Семейство AGCS
| Белок семейства симпортеров аланин/глицин:катион (AGCS) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | А3П053 | ||||||||
| Пфам | ПФ01235 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001463 | ||||||||
| ПРОСИТ | PS00873 | ||||||||
| |||||||||
Члены семейства симпортеров аланина или глицина:катиона (AGCS) (TC# 2.A.25) транспортируют аланин и/или глицин в симпорте с Na + и/или H + .
Структура и функции
Известные белки семейства AGCS имеют длину от 445 до 550 аминокислотных остатков и обладают 8–12 предполагаемыми трансмембранными α-спиральными стержнями. Члены могут обладать 11 трансмембранными сегментами (TMS), как, по-видимому, верно для DagA (TC# 2.A.25.1.1) и AgcS (TC# 2.A.25.1.3), хотя Acp (TC# 2.A.25.1.2) имеет только 8 TMS, возможно, в результате усечения. По состоянию на начало 2016 года, по-видимому, не было никаких данных о трехмерной кристаллической структуре для этих белков. Члены семейства AGCS были обнаружены в бактериях и археях, таких как экстремофильная галотолерантная цианобактерия Aphanothece halophytica и термофильная бактерия Bacillus PS3 . [1] [2] По состоянию на 2015 год были функционально охарактеризованы только три члена семейства. Эти белки демонстрируют ограниченное сходство последовательностей в семействе APC (TC# 2.A.3). [3] Высокоразрешающие структуры AgcS из Methanococcus maripaludis были получены с помощью рентгеновской кристаллографии и опубликованы в 2019 году и демонстрируют структурную гомологию с другими членами суперсемейства транспортеров аминокислота-полиамин-органокатион . [4]
Реакция переноса
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая семейством AGCS, выглядит следующим образом: [3]
аланин или глицин (выход) + Na + или H + (выход) → аланин или глицин (вход) + Na + или H + (вход).
Белки семейства AGCS
В настоящее время существует 10 белков, относящихся к семейству AGCS. Эти белки и их описания можно найти в Базе данных классификации транспортеров.
Ссылки
- ^ Буалуанг А., Кагеяма Х., Танака Й., Инчароенсакди А., Такабэ Т. (2015). «Функциональная характеристика члена аланина или глицина: семейство катионных симпортеров в галотолерантной цианобактерии Aphanothece halophytica». Бионаука, биотехнология и биохимия . 79 (2): 230– 5. doi : 10.1080/09168451.2014.968091 . PMID 25421789. S2CID 205616830.
- ^ Канамори М., Камата Х., Ягисава Х., Хирата Х. (март 1999 г.). «Сверхэкспрессия гена белка-переносчика аланина из термофильной бактерии PS3 в Escherichia coli». Журнал биохимии . 125 (3): 454–9 . doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022308. ПМИД 10050032.
- ^ ab Saier MH. "2.A.25 Семейство симпортеров аланина или глицина: катиона (AGCS)". База данных классификации транспортеров . Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.
- ^ Ma J, Lei HT, Reyes FE, Sanchez-Martinez S, Sarhan MF, Hattne J, Gonen T (февраль 2019 г.). «Структурная основа связывания субстрата и специфичность натрий-аланинового симпортера AgcS». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (6): 2086–2090 . Bibcode : 2019PNAS..116.2086M. doi : 10.1073/pnas.1806206116 . PMC 6369739. PMID 30659158 .
Дальнейшее чтение
- Родионов Д.А., Хеббельн П., Юдес А., Тер Бик Дж., Родионова И.А., Эркенс Г.Б. и др. (январь 2009 г.). «Новый класс модульных переносчиков витаминов у прокариот». Журнал бактериологии . 191 (1): 42–51 . doi :10.1128/JB.01208-08. ПМК 2612444 . ПМИД 18931129.
- Камата Х., Акияма С., Моросава Х., Охта Т., Хамамото Т., Камбе Т. и др. (октябрь 1992 г.). «Первичная структура белка-переносчика аланина термофильной бактерии PS3». Журнал биологической химии . 267 (30): 21650–5 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)36661-X . ПМИД 1400476.
На момент редактирования эта статья использует контент из "2.A.25 The Alanine or Glycine:Cation Symporter (AGCS) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.
 | Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
