АРЛ3

АРЛ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1FZQ, 3BH6, 3BH7, 4GOJ
Идентификаторы
Псевдонимы	ARL3 , ARFL3, фактор рибозилирования АДФ, такой как ГТФаза 3, JBTS35, RP83
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604695; МГИ : 1929699; гомологен : 48276; Генные карты : ARL3; OMA :ARL3 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 10 (человек)
Конец	102,714,397 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	46,561,637 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	бронхиальная эпителиальная клетка; ; слизистая оболочка околоносовых пазух; ; конъюнктива века; ; пигментный эпителий сетчатки; ; Понс; ; pars compacta; ; pars reticulata; ; большеберцовая кость; ; эпителий носоглотки; ; внешний бледный шар;
	Верх выражен в
	нервный слой сетчатки; ; Эпителий сосудистого сплетения; ; эпителий хрусталика; ; пигментный эпителий сетчатки; ; двигательный нейрон; ; собирательный проток мозгового вещества; ; ямка; ; черная субстанция; ; Ростральный миграционный поток; ; обонятельный эпителий;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; Привязка к ВВП; связывание микротрубочек; Связывание ГТФ; связывание ионов металлов; связывание белков; Активность ГТФазы; связывание ионов магния; Связывание белка, активирующего ГТФазу;
Клеточный компонент	цитоплазма; центросома; аппарат Гольджи; проекция клетки; мембрана; мембрана Гольджи; шпиндель; внутриклеточная анатомическая структура; фоторецептор, соединяющий ресничку; центр организации микротрубочек; середина тела; микротрубочка веретена; цитоплазматическая микротрубочка; внеклеточная экзосома; цитоскелет; ядро; ресничка; микротрубчатый цитоскелет;
Биологический процесс	сборка ресничек; развитие почек; внутриресничный транспорт; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой; развитие фоторецепторных клеток; транспорт, опосредованный везикулами пост-Гольджи; деление клеток; транспорт белков; клеточный цикл; сглаженный сигнальный путь; транспорт; митотический цитокинез; Транспорт от Гольджи к плазматической мембране; локализация белка в ресничке; локализация белка на цилиарной мембране;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	403
	56350
	ENSG00000138175
	ENSMUSG00000025035
	Р36405
	Q9WUL7
	NM_004311
	NM_019718 ; NM_001355233
	NP_004302
	NP_062692 ; NP_001342162
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 3, подобный фактору АДФ-рибозилирования, — это белок , который у людей кодируется геном ARL3 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

Фактор 3, подобный фактору АДФ-рибозилирования, является членом семейства факторов АДФ-рибозилирования ГТФ-связывающих белков. ARL3 связывает гуаниновые нуклеотиды, но не обладает активностью фактора АДФ-рибозилирования. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что ARL3 взаимодействует с гомологом белка unc-119 . ^[8]^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138175 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025035 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Cavenagh MM, Breiner M, Schurmann A, Rosenwald AG, Terui T, Zhang C, Randazzo PA, Adams M, Joost HG, Kahn RA (август 1994). "ADP-ribosylation factor (ARF)-like 3, a new member of the ARF family of GTP-binding proteins cloned from human and rat tissue". J. Biol. Chem . 269 (29): 18937– 42. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32257-3 . PMID 8034651.
^ Ким ХС (1998). «Присвоение гена человеческого фактора АДФ-рибозилирования 3 (ARL3) полосе q23.3 хромосомы 10 с помощью радиационного гибридного картирования». Cytogenet. Cell Genet . 83 ( 3–4 ): 246. doi :10.1159/000015194. PMID 10072593. S2CID 35440803.
^ ab "Ген Entrez: фактор 3, подобный фактору АДФ-рибозилирования ARL3".
^ Стельцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг С, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е, Дрёге А, Кробич С, Корн Б, Бирхмайер В, Лерах Х, Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68 . doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
^ Van Valkenburgh H, Shern JF, Sharer JD, Zhu X, Kahn RA (июнь 2001 г.). «Факторы АДФ-рибозилирования (ARF) и ARF-подобный 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характеристика белков, связывающих ARL1». J. Biol. Chem . 276 (25): 22826– 37. doi : 10.1074/jbc.M102359200 . PMID 11303027.

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARL3 и страница с подробностями гена ARL3 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3– 174. PMID 7566098.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal. Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК". Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
Linari M, Hanzal-Bayer M, Becker J (1999). «Дельта-субъединица специфической для стержней циклической GMP-фосфодиэстеразы, PDE delta, взаимодействует с Arf-подобным белком Arl3 специфическим для GTP образом». FEBS Lett . 458 (1): 55– 9. doi :10.1016/S0014-5793(99)01117-5. PMID 10518933. S2CID 23460401.
Hillig RC, Hanzal-Bayer M, Linari M, Becker J, Wittinghofer A, Renault L (2000). «Структурные и биохимические свойства показывают, что ARL3-GDP является отдельным связывающим GTP белком». Структура . 8 (12): 1239– 45. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00531-1 . PMID 11188688.
Bartolini F, Bhamidipati A, Thomas S, Schwahn U, Lewis SA, Cowan NJ (2002). «Функциональное перекрытие между белком пигментного ретинита 2 и кофактором тубулин-специфического шаперона C». J. Biol. Chem . 277 (17): 14629– 34. doi : 10.1074/jbc.M200128200 . PMID 11847227.
Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (2002). «Комплекс Arl2-GTP и PDE delta: от структуры к функции». EMBO J . 21 (9): 2095– 106. doi :10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981 . PMID 11980706.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Ray S, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). «Анализ экспрессированной последовательности тегов человеческой сетчатки для проекта NEIBank: ретбиндин, обильная, новая ретинальная кДНК и альтернативный сплайсинг других предпочтительных для сетчатки генных транскриптов». Mol. Vis . 8 : 196–204 . PMID 12107411.
Grayson C, Bartolini F, Chapple JP, Willison KR, Bhamidipati A, Lewis SA, Luthert PJ, Hardcastle AJ, Cowan NJ, Cheetham ME (2002). «Локализация в сетчатке человека белка пигментного ретинита, сцепленного с Х-хромосомой, RP2, его гомологичного кофактора C и взаимодействующего с RP2 белка Arl3». Hum. Mol. Genet . 11 (24): 3065– 74. doi : 10.1093/hmg/11.24.3065 . PMID 12417528.
Кюнель К, Вельтель С, Шлихтинг И, Виттингхофер А (2006). "Кристаллическая структура белка пигментного ретинита 2 человека и его взаимодействие с Arl3". Структура . 14 (2): 367– 78. doi : 10.1016/j.str.2005.11.008 . hdl : 11858/00-001M-0000-0015-8B49-9 . PMID 16472755.
Zhou C, Cunningham L, Marcus AI, Li Y, Kahn RA (2006). «Arl2 и Arl3 регулируют различные процессы, зависящие от микротрубочек». Mol. Biol. Cell . 17 (5): 2476– 87. doi :10.1091/mbc.E05-10-0929. PMC 1446103. PMID 16525022 .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 10 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138175 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025035 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8034651-5] Cavenagh MM, Breiner M, Schurmann A, Rosenwald AG, Terui T, Zhang C, Randazzo PA, Adams M, Joost HG, Kahn RA (август 1994). "ADP-ribosylation factor (ARF)-like 3, a new member of the ARF family of GTP-binding proteins cloned from human and rat tissue". J. Biol. Chem . 269 (29): 18937– 42. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32257-3 . PMID 8034651.

[pmid10072593-6] Ким ХС (1998). «Присвоение гена человеческого фактора АДФ-рибозилирования 3 (ARL3) полосе q23.3 хромосомы 10 с помощью радиационного гибридного картирования». Cytogenet. Cell Genet . 83 ( 3–4 ): 246. doi :10.1159/000015194. PMID 10072593. S2CID 35440803.

[entrez-7] "Ген Entrez: фактор 3, подобный фактору АДФ-рибозилирования ARL3".

[pmid16169070-8] Стельцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг С, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е, Дрёге А, Кробич С, Корн Б, Бирхмайер В, Лерах Х, Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68 . doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.

[pmid11303027-9] Van Valkenburgh H, Shern JF, Sharer JD, Zhu X, Kahn RA (июнь 2001 г.). «Факторы АДФ-рибозилирования (ARF) и ARF-подобный 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характеристика белков, связывающих ARL1». J. Biol. Chem . 276 (25): 22826– 37. doi : 10.1074/jbc.M102359200 . PMID 11303027.