Суперсемейство Ras

Суперсемейство белков малых ГТФаз
Структура H-Ras PDB 121p, поверхность окрашена в соответствии с консервативным выравниванием затравок Pfam : золотистый — наиболее консервативный; темно-голубой — наименее консервативный.
Идентификаторы
СимволРас
ПфамПФ00071
ИнтерПроIPR013753
ПРОСИТPDOC00017
СКОП25p21 / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00882
Мембраном206
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Суперсемейство Ras , полученное от «вируса саркомы крысы», представляет собой белковое суперсемейство малых ГТФаз . [1] Члены суперсемейства делятся на семейства и подсемейства на основе их структуры, последовательности и функции. Пять основных семейств — это ГТФазы Ras, Rho , Ran , Rab и Arf . [2] Само семейство Ras далее делится на 6 подсемейств: Ras , Ral , Rap , Rheb , Rad и Rit. Miro является недавним участником суперсемейства. Каждое подсемейство имеет общий основной домен G, который обеспечивает необходимую активность ГТФазы и обмена нуклеотидов.

Окружающая последовательность помогает определить функциональную специфичность малой ГТФазы, например, «вставочная петля», общая для подсемейства Rho, в частности, способствует связыванию с эффекторными белками, такими как WASP .

В целом, семейство Ras отвечает за пролиферацию клеток: Rho за морфологию клеток , Ran за ядерный транспорт, а Rab и Arf за транспорт везикул . [3]

Подсемейства и члены

Ниже приведен список человеческих белков, принадлежащих к суперсемейству Ras: [1]

Обзор
ПодсемействоФункцияУчастники
Распролиферация клеток [3]ДИРАС1 ; ДИРАС2; ДИРАС3 ; ЭРАС; ДРАГОЦЕННЫЙ КАМЕНЬ ; ХРАС ; КРАС ; МРАС ; НКИРАС1; НКИРАС2 ; НРАС ; РАЛА ; РАЛБ ; РАП1А ; РАП1Б ; РАП2А ; РАП2Б ; РАП2С; РАСД1 ; РАСД2 ; РАСЛ10А; РАСЛ10Б; РАСЛ11А; РАСЛ11Б ; РАСЛ12; РЕМ1; РЕМ2; РЕРГ ; РЕРГЛ; РРАД ; РРАС ; RRAS2
Родинамика/морфология цитоскелета [3]РОА ; РОБ ; РОБТБ1 ; РОБТБ2 ; РОБТБ3 ; РОК ; РОД ; РХОФ; РОГ ; РОХ ; РОЙ ; РХОК ; РГОУ; РОВ ; РНД1 ; РНД2 ; РНД3 ; РАК1 ; РАК2 ; РАК3 ; CDC42
Рабмембранный трафикРАБ1А ; РАБ1Б ; РАБ2; РАБ3А ; РАБ3Б ; РАБ3С ; РАБ3Д ; РАБ4А ; РАБ4Б ; РАБ5А ; РАБ5Б ; РАБ5С ; РАБ6А ; РАБ6Б ; РАБ6С ; РАБ7А ; РАБ7Б ; РАБ7Л1 ; РАБ8А ; РАБ8Б ; РАБ9; РАБ9Б; РАБЛ2А; РАБЛ2Б; РАБЛ4; РАБ10 ; РАБ11А ; РАБ11Б ; РАБ12; РАБ13 ; РАБ14 ; РАБ15 ; РАБ17 ; РАБ18 ; РАБ19; РАБ20; РАБ21 ; РАБ22А ; РАБ23 ; РАБ24; РАБ25 ; РАБ26 ; РАБ27А ; РАБ27Б; РАБ28; РАБ2Б ; РАБ30 ; РАБ31 ; РАБ32; РАБ33А ; РАБ33Б ; РАБ34 ; РАБ35 ; РАБ36 ; РАБ37 ; РАБ38 ; РАБ39; РАБ39Б ; РАБ40А ; РАБ40АЛ; РАБ40Б; РАБ40С; РАБ41; РАБ42; РАБ43
Рэпклеточная адгезияРАП1А ; РАП1Б ; РАП2А ; РАП2Б ; РАП2С
Арфвезикулярный транспорт [3]ARF1 ; ARF3 ; ARF4 ; ARF5 ; ARF6 ; ARL1 ; ARL2 ; ARL3 ; ARL4; ARL5; ARL5C; ARL6 ; ARL7; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11 ; ARL13A ; ARL13B ; ARL14 ; ARL15 ; ARL16; ARL17; TRIM23 , ARL4D ; ARFRP1 ; ARL13B
Ранядерный транспортРАН
Ребпуть mTORRHEB ; RHEBL1
РГКRRAD ; GEM ; REM; REM2
РитРИТ1 ; РИТ2
Миромитохондриальный транспортРХОТ1 ; РХОТ2

Несекретно:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (март 2005 г.). «Взгляд на суперсемейство Ras». J. Cell Sci . 118 (Pt 5): 843–6. doi : 10.1242/jcs.01660 . PMID  15731001.
  2. ^ Goitre, L; Trapani, E; Trabalzini, L; Retta, SF (26 декабря 2013 г.). Суперсемейство малых ГТФаз Ras: раскрытые секреты . Методы в молекулярной биологии. Т. 1120. С. 1–18. doi :10.1007/978-1-62703-791-4_1. ISBN 978-1-62703-790-7. PMID  24470015.
  3. ^ abcd Мунемицу С., Иннис М., Кларк Р., Маккормик Ф., Ульрих А., Полакис П. (1990). «Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК G25K, человеческого гомолога гена клеточного цикла дрожжей CDC42». Mol Cell Biol . 10 (11): 5977–82. doi :10.1128/MCB.10.11.5977. ISSN  0270-7306. PMC 361395. PMID 2122236  . 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ras_superfamily&oldid=1053689632#Miro"