312S. doi : 10.1038/nature22378. PMID 28514449. S2CID 2141649.
^ Холленстейн К, де Грааф К, Бортолато А, Ванг МВ, Маршалл ФХ, Стивенс РЦ (январь 2014 г.). «Взгляд на структуру GPCR класса B». Тенденции в фармакологических науках . 35 (1): 12– 22. doi : 10.1016 /j.tips.2013.11.001. PMC 3931419. PMID 24359917.
^ Кришнан А., Альмен М.С., Фредрикссон Р., Шиот Х.Б. (2012). Сюэ С. (ред.). «Происхождение GPCR: идентификация родопсина млекопитающих, адгезии, глутамата и Frizzled GPCR у грибов». PLOS ONE . 7 (1): e29817. Bibcode : 2012PLoSO...729817K. doi : 10.1371/journal.pone.0029817 . PMC 3251606. PMID 22238661 .
^ Универсальный номер доступа к белковым ресурсам O94910 в UniProt .
^ Универсальный номер доступа к белковым ресурсам O14514 в UniProt .

[pmid11790261-1] Harmar AJ (2001). "Семейство B G-белок-связанных рецепторов". Genome Biology . 2 (12): REVIEWS3013. doi : 10.1186/gb-2001-2-12-reviews3013 . PMC 138994. PMID 11790261 .

[2] Хаманн Дж., Ауст Г., Арас Д., Энгель Ф.Б., Формстоун К., Фредрикссон Р. и др. (2015). «Международный союз базовой и клинической фармакологии. XCIV. Рецепторы, сопряженные с белком адгезии G». Фармакологические обзоры . 67 (2): 338– 67. doi :10.1124/pr.114.009647. PMC 4394687. PMID 25713288 .

[Siu_2013-3] PDB : 4L6R ; Siu FY, He M, de Graaf C, Han GW, Yang D, Zhang Z и др. (июль 2013 г.). «Структура человеческого рецептора глюкагона класса B, связанного с G-белком». Nature . 499 (7459): 444– 9. Bibcode : 2013Natur.499..444S. doi : 10.1038/nature12393. PMC 3820480. PMID 23863937 .

[doi10.1038/nature22378-4] PDB : 5VEX ; Song G, Yang D, Wang Y, de Graaf C, Zhou Q, Jiang S и др. (июнь 2017 г.). «Структура трансмембранного домена рецептора человеческого GLP-1 в комплексе с аллостерическими модуляторами». Nature . 546 (7657): 312– 315. Bibcode : 2017Natur.546..312S. doi : 10.1038/nature22378. PMID 28514449. S2CID 2141649.

[pmid24359917-5] Холленстейн К, де Грааф К, Бортолато А, Ванг МВ, Маршалл ФХ, Стивенс РЦ (январь 2014 г.). «Взгляд на структуру GPCR класса B». Тенденции в фармакологических науках . 35 (1): 12– 22. doi : 10.1016 /j.tips.2013.11.001. PMC 3931419. PMID 24359917.

[pmid22238661-6] Кришнан А., Альмен М.С., Фредрикссон Р., Шиот Х.Б. (2012). Сюэ С. (ред.). «Происхождение GPCR: идентификация родопсина млекопитающих, адгезии, глутамата и Frizzled GPCR у грибов». PLOS ONE . 7 (1): e29817. Bibcode : 2012PLoSO...729817K. doi : 10.1371/journal.pone.0029817 . PMC 3251606. PMID 22238661 .

[7] Универсальный номер доступа к белковым ресурсам O94910 в UniProt .

[8] Универсальный номер доступа к белковым ресурсам O14514 в UniProt .