SNX1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SNX1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNX1 , HsT17379, VPS5, сортирующий нексин 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 601272; МГИ : 1928395; гомологен : 99716; Генные карты : SNX1; OMA :SNX1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

НМ_001242933
НМ_003099
НМ_148955
НМ_152826

NM_019727

RefSeq (белок)

НП_001229862
НП_003090
НП_683758

NP_062701

Местоположение (UCSC)Хр 15: 64.09 – 64.15 МбХр 9: 66 – 66.03 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Сортировочный нексин-1 — это белок , который у людей кодируется геном SNX1 . Белок, кодируемый этим геном, — сортировочный нексин . [5] SNX1 — это компонент ретромерного комплекса . [6] [7]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства сортировочных нексинов. Члены этого семейства содержат домен phox ( PX ), который является доменом связывания фосфоинозитида , и участвуют во внутриклеточном трафике . Этот эндосомальный белок регулирует экспрессию рецептора эпидермального фактора роста на поверхности клеток . Этот белок также играет роль в сортировке активируемого протеазой рецептора-1 из ранних эндосом в лизосомы . Этот белок может образовывать олигомерные комплексы с другими членами семейства. [8]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000028528 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032382 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Kurten RC, Cadena DL, Gill GN (май 1996). "Усиленная деградация рецепторов EGF сортирующим нексином, SNX1". Science . 272 ​​(5264): 1008– 10. Bibcode :1996Sci...272.1008K. doi :10.1126/science.272.5264.1008. PMID  8638121. S2CID  42608043.
  6. ^ Vergés M (2008). Retromer: multipurpose sorting and specialization in polarized transport . International Review of Cell and Molecular Biology. Vol. 271. pp.  153–98 . doi :10.1016/S1937-6448(08)01204-5. ISBN 9780123747280. PMID  19081543. {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
  7. ^ Bonifacino JS, Hurley JH (август 2008 г.). "Retromer". Curr. Opin . Cell Biol . 20 (4): 427–36 . doi :10.1016/j.ceb.2008.03.009. PMC 2833274. PMID  18472259. 
  8. ^ "Entrez Gene: сортировка nexin 1".

Дальнейшее чтение

  • Parks WT, Frank DB, Huff C и др. (2001). «Сортирующий нексин 6, новый SNX, взаимодействует с семейством трансформирующих факторов роста бета рецепторных серин-треониновых киназ». J. Biol. Chem . 276 (22): 19332– 9. doi : 10.1074/jbc.M100606200 . PMID  11279102.
  • Cozier GE, Carlton J, McGregor AH и др. (2002). "Зависимая от домена гомологии фокса (PX), опосредованная 3-фосфоинозитидом ассоциация сортирующего нексина-1 с ранним сортирующим эндосомальным компартментом необходима для его способности регулировать деградацию рецептора эпидермального фактора роста". J. Biol. Chem . 277 (50): 48730– 6. doi : 10.1074/jbc.M206986200 . PMID  12198132.
  • Shank BB, Wiley HS, Kurten RC (2001). «Структурная и функциональная характеристика человеческого гена сортировки нексина 1 (SNX1)». DNA Cell Biol . 20 (5): 287–96 . doi :10.1089/104454901750232481. PMID  11410165.
  • Liu H, Liu ZQ, Chen CX и др. (2006). «Ингибирующая регуляция деградации рецептора EGF путем сортировки нексина 5». Biochem. Biophys. Res. Commun . 342 (2): 537– 46. doi :10.1016/j.bbrc.2006.01.179. PMID  16487940.
  • Bryant DM, Kerr MC, Hammond LA и др. (2007). «EGF индуцирует макропиноцитоз и модулированную SNX1 рециркуляцию E-кадгерина». J. Cell Sci . 120 (Pt 10): 1818–28 . doi :10.1242/jcs.000653. PMID  17502486. S2CID  24175340.
  • Simpson F, Martin S, Evans TM и др. (2005). «Новое семейство белков, связанных с крючками, и характеристика белка 1, связанного с крючками». Traffic . 6 (6): 442–58 . doi : 10.1111/j.1600-0854.2005.00289.x . PMID  15882442. S2CID  25389776.
  • Имабаяши Х., Мори Т., Годзё С. и др. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека через формирование хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res . 288 (1): 35– 50. doi :10.1016/S0014-4827(03)00130-7. PMID  12878157.
  • Zhong Q, Watson MJ, Lazar CS и др. (2005). «Детерминанты эндосомальной локализации сортирующего нексина 1». Mol. Biol. Cell . 16 (4): 2049– 57. doi :10.1091/mbc.E04-06-0504. PMC  1073682. PMID  15673616 .
  • Mari M, Bujny MV, Zeuschner D, et al. (2008). "SNX1 определяет ранний выход эндосомальной рециркуляции для сортилина и маннозо-6-фосфатных рецепторов". Traffic . 9 (3): 380–93 . doi : 10.1111/j.1600-0854.2007.00686.x . PMID  18088323. S2CID  31922423.
  • Nguyen LN, Holdren MS, Nguyen AP и др. (2006). «Снижение регуляции нексина 1 способствует развитию опухолей толстой кишки». Clin. Cancer Res . 12 (23): 6952– 9. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-06-0317 . hdl : 11336/31768 . PMID  17145813.
  • Pons V, Hullin-Matsuda F, Nauze M и др. (2003). «Энтерофилин-1, новый партнер сортирующего нексина 1, снижает рецептор эпидермального фактора роста на поверхности клеток». J. Biol. Chem . 278 (23): 21155– 61. doi : 10.1074/jbc.M211008200 . PMID  12657642.
  • Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (2007). «Взаимозаменяемые, но существенные функции SNX1 и SNX2 в ассоциации ретромера с эндосомами и трафике рецепторов маннозы-6-фосфата». Mol. Cell. Biol . 27 (3): 1112– 24. doi :10.1128/MCB.00156-06. PMC  1800681. PMID  17101778 .
  • Gullapalli A, Wolfe BL, Griffin CT и др. (2006). «Важная роль SNX1 в лизосомальной сортировке активируемого протеазой рецептора-1: доказательства ретромер-, Hrs- и Tsg101-независимых функций сортирующих нексинов». Mol. Biol. Cell . 17 (3): 1228– 38. doi :10.1091/mbc.E05-09-0899. PMC  1382312. PMID  16407403 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Zhong Q, Lazar CS, Tronchère H и др. (2002). «Эндосомальная локализация и функция сортирующего нексина 1». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (10): 6767– 72. Bibcode : 2002PNAS...99.6767Z. doi : 10.1073 /pnas.092142699 . PMC  124477. PMID  11997453.
  • Wang Y, Zhou Y, Szabo K и др. (2002). «Понижение регуляции активируемого протеазой рецептора-1 регулируется сортировкой нексина 1». Mol. Biol. Cell . 13 (6): 1965–76 . doi :10.1091/mbc.E01-11-0131. PMC  117618. PMID  12058063 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2002). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Carlton J, Bujny M, Peter BJ и др. (2004). «Сортировка nexin-1 опосредует транспорт трубчатых эндосом в TGN посредством совпадения чувствительности мембран с высокой кривизной и 3-фосфоинозитидов». Curr. Biol . 14 (20): 1791– 800. doi : 10.1016/j.cub.2004.09.077. hdl : 1874/12362 . PMID  15498486. S2CID  10366991.
  • Куртен RC, Эддингтон AD, Чоудхури P и др. (2001). «Самосборка и связывание сортировочного нексина с сортировочными эндосомами». J. Cell Sci . 114 (Pt 9): 1743–56 . doi : 10.1242/jcs.114.9.1743 . PMID  11309204.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SNX1&oldid=1191145217"