ФГД3

ФГД3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2COC
Идентификаторы
Псевдонимы	FGD3 , ZFYVE5, FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий 3
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 617554; МГИ : 1353657; гомологен : 22925; GeneCards : FGD3; OMA :FGD3 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 9 (человек)
Конец	93,036,236 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	49,473,787 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	гранулоцит; ; кровь; ; тимус; ; моноцит; ; селезенка; ; клетки костного мозга; ; трабекулярная кость; ; протоковая клетка поджелудочной железы; ; лимфатический узел; ; приложение;
	Верх выражен в
	гранулоцит; ; гаструла; ; желточный мешок; ; эмбрион; ; тимус; ; зрительная кора; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; кора мозжечка; ; первичная зрительная кора; ; подчелюстная железа;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов металлов; связывание малого ГТФазы; активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; аппарат Гольджи; рябить; цитоскелет; ламеллиподиум;
Биологический процесс	регуляция активности ГТФазы; сборка филоподиума; организация цитоскелета; регуляция формы клеток; позитивная регуляция процесса апоптоза; регуляция передачи сигнала белка Rho; регуляция передачи сигнала, опосредованного малой ГТФазой; организация актинового цитоскелета; Сигнальный путь рецептора, связанного с G-белком;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	89846
	30938
	ENSG00000127084
	ENSMUSG00000037946
	Q5JSP0
	О88842
	NM_001083536 ; NM_001286993 ; NM_033086 ; NM_001369951 ; NM_001369952
	NM_015759
NP_001077005 ; NP_001273922 ; NP_149077 ; NP_001356880 ; NP_001356881;
	NP_001077005.1 ; NP_149077.2
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 3, содержащий домены FYVE, RhoGEF и PH, представляет собой белок , который у людей кодируется геном FGD3 . [ ^5]^[6]

Смотрите также

FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий
- Домен FYVE (домен цинкового пальца)
- Домен RhoGEF (с активностью фактора обмена гуаниновых нуклеотидов )
- Домен PH (домен гомологии плекстрина)

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000127084 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000037946 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т., Кикуно Р., Хиросава М., Охара О. (февраль 2001 г.). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». DNA Res . 7 (6): 357–66. doi : 10.1093/dnares/7.6.357 . PMID 11214971.
^ «Ген Entrez: FGD3 FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий 3».

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Pasteris NG, Nagata K, Hall A, Gorski JL (2000). «Выделение, характеристика и картирование гена Fgd3 у мышей, нового гомолога гена фациогенитальной дисплазии (FGD1; синдром Аарскога)». Gene . 242 (1–2): 237–47. doi :10.1016/S0378-1119(99)00518-1. PMID 10721717.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 9». Nature . 429 (6990): 369–74. Bibcode :2004Natur.429..369H. doi :10.1038/nature02465. PMC 2734081 . PMID 15164053.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Делаг V, Жакье А, Хамадуш Т и др. (2007). «Мутации в FGD4, кодирующем фактор обмена Rho GDP/GTP FRABIN, вызывают аутосомно-рецессивный тип Шарко-Мари-Тута 4H». Am. J. Hum. Genet . 81 (1): 1–16. doi :10.1086/518428. PMC 1950914 . PMID 17564959.

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого FYVE, RhoGEF и PH-домен-содержащего белка 3 (FGD3)

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 9 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000127084 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000037946 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11214971-5] Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т., Кикуно Р., Хиросава М., Охара О. (февраль 2001 г.). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». DNA Res . 7 (6): 357–66. doi : 10.1093/dnares/7.6.357 . PMID 11214971.

[entrez-6] «Ген Entrez: FGD3 FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий 3».