повторить YWTD
| Повтор рецептора ЛПНП класса B | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Ldl_recept_b | ||||||||
| Пфам | ПФ00058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000033 | ||||||||
| |||||||||
Повторы YWTD представляют собой четырехцепочечные повторы бета-пропеллера, обнаруженные в рецепторах липопротеинов низкой плотности (LDLR). Шесть повторов YWTD вместе складываются в шестилопастной бета-пропеллер ( InterPro : IPR011042 ). Каждая лопасть пропеллера состоит из четырех антипараллельных бета-нитей; самая внутренняя нить каждой лопасти обозначена как 1, а самая внешняя нить — как 4. Повторы последовательности смещены относительно лопастей пропеллера, так что любой заданный 40-остаточный повтор YWTD охватывает нити 24 одной лопасти пропеллера и нить 1 последующей лопасти. Это смещение обеспечивает закругление пропеллера, поскольку последняя нить последнего повтора последовательности действует как самая внутренняя нить 1 лопасти, которая содержит нити 24 из первого повтора последовательности. Повтор обнаружен в различных белках, включая рецептор вителлогенина из Drosophila melanogaster , рецептор липопротеинов низкой плотности (ЛПНП) [1] , препроэпидермальный фактор роста и нидоген (энтактин). [2]
LDLR регулирует гомеостаз холестерина в клетках млекопитающих. LDLR связывает холестерин-несущие LDL, ассоциируется с покрытыми клатрином ямками и интернализуется в кислые эндосомы , где он отделяется от своего лиганда. Лиганд деградирует в лизосомах , в то время как рецептор возвращается на поверхность клетки. [3] LDLR имеет несколько доменов. Домен связывания лиганда содержит семь повторов класса A рецептора LDL, каждый с тремя дисульфидными связями и координированным ионом Ca 2+ . Вторая консервативная область содержит два повтора EGF, за которыми следуют шесть повторов класса B рецептора YWTD или LDL и еще один повтор EGF. [4] Эта консервативная область имеет решающее значение для высвобождения лиганда и рециркуляции рецептора. [5]
Ссылки
- ^ Russell DW, Schneider WJ, Yamamoto T, Brown MS, Goldstein JL, Davis CG, Casey ML (1984). «Человеческий рецептор ЛПНП: богатый цистеином белок с множественными последовательностями Alu в его мРНК». Cell . 39 (1): 27– 38. doi :10.1016/0092-8674(84)90188-0. PMID 6091915.
- ^ Eck MJ, Springer TA, Blacklow SC, Takagi J, Jeon H, Meng W (2001). «Выводы из структуры пары доменов YWTD-EGF рецептора ЛПНП для семейной гиперхолестеринемии». Nat. Struct. Biol . 8 (6): 499– 504. doi :10.1038/88556. PMID 11373616.
- ^ Браун М.С., Голдштейн Дж.Л. (1986). «Рецепторно-опосредованный путь гомеостаза холестерина». Science . 232 (4746): 34–47 . doi :10.1126/science.3513311. PMID 3513311.
- ^ Springer TA (1998). «Внеклеточный модуль бета-пропеллера, предсказанный в липопротеиновых и скавенджерных рецепторах, тирозинкиназах, предшественнике эпидермального фактора роста и компонентах внеклеточного матрикса». J. Mol. Biol . 283 (4): 837– 862. doi :10.1006/jmbi.1998.2115. PMID 9790844.
- ^ Russell DW, Brown MS, Goldstein JL, Davis CG, Sudhof TC, Anderson RG (1987). «Кислотно-зависимая диссоциация лиганда и рециркуляция рецептора ЛПНП, опосредованная областью гомологии фактора роста». Nature . 326 (6115): 760– 765. doi :10.1038/326760a0. PMID 3494949.
