ТРИМ23

ТРИМ23
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM23 , ARD1, ARFD1, RNF46, трехкомпонентный мотив, содержащий 23
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601747; МГИ : 1933161; Гомологен : 1251; Генные карты : TRIM23; OMA :TRIM23 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 5 (человек)
Конец	65,625,975 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	104,339,880 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	червь мозжечка; ; фронтальный полюс; ; Ахиллово сухожилие; ; мозолистое тело; ; префронтальная кора; ; Район Бродмана 10; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; латеральная группа ядер таламуса; ; pars compacta; ; желудочковая зона;
	Верхний выражен в
	сперматоцит; ; доля мозжечка; ; миндалевидное тело; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; межреберная мышца; ; латеральное септальное ядро; ; сосцевидное тело; ; трехглавая мышца плеча; ; верхняя лобная извилина; ; собственно гиппокамп;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность активатора фермента; идентичное связывание белков; Активность ГТФазы; активность убиквитин-протеинтрансферазы; связывание белков; Привязка к ВВП; связывание ионов цинка; связывание ионов металлов; связывание нуклеотидов; Связывание ГТФ; трансферазная активность; связывание нуклеиновых кислот;
Клеточный компонент	эндомембранная система; мембрана Гольджи; ядро; лизосомальная мембрана; внутриклеточная анатомическая структура; мембрана; лизосома; цитоплазма; аппарат Гольджи; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	убиквитинирование белка; вирусный процесс; позитивная регуляция каталитической активности; процесс иммунной системы; врожденный иммунный ответ; внутриклеточный транспорт белков; Транспорт от Гольджи к плазматической мембране; везикулярно-опосредованный транспорт;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	373
	81003
	ENSG00000113595
	ENSMUSG00000021712
	Р36406
	Q8BGX0
	NM_001656 ; NM_033227 ; NM_033228
	НМ_030731 ; НМ_001361538 ; НМ_001361539
	NP_001647 ; NP_150230 ; NP_150231
	NP_001348467 ; NP_001348468
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

ГТФ-связывающий белок ARD-1 — это белок , который у человека кодируется геном TRIM23 . [ ^5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства трехкомпонентных мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три домена связывания цинка, RING, B-box типа 1 и B-box типа 2, а также область спиральной спирали. Этот белок также является членом семейства факторов рибозилирования АДФ семейства белков, связывающих гуаниновые нуклеотиды. Его карбоксильный конец содержит домен фактора рибозилирования АДФ и сайт связывания гуаниновых нуклеотидов, в то время как аминоконец содержит домен активирующего ГТФазу белка, который действует на сайт связывания гуаниновых нуклеотидов. Белок локализуется в лизосомах и аппарате Гольджи. Он играет роль в образовании внутриклеточных транспортных везикул, их перемещении из одного отсека в другой и активации фосфолипазы D. Были описаны три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта для этого гена. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что TRIM23 взаимодействует с TRIM31 , ^[7] TRIM29 ^[7] и PSCD1 . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000113595 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021712 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Mishima K, Tsuchiya M, Nightingale MS, Moss J, Vaughan M (апрель 1993 г.). "ARD 1, 64-кДа гуаниновый нуклеотид-связывающий белок с доменом фактора рибозилирования АДФ на карбоксильном конце". Журнал биологической химии . 268 (12): 8801–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52945-8 . PMID 8473324.
^ ab "Ген Entrez: трехкомпонентный мотив TRIM23, содержащий 23".
^ ab Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каир С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки». Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140. ПМК 125245 . ПМИД 11331580.
^ Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитогезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». Журнал биологической химии . 275 (28): 21331–9. дои : 10.1074/jbc.M909642199 . ПМИД 10748148.

Дальнейшее чтение

Vitale N, Moss J, Vaughan M (март 1996 г.). "ARD1, бифункциональный белок 64 кДа, содержащий домен фактора связывания АДФ-рибозилирования ГТФ 18 кДа и домен, активирующий ГТФазу 46 кДа". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (5): 1941–4. Bibcode : 1996PNAS...93.1941V. doi : 10.1073 /pnas.93.5.1941 . PMC 39887. PMID 8700863.
Vitale N, Moss J, Vaughan M (октябрь 1997 г.). «Характеристика области ингибирования диссоциации GDP доменного белка фактора рибозилирования АДФ ARD1». Журнал биологической химии . 272 (40): 25077–82. doi : 10.1074/jbc.272.40.25077 . PMID 9312116.
Vitale N, Moss J, Vaughan M (январь 1998). «Молекулярная характеристика домена, активирующего ГТФазу, белка домена фактора рибозилирования АДФ 1 (ARD1)». Журнал биологической химии . 273 (5): 2553–60. doi : 10.1074/jbc.273.5.2553 . PMID 9446556.
Vitale N, Horiba K, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (июль 1998 г.). "Локализация белка домена фактора АДФ-рибозилирования 1 (ARD1) в лизосомах и аппарате Гольджи". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (15): 8613–8. Bibcode : 1998PNAS...95.8613V. doi : 10.1073/pnas.95.15.8613 . PMC 21124. PMID 9671726 .
Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитогезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». Журнал биологической химии . 275 (28): 21331–9. дои : 10.1074/jbc.M909642199 . ПМИД 10748148.
Vitale N, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (октябрь 2000 г.). «Идентификация сигналов локализации лизосом и Гольджи в доменах GAP и ARF белка домена ARF 1». Молекулярная и клеточная биология . 20 (19): 7342–52. doi :10.1128/MCB.20.19.7342-7352.2000. PMC 86288. PMID 10982851 .
Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каиро С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки». Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140. ПМК 125245 . ПМИД 11331580.
Vichi A, Payne DM, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (февраль 2005 г.). "Активность E3 убиквитинлигазы трифункционального ARD1 (белок домена фактора рибозилирования АДФ 1)". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (6): 1945–50. Bibcode : 2005PNAS..102.1945V. doi : 10.1073/pnas.0409800102 . PMC 548593. PMID 15684077 .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 5 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000113595 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021712 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8473324-5] Mishima K, Tsuchiya M, Nightingale MS, Moss J, Vaughan M (апрель 1993 г.). "ARD 1, 64-кДа гуаниновый нуклеотид-связывающий белок с доменом фактора рибозилирования АДФ на карбоксильном конце". Журнал биологической химии . 268 (12): 8801–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52945-8 . PMID 8473324.

[entrez-6] "Ген Entrez: трехкомпонентный мотив TRIM23, содержащий 23".

[pmid11331580-7] Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каир С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки». Журнал ЭМБО . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140. ПМК 125245 . ПМИД 11331580.

[pmid10748148-8] Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитогезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». Журнал биологической химии . 275 (28): 21331–9. дои : 10.1074/jbc.M909642199 . ПМИД 10748148.