SNX17

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SNX17
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNX17 , сортировка nexin 17
Внешние идентификаторыОМИМ : 605963; МГИ : 2387801; гомологен : 8838; Генные карты : SNX17; OMA :SNX17 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001267059
NM_001267060
NM_001267061
NM_014748

NM_153680

RefSeq (белок)

NP_001253988
NP_001253989
NP_001253990
NP_055563

NP_710147

Местоположение (UCSC)Хр 2: 27.37 – 27.38 МбХр 5: 31.35 – 31.36 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Сортирующий нексин-17 — это белок , который у людей кодируется геном SNX17 . [ 5] [6] [7]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства сортировочных нексинов. Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который является доменом связывания фосфоинозитида, и участвуют во внутриклеточном трафике. Этот белок не содержит спиральную область, как некоторые члены семейства, но содержит домен B41. Этот белок взаимодействует с цитоплазматическим доменом P-селектина и может функционировать во внутриклеточном трафике P-селектина. [7]

Взаимодействия

Было показано, что SNX17 взаимодействует с белком 8, связанным с рецептором липопротеинов низкой плотности [5]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115234 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029146 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab Stockinger W, Sailler B, Strasser V, Recheis B, Fasching D, Kahr L, Schneider WJ, Nimpf J (август 2002 г.). «Белок PX-домена SNX17 взаимодействует с членами семейства рецепторов ЛПНП и модулирует эндоцитоз рецептора ЛПНП». EMBO J . 21 (16): 4259– 67. doi :10.1093/emboj/cdf435. PMC 126172 . PMID  12169628. 
  6. ^ Knauth P, Schlüter T, Czubayko M, Kirsch C, Florian V, Schreckenberger S, Hahn H, Bohnensack R (март 2005 г.). "Функции сортировки доменов nexin 17 и мотив распознавания для транспортировки P-selectin". J. Mol. Biol . 347 (4): 813– 25. doi :10.1016/j.jmb.2005.02.004. PMID  15769472.
  7. ^ ab «Ген Энтрез: SNX17, сортирующий нексин 17» .

Дальнейшее чтение

  • Номура Н, Нагасе Т, Миядзима Н, Сазука Т, Танака А, Сато С, Секи Н, Каварабаяси Ю, Исикава К, Табата С (1994). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Рез . 1 (5): 223–9 . doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . ПМИД  7584044.
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Hoja MR, Wahlestedt C, Höög C (2000). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации нехарактеризованных человеческих белков». Exp. Cell Res . 259 (1): 239– 46. doi :10.1006/excr.2000.4948. PMID  10942595.
  • Флориан В., Шлютер Т., Боненсак Р. (2001). «Новый член семейства сортирующих нексинов взаимодействует с С-концом P-селектина». Biochem. Biophys. Res. Commun . 281 (4): 1045– 50. doi :10.1006/bbrc.2001.4467. PMID  11237770.
  • Teasdale RD, Loci D, Houghton F, Karlsson L, Gleeson PA (2001). «Большое семейство локализованных в эндосомах белков, связанных с сортировкой nexin 1». Biochem. J . 358 (Pt 1): 7– 16. doi :10.1042/0264-6021:3580007. PMC  1222026 . PMID  11485546.
  • Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). «Исследование протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Biotechnol . 21 (5): 566– 9. doi :10.1038/nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
  • Burden JJ, Sun XM, García AB, Soutar AK (2004). «Мотивы сортировки во внутриклеточном домене рецептора липопротеинов низкой плотности взаимодействуют с новым доменом сортировки нексина-17». J. Biol. Chem . 279 (16): 16237– 45. doi : 10.1074/jbc.M313689200 . PMID  14739284.
  • Williams R, Schlüter T, Roberts MS, Knauth P, Bohnensack R, Cutler DF (2004). «Сортировка nexin 17 ускоряет интернализацию, но замедляет деградацию P-селектина». Mol. Biol. Cell . 15 (7): 3095– 105. doi :10.1091/mbc.E04-02-0143. PMC  452567. PMID  15121882 .
  • Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геном Рез . 14 (7): 1324– 32. doi :10.1101/gr.2334104. ПМЦ  442148 . ПМИД  15231748.
  • ван Керкхоф П., Ли Дж., Маккормик Л., Тетро Э., Лу В., Шенфиш М., Ооршот В., Строус Г.Дж., Кламперман Дж., Бу Г. (2005). «Сортировка нексина 17 облегчает переработку LRP в ранней эндосоме». ЭМБО Дж . 24 (16): 2851–61 . doi :10.1038/sj.emboj.7600756. ПМЦ  1187941 . ПМИД  16052210.
  • Czubayko M, Knauth P, Schlüter T, Florian V, Bohnensack R (2006). "Сортировочный нексин 17, несамоорганизующийся и высококлассный белок сродства PtdIns(3)P, взаимодействует с белком KRIT1, связанным с церебральной кавернозной мальформацией". Biochem. Biophys. Res. Commun . 345 (3): 1264– 72. doi :10.1016/j.bbrc.2006.04.129. PMID  16712798.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SNX17&oldid=1142690537"