Домен RhoGEF

Дедикатор цитокинеза (DOCK) домен RhoGEF
Дедикатор цитокинеза (DOCK) домен RhoGEF
Идентификаторы
Символ	RhoGEF
Пфам	ПФ06920
ИнтерПро	IPR010703 IPR026791, IPR010703
СКОП2	1wg7 / SCOPe / SUPFAM
CDD	cd11684
Пфам
Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры
ПДБ	1wg7

Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры
ПДБ	1foe E:1044-1233 1f5x A:198-372 1ki1 D:1241-1422 1nty A:1237-1407 1kzg C:636-811 1lb1 C:636-811 1kz7 C:636-811 1rj2 D:511-686 1xcg E:738-922 1txd A:791-976 1x86 E:791-976 1by1 A:275-4501дбх А:204-389 1xдв С:204-389 1xд4 А:204-389

Домен DH/PH RhoGEF
Домен DH/PH RhoGEF
	Структура домена RhoGEF из человеческого белка Son of sevenless, пример домена DH/PH RhoGEF.
Идентификаторы
Символ	RhoGEF
Пфам	ПФ00621
ИнтерПро	ИПР035899 ИПР000219, ИПР035899
УМНЫЙ	RhoGEF
СКОП2	1 дБч / SCOPe / SUPFAM
белок ОПМ	1xd4
CDD	cd00160
Пфам
Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры
ПДБ	1foe E:1044-1233 1f5x A:198-372 1ki1 D:1241-1422 1nty A:1237-1407 1kzg C:636-811 1lb1 C:636-811 1kz7 C:636-811 1rj2 D:511-686 1xcg E:738-922 1txd A:791-976 1x86 E:791-976 1by1 A:275-4501дбх А:204-389 1xдв С:204-389 1xд4 А:204-389

Домен белка

Домен RhoGEF описывает два различных структурных домена с активностью фактора обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для регуляции малых ГТФаз в семействе Rho . Малые ГТФазы Rho неактивны при связывании с GDP , но активны при связывании с GTP ; домены RhoGEF в белках способны способствовать высвобождению GDP и связыванию GTP для активации определенных членов семейства Rho, включая RhoA , Rac1 и Cdc42 .

Самый большой класс RhoGEF состоит из белков, содержащих домен « Dbl -гомологии» ( DH ), который почти всегда обнаруживается вместе с доменом плекстрин-гомологии (PH), образуя комбинированную структуру домена DH/PH. ^[2]^[3]

Отдельный класс RhoGEFs — это белки, содержащие домен DOCK/CZH/DHR-2 . Эта структура не имеет сходства последовательностей с доменами DBL-гомологии. ^[4]

Белки человека, содержащие домен DH/PH RhoGEF

ABR; AKAP13/ARHGEF13/Lbc ; ALS2 ; ALS2CL; ARHGEF1/p115-RhoGEF ; ARHGEF10 ; ARHGEF10L; ARHGEF11/PDZ-RhoGEF. ; ARHGEF12/LARG ; ARHGEF15; ARHGEF16; ARHGEF17; ARHGEF18; ARHGEF19; ARHGEF2 ; ARHGEF25; ARHGEF26; ARHGEF28; ARHGEF3 ; ARHGEF33; ARHGEF35 ; ARHGEF37; ARHGEF38; ARHGEF39; ARHGEF4 ; ARHGEF40; ARHGEF5 ; ARHGEF6/альфа-PIX ; ARHGEF7/бета-PIX ; ARHGEF9 ; BCR ; DNMBP; ECT2 ; ECT2L ; FARP1 ; FARP2 ; FGD1 ; FGD2 ; FGD3 ; FGD4 ; FGD5 ; FGD6; ITSN1/Интерсектин 1 ; ITSN2/Интерсектин 2 ; KALRN/Калирин ; MCF2 ; MCF2L ; MCF2L2; NET1 ; NGEF ; OBSCN ; PLEKHG1; PLEKHG2 ; PLEKHG3; PLEKHG4 ; PLEKHG4B; PLEKHG5 ; PLEKHG6; PREX1 ; PREX2 ; RASGRF1 ; RASGRF2 ; SPATA13 ; TIAM1 ; TIAM2; ТРИО ; VAV1 ; VAV2 ; VAV3 .

Белки человека, содержащие домен DOCK/CZH RhoGEF

DOCK1/DOCK180 ; DOCK2 ; DOCK3/MOCA ; DOCK4 ; DOCK5 ; DOCK6/ZIR1 ; DOCK7/ZIR2 ; DOCK8/ZIR3 ; DOCK9/Зизимин1 ; DOCK10/Зизимин2 ; DOCK11/Зизимин3

Смотрите также

Ссылки

^ Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого белка Son of sevenless». Cell . 95 (2): 259– 68. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . PMID 9790532. S2CID 11868669.
^ Форт П., Бланжи А. (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды». Genome Biology and Evolution . 9 (6): 1471– 1486. doi :10.1093/gbe/evx100. PMC 5499878. PMID 28541439 .
^ Cerione RA, Zheng Y (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl». Current Opinion in Cell Biology . 8 (2): 216– 22. doi : 10.1016/s0955-0674(96)80068-8 . PMID 8791419.
^ Коте Дж. Ф., Вуори К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства белков, связанных с DOCK180, с активностью обмена гуаниновыми нуклеотидами». Журнал клеточной науки . 115 (ч. 24): 4901– 13. doi : 10.1242/jcs.00219 . PMID 12432077.

Дальнейшее чтение

Hart MJ, Eva A, Evans T, Aaronson SA, Cerione RA (ноябрь 1991 г.). «Катализ обмена гуаниновых нуклеотидов на белке CDC42Hs продуктом онкогена dbl». Nature . 354 (6351): 311– 4. doi :10.1038/354311a0. PMID 1956381. S2CID 4240053.
Tan EC, Leung T, Manser E, Lim L (декабрь 1993 г.). «Ген, связанный с кластером активных точек разрыва человека, кодирует белок мозга с гомологией с белками обмена гуаниновых нуклеотидов и белками, активирующими ГТФазу». Журнал биологической химии . 268 (36): 27291– 8. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74248-3 . PMID 8262969.
Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (октябрь 1998 г.). "Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого белка Son of sevenless". Cell . 95 (2): 259– 68. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . PMID 9790532. S2CID 11868669.

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[pmid9790532-1] Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого белка Son of sevenless». Cell . 95 (2): 259– 68. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . PMID 9790532. S2CID 11868669.

[pmid28541439-2] Форт П., Бланжи А. (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды». Genome Biology and Evolution . 9 (6): 1471– 1486. doi :10.1093/gbe/evx100. PMC 5499878. PMID 28541439 .

[pmid8791419-3] Cerione RA, Zheng Y (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl». Current Opinion in Cell Biology . 8 (2): 216– 22. doi : 10.1016/s0955-0674(96)80068-8 . PMID 8791419.

[pmid12432077-4] Коте Дж. Ф., Вуори К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства белков, связанных с DOCK180, с активностью обмена гуаниновыми нуклеотидами». Журнал клеточной науки . 115 (ч. 24): 4901– 13. doi : 10.1242/jcs.00219 . PMID 12432077.