Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности
Домен рецептора липопротеинов низкой плотности класса А
Структура богатого цистеином повтора из рецептора липопротеинов низкой плотности. [1]
Идентификаторы
СимволLdl_recept_a
ПфамПФ00057
ИнтерПроIPR002172
УМНЫЙSM00192
ПРОСИТPS50068
СКОП21ldl / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM
Мембраном5
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Домен рецептора липопротеинов низкой плотности класса B
Структура внеклеточного домена рецептора ЛПНП при эндосомальном pH. [2]
Идентификаторы
СимволLdl_recept_b
ПфамПФ00058
Клан ПФАМ6CL0186
ИнтерПроIPR000033
УМНЫЙSM00135
ПРОСИТPS51120
СКОП21LRX / SCOPe / SUPFAM
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ПДБ1ijq ​, 1n7d ​, 1npe

Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности кодирует класс структурно связанных рецепторов клеточной поверхности , которые выполняют разнообразные биологические функции в различных органах, тканях и типах клеток. [3] Роль, которая чаще всего ассоциируется с этим эволюционно древним семейством, — это гомеостаз холестерина (поддержание соответствующей концентрации холестерина). У людей избыток холестерина в крови захватывается липопротеинами низкой плотности (ЛПНП) и удаляется печенью посредством эндоцитоза рецептора ЛПНП . [4] Последние данные указывают на то, что члены семейства генов рецепторов ЛПНП активны в сигнальных путях клеток между специализированными клетками во многих, если не во всех, многоклеточных организмах. [5] [6]

У млекопитающих имеется семь членов семейства ЛПНП, а именно:

Белки человека, содержащие этот домен

Ниже перечислены человеческие белки, содержащие домены рецепторов липопротеинов низкой плотности:

Класс А

C6 ; C7 ; 8A ; 8B ; C9 ; CD320 ; CFI; CORIN ; DGCR2 ; HSPG2 ; LDLR ; LDLRAD2; LDLRAD3; LRP1 ; LRP10 ; LRP11 ; LRP12; LRP1B ; LRP2 ; LRP3 ; LRP4 ; LRP5 ; LRP6 ; LRP8 ; MAMDC4; MFRP ; PRSS7; RXFP1 ; RXFP2 ; SORL1 ; SPINT1 ; SSPO ; ST14 ; TMPRSS4 ; TMPRSS6 ; TMPRSS7; TMPRSS9 (сераза-1B); VLDLR ;

Класс Б

EGF ; LDLR ; LRP1 ; LRP10 ; LRP1B ; LRP2 ; LRP4 ; LRP5 ; LRP5L; LRP6 ; LRP8 ; NID1 ; NID2 ; SORL1 ; VLDLR ;

Смотрите также

Структура

Модульная структура членов семейства рецепторов ЛПНП. Домены, изображенные заштрихованными, сплайсируются по-разному и встречаются только в некоторых изоформах рецепторов

Члены семейства LDLR характеризуются различными функциональными доменами, представленными в характерных числах. Эти модули:

  • Рецептор ЛПНП типа А (LA) повторяет 40 остатков каждый, демонстрируя отрицательно заряженную поверхность, стабилизированную тройной дисульфидной связью; считается, что определенные комбинации этих повторов «голова к хвосту» определяют лигандные взаимодействия;
  • Повторы рецептора ЛПНП типа B , также известные как области гомологии предшественника EGF, содержащие EGF-подобные повторы и домены бета-пропеллера YWTD ;
  • трансмембранный домен и
  • цитоплазматическая область с (a) сигналом(ами) для интернализации рецептора через покрытые ямки, содержащие консенсусный тетрапептид Asn-Pro-Xaa-Tyr (NPxY). Этот цитоплазматический хвост контролирует как эндоцитоз, так и сигнализацию, взаимодействуя с белками, содержащими домен связывания фосфотирозина (PTB).

В дополнение к этим доменам, которые можно обнаружить во всех рецепторах семейства генов, рецептор ЛПНП и некоторые изоформы ApoER2 и VLDLR содержат короткую область, которая может подвергаться O-связанному гликозилированию , известную как O-связанный сахарный домен. Кроме того, ApoER2 может содержать сайт расщепления для протеазы фурин между повторами типа A и типа B, что позволяет производить растворимый фрагмент рецептора путем опосредованной фурином обработки.

Ссылки

  1. ^ Daly NL, Scanlon MJ, Djordjevic JT, Kroon PA, Smith R (июль 1995 г.). "Трехмерная структура богатого цистеином повтора из рецептора липопротеинов низкой плотности". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (14): 6334–8. Bibcode :1995PNAS...92.6334D. doi : 10.1073/pnas.92.14.6334 . PMC  41512 . PMID  7603991.
  2. ^ Руденко Г., Генри Л., Хендерсон К. и др. (декабрь 2002 г.). «Структура внеклеточного домена рецептора ЛПНП при эндосомальном pH» (PDF) . Science . 298 (5602): 2353–8. Bibcode :2002Sci...298.2353R. doi :10.1126/science.1078124. PMID  12459547. S2CID  17712211.
  3. ^ Nykjaer A, Willnow TE (июнь 2002 г.). «Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности: клеточный швейцарский армейский нож?». Trends Cell Biol . 12 (6): 273–80. doi :10.1016/S0962-8924(02)02282-1. PMID  12074887.
  4. ^ Li Y, Lu W, Marzolo MP, Bu G (май 2001 г.). «Дифференциальные функции членов семейства рецепторов липопротеинов низкой плотности, предполагаемые их различными скоростями эндоцитоза». J. Biol. Chem . 276 (21): 18000–6. doi : 10.1074/jbc.M101589200 . PMID  11279214.
  5. ^ Gotthardt M, Trommsdorff M, Nevitt MF, Shelton J, Richardson JA, Stockinger W, Nimpf J, Herz J (август 2000 г.). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольными адаптерами и белками каркаса предполагает разнообразные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигнала». J. Biol. Chem . 275 (33): 25616–24. doi : 10.1074/jbc.M000955200 . PMID  10827173.
  6. ^ Beffert U, Stolt PC, Herz J (март 2004 г.). «Функции липопротеиновых рецепторов в нейронах». J. Lipid Res . 45 (3): 403–9. doi : 10.1194/jlr.R300017-JLR200 . PMID  14657206.
  • Схематическое изображение семи членов семейства рецепторов ЛПНП млекопитающих (ЛПНП)
  • Члены семейства рецепторов ЛПНП
  • Рецепторы ЛПНП в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Семейство_генов_рецепторов_липопротеинов_низкой_плотности&oldid=1245788918"