ФАРП1

Protein-coding gene in the species Homo sapiens
ФАРП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFARP1 , CDEP, FARP1-IT1, PLEKHC2, PPP1R75, FERM, ARH/RhoGEF и белок домена плекстрина 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 602654; МГИ : 2446173; гомологен : 38098; GeneCards : FARP1; OMA :FARP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_001001715
НМ_001286839
НМ_005766

NM_134082

RefSeq (белок)

НП_001001715
НП_001273768
НП_005757

NP_598843

Местоположение (UCSC)Хр 13: 98.14 – 98.46 МбХр 14: 121,27 – 121,52 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1, содержащий домен FERM, RhoGEF и плекстрин, представляет собой белок , который у людей кодируется геном FARP1 . [ 5] [6]

Этот ген был первоначально выделен посредством субтрактивной гибридизации из-за его повышенной экспрессии в дифференцированных хондроцитах по сравнению с дедифференцированными хондроцитами. Полученный белок содержит предсказанный ezrin -подобный домен, домен гомологии Dbl и домен гомологии плекстрина . Считается, что он является членом суперсемейства band 4.1 , члены которого связывают цитоскелет с клеточной мембраной . Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующих различные изоформы . [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000152767 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025555 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Koyano Y, Kawamoto T, Shen M, Yan W, Noshiro M, Fujii K, Kato Y (янв. 1998 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика CDEP, нового человеческого белка, содержащего эзрин-подобный домен суперсемейства полосы 4.1 и домен гомологии Dbl факторов обмена нуклеотидов гуанина Rho». Biochem Biophys Res Commun . 241 (2): 369–75 . doi :10.1006/bbrc.1997.7826. PMID  9425278.
  6. ^ ab "Ген Entrez: FARP1 FERM, RhoGEF (ARHGEF) и белок плекстринового домена 1 (происходящий из хондроцитов)".

Дальнейшее чтение

  • Zhuang B, Su YS, Sockanathan S (февраль 2009 г.). «FARP1 способствует дендритному росту подтипов спинальных двигательных нейронов посредством трансмембранной сигнализации Semaphorin6A и PlexinA4». Neuron . 61 (3): 359– 72. doi :10.1016/j.neuron.2008.12.022. PMC  2654783 . PMID  19217374.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 13». Nature . 428 (6982): 522– 8. Bibcode :2004Natur.428..522D. doi :10.1038/nature02379. PMC  2665288 . PMID  15057823.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res . 14 (10B): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .


Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=FARP1&oldid=1237044219"