Классификация мембранных белков, включая ионные каналы
База данных классификации транспортеров (или TCDB ) — это одобренная Международным союзом биохимии и молекулярной биологии (IUBMB) система классификации мембранных транспортных белков , включая ионные каналы . [1] [2] [3]
Классификация Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:
1.Каналы α-типа1.A.1 Суперсемейство потенциал-управляемых ионных каналов 1.A.2 Семейство каналов K + с внутренним выпрямлением 1.A.3 Рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор семейства каналов Ca 2+ 1.A.4 Семейство каналов Ca2 + с транзиторным рецепторным потенциалом 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина 1.A.6 Семейство эпителиальных Na + каналов 1.A.7 Семейство катионных каналов рецепторов P2X, управляемых АТФ 1.A.8 Главное суперсемейство внутренних белков 1.A.9 Нейротрансмиттерный рецептор, петля Cys, семейство лиганд-управляемых ионных каналов 1.A.10 Семейство рецепторов нейротрансмиттеров, содержащих ионные каналы, управляемые глутаматом 1.A.11 Семейство транспортеров аммониевых каналов 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов 1.A.14 Семейство генов, переносимых через яички 1.A.15 Семейство неселективных катионных каналов 2 1.A.16 Семейство переносчиков формиата-нитрита 1.A.17 Семейство кальций-зависимых хлоридных каналов 1.A.18 Семейство Tic110, образующее анионо-каналы хлоропластной оболочки 1.A.19 Семейство каналов матрицы-2 вируса гриппа типа А 1.A.20 Семейство белков 3, взаимодействующих с BCL2/Adenovirus E1B 1.A.21 Семейство Bcl-2 1.A.22 Механочувствительный ионный канал большой проводимости 1.A.23 Механочувствительный ионный канал малой проводимости 1.A.24 Семейство коннексинов, образующих щелевые контакты 1.A.25 Семейство иннексинов, образующих щелевые контакты 1.A.26 Семейство транспортеров Mg 2+ -E 1.A.27 Семейство фосфолемманов 1.A.28 Семейство переносчиков мочевины 1.A.29 Семейство мочевинных/амидных каналов 1.A.30 H+- или Na+-транслоцирующий бактериальный жгутиковый мотор MotAB/суперсемейство активаторов наружной мембраны транспорта ExbBD 1.A.31 Семейство аннексинов 1.A.32 Семейство каналов вируса гриппа типа B NB 1.A.33 Семейство белков теплового шока 70, образующих катионные каналы 1.A.34 Семейство комплексов, образующих каналы, подобные щелевым контактам Bacillus 1.A.35 Семейство переносчиков ионов металлов CorA 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов 1.A.37 Семейство каналов CD20 Ca2+ 1.A.38 Семейство регуляторов pH Гольджи 1.A.39 Семейство каналов CM2 вируса гриппа типа C 1.A.40 Вирус иммунодефицита человека типа I, семейство каналов Vpu 1.A.41 Птичий реовирус p10 семейства Vvroporin 1.A.42 Семейство вирусных белков ВИЧ R 1.A.43 Устойчивость к камфоре или семейство экспортеров фторида 1.A.44 Порообразующий хвостовой кончик pb2 белок семейства фагов T5 1.A.45 Семейство инъекционных фагов P22 1.A.46 Семейство бестрофинов, образующих анионные каналы 1.A.47 Нуклеотид-чувствительный анион-селективный канал, семейство ICln 1.A.48 Анионный канал Семья Твити 1.A.49 Человеческий коронавирус ns12.9 семейство виропоринов 1.A.50 Семейство фосфоламбанов (регулятор Ca 2+ -каналов и Ca 2+ -АТФазы) 1.A.51 Семейство потенциалзависимых протонных каналов (VPC) 1.A.52 Семейство каналов Ca 2+ , активируемых высвобождением Ca 2+ (CRAC) (CRAC-C) 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина вируса гепатита С P7 (HCV-P7) 1.A.54 Семейство пресенилинов ER Ca 2+ Leak Channel (пресенилины) 1.A.55 Синаптические везикулы-ассоциированные Ca 2+ каналы, семейство Flower (Flower) 1.A.56 Семейство транспортеров меди (Ctr) 1.A.57 Человеческий коронавирус SARS виропорин (SARS-VP) 1.A.58 Семейство белков матрикса вируса гриппа типа B 2 (BM2-C) 1.A.59 Порообразующий пептид вируса бурсальной болезни, семейство Pep46 (Pep46) 1.A.60 Пептид, формирующий реовирус млекопитающих, семейство Mu-1 (Mu-1) 1.A.61 Семейство каналообразующих цепей F (гамма-пептид) вируса насекомых 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC) 1.A.63 α-спиральный порин наружной мембраны Ignicoccus (семейство I-OMP) 1.A.64 Семейство плазмолипинов (Plasmolipin) 1.A.65 Семейство белков виропорина E коронавируса (виропорин E) 1.A.66 Семья Пардаксин (Пардаксин) 1.A.67 Семейство мембранных транспортеров Mg 2+ (MMgT) 1.A.68 Семейство вирусных малых гидрофобных виропоринов (V-SH) 1.A.69 Семейство гетеромерных каналов рецепторов запаха (HORC) 1.A.70 Молекула против микробов семейства A (MamA) 1.A.71 Семейство мозговых кислоторастворимых белковых каналов (канал BASP1) 1.A.72 Суперсемейство Mer 1.A.73 Семейство лизирующих белков колицина (CLP) 1.A.74 Семья Мицугумин 23 (MG23) 1.A.75 Механические ноцицепторы, семейство пьезо (пьезо) 1.A.76 Семейство транспортеров магния 1 (MagT1) 1.A.77 Семейство унипортеров Mg 2+ /Ca 2+ (MCU) 1.A.78 Семейство K + -селективных каналов в эндосомах и лизосомах (KEL) 1.A.79 Семейство белков, поглощающих холестерин (ChUP) или белков, поглощающих двухцепочечную РНК 1.A.80 Семейство виропоринов NS4a (NS4a) 1.A.81 Семейство низкоаффинных Ca 2+ каналов (LACC) 1.A.82 Семейство каналов механотрансдукции волосковых клеток (HCMC) 1.A.83 Семейство виропоринов VP2 вируса SV40 (SV40 VP2) 1.A.84 Семейство каналов модулятора гомеостаза кальция Ca 2+ (CALHM-C) 1.A.85 Семейство виропоринов полиовируса 2B (2B Viroporin) 1.A.86 Семейство вируса папилломы человека типа 16 (HPV16) L2 виропорин (L2 виропорин) 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA) 1.A.88 Семейство грибковых калиевых каналов (F-Kch) 1.A.89 Семейство человеческого коронавируса 229E Viroporin (229E Viroporin) 1.A.90 Семейство виропоринов человеческого метапневмовируса (HMPV) (HMPV-Viroporin) 1.A.91 Связанный с цитоадгезией бесполый белок 3.2 семейства Plasmodium falciparum (Clag3) 1.A.92 Семейство реовирусных виропоринов VP10 (RVP10) 1.A.93 Семейство неструктурного белка 3 вируса синего языка Виропорин (NS3) 1.A.94 Семейство неструктурного гликопротеина 4 виропорина ротавируса (NSP4) 1.A.95 Семейство виропоринов эфемеровирусов (EVVP) 1.A.96 Семейство виропоринов вируса полиомы человека (PVVP) 1.A.97 Семейство виропоринов вируса папилломы человека типа 16 E5 (HPV-E5) 1.A.98 Человеческий Т-лимфотропный вирус 1 белок P13 (HTLV1-P13) Семейство 1.A.99 Семейство малых мембранных белков E вируса инфекционного бронхита (IBV-E) 1.A.100 Предполагаемый виропорин Rhabdoviridae, семейство U5 (RV-U5) 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих белков Pex11 (Pex11) 1.A.102 Семейство виропоринов гриппа А PB1-F2 (PB1-F2) 1.A.103 Семейство вирусов парагриппа 5 (SV5-SH) 1.A.104 Предложенный Na + -канал жгутикового биосинтеза, семейство FlaH (FlaH) 1.A.105 Семейство доменов киназ смешанного происхождения (MLKL) 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых кальциевой нагрузкой (CLAC) 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)
1.D Каналы, не синтезируемые рибосомами 1.D.1 Семейство каналов грамицидина А 1.D.2 Семейство сирингомицинов , образующих каналы 1.D.3 Семейство сирингопептинов, образующих каналы 1.D.4 Каналообразующая семья Толаасин 1.D.5 Семейство антибиотиков аламетицина или пептабола , формирующих каналы 1.D.6 Семейство комплексных поли-3-гидроксибутиратных Ca 2+ каналов (cPHB-CC) 1.D.7 Семейство бетиколина 1.D.8 Семейство сапонинов 1.D.9 Семейство полиглутаминовых ионных каналов (PG-IC) 1.D.10 Семейство каналов, образующих церамиды 1.D.11 Семейство сурфактинов 1.D.12 Семейство Боверицинов (Боверицинов) 1.D.13 Антибиотики на основе амфипатических пептидов, доставляющие ДНК (DAPA) 1.D.14 Семейство синтетических лей/серных амфипатических каналообразующих пептидов (l/S-SCP) 1.D.15 Семейство даптомицинов (даптомицинов) 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH) 1.D.17 Комбинаторно-спроектированное, порообразующее, семейство β-слоистых пептидов 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозина и желчной кислоты 1.D.19 Препарат, образующий каналы Ca 2+ , семейство дигитоксинов 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков/грибковых агентов (ПМАК) 1.D.21 Семейство липидных нанопор (LipNP) 1.D.22 Протон-транслоцирующий каротиноидный пигмент, семейство зеаксантинов 1.D.23 Семейство порообразующих антимикробных препаратов на основе фениленэтинилена (ПЭПА) 1.D.24 Семейство морских губок политионамида B (pTB) 1.D.25 Семейство ариламиновых фолдамеров (AAF) 1.D.26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G) 1.D.27 Семейство изостеров тиомочевины 1.D.28 Семейство липопептаболов 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов 1.D.30 Семейство искусственных гидразид-присоединенных столбчатых[5]ареновых каналов (HAPA-C) 1.D.31 Семейство амфотерицина B 1.D.32 Семейство порообразующих новицидиновых соединений 1.D.33 Каналообразующее семейство политионамидов B 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные боламфифилы 1.D.35 Семейство циклических липодепсипептидов, образующих поры 1.D.36 Семейство каналов ионов олигоборнена 1.D.37 Семейство Hibicuslide C 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT) 1.D.39 Семейство амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола, управляемых светом (AAM-IC) 1.D.40 Семейство липидных тороидальных пор, индуцированных белком 1.D.41 Семейство ионофоров спротетонатного типа (спирогексанолиды) 1.D.42 Семейство каналов Phe-Arg Tripeptide-Pillar[5]Arene (TPPA-C) 1.D.43 Семейство каналов гуанозина динуклеозида триазола (TT-GDN-C) 1.D.44 Семейство синтетических ионных каналов с редокс-активным ферроценом (ICRF) 1.D.45 Семейство сонопорации и электропорации мембранных пор (SEMP) 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP) 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP) 1.D.48 Порообразующее семейство сирингомицина E 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC) 1.D.50 Семейство амфифильных бис-катехиновых анионных транспортеров (AC-AT) 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP) 1.D.52 Семейство ароматических олигоамидных макроциклических нанопор (OmnNP) 1.D.53 Семейство альфа-, гамма-пептидных нанотрубок (a,gPepNT) 1.D.54 Семейство калийселективных ионного канала гексил-бензоуреидо-15-краун-5-эфира (HBEC) 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфирина (PorNP) 1.D.56 Семейство олигомерных нанопор альфа-аминоизобутирата (Aib) (AibNP) 1.D.57 Семейство липидных электропор (LEP) 1.D.58 Семейство продигиозена (продигиозена), транспортирующего анионы 1.D.59 Семейство переносящих анионы переносчиков переносин (перенозинов) 1.D.60 Семейство альфа-гамма-циклических пептидов (AGCP) 1.D.61 Семейство анионофорных 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридиновых (ABBP) соединений 1.D.62 Семейство производных бис-триазолилдигуанозина, образующих каналы (TDG) 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP) 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT) 1.D.65 Семейство порообразующих амфидиноловых соединений (амфидинол) 1.D.66 Семейство спиральных макромолекулярных нанопор (HmmNP) 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов, модифицированных краун-эфиром (CEHP) 1.D.68 Семейство порообразующих плевронических блок-полимеров (PPBP) 1.D.69 Семейство конических нанопор (ConNP) 1.D.70 Семейство металлических (Au/Ag/Pt/графен) нанопор (MetNP) 1.D.71 Семейство синтетических пептидов TP359 (TP359) 1.D.72 Семейство триподальных рецепторов на основе триазина для переноса хлорида (CCTTR) 1.D.73 Семейство мезопористых кремниевых нанопор (SilNP) 1.D.74 Семейство синтетических жестких пор п-октифенилового стержня (SSROP), чувствительных к стимулам 1.F.1 Семейство пор слияния синаптосомальных везикул (SVF-поры) 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист) 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-1 (VMFP1) 1.G.2 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-2 (VMFP2) 1.G.3 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-3 (VMFP3) 1.G.4 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-4 (VMFP4) 1.G.5 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-5 (VMFP5) 1.G.6 Семейство белков слияния гепаднавируса S (белок HBV-S) 1.G.7 Семейство белков слияния реовирусов FAST (R-FAST) 1.G.8 Семейство белков слияния аренавирусов (AV-FP) 1.G.9 Семейство синцитинов (синцитинов) 1.G.10 Семейство комплексов слияния мембран вируса простого герпеса (HSV-MFC) 1.G.11 Семейство белкового комплекса проникновения в клетку поксвируса (PEP-C) 1.G.12 Семейство белков слияния вируса лейкоза птиц gp95 (ALV-gp95) 1.G.13 Семейство малых трансмембранных белков, ассоциированных со слиянием ортореовирусов (FAST) 1.G.14 Семейство гемагглютинина вируса гриппа/слияния порообразующих белков (Influenza-H/FPP) 1.G.15 Семейство гликопротеинов GP64 (GP64) вируса ядерного полиэдроза Autographa californica 1.G.16 Семейство пептидов слияния вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) (ВИЧ-FP) 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкемии крупного рогатого скота (BLV-Env) 1.G.18 Пептид слияния SARS-CoV в семействе предшественников гликопротеина-шипа (SARS-FP) 1.G.19 Семейство ротавирусного комплекса слияния поровых мембран (ротавирусного MFC) 1.G.20 Семейство гликопротеинов слияния оболочки Gc хантавируса (Gc-EFG) 1.G.21 Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса человека 4) семейство Gp42 (Gp42) 1.G.22 Семейство гликопротеинов gO (gO) цитомегаловируса (вируса герпеса человека 5 типа)
1.H Параклеточные каналы 1.H.1 Семейство плотных контактов Клаудина (Claudin1) 1.H.2 Семейство беспозвоночных PMP22-Клаудин (Клаудин2)
1.I Мембранно-связанные каналы
2. Электрохимические потенциал-управляемые транспортеры 2.A.1 Суперсемейство основных посредников (MFS), см. также Лактозопермеаза , Фосфатпермеаза и Транспортер глюкозы 2.A.2 Семейство гликозид-пентозид-гексуронидов (GPH): катионных симпортеров 2.A.3 Семейство аминокислот-полиаминов-органокатионов (APC) 2.A.4 Семейство катализаторов диффузии катионов (CDF) 2.A.5 Семейство пермеаз цинка (Zn 2+ )-железа (Fe 2+ ) 2.A.6 Суперсемейство резистентности-клубенькования-деления клеток , см. также белок SecDF-экспорт мембранного белка 2.A.7 Суперсемейство переносчиков лекарств/метаболитов (DMT) 2.A.8 Семейство глюконат:H + симпортеров (GntP) 2.A.9 Семейство инсертаз мембранных белков (YidC/Alb3/Oxa1) 2.A.10 Семейство транспортеров 2-кето-3-дезоксиглюконата (KdgT) 2.A.11 Семейство симпортеров цитрата-Mg 2+ :H + (CitM) цитрата-Ca 2+ :H + (CitH) (CitMHS) 2.A.12 Семейство антипортеров АТФ:АДФ 2.A.13 Семейство C4-дикарбоксилатных белков (Dcu) 2.A.14 Семейство лактатпермеаз 2.A.15 Семейство переносчиков бетаина/карнитина/холина (BCCT) 2.A.16 Семейство переносчиков теллурита/дикарбоксилата 2.A.17 Семейство протонзависимых олигопептидных транспортеров 2.A.18 Семейство пермеаз аминокислот и ауксинов (AAAP) 2.A.19 Семейство антипортеров катионов Ca 2+ (CaCA) 2.A.20 Семейство переносчиков неорганического фосфата (PiT) 2.A.21 Растворенное вещество: Семейство симпортеров натрия 2.A.22 Нейротрансмиттер: семейство симпортеров натрия 2.A.23 Семейство симпортеров дикарбоксилат/аминокислота:катион (Na + или H + ) (DAACS) 2.A.24 Семейство транспортеров 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT) 2.A.25 Семейство симпортеров аланина или глицина: катиона (AGCS) 2.A.26 Семейство симпортеров аминокислот с разветвленной цепью: катион (LIVCS) 2.A.27 Семейство симпортеров глутамата:Na + (ESS) 2.A.28 Желчная кислота: семейство Na + Symporter 2.A.29 Семья митохондриальных переносчиков 2.A.30 Семейство катион-хлоридных котранспортеров (CCC) 2.A.31 Семейство анионообменников 2.A.32 Семейство переносчиков кремния (Sit) 2.A.33 Семейство NhaA Na + :H + антипортер (NhaA) 2.A.34 Семейство антипортеров NhaB Na + :H + (NhaB) 2.A.35 Семейство антипортеров NhaC Na + :H + (NhaC) 2.A.36 Семейство моновалентных катионов: протонных антипортеров-1 (CPA1) 2.A.37 Семейство моновалентных катионов: протонных антипортеров-2 (CPA2) 2.A.38 K + Транспортер (Trk) Семейство 2.A.39 Семейство нуклеиновых оснований: катионный симпортер-1 (NCS1) 2.A.40 Семейство нуклеиновых оснований: катионный симпортер-2 (NCS2) 2.A.41 Семейство концентрирующих нуклеозидных транспортеров (CNT) 2.A.42 Семейство пермеаз гидрокси/ароматических аминокислот (HAAAP) 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистеина (LCT) 2.A.45 Семейство арсенита-антимонита 2.A.46 Семейство бензоат:H + симпортеров (BenE) 2.A.47 Семейство двухвалентных анионов:Na + симпортер (DASS) 2.A.48 Семейство переносчиков восстановленного фолата (RFC) 2.A.49 Семейство переносчиков/каналов хлорида (ClC) 2.A.50 Семейство глицериновых ингибиторов (GUP) 2.A.51 Семейство переносчиков ионов хромата (CHR) 2.A.52 Семейство переносчиков Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT) 2.A.53 Семейство сульфатпермеаз (SulP) 2.A.54 Семейство митохондриальных переносчиков трикарбоксилата (MTC) 2.A.55 Семейство переносчиков ионов металлов (Mn2 + -железо) (Nramp) 2.A.56 Семейство трехкомпонентных АТФ-независимых периплазматических транспортеров (TRAP-T) 2.A.57 Семейство транспортеров равновесных нуклеозидов (ENT) 2.A.58 Семейство фосфат:Na + симпортеров (PNaS) 2.A.59 Семейство резистентности к мышьяку-3 (ACR3) 2.A.60 Семейство переносчиков органоанионов (OAT) 2.A.61 Семейство C4-дикарбоксилата (DcuC) 2.A.62 Семейство NhaD Na + :H + антипортер (NhaD) 2.A.63 Семейство моновалентных катионов (K + или Na + ): протонных антипортеров-3 (CPA3) 2.A.64 Семейство двойных аргининовых нацеливающих белков (Tat) 2.A.65 Семейство переносчиков билирубина (BRT) 2.A.66 Суперсемейство мультилекарственных/олигосахаридил-липид/полисахаридных (MOP) флиппаз 2.A.67 Семейство олигопептидных транспортеров (OPT) 2.A.68 Семейство переносчиков п-аминобензоил-глутамата (AbgT) 2.A.69 Семейство переносчиков ауксина (AEC) 2.A.70 Семейство малонат:Na + симпортеров (MSS) 2.A.71 Семейство транспортеров фолиевой кислоты и биоптерина (FBT) 2.A.72 Семейство пермеаз поглощения калия ( KUP) 2.A.73 Семейство короткоцепочечных жирных кислот (AtoE) 2.A.74 Семейство 4 TMS мультилекарственных эндосомальных транспортеров (MET) 2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE) 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерина/треонина (RhtB) 2.A.77 Семейство кадмиестойких (CadD) 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E) 2.A.79 Семейство экспортеров треонина/серина (ThrE) 2.A.80 Семейство трикарбоксилатных транспортеров (ТТТ) 2.A.81 Семейство аспартат-аланиновых обменников (AAEx) 2.A.82 Семейство переносчиков органических растворенных веществ (OST) 2.A.83 Семейство Na + -зависимых переносчиков бикарбоната (SBT) 2.A.84 Семейство экспортеров хлоропластной мальтозы (MEX) 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE) 2.A.86 Семейство экспортеров аутоиндуктора-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC #9.B.22) 2.A.87 Семейство прокариотических транспортеров рибофлавина (P-RFT) 2.A.88 Семейство транспортеров поглощения витаминов (VUT или ECF) 2.A.89 Семейство вакуолярных транспортеров железа (VIT) 2.A.90 Семейство рецепторов/транспортеров витамина А (STRA6) 2.A.91 Комплекс импорта митохондриальной тРНК (M-RIC) (ранее 9.C.8) 2.A.92 Семейство холинопереносчиков (CTL) 2.A.94 Семейство фосфатпермеаз (Pho1) 2.A.95 Семейство нейтральных переносчиков аминокислот (NAAT) 6TMS 2.A.96 Семейство транспортеров захвата ацетата (AceTr) 2.A.97 Семейство обменников K + /H + и Ca 2+ /H + внутренней мембраны митохондрий (LetM1)2.A.98 Семейство предполагаемых экспортеров сульфата (PSE) 2.A.99 Семейство транспортеров поглощения 6TMS Ni 2+ (HupE-UreJ) 2.A.100 Семейство ферропортинов (Fpn) 2.A.101 Семейство малонатных ингибиторов поглощения (MatC) (ранее UIT1) 2.A.102 Семейство пермеаз поглощения 4-толуолсульфоната (TSUP) 2.A.103 Семейство экспортеров предшественников бактериального муреина (MPE) 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE) 2.A.105 Семейство митохондриальных переносчиков пирувата (MPC) 2.A.106 Семейство антипортеров Ca 2+ :H + (CaCA2) 2.A.107 Семейство экспортеров MntP Mn 2+ (MntP) 2.A.108 Семейство транспортеров железа/свинца (ILT) 2.A.109 Семейство теллур-ионного сопротивления (TerC) 2.A.110 Семейство белков-переносчиков гема (HRG) 2.A.111 Семейство Na + /H + антипортеров-E (NhaE) 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA) 2.A.113 Семейство переносчиков никеля/кобальта (NicO) 2.A.114 Предполагаемый пептидный транспортер углеродного голодания CstA (CstA) семейства 2.A.115 Семейство экспортеров новобиоцина (NbcE) 2.A.116 Семейство пептидогликолипидных адресных белков (GAP) 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексидина (CHX) 2.A.118 Семейство основных аминокислотных антипортеров (ArcD) 2.A.119 Семья экспортеров мышьякоорганических соединений (ArsP) 2.A.120 Семейство предполагаемых аминокислотных пермеаз (PAAP) 2.A.121 Семейство переносчиков сульфата (CysZ) 2.A.122 Семейство вспомогательных холиноподобных белков LrgB/CidB (LrgB/CidB) 2.A.123 Сладкий; PQ-петля; Слюна; Семейство MtN3 (сладкий) 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO) 2.A.125 Семейство эукариотических транспортеров рибофлавина (E-RFT) 2.A.126 Семейство экспортеров жирных кислот (FAX) 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)
2.B Портеры, синтезируемые нерибосомально 2.B.1 Семейство переносчиков валиномицина 2.B.2 Семья Монензинов 2.B.3 Семейство нигерицинов 2.B.4 Семейство антибиотиков макротетролидов (МА) 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (МП) 2.B.6 Семейство иономицинов 2.B.7 Семейство трансмембранной α-спиральной пептидной фосфолипидной транслокации (TMP-PLT) 2.B.8 Семейство бафиломицина А1 (бафиломицина) 2.B.9 Функциональное семейство пептидов, проникающих в клетки (CPP) 2.B.10 Синтетический CPP, семейство транспортанов 2.B.11 Семейство ионофоров кальцимицинового или A23187-носителей 2.B.12 Семейство салиномицинов 2.B.13 Семейство антипортеров тетрапиррольных макроциклических анионов (TPMC-AA) 2.B.14 Семейство ионофоров Lasalocid A или X-537A (Lasalocid) 2.B.15 Семейство хлоридных носителей на основе тритиомочевины (TTT-CC) 2.B.16 Семейство соединений-анионов, содержащих галогеновые связи (HCAC) 2.B.17 Семейство котранспортеров (IDC) производных изофталамида H + :Cl − 2.B.18 Производное пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H+:Cl − семейство котранспортеров 2.B.19 Семейство производных каликс(4)пиррола (C4P) 2.B.20 Семейство хлорид/бикарбонатных обменников продигиозина (Prodigiosin) 2.B.21 Семейство анионных транспортеров производных орто-фенилендиамин-бис-мочевины (oPDA-U) 2.B.22 Семейство имидазолиевых функционализированных анионных транспортеров (IAT) 2.B.23 Гомотетрамерный трансмембранный Zn2 + /Co2 + : протонный синтетический антипортер, семейство Rocker (Рокер) 2.B.24 Семейство анионных носителей 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридина (BBP-AC) 2.B.25 Семейство пептид-опосредованных липидных флип-флопов (PLFF) 2.B.26 Семейство бис(имидазолил)-функционализированных бис(холоил) конъюгатов (BIBCC) 2.B.27 Семейство переносчиков анионов трис-мочевины 2.B.29 Анионофорные морские алкалоиды семейства тамбджаминов
2.C Ионно-градиентные источники энергии 2.C.1 Семейство вспомогательных белков TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) для энергизации активного транспорта, опосредованного рецептором внешней мембраны (OMR)
3.A. Транспортеры, управляемые гидролизом PP-связей 3.A.1 ABC-транспортеры, включая BtuCD, транспортер поглощения молибдата, регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие 3.A.2 Суперсемейство H + - или Na + -транслоцирующих АТФаз F-типа , АТФаз V-типа и АТФаз A-типа 3.A.3 Суперсемейство АТФазы P-типа 3.A.4 Семейство арсенита-антимонита 3.A.5 Общий секреторный путь (Sec) транслокон (препротеин транслоказа SecY) 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанных с вирулентностью) (IIISP) 3.A.7 Семейство секреторного пути типа IV (конъюгационный перенос ДНК-белка или VirB) (IVSP) 3.A.8 Семейство митохондриальных протеинтранслоказ (MPT) 3.A.9 Семейство транслоказ белка оболочки хлоропласта (CEPT или Tic-Toc) 3.A.10 Семейство пирофосфатаз, транслоцирующих H + , Na + 3.A.11 Семейство ДНК-транспортеров трансформации, связанных с бактериальной компетентностью (ДНК-Т) 3.A.12 Семейство транслокаторов септальной ДНК (S-DNA-T) 3.A.13 Семейство экспортеров нитчатых фагов (FPhE) 3.A.14 Семейство экспортеров фимбрилина/белка (FPE) 3.A.15 Семейство белков внешней мембраны, секретирующих главную терминальную ветвь (MTB) 3.A.16 Семейство ретротранслоконов эндоплазматического ретикулярного белка (ER-RT) 3.A.17 Семейство инъектисом фага T7 (T7 Injectisome) 3.A.18 Семейство ядерных экспортеров мРНК (мРНК-Е) 3.A.19 Семейство комплексов распознавания/вставки TMS (TRC) 3.A.20 Семейство импортеров пероксисомальных белков (PPI) 3.A.21 Семейство комплекса биогенеза/вставки мембранного белка, закрепленного на С-концевом хвосте (TAMP-B) 3.A.22 Семейство комплексов экспорта ядерной мРНК (TREX), связанных с транскрипцией TREX/TAP 3.A.23 Семейство путей симбиоза/вирулентности VI типа (VISP) 3.A.24 Семейство систем секреции белков типа VII или ESX (T7SS) 3.A.25 Семейство симбионт-специфических ERAD-подобных машин (SELMA) 3.A.26 Семейство транслоконов экспортируемых белков плазмодия (PTEX)
3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием 3.B.1 Семейство Na + -транспортирующих декарбоксилаз карбоновых кислот (NaT-DC)
3.C Транспортеры, управляемые метилтрансфером 3.C.1 Семейство Na + -переносящих метилтетрагидрометаноптерин:кофермент М метилтрансфераз (NaT-MMM)
3.D. Окислительно-восстановительные транспортеры Они включают ряд трансмембранных цитохром b -подобных белков, включая кофермент Q - цитохром c-редуктазу (цитохром bc1); комплекс цитохрома b6f ; формиатдегидрогеназу, респираторную нитратредуктазу ; сукцинат - кофермент Q-редуктазу (фумаратредуктазу); и сукцинатдегидрогеназу . См. цепь переноса электронов .
3.D.1 Семейство H + или Na + -транслоцирующих НАДН-дегидрогеназ («комплекс I») 3.D.2 Семейство трансгидрогеназ, транслоцирующих протоны (ПТГ) 3.D.3 Протон-транслоцирующее хинол:цитохром с-редуктазное суперсемейство 3.D.4 Суперсемейство протон-транслоцирующей цитохромоксидазы (COX) 3.D.5 Семейство Na + -транслоцирующих НАДН:хинондегидрогеназ (Na-NDH или NQR) 3.D.6 Предполагаемое семейство НАДН:ферредоксин оксидоредуктаз (НФО или РНФ), перемещающее ионы (Н + или Na + ) 3.D.7 Семейство H2 : гетеродисульфид оксидоредуктаз (HHO) 3.D.8 Семейство Na + - или H + -перекачивающих формилметанофурандегидрогеназ (FMF-DH) 3.D.9 Семейство дегидрогеназ F420H2 (F420H2DH), транслоцирующих H + 3.D.10 Семейство прокариотических сукцинатдегидрогеназ (SDH)
3.E. Транспортеры, управляемые поглощением света
4. Групповые транслокаторы
4. Групповые транслокаторы, управляемые фосфопереносом
4.B Транспортеры захвата никотинамид рибонуклеозида 4.B.1 Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозида (NR) (PnuC)
4.C Транспортеры, связанные с ацил-КоА-лигазой 4.C.1 Предлагаемое семейство транспортеров жирных кислот (FAT) 4.C.2 Семейство карнитин-О-ацилтрансферазы (CrAT) 4.C.3 Семейство ацил-КоА-тиоэстераз (AcoT)
4.D Полисахаридсинтаза/Экспортеры4.D.1 Предполагаемое семейство векторной гликозилполимеризации (VGP) 4.D.2 Семейство гликозилтрансферазы 2 (GT2) 4.D.3 Семейство гликанглюкозилтрансфераз (OpgH)
4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуолярной полифосфатполимеразой 4.E.1 Семейство вакуолярной (ацидокальцисомной) полифосфатполимеразы (V-PPP)
5. Транспортные переносчики электронов
5.A Трансмембранные переносчики 2-электронов 5.A.1 Семейство оксидоредуктаз дисульфидных связей D (DsbD) 5.A.2 Семейство оксидоредуктаз дисульфидных связей B (DsbB) 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптеринсодержащих оксидоредуктаз (PMO)
5.B Трансмембранные переносчики 1-электрона 5.B.1 Семейство НАДФН-оксидазы фагоцитов ( gp91phox ) 5.B.2 Эукариотическое семейство цитохромов b561 (Cytb561) 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire Electron Transfer (G-NET) 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы I растений (PSI) 5.B.5 Семейство внеклеточных металлооксидоредуктаз (EMOR) 5.B.6 Семейство трансмембранного эпителиального антигенного белка-3 железоредуктазы (STEAP) 5.B.7 Семья YedZ (YedZ) 5.B.8 Семейство транс-наружных мембранных пориновых/цитохромных комплексов переноса электронов (ET-PCC) 5.B.9 Семейство поринов-цитохромов c (Cyc2)
8. Вспомогательные факторы, участвующие в транспорте
8.A Вспомогательные транспортные белки
8.B Рибосомально синтезируемые белковые/пептидные токсины, нацеленные на каналы и переносчики
8.C Токсины, синтезируемые не рибосомами, которые воздействуют на каналы и переносчики
9. Не полностью охарактеризованные транспортные системы
9.A Признанные транспортеры неизвестного биохимического механизма
9.B Предполагаемые транспортные белки
9.C Функционально охарактеризованные транспортеры, не имеющие идентифицированных последовательностей
Ссылки ^ Saier, Milton H.; Reddy, Vamsee S.; Tamang, Dorjee G.; Västermark, Åke (январь 2014 г.). «База данных классификации транспортеров». Nucleic Acids Research . 42 (D1): D251 – D258 . doi :10.1093/nar/gkt1097. PMC 3964967. PMID 24225317 . ^ Saier, MH; Yen, MR; Noto, K.; Tamang, DG; Elkan, C. (1 января 2009 г.). «База данных классификации транспортеров: последние достижения». Nucleic Acids Research . 37 (База данных): D274 – D278 . doi :10.1093/nar/gkn862. PMC 2686586 . PMID 19022853. ^ Saier, MH; Tran, CV; Barabote, RD (1 января 2006 г.). "TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках". Nucleic Acids Research . 34 (90001): D181 – D186 . doi :10.1093/nar/gkj001. PMC 1334385 . PMID 16381841.
Внешние ссылки База данных классификации транспортеров Список на qmul.ac.uk Saier MH, Tran CV, Barabote RD (январь 2006 г.). "TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках". Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D181–6. doi :10.1093/nar/gkj001. PMC 1334385. PMID 16381841 . Busch W, Saier MH (2002). «Система классификации транспортеров (TC), 2002». Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 37 (5): 287– 337. doi :10.1080/10409230290771528. PMID 12449427. S2CID 10558982. Классификация переносчиков человека в фармакологии