ГПР113
| ADGRF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ADGRF3 , PGR23, hGPCR37, GPR113, адгезионный рецептор G-белка F3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | MGI : 2685887; HomoloGene : 17826; GeneCards : ADGRF3; OMA :ADGRF3 - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GPR113 — это ген , кодирующий вероятный белок рецептора 113, связанный с G-белком . [5] [6]
Ген
Ген человека GPR113 расположен на хромосоме 2 (2p23.3). Этот ген охватывает длину области 38,65 кб от основания 26531041 до 26569685 на отрицательной цепи. [7] Ген GPR113 имеет двух соседей с каждой стороны на отрицательной цепи: OTOF отоферлин, предшествующий ему, и HADHA гидроксиацил-КоА, следующий за ним. Прямо напротив GPR113 на положительной цепи находится ген EPT1. Ген GPR113 также известен под псевдонимами PGR23 и HGPCR37. [8]
Эволюция
GPR113 имеет 5 человеческих паралогов GPR110, GPR115, GPR128, GPR111 и GPR116. [8] GPR113 хорошо сохраняется у млекопитающих от приматов до полуводных видов, а также у некоторых амфибий. К ним относятся обыкновенный шимпанзе, африканский слон, утконос и западная когтистая лягушка. [9] Гомологичные домены, которые хорошо сохраняются у всех ортологов, сосредоточены в области 7 трансмембранных рецепторов (семейство секретинов), выделенной на рисунке фиолетовым цветом. [10]
Белок
Белковый продукт гена GPR113 представляет собой рецептор, сопряженный с G-белком. У человека этот белок имеет три варианта транскрипта. [11] Из этих трех вариантов GPR113 Variant 1 имеет самую длинную аминокислотную последовательность и самую высокую идентичность с ортологами. Это приводит к выводу, что GPR113 Variant 1 является потомком предкового гена GPR113 у homo sapiens. GPR113 Var 1 содержит 1079 аминокислот и является неотъемлемой частью плазматической мембраны. [12] 7-проходной рецептор содержит 4 домена, выделенных на рисунке справа: сигнальный пептид (красный), домен рецептора гормона (синий), домен GPS, подобный латрофилину/CL-1 (оранжевый) и 7-трансмембранный рецептор (фиолетовый). Между доменом рецептора гормона и GPS находится домен неизвестной функции , который не выделен.
Функция
GPR113 — это рецептор, связанный с G-белком , который участвует в нейропептидном сигнальном пути. [12]
Клиническая значимость
Было обнаружено, что GPR113 экспрессируется по-разному при болезненных состояниях. При диабете 2 типа процентильный ранг относительно других транскриптов уменьшается относительно нормальной функции клеток. [13] Удаление TP63 , который опосредует широкий спектр важных процессов организма, также приводит к снижению экспрессии GPR113. [14] В мозге мышей, мозжечке и обонятельной луковице, как показывают транскрипции гена GPR113. [15] Кроме того, исследование Национального института глухоты и других расстройств коммуникации выявило, что экспрессия GPR113 в значительной степени ограничена подмножеством клеток вкусовых рецепторов. [16] Выводы этой статьи, в сочетании с уровнями экспрессии обонятельной луковицы, могут предоставить возможность для будущих исследований, потенциально проливающих больше света на функцию GPR113.
Взаимодействующий белок
Было показано, что GPR113 ассоциируется с рецептором GPR123, связанным с орфанным G-белком . [17]
Факторы транскрипции
| Топ-10 факторов транскрипции с наибольшей вероятностью [18] |
|---|
| Сайт связывания для гомеодоменов типа S8 |
| Сайт связывания для гомеодоменов типа S8 |
| Места связывания DLX-1, -2 и -5 |
| TCF/LEF-1 (предпочтение вторичного связывания ДНК) |
| Гомеобокс, содержащий фактор транскрипции, специфичный для зародышевых клеток NOBOX |
| Сплеттоподобный фактор транскрипции 1 |
| Транскрипционный репрессор CDP |
| Альтернативный вариант сплайсинга FOXP1, активированный в эмбриональных стволовых клетках |
| Сайт связывания для гомеодоменов типа S8 |
| Гомеобокс, содержащий фактор транскрипции, специфичный для зародышевых клеток NOBOX |
Клиническое значение
Клиническое значение этого белка не установлено. Однако профили экспрессии открывают захватывающие направления для будущих исследований гена GPR113, особенно в областях, изучающих вкус и обоняние.
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000173567 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000067642 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Fredriksson R, Lagerström MC, Höglund PJ, Schiöth HB (ноябрь 2002 г.). «Новые человеческие рецепторы, сопряженные с G-белком, с длинными N-концами, содержащими домены GPS и регионы, богатые Ser/Thr». FEBS Letters . 531 (3): 407– 414. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03574-3 . PMID 12435584. S2CID 7449692.
- ^ "Ген Энтреза: рецептор 113, связанный с G-белком GPR113".
- ^ "Homo sapiens хромосома 2, GRCh37.p13 Первичная сборка". Нуклеотид . Национальная медицинская библиотека США. 2013-08-13.
- ^ ab "Ген ADGRF3 - GeneCards | Белок AGRF3 | Антитело AGRF3".
- ^ «BLAST: Базовый инструмент поиска локального выравнивания».
- ^ "SDSC Biology Workbench".
- ^ "Homo sapiens адгезия G белок-связанный рецептор F3 (ADGRF3), транскрипт вариант 2, мРНК". Нуклеотид . Национальная медицинская библиотека США. 2018-06-24.
- ^ ab "ADGRF3 - Предшественник рецептора F3, связанного с адгезионным G-белком - Homo sapiens (человек) - Ген и белок ADGRF3".
- ^ "ADGRF3 - диабет 2 типа и роль гепатокинов". Профили GEO . Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI). 71224040.
- ^ "Эффект истощения ADGRF3 - p63". Профили GEO . Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI). 34655140.
- ^ "G-белок-связанный рецептор 113". Allen Brain Atlas: Мышиный мозг .
- ^ LopezJimenez ND, Sainz E, Cavenagh MM, Cruz-Ithier MA, Blackwood CA, Battey JF и др. (апрель 2005 г.). «Два новых гена, Gpr113, который кодирует рецептор, связанный с G-белком семейства 2, и Trcg1, селективно экспрессируются в клетках вкусовых рецепторов». Genomics . 85 (4): 472– 482. doi :10.1016/j.ygeno.2004.12.005. PMID 15780750.
- ^ "STRING: Функциональные сети ассоциаций белков".
- ^ "ElDorado Introduction". Архивировано из оригинала 2021-05-22 . Получено 2013-05-12 .
Дальнейшее чтение
- Takeda S, Kadowaki S, Haga T, Takaesu H, Mitaku S (июнь 2002 г.). «Идентификация генов рецепторов, сопряженных с G-белком, из последовательности генома человека». FEBS Letters . 520 ( 1–3 ): 97–101 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)02775-8 . PMID 12044878. S2CID 7116392.
- Vassilatis DK, Hohmann JG, Zeng H, Li F, Ranchalis JE, Mortrud MT и др. (апрель 2003 г.). «Репертуары рецепторов, связанных с G-белком, у человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (8): 4903– 4908. Bibcode : 2003PNAS..100.4903V . doi : 10.1073/pnas.0230374100 . PMC 153653. PMID 12679517.
- Бьярнадоттир Т.К., Фредрикссон Р., Хёглунд П.Дж., Глориам Д.Е., Лагерстрём М.К., Шиот Х.Б. (июль 2004 г.). «Репертуар семейства адгезивных рецепторов, связанных с G-белком, человека и мыши». Геномика . 84 (1): 23–33 . doi :10.1016/j.ygeno.2003.12.004. ПМИД 15203201.
