SNX5

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SNX5
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNX5 , сортировка nexin 5
Внешние идентификаторыОМИМ : 605937; МГИ : 1916428; гомологен : 40944; Генные карты : SNX5; OMA :SNX5 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_152227
НМ_001282454
НМ_014426

NM_001199188
NM_024225

RefSeq (белок)

НП_001269383
НП_055241
НП_689413

NP_001186117
NP_077187

Местоположение (UCSC)Хр 20: 17.94 – 17.97 МбХр 2: 144.09 – 144.11 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Сортирующий нексин-5 — это белок , который у людей кодируется геном SNX5 . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует члена семейства сортировочных нексинов . Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который является доменом связывания фосфоинозитида, и участвуют во внутриклеточном трафике. Этот белок является компонентом ретромерного комплекса млекопитающих, [6] который облегчает извлечение груза из эндосом в транс-сеть Гольджи . Также было показано, что он связывается с анемией Фанкони, белком группы комплементации А. Этот ген приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим один и тот же белок. [7]

Взаимодействия

Было показано, что SNX5 взаимодействует с FANCA . [5]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000089006 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027423 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab Otsuki T; Kajigaya S; Ozawa K; Liu JM (январь 2000 г.). "SNX5, новый член семейства сортирующих нексинов, связывается с белком группы комплементации анемии Фанкони A". Biochem Biophys Res Commun . 265 (3): 630– 5. doi :10.1006/bbrc.1999.1731. PMID  10600472.
  6. ^ ab Wassmer T; Attar N; Bujny MV; Oakley J; Traer CJ; Cullen PJ (декабрь 2006 г.). «Скрининг потери функции выявляет SNX5 и SNX6 как потенциальные компоненты ретромера млекопитающих». J Cell Sci . 120 (Pt 1): 45–54 . doi : 10.1242/jcs.03302 . PMID  17148574.
  7. ^ ab «Ген Энтрез: SNX5, сортирующий нексин 5» .

Дальнейшее чтение

  • Маруяма К; Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Teasdale RD, Loci D, Houghton F и др. (2001). «Большое семейство локализованных в эндосомах белков, связанных с сортировкой нексина 1». Biochem. J . 358 (Pt 1): 7– 16. doi :10.1042/0264-6021:3580007. PMC  1222026 . PMID  11485546.
  • Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID  11780052.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Towler MC, Gleeson PA, Hoshino S и др. (2005). «Изоформа клатрина CHC22, компонент нейромышечных и миотендинозных соединений, связывает сортирующий нексин 5 и повышает экспрессию во время миогенеза и регенерации мышц». Mol. Biol. Cell . 15 ( 7): 3181– 95. doi :10.1091/mbc.E04-03-0249. PMC  452575. PMID  15133132.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Merino-Trigo A, Kerr MC, Houghton F и др. (2005). «Сортирующий нексин 5 локализуется в субдомене ранних эндосом и привлекается к плазматической мембране после стимуляции EGF». J. Cell Sci . 117 (Pt 26): 6413– 24. doi :10.1242/jcs.01561. PMID  15561769. S2CID  39278533.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.



Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SNX5&oldid=1190502431"