SNX9

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SNX9
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNX9 , SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, сортировка нексина 9
Внешние идентификаторыОМИМ : 605952; МГИ : 1913866; гомологен : 49454; Генные карты : SNX9; OMA :SNX9 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_016224

NM_025664

RefSeq (белок)

NP_057308

NP_079940

Местоположение (UCSC)Хр 6: 157,7 – 157,95 МбХр 17: 5.89 – 5.98 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Сортирующий нексин-9 — это белок , который у людей кодируется геном SNX9 . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует члена семейства сортировочных нексинов. Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который является доменом связывания фосфоинозитида, и участвуют во внутриклеточном трафике. Этот белок не содержит спиральную область спирали, как некоторые члены семейства, но содержит домен SH3 около своего N-конца . Этот белок взаимодействует с цитоплазматическими доменами предшественника, но не с обработанными формами домена дезинтегрина и металлопротеазы 9 и 15. Этот белок связывает домен бета-придатка адаптерного белка 2 и может функционировать, помогая адаптерному белку 2 в его роли на плазматической мембране. Этот белок взаимодействует с активированной Cdc42-ассоциированной киназой-2, чтобы регулировать деградацию рецепторного белка эпидермального фактора роста. [7]

Взаимодействия

Было показано, что SNX9 взаимодействует с ADAM9 , [5] DNM2 [8] и ADAM15 . [5]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000130340 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000002365 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abc Howard L; Nelson KK; Maciewicz RA; Blobel CP (декабрь 1999 г.). «Взаимодействие металлопротеазных дезинтегринов MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1». J Biol Chem . 274 (44): 31693– 9. doi : 10.1074/jbc.274.44.31693 . PMID  10531379.
  6. ^ Yarar D; Waterman-Storer CM; Schmid SL (июль 2007 г.). «SNX9 связывает сборку актина с сигналами фосфоинозитида и необходим для ремоделирования мембраны во время эндоцитоза». Dev Cell . 13 (1): 43– 56. doi : 10.1016/j.devcel.2007.04.014 . PMID  17609109.
  7. ^ ab «Ген Энтрез: SNX9, сортирующий нексин 9» .
  8. ^ Lundmark, Richard; Carlsson Sven R (ноябрь 2003 г.). «Сортировка nexin 9 участвует в эндоцитозе, опосредованном клатрином, посредством взаимодействия с основными компонентами». J. Biol. Chem . 278 (47). Соединенные Штаты: 46772– 81. doi : 10.1074/jbc.M307334200 . ISSN  0021-9258. PMID  12952949.

Дальнейшее чтение

  • Teasdale RD, Loci D, Houghton F и др. (2001). «Большое семейство локализованных в эндосомах белков, связанных с сортировкой нексина 1». Biochem. J . 358 (Pt 1): 7– 16. doi :10.1042/0264-6021:3580007. PMC  1222026 . PMID  11485546.
  • Lin Q; Lo CG; Cerione RA; Yang W (2002). «Цель Cdc42 ACK2 взаимодействует с сортирующим нексином 9 (SH3PX1) для регуляции деградации рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem . 277 (12): 10134– 8. doi : 10.1074/jbc.M110329200 . PMID  11799118.
  • Lundmark R; Carlsson SR (2002). «Бета-придатки четырех комплексов адаптерного белка (AP): структура и свойства связывания, а также идентификация сортирующего нексина 9 как вспомогательного белка для AP-2». Biochem. J . 362 (Pt 3): 597– 607. doi :10.1042/0264-6021:3620597. PMC  1222423 . PMID  11879186.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Lundmark R; Carlsson SR (2004). «Сортирующий нексин 9 участвует в эндоцитозе, опосредованном клатрином, посредством взаимодействия с основными компонентами». J. Biol. Chem . 278 (47): 46772– 81. doi : 10.1074/jbc.M307334200 . PMID  12952949.
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805– 11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
  • Шульце В. К.; Манн М. (2004). «Новый протеомный экран для пептидно-белковых взаимодействий». J. Biol. Chem . 279 (11): 10756– 64. doi : 10.1074/jbc.M309909200 . PMID  14679214.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Lehner B; Sanderson CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res . 14 (7): 1315– 23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC  442147. PMID  15231747 .
  • Lundmark R; Carlsson SR (2004). «Регулируемое мембранное рекрутирование динамина-2, опосредованное сортировкой нексина 9». J. Biol. Chem . 279 (41): 42694– 702. doi : 10.1074/jbc.M407430200 . PMID  15299020.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Soulet F; Yarar D; Leonard M; Schmid SL (2005). «SNX9 регулирует сборку динамина и необходим для эффективного эндоцитоза, опосредованного клатрином». Mol. Biol. Cell . 16 (4): 2058– 67. doi :10.1091/mbc.E04-11-1016. PMC  1073683. PMID  15703209 .
  • Yeow-Fong L; Lim L; Manser E (2005). "SNX9 как адаптер для связывания синаптоянина-1 с эффектором Cdc42 ACK1". FEBS Lett . 579 (22): 5040– 8. doi : 10.1016/j.febslet.2005.07.093 . PMID  16137687. S2CID  44482842.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Чайлдресс К; Линь К; Янг В (2006). «Димеризация необходима для фосфорилирования тирозина SH3PX1 в ответ на сигнализацию эпидермального фактора роста и взаимодействие с ACK2». Biochem. J . 394 (Pt 3): 693– 8. doi :10.1042/BJ20050576. PMC  1383719 . PMID  16316319.
  • Marchès O, Batchelor M, Shaw RK и др. (2006). "EspF энтеропатогенной Escherichia coli связывает сортирующий нексин 9". J. Bacteriol . 188 (8): 3110– 5. doi :10.1128/JB.188.8.3110-3115.2006. PMC  1447016. PMID  16585770 .
  • Schmid EM, Ford MG, Burtey A и др. (2007). «Роль узла бета-придатка AP2 в подборе партнеров для сборки везикул, покрытых клатрином». PLOS Biol . 4 (9): e262. doi : 10.1371/journal.pbio.0040262 . PMC  1540706. PMID  16903783 .
  • Badour K, McGavin MK, Zhang J, et al. (2007). «Взаимодействие белка синдрома Вискотта-Олдрича с сортирующим нексином 9 необходимо для эндоцитоза CD28 и косигнализации в Т-клетках». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 104 (5): 1593– 8. Bibcode :2007PNAS..104.1593B. doi : 10.1073/pnas.0610543104 . PMC  1785243 . PMID  17242350.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SNX9&oldid=1188047778"