ARHGEF7
Ген, кодирующий белок у человека
ARHGEF7
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGEF7 , BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, фактор обмена нуклеотидов Rho-гуанина 7
Внешние идентификаторыОМИМ : 605477; МГИ : 1860493; гомологен : 2895; GeneCards : ARHGEF7; OMA :ARHGEF7 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

8874

54126

Ансамбль

ENSG00000102606

ENSMUSG00000031511

UniProt

Q14155

Q9ES28

РефСек (мРНК)
RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Хр 13: 111.11 – 111.31 МбХр 8: 11.73 – 11.84 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанином Rho 7 — это белок , который у людей кодируется геном ARHGEF7 . [5] [6] [7] [8]

ARHGEF7 широко известен как фактор обмена бета p21 - активируемой протеинкиназы (beta-PIX или βPIX), поскольку он был идентифицирован путем связывания с p21-активируемой киназой (PAK) , а также содержит домен фактора обмена гуаниновых нуклеотидов . [6]

Домены и функции

βPIX — это многодоменный белок, который функционирует как сигнальный белок-скаффолд и как фермент . [9] βPIX разделяет эту доменную структуру и сигнальную функцию с очень похожим белком ARHGEF6/αPIX .

βPIX подвергается обширному альтернативному сплайсингу для создания множественных вариантных белков, содержащих или не содержащих определенные белковые домены. [9] У всех взрослых форм отсутствует аминоконцевой домен CH, а два основных варианта взрослых имеют альтернативную карбоксильную концевую область (называемые β1 и β2): формы β1 содержат домен тримеризации в виде спирали и мотив PDZ-мишени для связывания с белками PDZ (см. ниже), тогда как у форм β2 отсутствуют оба домена и соответствующие им функции. [9]

βPIX содержит центральный домен DH/PH RhoGEF , который функционирует как фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для малых ГТФаз семейства Rho , и в частности Rac и Cdc42 . [6] Как и другие ГТФ, βPIX может способствовать как высвобождению ГДФ из неактивного малого ГТФ-связывающего белка, так и связыванию ГТФ для содействия его активации. Сигнальные каркасы связываются с определенными партнерами для содействия эффективной передаче сигнала путем расположения последовательных элементов пути рядом друг с другом для облегчения взаимодействия/передачи информации, а также путем удерживания этих комплексов белков-партнеров в определенных местах внутри клетки для содействия локальной или региональной сигнализации. В случае βPIX его домен SH3 связывается с белками-партнерами с соответствующими полипролиновыми мотивами, и в частности с киназами, активируемыми p21 группы I (PAK) ( PAK1 , PAK2 и PAK3 ). [6] PAK связан с доменом βPIX SH3 в неактивном состоянии, а активированное связывание Rac1 или Cdc42 с этим PAK стимулирует его протеинкиназную активность, что приводит к последующему фосфорилированию целевого белка ; поскольку βPIX может активировать малые ГТФазы «p21» Rac1 или Cdc42 посредством своей активности GEF, этот комплекс βPIX/PAK/Rac является примером функции каркаса.

Структурно βPIX собирается как тример через домен спиральной спирали карбоксильного конца, который присутствует в основном варианте сплайсинга карбоксильного конца β1, и далее взаимодействует с димерами GIT1 или GIT2 через соседний домен связывания GIT с образованием олигомерных комплексов GIT-PIX. [9] Благодаря этому комплексу GIT-PIX функция каркаса βPIX усиливается также за счет способности удерживать партнеров GIT вблизи партнеров βPIX. Напротив, варианты с карбоксильным концом β2 лишены этой области спиральной спирали и, как предполагается, не способны тримеризоваться. Основной вариант с карбоксильным концом β1 также имеет мотив целевого связывания домена PDZ , который связывается с доменами PDZ в белках SHANK1 , [10] scribble , [11] и SNX27 [12] . Некоторые варианты сплайсинга βPIX содержат аминоконцевой домен гомологии кальпонина (CH) , функции которого остаются относительно плохо определенными, но могут взаимодействовать с белками семейства парвина/аффиксина . [13] [9] Варианты βPIX с этим расширенным аминоконцевым доменом CH наиболее сильно экспрессируются на ранних стадиях развития, но встречаются редко после рождения. [9]

Взаимодействия

Сообщается, что βPIX взаимодействует с более чем 120 белками. [9] [14]

К основным взаимодействующим белкам относятся:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000102606 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031511 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Oh WK, Yoo JC, Jo D, Song YH, Kim MG, Park D (июль 1997 г.). «Клонирование белка p85SPR, содержащего домен SH3 и богатого пролином, и его локализация в фокальной адгезии». Biochemical and Biophysical Research Communications . 235 (3): 794– 798. doi :10.1006/bbrc.1997.6875. PMID  9207241.
  6. ^ abcd Manser E, Loo TH, Koh CG, Zhao ZS, Chen XQ, Tan L, Tan I, Leung T, Lim L (июль 1998). "Киназы PAK напрямую связаны с семейством факторов обмена нуклеотидов PIX". Molecular Cell . 1 (2): 183– 192. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80019-2 . PMID  9659915.
  7. ^ Bagrodia S, Taylor SJ, Jordon KA, Van Aelst L, Cerione RA (октябрь 1998 г.). «Новый регулятор p21-активируемых киназ». Журнал биологической химии . 273 (37): 23633– 23636. doi : 10.1074/jbc.273.37.23633 . PMID  9726964.
  8. ^ "Ген Энтреза: ARHGEF7 Rho фактор обмена нуклеотидов гуанина (GEF) 7".
  9. ^ abcdefg Zhou W, Li X, Premont RT (май 2016 г.). «Расширение функций GIT Arf GTPase-активирующих белков, факторов обмена гуаниновых нуклеотидов PIX Rho и комплексов GIT-PIX». Journal of Cell Science . 129 (10): 1963– 1974. doi :10.1242/jcs.179465. PMC 6518221 . PMID  27182061. 
  10. ^ Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, Park D, Sheng M, Kim E (2003). «Семейство белков постсинаптической плотности Shank взаимодействует с фактором обмена нуклеотидов гуанина бета PIX для Rac1 и Cdc42 и способствует его синаптической аккумуляции». J. Biol. Chem . 278 (21): 19220– 9. doi : 10.1074/jbc.M301052200 . PMID  12626503.
  11. ^ Одеберт С., Наварро С., Нурри С., Шасеро-Голаз С., Лесин П., Беллайш И., Дюпон Дж.Л., Премон RT, Семпере С., Струб Дж.М., Ван Дорсселер А., Витале Н., Борг Дж.П. (июнь 2004 г.). «Scribble млекопитающих образует плотный комплекс с обменным фактором betaPIX». Современная биология . 14 (11): 987–995 . doi : 10.1016/j.cub.2004.05.051 . ПМИД  15182672.
  12. ^ Valdes JL, Tang J, McDermott MI, Kuo JC, Zimmerman SP, Wincovitch SM, Waterman CM, Milgram SL, Playford MP (ноябрь 2011 г.). «Сортировка белка nexin 27 регулирует перемещение комплекса белка, взаимодействующего с p21-активированной киназой (PAK) и фактором обмена (β-Pix)-G, связанным с рецептором киназы (GIT), через взаимодействие с доменом PDZ». Журнал биологической химии . 286 (45): 39403– 39416. doi : 10.1074/jbc.M111.260802 . PMC 3234764. PMID  21926430 . 
  13. ^ Розенбергер Г., Янтке И., Гал А., Кутше К. (2003). «Взаимодействие альфаПИК (ARHGEF6) с бета-парвином (PARVB) предполагает участие альфаПИК в опосредованной интегрином сигнализации». Молекулярная генетика человека . 12 (2): 155–167 . doi : 10.1093/hmg/ddg019 . PMID  12499396.
  14. ^ «Сводка результатов ARHGEF7».

Дальнейшее чтение

  • Turner CE, Brown MC, Perrotta JA, Riedy MC, Nikolopoulos SN, McDonald AR, Bagrodia S, Thomas S, Leventhal PS (1999). "Мотив Paxillin LD4 связывает PAK и PIX через новый 95-кДа анкириновый повтор, белок ARF-GAP: роль в ремоделировании цитоскелета". J. Cell Biol . 145 (4): 851– 63. doi :10.1083/jcb.145.4.851. PMC  2133183. PMID  10330411 .
  • Bagrodia S, Bailey D, Lenard Z, Hart M, Guan JL, Premont RT, Taylor SJ, Cerione RA (1999). «Тирозин-фосфорилированный белок, который связывается с важной регуляторной областью семейства cool белков, связывающих активируемую p21 киназу». J. Biol. Chem . 274 (32): 22393– 400. doi : 10.1074/jbc.274.32.22393 . PMID  10428811.
  • Premont RT, Claing A, Vitale N, Perry SJ, Lefkowitz RJ (2000). «Семейство белков GIT, активирующих фактор АДФ-рибозилирования ГТФазу. Функциональное разнообразие GIT2 через альтернативный сплайсинг». J. Biol. Chem . 275 (29): 22373– 80. doi : 10.1074/jbc.275.29.22373 . PMID  10896954.
  • Ku GM, Yablonski D, Manser E, Lim L, Weiss A (2001). «Комплекс PAK1-PIX-PKL активируется рецептором Т-клеток независимо от Nck, Slp-76 и LAT». EMBO J . 20 (3): 457– 65. doi :10.1093/emboj/20.3.457. PMC  133476 . PMID  11157752.
  • Koh CG, Tan EJ, Manser E, Lim L (2002). «P21-активируемая киназа PAK отрицательно регулируется POPX1 и POPX2, парой серин/треониновых фосфатаз семейства PP2C». Curr. Biol . 12 (4): 317– 21. doi : 10.1016/S0960-9822(02)00652-8 . PMID  11864573.
  • Brown MC, West KA, Turner CE (2002). «Паксиллин-зависимый линкер киназы паксиллина и локализация p21-активируемой киназы в очаговых спайках включают многоступенчатый путь активации». Mol. Biol. Cell . 13 (5): 1550– 65. doi :10.1091/mbc.02-02-0015. PMC  111126 . PMID  12006652.
  • Shin EY, Shin KS, Lee CS, Woo KN, Quan SH, Soung NK, Kim YG, Cha CI, Kim SR, Park D, Bokoch GM, Kim EG (2003). "Фосфорилирование p85 beta PIX, фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичного для Rac/Cdc42, через путь Ras/ERK/PAK2 необходимо для роста нейритов, вызванного основным фактором роста фибробластов". J. Biol. Chem . 277 (46): 44417– 30. doi : 10.1074/jbc.M203754200 . PMID  12226077.
  • Rosenberger G, Jantke I, Gal A, Kutsche K (2003). «Взаимодействие alphaPIX (ARHGEF6) с бета-парвином (PARVB) предполагает участие alphaPIX в опосредованной интегрином сигнализации». Hum. Mol. Genet . 12 (2): 155– 67. doi : 10.1093/hmg/ddg019 . PMID  12499396.
  • Mignone F, Grillo G, Liuni S, Pesole G (2003). "Вычислительная идентификация потенциала кодирования белка консервативных последовательностей тегов посредством межвидового эволюционного анализа". Nucleic Acids Res . 31 (15): 4639– 45. doi :10.1093/nar/gkg483. PMC  169873. PMID  12888525 .
  • Yamamoto Y, Fujimoto Y, Arai R, Fujie M, Usami S, Yamada T (2003). "Ретротранспозон-опосредованное восстановление теломер Chlorella: накопление ретротранспозонов Zepp на концах вновь образованных минихромосом". Nucleic Acids Res . 31 (15): 4646– 53. doi :10.1093/nar/gkg490. PMC  169880. PMID  12888526 .
  • Flanders JA, Feng Q, Bagrodia S, Laux MT, Singavarapu A, Cerione RA (2003). «Белки Cbl являются партнерами по связыванию для семейства Cool/Pix белков, связывающих активируемую p21 киназу». FEBS Lett . 550 ( 1– 3): 119– 23. doi :10.1016/S0014-5793(03)00853-6. PMID  12935897. S2CID  46540220.
  • Shin EY, Woo KN, Lee CS, Koo SH, Kim YG, Kim WJ, Bae CD, Chang SI, Kim EG (2004). «Основной фактор роста фибробластов стимулирует активацию Rac1 через путь, зависящий от фосфорилирования p85 betaPIX». J. Biol. Chem . 279 (3): 1994–2004 . doi : 10.1074/jbc.M307330200 . PMID  14557270.
  • Lim CS, Kim SH, Jung JG, Kim JK, Song WK ​​(2004). «Регуляция фосфорилирования SPIN90 и взаимодействие с Nck с помощью ERK и клеточной адгезии». J. Biol. Chem . 278 (52): 52116– 23. doi : 10.1074/jbc.M310974200 . PMID  14559906.
  • Информация ARHGEF7 со ссылками в шлюзе миграции ячеек
  • Расположение генома человека ARHGEF7 и страница с подробностями гена ARHGEF7 в браузере геномов UCSC .
  • Расположение генома человека PAK3 и страница с подробностями гена PAK3 в браузере геномов UCSC .



Значок заглушки

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 13 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ARHGEF7&oldid=1229310667"