РАБ23

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
РАБ23
Идентификаторы
ПсевдонимыRAB23 , HSPC137, член семейства онкогенов RAS
Внешние идентификаторыОМИМ : 606144; МГИ : 99833; гомологен : 7503; Генные карты : RAB23; OMA :RAB23 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001278666
NM_001278667
NM_001278668
NM_016277
NM_183227

NM_001159729
NM_008999

RefSeq (белок)

NP_001265595
NP_001265596
NP_001265597
NP_057361
NP_899050

н/д

Местоположение (UCSC)Хр 6: 57.19 – 57.22 МбХр 1: 33,76 – 33,78 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок Rab-23, связанный с Ras, — это белок , который у людей кодируется геном RAB23 . [ 5] [6] [7] В этом локусе гена происходит альтернативный сплайсинг, и были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующих один и тот же белок. [8]

Функция

RAB23 принадлежит к суперсемейству малых ГТФаз , семейству Rab . Он может участвовать в передаче сигнала, опосредованной малыми ГТФазами, и внутриклеточной транспортировке белков. [8]

RAB23 является важным отрицательным регулятором сигнального пути Sonic hedgehog . [6] Первое понимание биологических процессов, требующих гена Rab23, пришло из 2 независимых мутаций мыши в гене [9] [10] и анализа эпистаза с мутациями в гене мыши shh. [6] Эти исследования показали, что ген необходим для нормального развития головного и спинного мозга и что морфологические дефекты, наблюдаемые у мутантных эмбрионов, такие как неспособность закрыть дорсальные области нервной трубки во время развития, кажутся вторичными по отношению к расширению вентральной и редукции дорсальной идентичности в развивающейся нервной трубке. Эти же мутации вовлекают ген RAB23 в развитие пальцев и глаз. Гены мышиного открытого мозга (opb) и Sonic hedgehog (Shh) играют противоположные роли в формировании нейронных паттернов : opb требуется для дорсальных типов клеток, а Shh требуется для вентральных типов клеток в спинном мозге. [6]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000112210 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004768 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Res . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934. PMID  11042152. 
  6. ^ abcd Eggenschwiler JT, Espinoza E, Anderson KV (июль 2001 г.). "Rab23 является существенным отрицательным регулятором сигнального пути Sonic hedgehog у мышей". Nature . 412 (6843): 194– 8. Bibcode :2001Natur.412..194E. doi :10.1038/35084089. PMID  11449277. S2CID  8151368.
  7. ^ Marcos I, Borrego S, Antiñolo G (декабрь 2003 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческого RAB23, члена группы Rab GTPases». Int. J. Mol. Med . 12 (6): 983– 7. doi :10.3892/ijmm.12.6.983. PMID  14612978.
  8. ^ ab "Ген Entrez: RAB23 RAB23, член семейства онкогенов RAS".
  9. ^ Günther T, Struwe M, Aguzzi A, Schughart K (ноябрь 1994 г.). «Открытый мозг, новый мутант мыши с тяжелыми дефектами нервной трубки, демонстрирует измененные паттерны экспрессии генов в развивающемся спинном мозге». Development . 120 (11): 3119– 30. doi :10.1242/dev.120.11.3119. PMID  7720556.
  10. ^ Kasarskis A, Manova K, Anderson KV (июнь 1998 г.). «Скрининг эмбриональных летальных мутаций у мышей на основе фенотипа». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (13): 7485– 90. Bibcode :1998PNAS...95.7485K. doi : 10.1073/pnas.95.13.7485 . PMC 22659 . PMID  9636176. 

Дальнейшее чтение

  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Имабаяши Х., Мори Т., Годзё С. и др. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека через формирование хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res . 288 (1): 35– 50. doi :10.1016/S0014-4827(03)00130-7. PMID  12878157.
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805– 11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
  • Evans TM, Ferguson C, Wainwright BJ и др. (2004). «Rab23, отрицательный регулятор сигнализации hedgehog, локализуется в плазматической мембране и эндоцитозном пути». Traffic . 4 (12): 869– 84. doi : 10.1046/j.1600-0854.2003.00141.x . PMID  14617350. S2CID  21636234.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Liu YJ, Wang Q, Li W и др. (2007). «Rab23 — потенциальная биологическая мишень для лечения гепатоцеллюлярной карциномы». World J. Gastroenterol . 13 (7): 1010– 7. doi : 10.3748/wjg.v13.i7.1010 . PMC  4146862. PMID  17373734 .
  • Jenkins D, Seelow D, Jehee FS и др. (2007). «Мутации RAB23 при синдроме Карпентера указывают на неожиданную роль сигнализации hedgehog в развитии черепного шва и ожирении». Am. J. Hum. Genet . 80 (6): 1162– 70. doi :10.1086/518047. PMC  1867103 . PMID  17503333.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RAB23&oldid=1174277881"