АРЛ2

АРЛ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3DOE, 3DOF
Идентификаторы
Псевдонимы	ARL2 , ARFL2, фактор рибозилирования АДФ, такой как ГТФаза 2, MRCS1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601175; МГИ : 1928393; Гомологен : 1260; Генные карты : ARL2; OMA :ARL2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	65,022,184 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	6,191,578 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Сегмент С1; ; прилежащее ядро; ; верхушка сердца; ; хвостатое ядро; ; путамен; ; большеберцовый нерв; ; правая лобная доля; ; левая коронарная артерия; ; восходящая аорта; ; правое предсердие;
	Верх выражен в
	мышца бедра; ; правый желудочек; ; желточный мешок; ; верхняя лобная извилина; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; правая почка; ; мешочек; ; первичная зрительная кора; ; слуховая плакода; ; слуховой пузырек;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; Связывание ГТФ; Активность ингибитора ГТФазы; связывание белков; Активность ГТФазы; Привязка к ВВП;
Клеточный компонент	цитоплазма; центросома; боковая плазматическая мембрана; митохондриальное межмембранное пространство; внутриклеточная анатомическая структура; центр организации микротрубочек; митохондриальный матрикс; митохондрия; цитоскелет; ядро; ядрышко; аппарат Гольджи; цитозоль; фокальная адгезия; ресничка; микротрубчатый цитоскелет;
Биологический процесс	сборка тубулинового комплекса; регуляция секреции инсулина; отрицательная регуляция активности ГТФазы; регуляция полимеризации микротрубочек; сборка двухклеточных плотных соединений; позитивная регуляция полимеризации микротрубочек; клеточный цикл; сохранение локализации белка в ядре; позитивная регуляция адгезии клеток к субстрату; цикл центросомы;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	402
	56327
	ENSG00000213465
	ENSMUSG00000024944
	Р36404
	Q9D0J4
	NM_001667 ; NM_001199745
	NM_019722
	NP_001186674 ; NP_001658
	NP_062696
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 2, подобный фактору АДФ-рибозилирования, — это белок , который у людей кодируется геном ARL2 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

Гены фактора АДФ-рибозилирования (ARF) представляют собой небольшие ГТФ-связывающие белки суперсемейства RAS. ARL2 является членом функционально отличной группы генов, подобных ARF. ^[7]
В фоторецепторах ARL2 участвует в транспортировке липидированных мембранно-ассоциированных белков. ^[8]
Имеются данные о том, что повышенная активность белка ARL2 тесно связана с повышенным слиянием митохондрий , тогда как потеря активности ARL2 приводит к снижению скорости слияния. ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что ARL2 взаимодействует с гомологом белка unc-119 , ^[10] TBCD ^[11]^[12] и PDE6D . ^[13]^[14]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213465 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024944 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Clark J, Moore L, Krasinskas A, Way J, Battey J, Tamkun J, Kahn RA (ноябрь 1993 г.). «Избирательная амплификация дополнительных членов семейства факторов АДФ-рибозилирования (ARF): клонирование дополнительных человеческих и дрозофильных ARF-подобных генов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (19): 8952– 6. Bibcode :1993PNAS...90.8952C. doi : 10.1073/pnas.90.19.8952 . PMC 47479 . PMID 8415637.
^ Guru SC, Agarwal SK, Manickam P, Olufemi SE, Crabtree JS, Weisemann JM, Kester MB, Kim YS, Wang Y, Emmert-Buck MR, Liotta LA, Spiegel AM, Boguski MS, Roe BA, Collins FS, Marx SJ, Burns L, Chandrasekharappa SC (сентябрь 1997 г.). "Карта транскриптов для региона размером 2,8 Мб, содержащего локус множественной эндокринной неоплазии типа 1". Genome Res . 7 (7): 725– 35. doi :10.1101/gr.7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601 .
^ ab "Ген Entrez: фактор 2, подобный фактору АДФ-рибозилирования ARL2".
^ Ханке-Гогохия, К.; Чжан, Х.; Фредерик, Дж. М.; Бэр, В. (2016). «Функция Arf-подобных белков ARL2 и ARL3 в фоторецепторах». Ретинальные дегенеративные заболевания . Достижения в экспериментальной медицине и биологии. Т. 854. С. 655– 661. doi :10.1007/978-3-319-17121-0_87. ISBN 978-3-319-17120-3. PMID 26427472.
^ Newman, LE; Schiavon, CR; Turn, RE; Kahn, RA (2017). «ГТФаза ARL2 регулирует слияние митохондрий из межмембранного пространства». Cellular Logistics . 7 (3): e1340104. doi :10.1080/21592799.2017.1340104. PMC 5602422 . PMID 28944094.
^ Kobayashi A, Kubota S, Mori N, McLaren MJ, Inana G (январь 2003 г.). «Фоторецепторный синаптический белок HRG4 (UNC119) взаимодействует с ARL2 через предполагаемый консервативный домен». FEBS Lett . 534 ( 1– 3): 26– 32. Bibcode : 2003FEBSL.534...26K. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03766-3 . PMID 12527357. S2CID 22603052.
^ Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (октябрь 2003 г.). «Цитозольный Arl2 образует комплекс с кофактором D и протеинфосфатазой 2A». J. Biol. Chem . 278 (42): 40829– 36. doi : 10.1074/jbc.M308678200 . PMID 12912990.
^ Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (май 2000 г.). «ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) adjustable the interaction tubulin-folding cofactor D with native tubulin». J. Cell Biol . 149 (5): 1087–96 . doi :10.1083/jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612 .
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (май 2002 г.). «Комплекс Arl2-GTP и PDE delta: от структуры к функции». EMBO J . 21 (9): 2095– 106. doi :10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981 . PMID 11980706.

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARL2 и страница с подробностями гена ARL2 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (2000). «ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) adjustable the interaction tubulin-folding cofactor D with native tubulin». J. Cell Biol . 149 (5): 1087–96 . doi :10.1083/jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612 .
Sharer JD, Shern JF, Van Valkenburgh H, Wallace DC, Kahn RA (2002). «ARL2 и BART входят в митохондрии и связывают транспортер адениновых нуклеотидов». Mol. Biol. Cell . 13 (1): 71– 83. doi :10.1091/mbc.01-05-0245. PMC 65073. PMID 11809823 .
Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (2002). «Комплекс Arl2-GTP и PDE delta: от структуры к функции». EMBO J . 21 (9): 2095– 106. doi :10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981 . PMID 11980706.
Антошечкин И, Хан М (2002). «Ген C. elegans evl-20 является гомологом малой ГТФазы ARL2 и регулирует динамику цитоскелета во время цитокинеза и морфогенеза». Dev. Cell . 2 (5): 579– 91. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00146-6 . PMID 12015966.
Kobayashi A, Kubota S, Mori N, McLaren MJ, Inana G (2003). «Фоторецепторный синаптический белок HRG4 (UNC119) взаимодействует с ARL2 через предполагаемый консервативный домен». FEBS Lett . 534 ( 1– 3): 26– 32. Bibcode : 2003FEBSL.534...26K. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03766-3 . PMID 12527357. S2CID 22603052.
Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (2003). «Цитозольный Arl2 образует комплекс с кофактором D и протеинфосфатазой 2A». J. Biol. Chem . 278 (42): 40829– 36. doi : 10.1074/jbc.M308678200 . PMID 12912990.
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Zhou C, Cunningham L, Marcus AI, Li Y, Kahn RA (2006). «Arl2 и Arl3 регулируют различные процессы, зависящие от микротрубочек». Mol. Biol. Cell . 17 (5): 2476– 87. doi :10.1091/mbc.E05-10-0929. PMC 1446103. PMID 16525022 .
Beghin A, Honore S, Messana C, Matera EL, Aim J, Burlinchon S, Braguer D, Dumontet C (2007). "ADP ribosylation factor like 2 (Arl2) protein influences microtubule dynamics in breast cancer cells". Exp. Cell Res . 313 (3): 473–85 . doi :10.1016/j.yexcr.2006.10.024. PMID 17188265.

Эта статья о белках — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213465 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024944 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8415637-5] Clark J, Moore L, Krasinskas A, Way J, Battey J, Tamkun J, Kahn RA (ноябрь 1993 г.). «Избирательная амплификация дополнительных членов семейства факторов АДФ-рибозилирования (ARF): клонирование дополнительных человеческих и дрозофильных ARF-подобных генов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (19): 8952– 6. Bibcode :1993PNAS...90.8952C. doi : 10.1073/pnas.90.19.8952 . PMC 47479 . PMID 8415637.

[pmid9253601-6] Guru SC, Agarwal SK, Manickam P, Olufemi SE, Crabtree JS, Weisemann JM, Kester MB, Kim YS, Wang Y, Emmert-Buck MR, Liotta LA, Spiegel AM, Boguski MS, Roe BA, Collins FS, Marx SJ, Burns L, Chandrasekharappa SC (сентябрь 1997 г.). "Карта транскриптов для региона размером 2,8 Мб, содержащего локус множественной эндокринной неоплазии типа 1". Genome Res . 7 (7): 725– 35. doi :10.1101/gr.7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601 .

[entrez-7] "Ген Entrez: фактор 2, подобный фактору АДФ-рибозилирования ARL2".

[8] Ханке-Гогохия, К.; Чжан, Х.; Фредерик, Дж. М.; Бэр, В. (2016). «Функция Arf-подобных белков ARL2 и ARL3 в фоторецепторах». Ретинальные дегенеративные заболевания . Достижения в экспериментальной медицине и биологии. Т. 854. С. 655– 661. doi :10.1007/978-3-319-17121-0_87. ISBN 978-3-319-17120-3. PMID 26427472.

[9] Newman, LE; Schiavon, CR; Turn, RE; Kahn, RA (2017). «ГТФаза ARL2 регулирует слияние митохондрий из межмембранного пространства». Cellular Logistics . 7 (3): e1340104. doi :10.1080/21592799.2017.1340104. PMC 5602422 . PMID 28944094.

[pmid12527357-10] Kobayashi A, Kubota S, Mori N, McLaren MJ, Inana G (январь 2003 г.). «Фоторецепторный синаптический белок HRG4 (UNC119) взаимодействует с ARL2 через предполагаемый консервативный домен». FEBS Lett . 534 ( 1– 3): 26– 32. Bibcode : 2003FEBSL.534...26K. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03766-3 . PMID 12527357. S2CID 22603052.

[pmid12912990-11] Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (октябрь 2003 г.). «Цитозольный Arl2 образует комплекс с кофактором D и протеинфосфатазой 2A». J. Biol. Chem . 278 (42): 40829– 36. doi : 10.1074/jbc.M308678200 . PMID 12912990.

[pmid10831612-12] Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (май 2000 г.). «ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) adjustable the interaction tubulin-folding cofactor D with native tubulin». J. Cell Biol . 149 (5): 1087–96 . doi :10.1083/jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612 .

[pmid16189514-13] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid11980706-14] Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (май 2002 г.). «Комплекс Arl2-GTP и PDE delta: от структуры к функции». EMBO J . 21 (9): 2095– 106. doi :10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981 . PMID 11980706.