ARHGAP5

ARHGAP5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EE4, 2EE5
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP5 , GFI2, RhoGAP5, p190-B, p190BRhoGAP, Rho GTPase активирующий белок 5
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602680; МГИ : 1332637; гомологен : 907; GeneCards : ARHGAP5; OMA :ARHGAP5 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 14 (человек)
Конец	32,159,728 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	52,618,758 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Ахиллово сухожилие; ; желудочковая зона; ; эндотелиальная клетка; ; Эпителий сосудистого сплетения; ; эпителий толстой кишки; ; Район Бродмана 23; ; мозолистое тело; ; пигментный эпителий сетчатки; ; клетка слизистой оболочки щеки; ; корпус придатка яичка;
	Верх выражен в
	доля мозжечка; ; цилиарное тело; ; пигментный эпителий сетчатки; ; червь мозжечка; ; сперматоцит; ; ирис; ; Ростральный миграционный поток; ; вестибулярный сенсорный эпителий; ; околоушная железа; ; глубокие ядра мозжечка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	Связывание ГТФ; Связывание домена SH2; связывание белков; Активность активатора ГТФазы; Активность ГТФазы;
Клеточный компонент	эндоплазматический ретикулум; мембрана; цитоплазма; цитозоль; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	адгезия клеток; регуляция передачи сигнала, опосредованного малой ГТФазой; Передача сигнала белка Rho; передача сигнала; развитие молочной железы; положительная регуляция активности ГТФазы;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	394
	11855
	ENSG00000100852
	ENSMUSG00000035133
	Q13017
	Р97393
	NM_001030055 ; NM_001173
	NM_009706
	NP_001025226 ; NP_001164
	NP_033836
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 5, активирующий Rho GTPase, представляет собой фермент , который у человека кодируется геном ARHGAP5 . ^[5]^[6]

Функция

Активирующий белок Rho GTPase 5 отрицательно регулирует RHO GTPases, семейство, которое может опосредовать изменения цитоскелета, стимулируя гидролиз связанного GTP. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ARHGAP5 взаимодействует с Rnd1 , ^[7] Rnd2 , ^[7] Rnd3 ^[7] и RHOA . ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100852 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000035133 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, Hall A, Yamada Y (1995). "p190-B, новый член семейства Rho GAP, и Rho индуцируются к кластеризации после сшивания интегрина". J. Biol. Chem . 270 (52): 30919–26. doi : 10.1074/jbc.270.52.30919 . PMID 8537347.
^ ab "Ген Entrez: ARHGAP5 Rho GTPase активирующий белок 5".
^ abcd Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (июль 2003 г.). "Rnd-белки функционируют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP". Curr. Biol . 13 (13): 1106–15. doi :10.1016/S0960-9822(03)00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARHGAP5 и страница с подробностями гена ARHGAP5 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Ellis C, Moran M, McCormick F, Pawson T (1990). «Фосфорилирование GAP и GAP-ассоциированных белков с помощью трансформирующих и митогенных тирозинкиназ». Nature . 343 (6256): 377–81. Bibcode :1990Natur.343..377E. doi :10.1038/343377a0. hdl : 1807/9436 . PMID 1689011. S2CID 4350408.
Foster R, Hu KQ, Shaywitz DA, Settleman J (1994). "p190 RhoGAP, основной белок, ассоциированный с RasGAP, напрямую связывает GTP". Mol. Cell. Biol . 14 (11): 7173–81. doi :10.1128/mcb.14.11.7173. PMC 359251. PMID 7935432 .
McGlade J, Brunkhorst B, Anderson D, Mbamalu G, Settleman J, Dedhar S, Rozakis-Adcock M, Chen LB, Pawson T (1993). «N-концевая область GAP регулирует структуру цитоскелета и клеточную адгезию». EMBO J . 12 (8): 3073–81. doi :10.1002/j.1460-2075.1993.tb05976.x. PMC 413572 . PMID 8344248.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Zrihan-Licht S, Fu Y, Settleman J, Schinkmann K, Shaw L, Keydar I, Avraham S, Avraham H (2000). "Тирозинкиназа RAFTK/Pyk2 опосредует связь p190 RhoGAP с RasGAP и участвует в инвазии клеток рака груди". Oncogene . 19 (10): 1318–28. doi : 10.1038/sj.onc.1203422 . PMID 10713673.
Кулкарни С.В., Гиш Г., ван дер Гир П., Хенкемейер М., Поусон Т. (2000). «Роль p120 Ras-GAP в направленном движении клеток». J. Cell Biol . 149 (2): 457–70. doi :10.1083/jcb.149.2.457. PMC 2175152. PMID 10769036 .
Chakravarty G, Roy D, Gonzales M, Gay J, Contreras A, Rosen JM (2000). "P190-B, белок, активирующий Rho-GTPase, по-разному экспрессируется в терминальных концевых почках и раке молочной железы". Cell Growth Differ . 11 (7): 343–54. PMID 10939588.
Shiota M, Tanihiro T, Nakagawa Y, Aoki N, Ishida N, Miyazaki K, Ullrich A, Miyazaki H (2003). «Протеиновая тирозиновая фосфатаза PTP20 индуцирует реорганизацию актинового цитоскелета путем дефосфорилирования p190 RhoGAP в гранулезных клетках яичников крыс, стимулированных фолликулостимулирующим гормоном». Mol. Endocrinol . 17 (4): 534–49. doi : 10.1210/me.2002-0187 . PMID 12554790.
Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (2003). «Rnd-белки функционируют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP». Curr. Biol . 13 (13): 1106–15. doi :10.1016/S0960-9822(03)00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009 .
Su L, Agati JM, Parsons SJ (2003). "p190RhoGAP регулируется клеточным циклом и влияет на цитокинез". J. Cell Biol . 163 (3): 571–82. doi :10.1083/jcb.200308007. PMC 2173658. PMID 14610059 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104. ПМК 442148 . ПМИД 15231748.
Blanchetot C, Chagnon M, Dubé N, Hallé M, Tremblay ML (2005). «Методы захвата субстрата при идентификации клеточных мишеней PTP». Методы . 35 (1): 44–53. doi :10.1016/j.ymeth.2004.07.007. PMID 15588985.
Vargo-Gogola T, Heckman BM, Gunther EJ, Chodosh LA, Rosen JM (2006). "Сверхэкспрессия белка, активирующего ГТФазу P190-B Rho, нарушает морфогенез протоков и вызывает гиперпластические поражения в развивающейся молочной железе". Mol. Endocrinol . 20 (6): 1391–405. doi : 10.1210/me.2005-0426 . PMID 16469769.
Zhan X, Desiderio DM (2006). «Нитропротеины из ткани аденомы гипофиза человека, обнаруженные с помощью колонки с нитротирозиновым сродством и тандемной масс-спектрометрии». Anal. Biochem . 354 (2): 279–89. doi :10.1016/j.ab.2006.05.024. PMID 16777052.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 14 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100852 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000035133 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8537347-5] Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, Hall A, Yamada Y (1995). "p190-B, новый член семейства Rho GAP, и Rho индуцируются к кластеризации после сшивания интегрина". J. Biol. Chem . 270 (52): 30919–26. doi : 10.1074/jbc.270.52.30919 . PMID 8537347.

[entrez-6] "Ген Entrez: ARHGAP5 Rho GTPase активирующий белок 5".

[pmid12842009-7] Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (июль 2003 г.). "Rnd-белки функционируют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP". Curr. Biol . 13 (13): 1106–15. doi :10.1016/S0960-9822(03)00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009 .