АРФ4

АРФ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1Z6X
Идентификаторы
Псевдонимы	ARF4 , ARF2, фактор рибозилирования АДФ 4
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601177; МГИ : 99433; гомологен : 55593; GeneCards : ARF4; OMA :ARF4 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	57,598,220 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 14 (мышь)
Конец	26,386,239 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	большеберцовая кость; ; париетальная плевра; ; висцеральная плевра; ; зародышевый эпителий; ; корпус придатка яичка; ; слизистая оболочка сигмовидной кишки; ; эпителиальная клетка поджелудочной железы; ; околоушная железа; ; эпителий носоглотки; ; стромальная клетка эндометрия;
	Верх выражен в
	генитальный бугорок; ; хвост эмбриона; ; желудочковая зона; ; правая почка; ; пищевод; ; эмбрион; ; эмбрион; ; губа; ; желточный мешок; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; связывание рецептора эпидермального фактора роста; Связывание ГТФ; связывание белков; Активность ГТФазы;
Клеточный компонент	цитозоль; аппарат Гольджи; мембрана; дендритный шипик; внутриклеточная анатомическая структура; гофрированная мембрана; внеклеточная экзосома; внеклеточный матрикс; цитоплазма; плазматическая мембрана; глутаматергический синапс;
Биологический процесс	АДФ-рибозилирование белка; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой; негативная регуляция процесса апоптоза; регуляция метаболических процессов активных форм кислорода; транспорт от эндоплазматического ретикулума к везикулам Гольджи; активация активности фосфолипазы D; транспорт белков; миграция клеток; везикулярно-опосредованный транспорт; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; ретроградный везикулярно-опосредованный транспорт, Гольджи в эндоплазматический ретикулум; транспорт; развитие дендритных шипиков; внутриклеточный транспорт белков; Транспорт от Гольджи к плазматической мембране; сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста; развитие мозга; обучение; апикальная локализация белка; установление или поддержание апикальной/базальной полярности эпителиальных клеток; ответ на повреждение аксона; регуляция организации синапсов; локализация белка в ресничке; регуляция постсинаптической организации;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	378
	11843
	ENSG00000168374
	ENSMUSG00000021877
	Р18085
	Р61750
	NM_001660
	NM_007479
	NP_001651
	NP_031505
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор АДФ-рибозилирования 4 — это белок , который у человека кодируется геном ARF4 . [ ^5]^[6]

Функция

Фактор 4 АДФ-рибозилирования (ARF4) является членом семейства генов ARF человека. Эти гены кодируют небольшие белки, связывающие гуаниновые нуклеотиды, которые стимулируют активность АДФ-рибозилтрансферазы холерного токсина и играют роль в везикулярном транспорте, а также являются активаторами фосфолипазы D. Продукты генов включают 5 белков ARF и 11 белков, подобных ARF, и составляют 1 семейство суперсемейства RAS. Белки ARF подразделяются на класс I (ARF1 и ARF3), класс II (ARF4 и ARF5) и класс III (ARF6). Члены каждого класса имеют общую генную организацию. Ген ARF4 охватывает приблизительно 12 кб и содержит шесть экзонов и пять интронов. ARF4 является наиболее дивергентным членом ARF человека. Для этого гена были зарегистрированы конфликтующие позиции на карте в 3p14 или 3p21. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ARF4 взаимодействует с рецептором эпидермального фактора роста ^[7] и с мотивами RVxP . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168374 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021877 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Monaco L, Murtagh JJ, Newman KB, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и связанного с ней псевдогена для человеческого фактора АДФ-рибозилирования, гуанинового нуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (6): 2206– 10. Bibcode :1990PNAS...87.2206M. doi : 10.1073/pnas.87.6.2206 . PMC 53655 . PMID 2107548.
^ ab "Ген Энтреза: фактор 4 АДФ-рибозилирования ARF4".
^ Ким SW, Хаяши M, Ло JF, Ян Y, Ю JS, Ли JD (январь 2003 г.). "Малая ГТФаза фактора АДФ-рибозилирования 4 опосредует активацию фосфолипазы D2, зависящую от рецептора эпидермального фактора роста". J. Biol. Chem . 278 (4): 2661– 8. doi : 10.1074/jbc.M205819200 . PMID 12446727.
^ Ward, Heather H.; Brown-Glaberman, Ursa; Wang, Jing; Morita, Yoshiko; Alper, Seth L.; Bedrick, Edward J.; Gattone, Vincent H.; Deretic, Dusanka; Wandinger-Ness, Angela (20 июля 2011 г.). «Для цилиарного транспорта полицистина-1 требуются консервативный сигнал и комплекс ГТФазы». Молекулярная биология клетки . 22 (18): 3289– 3305. doi : 10.1091/mbc.e11-01-0082 . ISSN 1059-1524. PMC 3172256. PMID 21775626 .

Дальнейшее чтение

Ли Ф.Дж., Мосс Дж., Воган М. (1992). «Факторы АДФ-рибозилирования человека и лямблий (ARF) дополняют функцию ARF в Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem . 267 (34): 24441– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(18)35786-7 . PMID 1447192.
Kahn RA, Kern FG, Clark J, Gelmann EP, Rulka C (1991). "Факторы АДФ-рибозилирования человека. Функционально консервативное семейство белков, связывающих ГТФ". J. Biol. Chem . 266 (4): 2606– 14. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52288-2 . PMID 1899243.
Stearns T, Willingham MC, Botstein D, Kahn RA (1990). «Фактор АДФ-рибозилирования функционально и физически связан с комплексом Гольджи». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (3): 1238– 42. Bibcode :1990PNAS...87.1238S. doi : 10.1073/pnas.87.3.1238 . PMC 53446 . PMID 2105501.
Воробьева Н., Протопопов А., Протопопова М., Кашуба В., Алликметс Р.Л., Моди В., Забаровский Э.Р., Клейн Г., Киселев Л., Графодатский А. (1995). «Локализация генов ARF2 и NCK человека и 13 других NotI-связывающих клонов на хромосоме 3 методом флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet . 68 ( 1– 2): 91– 4. doi :10.1159/000133898. PMID 7956370.
Orcl L, Palmer DJ, Amherdt M, Rothman JE (1993). «Сборка покрытых пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомер и белки ARF из цитозоля». Nature . 364 (6439): 732– 4. Bibcode :1993Natur.364..732O. doi :10.1038/364732a0. PMID 8355790. S2CID 4348442.
Helms JB, Palmer DJ, Rothman JE (1993). «Две различные популяции ARF, связанных с мембранами Гольджи». J. Cell Biol . 121 (4): 751– 60. doi :10.1083/jcb.121.4.751. PMC 2119793. PMID 8491770 .
Pardinas J, Pang Z, Houghton J, Palejwala V, Donnelly RJ, Hubbard K, Small MB, Ozer HL (1997). "Дифференциальная экспрессия генов при иммортализации фибробластов человека, опосредованной SV40". J. Cell. Physiol . 171 (3): 325– 35. doi :10.1002/(SICI)1097-4652(199706)171:3<325::AID-JCP11>3.0.CO;2-9. PMID 9180902. S2CID 3026138.
Kim HS (1998). "Ген фактора рибозилирования АДФ-4 человека (ARF4). Положение на карте 3p14.1". Chromosome Res . 6 (8): 663. doi :10.1023/A:1009230216005. PMID 10099884. S2CID 31829743.
Лебеда РА, Хаун РС (1999). «Клонирование и характеристика гена человеческого фактора рибозилирования АДФ 4». Gene . 237 (1): 209– 14. doi :10.1016/S0378-1119(99)00290-5. PMID 10524252.
Shin OH, Ross AH, Mihai I, Exton JH (1999). «Идентификация арфофилина, целевого белка для факторов АДФ-рибозилирования класса II, связанных с ГТФ». J. Biol. Chem . 274 (51): 36609– 15. doi : 10.1074/jbc.274.51.36609 . PMID 10593962.
Nevrivy DJ, Peterson VJ, Avram D, Ishmael JE, Hansen SG, Dowell P, Hruby DE, Dawson MI, Leid M (2000). "Взаимодействие GRASP, белка, кодируемого новым геном, индуцируемым ретиноевой кислотой, с членами семейства цитогезинов факторов обмена гуаниновых нуклеотидов". J. Biol. Chem . 275 (22): 16827– 36. doi : 10.1074/jbc.275.22.16827 . PMID 10828067.
Prekeris R, Davies JM, Scheller RH (2001). «Идентификация нового связывающего домена Rab11/25, присутствующего в белках Eferin и Rip». J. Biol. Chem . 276 (42): 38966– 70. doi : 10.1074/jbc.M106133200 . PMID 11481332.
Kim SW, Hayashi M, Lo JF, Yang Y, Yoo JS, Lee JD (2003). "ADP-рибозилирующий фактор 4 малая ГТФаза опосредует активацию фосфолипазы D2, зависящую от рецептора эпидермального фактора роста". J. Biol. Chem . 278 (4): 2661– 8. doi : 10.1074/jbc.M205819200 . PMID 12446727.
Katayama T, Imaizumi K, Yoneda T, Taniguchi M, Honda A, Manabe T, Hitomi J, Oono K, Baba K, Miyata S, Matsuzaki S, Takatsuji K, Tohyama M (2004). "Роль ARF4L в рециркуляции между эндосомами и плазматической мембраной". Cell. Mol. Neurobiol . 24 (1): 137– 47. doi :10.1023/B:CEMN.0000012719.12015.ec. PMID 15049518. S2CID 6273028.

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARF4 и страница с подробностями гена ARF4 в браузере геномов UCSC .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168374 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021877 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2107548-5] Monaco L, Murtagh JJ, Newman KB, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и связанного с ней псевдогена для человеческого фактора АДФ-рибозилирования, гуанинового нуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (6): 2206– 10. Bibcode :1990PNAS...87.2206M. doi : 10.1073/pnas.87.6.2206 . PMC 53655 . PMID 2107548.

[entrez-6] "Ген Энтреза: фактор 4 АДФ-рибозилирования ARF4".

[pmid12446727-7] Ким SW, Хаяши M, Ло JF, Ян Y, Ю JS, Ли JD (январь 2003 г.). "Малая ГТФаза фактора АДФ-рибозилирования 4 опосредует активацию фосфолипазы D2, зависящую от рецептора эпидермального фактора роста". J. Biol. Chem . 278 (4): 2661– 8. doi : 10.1074/jbc.M205819200 . PMID 12446727.

[8] Ward, Heather H.; Brown-Glaberman, Ursa; Wang, Jing; Morita, Yoshiko; Alper, Seth L.; Bedrick, Edward J.; Gattone, Vincent H.; Deretic, Dusanka; Wandinger-Ness, Angela (20 июля 2011 г.). «Для цилиарного транспорта полицистина-1 требуются консервативный сигнал и комплекс ГТФазы». Молекулярная биология клетки . 22 (18): 3289– 3305. doi : 10.1091/mbc.e11-01-0082 . ISSN 1059-1524. PMC 3172256. PMID 21775626 .