Список РНК

Рибонуклеиновая кислота (РНК) встречается в различных формах в организмах и выполняет множество различных функций. Здесь перечислены типы РНК, сгруппированные по роли. Сокращения для различных типов РНК перечислены и объяснены.

По роли

РНК, участвующие в синтезе белка
Тип	Сокр.	Функция	Распределение	Ссылка.
Информационная РНК	мРНК	Коды для белка	Все организмы
Рибосомальная РНК	рРНК	Перевод	Все организмы
Сигнальная частица распознавания РНК	7SL РНК или SRP РНК	Мембранная интеграция	Все организмы	^[1]
Транспортная РНК	тРНК	Перевод	Все организмы
РНК-носитель-трансфер	тмРНК	Спасение остановившихся рибосом	Бактерии	^[2]

РНК, участвующие в посттранскрипционной модификации или репликации ДНК
Тип	Сокр.	Функция	Распределение	Ссылка.
Малая ядерная РНК	мяРНК	Сращивание и другие функции	Эукариоты и археи	^[3]
Малая ядрышковая РНК	snoRNA	Нуклеотидная модификация РНК	Эукариоты и археи	^[4]
SmY РНК	СмИ	транссплайсинг мРНК	Нематоды	^[5]
Малая специфическая РНК тельца Кахала	скарна	Тип snoRNA; Нуклеотидная модификация РНК
Направляющая РНК	гРНК	модификация нуклеотидов мРНК	Кинетопластидные митохондрии	^[6]
Рибонуклеаза P	РНКаза P	созревание тРНК	Все организмы	^[7]
Рибонуклеаза MRP	РНКаза MRP	Созревание рРНК, репликация ДНК	Эукариоты	^[8]
Y-РНК		Обработка РНК, репликация ДНК	Животные	^[9]
Компонент РНК теломеразы	ТЕРЦ	Синтез теломер	Большинство эукариот	^[10]
Сплайсинг лидерной РНК	СЛ РНК	транссплайсинг мРНК, процессинг РНК

Регуляторные РНК
Тип	Сокр.	Функция	Распределение	Ссылка.
Антисмысловая РНК	аРНК, асРНК	Транскрипционное ослабление / Деградация мРНК / Стабилизация мРНК / Блокировка трансляции	Все организмы	^[11]^[12]
Цис-естественный антисмысловой транскрипт	цис-НАТ	Регуляция генов
CRISPR- РНК	крРНК	Устойчивость к паразитам путем воздействия на их ДНК	Бактерии и археи	^[13]
Длинная некодирующая РНК	днкРНК	Регуляция транскрипции генов, эпигенетическая регуляция	Эукариоты
МикроРНК	миРНК	Регуляция генов	Большинство эукариот	^[14]
Piwi-взаимодействующая РНК	пиРНК	Защита транспозона, возможно, другие функции	Большинство животных	^[15]^[16]
Малая интерферирующая РНК	siRNA	Регуляция генов	Большинство эукариот	^[17]
Короткая шпильковая РНК	shRNA	Регуляция генов	Большинство эукариот	^[18]
Транс-действующая siRNA	тасиРНК	Регуляция генов	Наземные растения	^[19]
Повтор ассоциированной siRNA	расиРНК	Тип пиРНК; защита транспозона	Дрозофила	^[20]
7SK РНК	7СК	отрицательно регулирующий комплекс CDK9/циклин T
Усилитель РНК	эРНК	Регуляция генов		^[21]

Паразитарные РНК
Тип	Функция	Распределение	Ссылка.
Ретротранспозон	Саморазмножающийся	Эукариоты и некоторые бактерии	^[22]
Вирусный геном	Носитель информации	Вирусы с двухцепочечной РНК , вирусы с положительной РНК , вирусы с отрицательной РНК , многие вирусы-сателлиты и вирусы с обратной транскрипцией
Вироид	Саморазмножающийся	Зараженные растения	^[23]
Сателлитная РНК	Саморазмножающийся	Инфицированные клетки

Другие РНК
Тип	Сокр.	Функция	Распределение	Ссылка.
Хранилище РНК	вРНК, втРНК	Выделение ксенобиотиков (предполагается)		^[24]
ГликоРНК	-	Неизвестный

Сокращения РНК

Сокр.	Имя	Семья	Описание	Ссылка.
некодируемая РНК	некодирующая РНК	-
нмРНК	неинформационная РНК	-	синоним нкРНК
мРНК	малая РНК	-	синоним нкРНК
smnRNA	малая неинформационная РНК	-	синоним нкРНК
тРНК	передача РНК	РФ00005
мРНК	растворимая РНК	-	синоним тРНК
мРНК	информационная РНК	-
пкРНК	белок кодирующий РНК	-	синоним мРНК
рРНК	рибосомальная РНК	несколько семей
5S рРНК	5S рибосомальная РНК	РФ00001
5.8S рРНК	5.8S рибосомальная РНК	РФ00002
SSU рРНК	малая субъединица рибосомальной РНК	CL00111
LSU рРНК	большая субъединица рибосомальной РНК	CL00112
РНК NoRC	РНК, ассоциированная с комплексом ремоделирования ядрышка	РФ01518
пРНК	промоутерная РНК	РФ01518	синоним NoRC РНК
6S РНК	6S РНК	РФ00013
SsrS РНК		РФ00013	синоним 6S РНК
аРНК	антисмысловая РНК	-	синоним асРНК
асРНК	антисмысловая РНК	-
асмиРНК	антисмысловая микроРНК	-
цис-НАТ	цис-натуральный антисмысловой транскрипт	-	Естественные антисмысловые транскрипты, транскрибированные из того же геномного локуса, что и их цель, но из противоположной цепи ДНК, и образуют идеальные пары
крРНК	CRISPR-РНК	-
tracrRNA	транс-активирующая crRNA	-
CRISPR- РНК	CRISPR-Cas РНК	несколько семей
ДД РНК	ответ на повреждение ДНК РНК	-	РНК, активирующая ответ на повреждение ДНК
диРНК	Малые РНК, индуцированные DSB	-
дсРНК	двухцепочечная РНК	-
эндо-siRNA	эндогенная малая интерферирующая РНК	-
эксРНК	внеклеточная РНК	-
гРНК	направляющая РНК	-
hc-siRNA	гетерохроматиновая малая интерферирующая РНК	-
hcsiRNA	гетерохроматиновая малая интерферирующая РНК	-	синоним hc-siRNA
гнРНК	гетерогенная ядерная РНК	-	синоним пре-мРНК (в строгом смысле, может включать ядерные транскрипты РНК, которые не превращаются в цитоплазматическую мРНК)
РНК-интерференция	РНК-интерференция	-	Процесс, в котором РНК подавляет экспрессию или трансляцию генов , нейтрализуя целевые молекулы мРНК.
lincRNA	длинная межгенная некодирующая РНК	-
днкРНК	длинная некодирующая РНК	-
миРНК	микро РНК	несколько семей
мрРНК	рибонуклеаза процессинга митохондриальной РНК	-	синоним РНКазы MRP
нат-siRNA	природная антисмысловая короткая интерферирующая РНК	-	синоним natsiRNA
нациРНК	природная антисмысловая короткая интерферирующая РНК	-	Эндогенные регуляторы РНК длиной от 21 до 24 нуклеотидов генерируются из комплементарных транскриптов мРНК , которые далее перерабатываются в siRNA.
ОксиС РНК	РНК-реакция на окислительный стресс	РФ00035	Малая некодирующая РНК, которая индуцируется в ответ на окислительный стресс в Escherichia coli
пиРНК	РНК, взаимодействующая с piwi	несколько семей	Малые РНК, которые образуют комплексы РНК-белок с белками piwi в клетках животных
qiRNA	QDE-2 интерферирующая РНК	-
расиРНК	Повтор ассоциированной siRNA	-	Малая РНК, которая участвует в пути РНК-интерференции , тип пиРНК
РНКаза MRP	рибонуклеаза процессинга митохондриальной РНК	РФ00030
РНКаза P	рибонуклеаза P	РФ00010	Тип рибонуклеазы, расщепляющей РНК.
скарна	малая РНК, специфичная для тельца Кахаля	РФ00553
scnRNA	РНК малого сканирования	-
scRNA	малая цитоплазматическая РНК	-
scRNA	малая условная РНК	-
РНК SgrS	мРНК, связанная с транспортом сахара	РФ00534	Малая РНК, которая активируется SgrR в Escherichia coli во время глюкозо-фосфатного стресса
shRNA	короткая шпильковая РНК	-
siRNA	малая интерферирующая РНК	-
СЛ РНК	сплайсированная лидерная РНК	несколько семей
SmY РНК	транссплайсинг мРНК	РФ01844	Малые ядерные РНК, обнаруженные у некоторых видов нематод, предположительно участвуют в транссплайсинге мРНК.
snoRNA	малая ядрышковая РНК	несколько семей
мяРНК	малая ядерная РНК	несколько семей
snRNP	малые ядерные рибонуклеиновые белки	-
SPA днРНК	5' малая ядрышковая РНК, кэпированная и 3' полиаденилированная длинная некодирующая РНК	-
SRP-РНК	РНК-частица распознавания сигнала	CL00003
одноцепочечная РНК	одноцепочечная РНК	-
сРНК	малая временная РНК	-
тасиРНК	транс-действующая siRNA	-
тмРНК	РНК-носитель-трансфер	РФ00023	Молекула бактериальной РНК с двойными свойствами тРНК-подобными и матричной РНК-подобными
uRNA	U-сплайсосомная РНК	несколько семей
вРНК	хранилище РНК	-	синоним vtRNA
втРНК	хранилище РНК	РФ00006
Xist РНК	X-неактивный специфический транскрипт	-
Y-РНК	Y-РНК	РФ00019	Компоненты рибонуклеопротеиновой частицы Ro60, необходимые для репликации ДНК посредством взаимодействия с хроматином и белками инициации.
NAT-ы	естественные антисмысловые транскрипты	-	Естественные антисмысловые транскрипты, закодированные в клетке, которые имеют транскриптную комплементарность с другими транскриптами РНК
пре-мРНК	предшественник информационной РНК	-	Незрелая одиночная цепь матричной РНК
кольцевая РНК	кольцевая РНК	-
мсРНК	многокопийная, одноцепочечная РНК	-	Продукты обратной транскриптазы (ОТ) , кодируемой ретроном , которые образуют комплекс ОТ-мсДНК, действующий как антифаговый антитоксин	^[25]^[26]
cfRNA	бесклеточная РНК	-

Смотрите также

Ссылки

^ Грибальдо С., Брошье-Арманет С. (2006). «Происхождение и эволюция архей: современное состояние». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 361 (1470): 1007– 22. doi :10.1098/rstb.2006.1841. PMC 1578729. PMID 16754611 .
^ Gillet R, Felden B (2001). "Появляющиеся взгляды на опосредованное тмРНК маркирование белков и спасение рибосом" . Молекулярная микробиология . 42 (4): 879– 85. doi :10.1046/j.1365-2958.2001.02701.x. PMID 11737633. S2CID 45056681.
^ Thore S, Mayer C, Sauter C, Weeks S, Suck D (2003). «Кристаллические структуры ядра Pyrococcus abyssi Sm и его комплекса с РНК». J. Biol. Chem . 278 (2): 1239– 47. doi : 10.1074/jbc.M207685200 . PMID 12409299.
^ Kiss T (2001). «Посттранскрипционная модификация клеточных РНК, направляемая малой ядрышковой РНК». Журнал EMBO . 20 (14): 3617– 22. doi :10.1093/emboj/20.14.3617. PMC 125535. PMID 11447102 .
^ Джонс Т.А., Отто В., Марц М., Эдди С.Р., Стадлер П.Ф. (2009). «Обзор SmY-РНК нематод». РНК Биол . 6 (1): 5– 8. дои :10.4161/rna.6.1.7634. PMID 19106623. S2CID 32095624.
^ Alfonzo JD, Thiemann O, Simpson L (1997). «Механизм редактирования РНК вставкой/делецией U в митохондриях кинетопластидов». Nucleic Acids Research . 25 (19): 3751– 59. doi :10.1093/nar/25.19.3751 (неактивен 1 ноября 2024 г.). PMC 146959. PMID 9380494 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
^ Pannucci JA, Haas ES, Hall TA, Harris JK, Brown JW (1999). «РНКазы P из некоторых архей каталитически активны». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (14): 7803– 08. Bibcode : 1999PNAS ...96.7803P. doi : 10.1073/pnas.96.14.7803 . PMC 22142. PMID 10393902.
^ Woodhams MD, Stadler PF, Penny D, Collins LJ (2007). "RNase MRP и каскад процессинга РНК у эукариотического предка". BMC Evolutionary Biology . 7 (Suppl 1): S13. Bibcode :2007BMCEE...7S..13W. doi : 10.1186/1471-2148-7-S1-S13 . PMC 1796607 . PMID 17288571.
^ Perreault J, Perreault JP, Boire G (2007). «Ro-ассоциированные Y РНК у метазоа: эволюция и диверсификация». Молекулярная биология и эволюция . 24 (8): 1678–89 . doi : 10.1093/molbev/msm084 . PMID 17470436.
^ Lustig AJ (1999). «Кризисное вмешательство: роль теломеразы». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (7): 3339– 41. Bibcode : 1999PNAS...96.3339L. doi : 10.1073/pnas.96.7.3339 . PMC 34270. PMID 10097039 .
^ Brantl S (2002). «Регулирование антисмысловой РНК и интерференция РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1575 ( 1– 3): 15– 25. doi :10.1016/S0167-4781(02)00280-4. PMID 12020814.
^ Брантл С. (2007). «Регуляторные механизмы, используемые цис-кодируемыми антисмысловыми РНК». Curr. Opin. Microbiol . 10 (2): 102– 9. doi :10.1016/j.mib.2007.03.012. PMID 17387036.
^ Brouns SJ, Jore MM, Lundgren M, et al. (август 2008 г.). «Малые CRISPR РНК направляют противовирусную защиту прокариот». Science . 321 (5891): 960– 4. Bibcode :2008Sci...321..960B. doi :10.1126/science.1159689. PMC 5898235 . PMID 18703739.
^ Lin SL, Miller JD, Ying SY (2006). «Интронная микроРНК (miRNA)». Журнал биомедицины и биотехнологии . 2006 (4): 1– 13. doi : 10.1155/JBB/2006/26818 . PMC 1559912. PMID 17057362 .
^ Horwich MD, Li C, Matranga C, Vagin V, Farley G, Wang P, Zamore PD (2007). «РНК-метилтрансфераза дрозофилы, DmHen1, модифицирует piRNAs зародышевой линии и одноцепочечные siRNAs в RISC». Current Biology . 17 (14): 1265–72 . Bibcode : 2007CBio...17.1265H. doi : 10.1016/j.cub.2007.06.030 . PMID 17604629. S2CID 18880444.
^ Ghildiyal M, Zamore PD (февраль 2009 г.). «Малые подавляющие РНК: расширяющаяся вселенная». Nat. Rev. Genet . 10 (2): 94– 108. doi :10.1038/nrg2504. PMC 2724769. PMID 19148191 .
^ Ахмад К, Хеникофф С (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом». Cell . 111 (3): 281– 84. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . PMID 12419239. S2CID 17735718.
^ Ахмад К, Хеникофф С (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом». Cell . 111 (3): 281– 84. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . PMID 12419239. S2CID 17735718.
^ Vazquez F, Vaucheret H (2004). «Эндогенные транс-действующие siRNA регулируют накопление мРНК Arabidopsis». Mol. Cell . 16 (1): 69–79 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.028 . PMID 15469823.
^ Desset S, Buchon N, Meignin C, Coiffet M, Vaury C (2008). Volff JN (ред.). "У Drosophila melanogaster локус COM управляет соматическим подавлением двух ретротранспозонов как через Piwi-зависимые, так и через Piwi-независимые пути". PLOS ONE . 3 (2): e1526. Bibcode :2008PLoSO...3.1526D. doi : 10.1371/journal.pone.0001526 . PMC 2211404 . PMID 18253480.
^ Ли, Вэньбо; Нотани, Димпл; Розенфельд, Майкл Г. (2016-03-07). «Усилители как некодирующие единицы транскрипции РНК: последние идеи и будущие перспективы». Nature Reviews. Genetics . 17 (4). Springer Nature: 207– 223. doi :10.1038/nrg.2016.4. ISSN 1471-0056. PMID 26948815. S2CID 215371.
^ Boeke JD (2003). "Необычное филогенетическое распределение ретротранспозонов: гипотеза". Genome Research . 13 (9): 1975–83 . doi : 10.1101/gr.1392003 . PMID 12952870.
^ Флорес Р., Эрнандес С., Мартинес де Альба А.Е., Дарос Х.А., Ди Серио Ф (2005). «Вироиды и взаимодействие вироидов с хозяином». Ежегодный обзор фитопатологии . 43 : 117– 39. doi :10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243. ПМИД 16078879.
^ Gopinath SC, Matsugami A, Katahira M, Kumar PK (2005). "Некодирующие РНК, связанные с криптокортикоидным хранилищем человека, связываются с митоксантроном, химиотерапевтическим соединением". Nucleic Acids Res . 33 (15): 4874– 81. doi :10.1093/nar/gki809. PMC 1201340. PMID 16150923 .
^ Саймон, Дон М.; Циммерли, Стивен (2008-11-12). «Разнообразие нехарактеризованных обратных транскриптаз у бактерий». Nucleic Acids Research . 36 (22): 7219– 7229. doi :10.1093/nar/gkn867. ISSN 1362-4962. PMC 2602772. PMID 19004871 .
^ Бобонис, Джейкоб; Митош, Карин; Матеуш, Андре; Керхер, Николай; Критикос, Джордж; Селкриг, Джоэл; Зиетек, Матильда; Монзон, Вивиан; Пфальц, Биргит; Гарсия-Сантамарина, Сарела; Галардини, Марко; Суэки, Анна; Кобаяши, Кэлли; Штейн, Фрэнк; Бейтман, Алекс (01 сентября 2022 г.). «Бактериальные ретроны кодируют трехсторонние системы токсин-антитоксин, защищающие фага» (PDF) . Природа . 609 (7925): 144–150 . Бибкод : 2022Natur.609..144B. дои : 10.1038/s41586-022-05091-4. ISSN 0028-0836. PMID 35850148. S2CID 250643138.

Внешние ссылки

База данных Rfam — коллекция семейств РНК
Европейская база данных рибосомальной РНК

[1] Грибальдо С., Брошье-Арманет С. (2006). «Происхождение и эволюция архей: современное состояние». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 361 (1470): 1007– 22. doi :10.1098/rstb.2006.1841. PMC 1578729. PMID 16754611 .

[pmid17488812-2] Gillet R, Felden B (2001). "Появляющиеся взгляды на опосредованное тмРНК маркирование белков и спасение рибосом" . Молекулярная микробиология . 42 (4): 879– 85. doi :10.1046/j.1365-2958.2001.02701.x. PMID 11737633. S2CID 45056681.

[3] Thore S, Mayer C, Sauter C, Weeks S, Suck D (2003). «Кристаллические структуры ядра Pyrococcus abyssi Sm и его комплекса с РНК». J. Biol. Chem . 278 (2): 1239– 47. doi : 10.1074/jbc.M207685200 . PMID 12409299.

[4] Kiss T (2001). «Посттранскрипционная модификация клеточных РНК, направляемая малой ядрышковой РНК». Журнал EMBO . 20 (14): 3617– 22. doi :10.1093/emboj/20.14.3617. PMC 125535. PMID 11447102 .

[5] Джонс Т.А., Отто В., Марц М., Эдди С.Р., Стадлер П.Ф. (2009). «Обзор SmY-РНК нематод». РНК Биол . 6 (1): 5– 8. дои :10.4161/rna.6.1.7634. PMID 19106623. S2CID 32095624.

[6] Alfonzo JD, Thiemann O, Simpson L (1997). «Механизм редактирования РНК вставкой/делецией U в митохондриях кинетопластидов». Nucleic Acids Research . 25 (19): 3751– 59. doi :10.1093/nar/25.19.3751 (неактивен 1 ноября 2024 г.). PMC 146959. PMID 9380494 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )

[7] Pannucci JA, Haas ES, Hall TA, Harris JK, Brown JW (1999). «РНКазы P из некоторых архей каталитически активны». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (14): 7803– 08. Bibcode : 1999PNAS ...96.7803P. doi : 10.1073/pnas.96.14.7803 . PMC 22142. PMID 10393902.

[8] Woodhams MD, Stadler PF, Penny D, Collins LJ (2007). "RNase MRP и каскад процессинга РНК у эукариотического предка". BMC Evolutionary Biology . 7 (Suppl 1): S13. Bibcode :2007BMCEE...7S..13W. doi : 10.1186/1471-2148-7-S1-S13 . PMC 1796607 . PMID 17288571.

[9] Perreault J, Perreault JP, Boire G (2007). «Ro-ассоциированные Y РНК у метазоа: эволюция и диверсификация». Молекулярная биология и эволюция . 24 (8): 1678–89 . doi : 10.1093/molbev/msm084 . PMID 17470436.

[10] Lustig AJ (1999). «Кризисное вмешательство: роль теломеразы». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (7): 3339– 41. Bibcode : 1999PNAS...96.3339L. doi : 10.1073/pnas.96.7.3339 . PMC 34270. PMID 10097039 .

[11] Brantl S (2002). «Регулирование антисмысловой РНК и интерференция РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1575 ( 1– 3): 15– 25. doi :10.1016/S0167-4781(02)00280-4. PMID 12020814.

[12] Брантл С. (2007). «Регуляторные механизмы, используемые цис-кодируемыми антисмысловыми РНК». Curr. Opin. Microbiol . 10 (2): 102– 9. doi :10.1016/j.mib.2007.03.012. PMID 17387036.

[13] Brouns SJ, Jore MM, Lundgren M, et al. (август 2008 г.). «Малые CRISPR РНК направляют противовирусную защиту прокариот». Science . 321 (5891): 960– 4. Bibcode :2008Sci...321..960B. doi :10.1126/science.1159689. PMC 5898235 . PMID 18703739.

[14] Lin SL, Miller JD, Ying SY (2006). «Интронная микроРНК (miRNA)». Журнал биомедицины и биотехнологии . 2006 (4): 1– 13. doi : 10.1155/JBB/2006/26818 . PMC 1559912. PMID 17057362 .

[fruitfly_piRNA-15] Horwich MD, Li C, Matranga C, Vagin V, Farley G, Wang P, Zamore PD (2007). «РНК-метилтрансфераза дрозофилы, DmHen1, модифицирует piRNAs зародышевой линии и одноцепочечные siRNAs в RISC». Current Biology . 17 (14): 1265–72 . Bibcode : 2007CBio...17.1265H. doi : 10.1016/j.cub.2007.06.030 . PMID 17604629. S2CID 18880444.

[16] Ghildiyal M, Zamore PD (февраль 2009 г.). «Малые подавляющие РНК: расширяющаяся вселенная». Nat. Rev. Genet . 10 (2): 94– 108. doi :10.1038/nrg2504. PMC 2724769. PMID 19148191 .

[17] Ахмад К, Хеникофф С (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом». Cell . 111 (3): 281– 84. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . PMID 12419239. S2CID 17735718.

[18] Ахмад К, Хеникофф С (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом». Cell . 111 (3): 281– 84. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . PMID 12419239. S2CID 17735718.

[19] Vazquez F, Vaucheret H (2004). «Эндогенные транс-действующие siRNA регулируют накопление мРНК Arabidopsis». Mol. Cell . 16 (1): 69–79 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.028 . PMID 15469823.

[20] Desset S, Buchon N, Meignin C, Coiffet M, Vaury C (2008). Volff JN (ред.). "У Drosophila melanogaster локус COM управляет соматическим подавлением двух ретротранспозонов как через Piwi-зависимые, так и через Piwi-независимые пути". PLOS ONE . 3 (2): e1526. Bibcode :2008PLoSO...3.1526D. doi : 10.1371/journal.pone.0001526 . PMC 2211404 . PMID 18253480.

[21] Ли, Вэньбо; Нотани, Димпл; Розенфельд, Майкл Г. (2016-03-07). «Усилители как некодирующие единицы транскрипции РНК: последние идеи и будущие перспективы». Nature Reviews. Genetics . 17 (4). Springer Nature: 207– 223. doi :10.1038/nrg.2016.4. ISSN 1471-0056. PMID 26948815. S2CID 215371.

[22] Boeke JD (2003). "Необычное филогенетическое распределение ретротранспозонов: гипотеза". Genome Research . 13 (9): 1975–83 . doi : 10.1101/gr.1392003 . PMID 12952870.

[23] Флорес Р., Эрнандес С., Мартинес де Альба А.Е., Дарос Х.А., Ди Серио Ф (2005). «Вироиды и взаимодействие вироидов с хозяином». Ежегодный обзор фитопатологии . 43 : 117– 39. doi :10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243. ПМИД 16078879.

[24] Gopinath SC, Matsugami A, Katahira M, Kumar PK (2005). "Некодирующие РНК, связанные с криптокортикоидным хранилищем человека, связываются с митоксантроном, химиотерапевтическим соединением". Nucleic Acids Res . 33 (15): 4874– 81. doi :10.1093/nar/gki809. PMC 1201340. PMID 16150923 .

[25] Саймон, Дон М.; Циммерли, Стивен (2008-11-12). «Разнообразие нехарактеризованных обратных транскриптаз у бактерий». Nucleic Acids Research . 36 (22): 7219– 7229. doi :10.1093/nar/gkn867. ISSN 1362-4962. PMC 2602772. PMID 19004871 .

[26] Бобонис, Джейкоб; Митош, Карин; Матеуш, Андре; Керхер, Николай; Критикос, Джордж; Селкриг, Джоэл; Зиетек, Матильда; Монзон, Вивиан; Пфальц, Биргит; Гарсия-Сантамарина, Сарела; Галардини, Марко; Суэки, Анна; Кобаяши, Кэлли; Штейн, Фрэнк; Бейтман, Алекс (01 сентября 2022 г.). «Бактериальные ретроны кодируют трехсторонние системы токсин-антитоксин, защищающие фага» (PDF) . Природа . 609 (7925): 144–150 . Бибкод : 2022Natur.609..144B. дои : 10.1038/s41586-022-05091-4. ISSN 0028-0836. PMID 35850148. S2CID 250643138.