АРФ5

АРФ5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2B6H
Идентификаторы
Псевдонимы	ARF5 , фактор рибозилирования АДФ 5
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 103188; МГИ : 99434; гомологен : 129625; GeneCards : ARF5; OMA :ARF5 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 7 (человек)
Конец	127,591,700 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	28,426,601 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	префронтальная кора; ; Район Бродмана 9; ; кожа ноги; ; правая лобная доля; ; кожа живота; ; тело поджелудочной железы; ; правое полушарие мозжечка; ; первичная зрительная кора; ; верхняя лобная извилина; ; гранулоцит;
	Верх выражен в
	губа; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; гранулоцит; ; первичная зрительная кора; ; верхняя лобная извилина; ; желудочковая зона; ; околоносовая кора; ; правая почка; ; желточный мешок; ; энторинальная кора;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; Связывание ГТФ; связывание белков; Активность ГТФазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; перинуклеарная область цитоплазмы; плазматическая мембрана; аппарат Гольджи; внеклеточная экзосома; внутриклеточная анатомическая структура; мембрана;
Биологический процесс	транспорт белков; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой; везикулярно-опосредованный транспорт; ретроградный везикулярно-опосредованный транспорт, Гольджи в эндоплазматический ретикулум; транспорт; внутриклеточный транспорт белков; Транспорт от Гольджи к плазматической мембране;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	381
	11844
	ENSG00000004059
	ENSMUSG00000020440
	Р84085
	Р84084
	NM_001662
	NM_007480
	NP_001653
	NP_031506
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор 5 АДФ-рибозилирования — это белок , который у человека кодируется геном ARF5 . [ ^5]^[6]

Фактор 5 АДФ-рибозилирования (ARF5) является членом семейства генов ARF человека. Эти гены кодируют небольшие белки, связывающие гуаниновые нуклеотиды, которые стимулируют активность АДФ-рибозилтрансферазы холерного токсина и играют роль в везикулярном транспорте, а также являются активаторами фосфолипазы D. Продукты генов включают 6 белков ARF и 11 белков, подобных ARF, и составляют 1 семейство суперсемейства RAS. Белки ARF подразделяются на класс I (ARF1, ARF2 и ARF3), класс II (ARF4 и ARF5) и класс III (ARF6). Члены каждого класса имеют общую генную организацию. Ген ARF5 охватывает приблизительно 3,2 кб геномной ДНК и содержит шесть экзонов и пять интронов. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ARF5 взаимодействует с ARFIP2 . ^[7]^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000004059 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020440 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tsuchiya M, Price SR, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (март 1991). «Молекулярная идентификация мРНК фактора АДФ-рибозилирования и их экспрессия в клетках млекопитающих». J Biol Chem . 266 (5): 2772– 7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)49913-9 . PMID 1993656.
^ ab "Ген Энтреза: фактор 5 АДФ-рибозилирования ARF5".
^ Kanoh, H; Williger BT; Exton JH (февраль 1997 г.). «Arfaptin 1, предполагаемый цитозольный целевой белок фактора АДФ-рибозилирования, привлекается к мембранам Гольджи». J. Biol. Chem . 272 (9). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ: 5421– 9. doi : 10.1074/jbc.272.9.5421 . ISSN 0021-9258. PMID 9038142.
^ Shin, OH; Exton JH (август 2001 г.). «Дифференциальное связывание арфаптина 2/POR1 с факторами АДФ-рибозилирования и Rac1». Biochem. Biophys. Res. Commun . 285 (5). Соединенные Штаты: 1267– 73. doi :10.1006/bbrc.2001.5330. ISSN 0006-291X. PMID 11478794.

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARF5 и страница с подробностями гена ARF5 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Ли Ф.Дж., Мосс Дж., Воган М. (1992). «Факторы АДФ-рибозилирования человека и лямблий (ARF) дополняют функцию ARF в Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem . 267 (34): 24441– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(18)35786-7 . PMID 1447192.
Stearns T, Willingham MC, Botstein D, Kahn RA (1990). «Фактор АДФ-рибозилирования функционально и физически связан с комплексом Гольджи». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (3): 1238– 42. Bibcode :1990PNAS...87.1238S. doi : 10.1073/pnas.87.3.1238 . PMC 53446 . PMID 2105501.
Orcl L, Palmer DJ, Amherdt M, Rothman JE (1993). «Сборка покрытых пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомер и белки ARF из цитозоля». Nature . 364 (6439): 732– 4. Bibcode :1993Natur.364..732O. doi :10.1038/364732a0. PMID 8355790. S2CID 4348442.
Helms JB, Palmer DJ, Rothman JE (1993). «Две различные популяции ARF, связанных с мембранами Гольджи». J. Cell Biol . 121 (4): 751– 60. doi :10.1083/jcb.121.4.751. PMC 2119793. PMID 8491770 .
Kanoh H, Williger BT, Exton JH (1997). «Арфаптин 1, предполагаемый цитозольный целевой белок фактора АДФ-рибозилирования, привлекается к мембранам Гольджи». J. Biol. Chem . 272 (9): 5421– 9. doi : 10.1074/jbc.272.9.5421 . PMID 9038142.
McGuire RE, Daiger SP, Green ED (1997). «Локализация и характеристика гена человеческого фактора 5 АДФ-рибозилирования (ARF5)». Геномика . 41 (3): 481– 4. doi :10.1006/geno.1997.4689. PMID 9169151.
Андреев Дж., Саймон Дж. П., Сабатини Д. Д. и др. (1999). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP». Mol. Cell. Biol . 19 (3): 2338– 50. doi :10.1128/MCB.19.3.2338. PMC 84026. PMID 10022920 .
Honda A, Nogami M, Yokozeki T и др. (1999). «Фосфатидилинозитол 4-фосфат 5-киназа альфа является нижестоящим эффектором малого G-белка ARF6 при формировании мембранной складки». Cell . 99 (5): 521– 32. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81540-8 . PMID 10589680. S2CID 10031591.
Shin OH, Ross AH, Mihai I, Exton JH (2000). «Идентификация арфофилина, целевого белка для факторов АДФ-рибозилирования класса II, связанных с ГТФ». J. Biol. Chem . 274 (51): 36609– 15. doi : 10.1074/jbc.274.51.36609 . PMID 10593962.
Kondo A, Hashimoto S, Yano H и др. (2000). «Новый белок, связывающий паксиллин, PAG3/Papα/KIAA0400, несущий активность белка, активирующего фактор АДФ-рибозилирования ГТФазу, участвует в привлечении паксиллина к фокальным адгезиям и миграции клеток». Mol. Biol. Cell . 11 (4): 1315– 27. doi :10.1091/mbc.11.4.1315. PMC 14849 . PMID 10749932.
Nevrivy DJ, Peterson VJ, Avram D и др. (2000). «Взаимодействие GRASP, белка, кодируемого новым геном, индуцируемым ретиноевой кислотой, с членами семейства цитогезинов факторов обмена гуаниновых нуклеотидов». J. Biol. Chem . 275 (22): 16827– 36. doi : 10.1074/jbc.275.22.16827 . PMID 10828067.
Shin OH, Couvillon AD, Exton JH (2001). «Арфофилин является общей целью факторов АДФ-рибозилирования как класса II, так и класса III». Биохимия . 40 (36): 10846– 52. doi :10.1021/bi0107391. PMID 11535061.
Austin C, Boehm M, Tooze SA (2002). «Сайт-специфическое перекрестное связывание выявляет дифференциальное прямое взаимодействие факторов АДФ-рибозилирования классов 1, 2 и 3 с комплексами адаптерных белков 1 и 3». Биохимия . 41 (14): 4669–77 . doi :10.1021/bi016064j. PMID 11926829.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология». Science . 300 (5620): 767– 72. Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961 . PMID 12690205.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 7 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000004059 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020440 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1993656-5] Tsuchiya M, Price SR, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (март 1991). «Молекулярная идентификация мРНК фактора АДФ-рибозилирования и их экспрессия в клетках млекопитающих». J Biol Chem . 266 (5): 2772– 7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)49913-9 . PMID 1993656.

[entrez-6] "Ген Энтреза: фактор 5 АДФ-рибозилирования ARF5".

[pmid9038142-7] Kanoh, H; Williger BT; Exton JH (февраль 1997 г.). «Arfaptin 1, предполагаемый цитозольный целевой белок фактора АДФ-рибозилирования, привлекается к мембранам Гольджи». J. Biol. Chem . 272 (9). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ: 5421– 9. doi : 10.1074/jbc.272.9.5421 . ISSN 0021-9258. PMID 9038142.

[pmid11478794-8] Shin, OH; Exton JH (август 2001 г.). «Дифференциальное связывание арфаптина 2/POR1 с факторами АДФ-рибозилирования и Rac1». Biochem. Biophys. Res. Commun . 285 (5). Соединенные Штаты: 1267– 73. doi :10.1006/bbrc.2001.5330. ISSN 0006-291X. PMID 11478794.