Семья автовозов
| Автотранспортер бета-домен | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура аутотранспортерного домена NalP из Neisseria meningitidis . Запись PDB 1uyn [1] | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | Автовозчик | ||||||||||
| Пфам | ПФ03797 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR005546 | ||||||||||
| ПРОСИТ | PDOC51208 | ||||||||||
| СКОП2 | 1uyn / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| TCDB | 1.Б.12 | ||||||||||
| суперсемейство OPM | 28 | ||||||||||
| белок ОПМ | 1уё | ||||||||||
| |||||||||||
В молекулярной биологии аутотранспортерный домен — это структурный домен, обнаруженный в некоторых бактериальных белках внешней мембраны. Домен всегда расположен на С- конце белка и образует структуру бета-бочки . Бочка ориентирована в мембране таким образом, что N-концевая часть белка, называемая доменом-пассажиром, представлена на поверхности клетки. Эти белки обычно являются факторами вирулентности , связанными с инфекцией или вирулентностью у патогенных бактерий.
Название аутотранспортер происходит от первоначального понимания того, что белок был самодостаточным в транспортировке домена пассажира через внешнюю мембрану. Эта точка зрения с тех пор была оспорена Бенцем и Шмидтом. [2]
Секреция полипептидных цепей через внешнюю мембрану грамотрицательных бактерий может происходить несколькими различными путями. Путь секреции типа V(a), или аутотранспортерный, составляет наибольшее количество секретируемых факторов вирулентности любого из семи известных типов секреции у грамотрицательных бактерий. Этот путь секреции иллюстрируется прототипической протеазой IgA1 Neisseria gonorrhoeae . [3] Белок направляется к внутренней мембране сигнальным пептидом , транспортируемым через внутреннюю мембрану с помощью механизма Sec. Попав в периплазму , домен аутотранспортера встраивается во внешнюю мембрану. Пассажирский домен проходит через центр домена аутотранспортера, чтобы быть представленным снаружи клетки, однако механизм, с помощью которого это происходит, остается неясным. [4]
С-концевой транслокаторный домен соответствует домену бета-бочки внешней мембраны. N-концевой пассажирский домен транслоцируется через мембрану и может или не может быть отщеплен от транслокаторного домена. [5] В тех белках, где расщепление является автокаталитическим, пептидазные домены принадлежат к семействам пептидаз MEROPS S6 и S8. Было показано, что структурно охарактеризованные на сегодняшний день пассажирские домены доминируют в белковой складке, известной как бета-спираль , типичным представителем которой является пертактин . Считается, что складчатость этого домена неразрывно связана с его методом транслокации внешней мембраны.
Смотрите также
Тримерные аутотранспортные адгезины (ТАА)
Ссылки
- ^ Омен CJ, ван Ульсен П., ван Гелдер П., Фейен М., Томмассен Дж., Грос П. (март 2004 г.). «Структура транслокаторного домена бактериального аутотранспортера». Журнал ЭМБО . 23 (6): 1257–66. doi : 10.1038/sj.emboj.7600148. ПМЦ 381419 . ПМИД 15014442.
- ^ Benz I, Schmidt MA (август 2011). «Структуры и функции аутотранспортерных белков у микробных патогенов». Международный журнал медицинской микробиологии . 301 (6): 461–8. doi :10.1016/j.ijmm.2011.03.003. PMID 21616712.
- ^ Pohlner J, Halter R, Beyreuther K, Meyer TF (1987). «Структура гена и внеклеточная секреция протеазы IgA Neisseria gonorrhoeae». Nature . 325 (6103): 458–62. doi :10.1038/325458a0. PMID 3027577. S2CID 25569.
- ^ Leo JC, Grin I, Linke D (апрель 2012 г.). «Секреция типа V: механизм(ы) аутотранспорта через бактериальную наружную мембрану». Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Серия B, Биологические науки . 367 (1592): 1088–101. doi : 10.1098/rstb.2011.0208. PMC 3297439. PMID 22411980.
- ^ Хендерсон IR, Наварро-Гарсия F, Натаро JP (сентябрь 1998 г.). «Великий побег: структура и функция аутотранспортерных белков». Тенденции в микробиологии . 6 (9): 370–8. doi :10.1016/s0966-842x(98)01318-3. PMID 9778731.
Дальнейшее чтение
- Вейга Э., Сугавара Э., Никайдо Х., де Лоренцо В., Фернандес Л.А. (май 2002 г.). «Экспорт аутотранспортируемых белков происходит через олигомерное кольцо, образованное С-концевыми доменами». Журнал ЭМБО . 21 (9): 2122–31. дои : 10.1093/emboj/21.9.2122. ПМК 125980 . ПМИД 11980709.
- Омен CJ, ван Ульсен П., ван Гелдер П., Фейен М., Томмассен Дж., Грос П. (март 2004 г.). «Структура транслокаторного домена бактериального аутотранспортера». Журнал ЭМБО . 23 (6): 1257–66. doi : 10.1038/sj.emboj.7600148. ПМЦ 381419 . ПМИД 15014442.
 | Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
