Сортировка nexin

Домен PX
Структура домена PX из p40(phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом. [1]
Идентификаторы
СимволПХ
ПфамПФ00787
ИнтерПроIPR001683
УМНЫЙПХ
ПРОСИТPDOC50195
СКОП21ч6ч / SCOPe / SUPFAM
суперсемейство OPM57
белок ОПМ4на3
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Сортировка нексина, N-концевой домен
Идентификаторы
СимволСортировка_nexin
ПфамПФ03700
ИнтерПроIPR005329
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Vps5 C-терминал (BAR-домен)
Идентификаторы
СимволVps5
ПфамПФ09325
ИнтерПроИПР015404
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Сортировка нексина, С-концевой домен
Идентификаторы
СимволНексин_С
ПфамПФ08628
ИнтерПроIPR013937
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
WASP-связывающий домен белка сортировки нексина
Идентификаторы
СимволBAR3-WASP
ПфамПФ10456
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Сортирующие нексины представляют собой большую группу белков, которые локализуются в цитоплазме и обладают потенциалом для ассоциации с мембраной либо через свой связывающий липиды домен PX ( фосфолипид -связывающий мотив ), либо через белок-белковые взаимодействия с мембранно-ассоциированными белковыми комплексами [2] [3]. Было показано, что некоторые члены этого семейства облегчают сортировку белков .

Члены семьи

У людей сортировочные нексины транскрибируются со следующих генов:

ГеныСостав домена
N-конецСередина 1Середина 2Середина 3C-конец
SNX1 , SNX2Сортировка_nexin_NПХБАР [4] (Vps5)
SNX4 , SNX7, SNX8 , SNX30ПХБАР [4] (Vsp5)
SNX5 , SNX6 , SNX32ПХБАР [4]
SNX9 , SNX18 , SNX33Ш3ПХБАР [4] (BAR_3_WASP_bdg) [5]
SNX13 , SNX14, SNX19, SNX25ПХА [6]РГОПХНексин_С
SNX15ПХМассачусетский технологический институт [7]
SNX17 , SNX31ПХРА [8]ФЕРМ_М [9]
SNX23кинезин_моторSMAD_FHA [10]ПХ
SNX26ПХШ3RhoGAP
SNX27ПДЗПХ-ФЕРМ_М [9]
SNX28ПХШ3Ш3
SNX3 , SNX10, SNX11, SNX12, SNX16, SNX20, SNX21 , SNX22, SNX24, SNX29ПХ

Структура

Сортировочные нексины либо состоят исключительно из домена PX (например, SNX3), либо имеют модульную структуру, состоящую из домена PX и дополнительных доменов .

Подгруппа сортировочных нексинов (включающая у людей SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 и SNX33) имеет домен BAR на своем C-конце. (Домен BAR SNX 1, 2, 4, 7, 8 и 30 классифицируется pfam как «подобный C-концу Vps5».)

Пример структуры домена сортировки нексина можно увидеть здесь для SNX1:

  1. NTD – N-концевой домен
  2. Домен PX
  3. CTD – C-концевой BAR-домен
Схематическая диаграмма 1D-структур типичного сортировочного нексина, сортировочного нексина 1 (SNX1). NTD = N-концевой SNX-домен, PX = PX-домен, CTD = C-концевой BAR-домен.

Ссылки

  1. ^ Bravo J, Karathanassis D, Pacold CM и др. (октябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура домена PX из p40(phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом». Mol. Cell . 8 (4): 829–39. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00372-0 . PMID  11684018.
  2. ^ Dixon JE, Worby CA (2002). «Сортировка клеточных функций сортировки нексинов». Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (12): 919–931. doi :10.1038/nrm974. PMID  12461558. S2CID  36361630.
  3. ^ Worby CA, Dixon JE (2002). «Сортировка клеточных функций сортировки нексинов». Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (12): 919–31. doi :10.1038/nrm974. PMID  12461558. S2CID  36361630.
  4. ^ abcd Frost A, Unger VM, De Camilli P (апрель 2009 г.). «Суперсемейство доменов BAR: макромолекулы, формирующие мембраны». Cell . 137 (2): 191–196. doi :10.1016/j.cell.2009.04.010. PMC 4832598 . PMID  19379681. 
  5. ^ BAR_3_WASP_bdg: WASP-связывающий домен белка сортировки нексина, Pfam PF10456
  6. ^ PXA: Домен PXA, Pfam PF02194
  7. ^ MIT: домен MIT (взаимодействие и транспорт микротрубочек), Pfam PF04212
  8. ^ RA: Домен ассоциации Ras (RalGDS/AF-6), Pfam PF00788
  9. ^ ab FERM_M: центральный домен FERM, Pfam PF00373
  10. ^ SMAD_FHA: домен SMAD/FHA, InterProIPR008984


Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Sorting_nexin&oldid=1072836020"