ARFRP1

ARFRP1
Идентификаторы
Псевдонимы	ARFRP1 , ARL18, ARP, Arp1, белок 1, связанный с фактором рибозилирования АДФ
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604699; МГИ : 1923938; гомологен : 2425; GeneCards : ARFRP1; OMA :ARFRP1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 20 (человек)
Конец	63,708,025 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	181,007,197 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	бета-клетка; ; верхушка сердца; ; обонятельная луковица; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; селезенка; ; правая лобная доля; ; правое полушарие мозжечка; ; стромальная клетка эндометрия; ; гранулоцит; ; правое предсердие;
	Верх выражен в
	мешочек; ; нервный слой сетчатки; ; слуховая плакода; ; слуховой пузырек; ; собирательный проток мозгового вещества; ; желудочковая зона; ; наружная сонная артерия; ; мышца бедра; ; внутренняя сонная артерия; ; гранулоцит;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; Связывание ГТФ; связывание белков; Активность ГТФазы;
Клеточный компонент	транс-сеть Гольджи; аппарат Гольджи; внутриклеточная анатомическая структура; мембрана; цитозоль; мембрана транс-Гольджи сети;
Биологический процесс	Транспорт белков от аппарата Гольджи к плазматической мембране; ретроградный транспорт, эндосома в Гольджи; гаструляция; передача сигнала; локализация белка в аппарате Гольджи; внутриклеточный транспорт белков; локализация белка в органелле; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	10139
	76688
	ENSG00000101246
	ENSMUSG00000038671
	Q13795
	Q8BXL7
NM_001134758 ; NM_001267544 ; NM_001267545 ; NM_001267546 ; NM_001267547;
	НМ_001267548 ; НМ_001267549 ; НМ_003224
	NM_001165991 ; NM_001165992 ; NM_001165995 ; NM_029702
NP_001128230 ; NP_001254473 ; NP_001254474 ; NP_001254475 ; NP_001254476;
	NP_001254477 ; NP_001254478 ; NP_003215 ; NP_001254476.1
	NP_001159463 ; NP_001159464 ; NP_001159467 ; NP_083978
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 1, связанный с фактором рибозилирования АДФ, — это белок , который у людей кодируется геном ARFRP1 . [ ^5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является мембранно-ассоциированной ГТФ-азой и локализуется в плазматической мембране. Он связан с генами фактора АДФ-рибозилирования ( ARF ) и генами ARF-подобных генов (ARL). Ген расположен в кластере генов, включающем ген a ( M68 ), который сверхэкспрессируется в некоторых опухолях. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ARFRP1 взаимодействует с PSCD1 . ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000101246 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038671 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Schurmann A, Massmann S, Joost HG (январь 1996 г.). «ARP — это связанная с плазматической мембраной Ras-родственная GTPase с отдаленным сходством с семейством факторов АДФ-рибозилирования». J Biol Chem . 270 (51): 30657– 63. doi : 10.1074/jbc.270.51.30657 . PMID 8530503.
^ ab "Ген Entrez: белок 1, связанный с фактором АДФ-рибозилирования ARFRP1".
^ Schürmann A, Schmidt M, Asmus M, Bayer S, Fliegert F, Koling S, Massmann S, Schilf C, Subauste MC, Voss M, Jakobs KH, Joost HG (апрель 1999 г.). "ADP-ribosylation factor (ARF)-related GTPase ARF-related protein связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитогезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D". J. Biol. Chem . 274 (14): 9744– 51. doi : 10.1074/jbc.274.14.9744 . PMID 10092663.

Дальнейшее чтение

Zahn C, Hommel A, Lu L и др. (2007). «Выключение Arfrp1 приводит к нарушению нацеливания ARF-like1 (ARL1) на транс-Гольджи в эмбрионах мышей и клетках HeLa». Mol. Membr. Biol . 23 (6): 475–85 . doi :10.1080/09687860600840100. PMID 17127620. S2CID 22778359.
Shin HW, Kobayashi H, Kitamura M и др. (2005). «Роль ARFRP1 (белок 1, связанный с фактором рибозилирования АДФ) в транспорте через мембрану Гольджи». J. Cell Sci . 118 (Pt 17): 4039–48 . doi : 10.1242/jcs.02524 . PMID 16129887.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). "Высокопроизводительное картирование динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих". Science . 307 (5715): 1621– 5. Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Behnia R, Panic B, Whyte JR, Munro S (2004). «Нацеливание Arf-подобной ГТФазы Arl3p на аппарат Гольджи требует N-концевого ацетилирования и мембранного белка Sys1p». Nat. Cell Biol . 6 (5): 405–13 . doi :10.1038/ncb1120. PMID 15077113. S2CID 22954283.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052.
Coppola T, Magnin-Luthi S, Perret-Menoud V и др. (2001). «Прямое взаимодействие RIM эффектора Rab3 с каналами Ca2+, SNAP-25 и синаптотагмином». J. Biol. Chem . 276 (35): 32756– 62. doi : 10.1074/jbc.M100929200 . PMID 11438518.
Bai C, Connolly B, Metzker ML и др. (2000). «Сверхэкспрессия M68/DcR3 в опухолях желудочно-кишечного тракта человека независимо от амплификации гена и ее расположение в кластере из четырех генов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (3): 1230– 5. Bibcode : 2000PNAS...97.1230B. doi : 10.1073/pnas.97.3.1230 . PMC 15578. PMID 10655513.
Schürmann A, Schmidt M, Asmus M и др. (1999). "ADP-ribosylation factor (ARF)-related GTPase ARF-related protein связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитогезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D". J. Biol. Chem . 274 (14): 9744– 51. doi : 10.1074/jbc.274.14.9744 . PMID 10092663.

Внешние ссылки

Расположение гена человека ARFRP1 в браузере генома UCSC .
Подробная информация о гене человека ARFRP1 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000101246 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038671 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8530503-5] Schurmann A, Massmann S, Joost HG (январь 1996 г.). «ARP — это связанная с плазматической мембраной Ras-родственная GTPase с отдаленным сходством с семейством факторов АДФ-рибозилирования». J Biol Chem . 270 (51): 30657– 63. doi : 10.1074/jbc.270.51.30657 . PMID 8530503.

[entrez-6] "Ген Entrez: белок 1, связанный с фактором АДФ-рибозилирования ARFRP1".

[pmid10092663-7] Schürmann A, Schmidt M, Asmus M, Bayer S, Fliegert F, Koling S, Massmann S, Schilf C, Subauste MC, Voss M, Jakobs KH, Joost HG (апрель 1999 г.). "ADP-ribosylation factor (ARF)-related GTPase ARF-related protein связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитогезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D". J. Biol. Chem . 274 (14): 9744– 51. doi : 10.1074/jbc.274.14.9744 . PMID 10092663.