Николя Ле Новер
Николя Ле Новер
Рожденный( 1969-03-12 )12 марта 1969 г. (55 лет)
Альма-матер
ИзвестныйБаза данных биомоделей , SBGN , SBML , MIRIAM
Научная карьера
Поля
Учреждения
Научные консультанты

Николя Ле Новер — британский и французский биолог. Его исследования сосредоточены на моделировании сигнальных путей и разработке инструментов для обмена математическими моделями .

Образование

Ле Новер получил степень бакалавра в Prytanée National Militaire . Он получил степень магистра (1993) по биологии и биохимии в École Normale Supérieure , степень бакалавра по клеточной биологии и физиологии (1991) и степень доктора философии по молекулярной и клеточной фармакологии (1998) в Университете Пьера и Марии Кюри . [1] С 1999 по 2001 год он был постдокторантом в Кембриджском университете (Великобритания).

Исследовать

Первая часть карьеры Ле Новера, в лаборатории Жана-Пьера Шанже в Институте Пастера , была сосредоточена на изучении никотиновых ацетилхолиновых рецепторов в мозге. Он реконструировал их филогению, [2] предсказал [3] и смоделировал их структуру. [4] Он также исследовал роль субъединицы альфа6 в дофаминергических нейронах среднего мозга. [5] [6]

Во время своей постдокторской стажировки в группе Денниса Брея в Кембриджском университете он моделировал молекулярные сети, лежащие в основе бактериального хемотаксиса . [7] [8] Затем Ле Новер стал участвовать в разработке стандартов для обмена математическими моделями , такими как SBML , [9] редактором которого он позже стал.

В 2003 году Ле Новер создал исследовательскую группу в Европейском институте биоинформатики (EMBL-EBI) . Группа изучала сигнальные пути, лежащие в основе синаптической пластичности , в частности аллостерические кальциевые сенсоры. [10] [11] [12] Параллельно его группа координировала разработку согласованного набора стандартов в системной биологии, включая графическую нотацию SBGN , [13] руководящие принципы MIRIAM [14] и MIASE , [15] языки SED-ML [16] и PharmML, а также онтологии [17], такие как онтология системной биологии . Он также создал базу данных BioModels [18] и URI Identifiers.org [19] .

С 2012 по 2018 год Ле Новер перевел свою группу в Институт Бабрахама .

До сентября 2018 года он был заместителем редактора журналов BMC Systems Biology и npj Systems Biology and Applications. С 2017 по 2018 год он был заведующим секцией системной и сетевой биологии факультета 1000.

Старший член Международного общества вычислительной биологии , входил в совет директоров с 2017 по 2018 год.

Убеждение

В сентябре 2018 года Ле Новер был приговорен к 8 месяцам лишения свободы (условно на 2 года), когда он признался в загрузке непристойных изображений ребенка и хранении экстремального порнографического изображения. [20] [21] [22] Впоследствии его уволили из Института Бабрахама, где он работал.

Ссылки

  1. ^ "Nicolas Le Novere CV" . Получено 25 июля 2015 г.
  2. ^ Le Novère N, Changeux JP (1995). «Молекулярная эволюция никотинового ацетилхолинового рецептора: пример мультигенного семейства в возбудимых клетках». Журнал молекулярной эволюции . 40 (2): 155– 172. Bibcode : 1995JMolE..40..155L. doi : 10.1007/BF00167110. PMID  7699721. S2CID  2040912.
  3. ^ Le Novère N, Corringer PJ, Changeux JP (1999). «Улучшенные предсказания вторичной структуры для субъединицы никотинового рецептора. Включение доступности растворителя и экспериментальных данных в двумерное представление». Biophysical Journal . 76 (5): 2329– 2345. doi :10.1016/S0006-3495(99)77390-X. PMC 1300207 . PMID  10233052. 
  4. ^ Le Novère N, Grutter T, Changeux JP (2002). «Модели внеклеточного домена никотиновых рецепторов и агонистов и сайтов связывания Ca++». Труды Национальной академии наук США . 99 (5): 3210– 5. Bibcode : 2002PNAS ...99.3210L. doi : 10.1073/pnas.042699699 . PMC 122498. PMID  11867716. 
  5. ^ Le Novère N, Zoli M, Changeux JP (1996). «МРНК субъединицы нейронального никотинового рецептора α6 селективно концентрируется в катехоламинергических ядрах мозга крысы». European Journal of Neuroscience . 8 (11): 2428– 2439. doi :10.1111/j.1460-9568.1996.tb01206.x. PMID  8950106. S2CID  23102912.
  6. ^ Le Novère N, Zoli M, Léna C, Ferrari R, Picciotto MR, Merlo-Pich E, Changeux JP (1999). «Участие субъединицы никотинового рецептора α6 в локомоции, вызванной никотином, продемонстрированное инфузией антисмыслового олигонуклеотида in vivo». NeuroReport . 10 (12): 2497– 2501. doi :10.1097/00001756-199908200-00012. PMID  10574359.
  7. ^ Shimizu TS, Le Novère N, Levin MD, Beavil AJ, Sutton BJ, Bray D (2000). «Молекулярная модель решетки сигнальных белков, участвующих в бактериальном хемотаксисе». Nature Cell Biology . 2 (11): 792– 796. doi :10.1038/35041030. PMID  11056533. S2CID  10852897.
  8. ^ Дьюк, TAJ; Ле Новер, Н.; Брей, Д. (2001). «Конформационное распространение в кольце белков: стохастический подход к аллостерии». Журнал молекулярной биологии . 308 (3): 541– 553. doi :10.1006/jmbi.2001.4610. PMID  11327786. S2CID  14914075.
  9. ^ Хука, М.; Финни, А.; Сауро, HM; Болури, Х.; Дойл, Дж. К.; Китано, Х.; Аркин, АП; Борнштейн, Би Джей; Брей, Д; Корниш-Боуден, А.; Куэльяр, А.А.; Дронов С.; Жиль, Эд; Гинкель, М; Гор, В.; Горянин, И.И.; Хедли, штат Вашингтон; Ходжман, TC; Хофмейр, Ж.-Х.; Хантер, ПиДжей; Джути, Н.С.; Касбергер, Дж.Л.; Кремлинг, А.; Куммер, У.; Ле Новер, Н.; Лоу, LM; Лусио, Д.; Мендес, П.; Минч, Э.; Мьёлснесс, Эд; Накаяма, Ю.; Нельсон, MR; Нильсен, ПФ; Сакурада, Т.; Шафф, Дж. К.; Шапиро, BE; Шимизу, TS; Спенс, HD; Стеллинг, J.; Такахаши, K.; Томита, M.; Вагнер, J.; Ван, J. (2003). «Язык разметки системной биологии (SBML): Средство для представления и обмена моделями биохимических сетей». Биоинформатика . 19 (4): 524–531 . doi : 10.1093/bioinformatics/btg015 . PMID  12611808.
  10. ^ Стефан MI, Эдельштейн SJ, Ле Новер N (2008). «Аллостерическая модель кальмодулина объясняет дифференциальную активацию PP2B и CaMKII». Труды Национальной академии наук . 105 (31): 10768– 10773. Bibcode : 2008PNAS..10510768S. doi : 10.1073/pnas.0804672105 . PMC 2504824. PMID  18669651 . 
  11. ^ Li L, Stefan MI, Le Novère N (2012). «Частота, длительность и амплитуда поступления кальция дифференциально модулируют относительную активацию кальциневрина и CaMKII». PLOS ONE . ​​7 (9): e43810. Bibcode :2012PLoSO...743810L. doi : 10.1371/journal.pone.0043810 . PMC 3433481 . PMID  22962589. 
  12. ^ Lai M, Brun D, ​​Edelstein SJ, Le Novère N (2015). «Модуляция долей кальмодулина различными мишенями: аллостерическая модель с гемисогласованными конформационными переходами». PLOS Computational Biology . 11 (1): e1004063. arXiv : 1406.2195 . Bibcode : 2015PLSCB..11E4063L. doi : 10.1371/journal.pcbi.1004063 . PMC 4303274. PMID  25611683 . 
  13. ^ Le Novère N, Hucka M, Mi H, Moodie S, Shreiber F, Sorokin A, Demir E, Wegner K, Aladjem M, Wimalaratne S, Bergman FT, Gauges R, Ghazal P, Kawaji H, Li L, Matsuoka Y, Villéger A, Boyd SE, Calzone L, Courtot M, Dogrusoz U, Freeman T, Funahashi A, Ghosh S, Jouraku A, Kim S, Kolpakov F, Luna A, Sahle S, Schmidt E, Watterson S, Goryanin I, Kell DB, Sander C, Sauro H, Snoep JL, Kohn K, Kitano H (2009). "Графическая нотация системной биологии". Nature Biotechnology . 27 (8): 735– 741. doi : 10.1038/nbt.1558 . hdl : 11693/38162. PMID  19668183.
  14. ^ Ле Новер Н., Финни А., Хука М., Бхалла США, Кампань Ф., Колладо-Видес Дж., Крампин Э.Дж., Холстед М., Клипп Э., Мендес П., Нильсен П., Сауро Х., Шапиро Б., Сноп Дж.Л., Спенс HD, Ваннер БЛ (2005). «Минимум информации, запрашиваемой в аннотации биохимических моделей (МИРИАМ)». Природная биотехнология . 23 (12): 1509–1515 . doi : 10.1038/nbt1156 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-853F-C . ПМИД  16333295.
  15. ^ Waltemath D, Adams R, Beard DA, Bergmann FT, Bhalla US, Britten R, Chelliah V, Cooling MT, Cooper J, Crampin E, Garny A, Hoops S, Hucka M, Hunter P, Klipp E, Laibe C, Miller A, Moraru I, Nickerson D, Nielsen P, Nikolski M, Sahle S, Sauro HM, Schmidt H, Snoep JL, Tolle D, Wolkenhauer O, Le Novère N (2011). "Минимальная информация об эксперименте по моделированию (MIASE)". PLOS Computational Biology . 7 (4): e1001122. Bibcode : 2011PLSCB...7E1122W. doi : 10.1371/journal.pcbi.1001122 . PMC 3084216. PMID 21552546  . 
  16. ^ Waltemath D, Adams R, Bergmann FT, Hucka M, Kolpakov F, Miller AK, Moraru II, Nickerson D, Sahle S, Snoep JL, Le Novère N (2011). "Воспроизводимые эксперименты по вычислительной биологии с SED-ML - Язык разметки описания экспериментов моделирования". BMC Systems Biology . 5 : 198. doi : 10.1186/1752-0509-5-198 . PMC 3292844 . PMID  22172142. 
  17. ^ Courtot M, Juty N, Knüpfer C, Waltemath D, Zhukova A, Dräger A, Dumontier M, Finney A, Golebiewski M, Hastings J, Hoops S, Keating S, Kell DB, Kerrien S, Lawson J, Lister A, Lu J, Machne R, Mendes P, Pocock M, Rodriguez N, Villeger A, Wilkinson DJ, Wimalaratne S, Laibe C, Hucka M, Le Novère N (2011). "Контролируемые словари и семантика в системной биологии". Молекулярная системная биология . 7 : 543. doi :10.1038/msb.2011.77. PMC 3261705 . PMID  22027554. 
  18. ^ Le Novère N, Bornstein B, Broicher A, Courtot M, Donizelli M, Dharuri H, Li L, Sauro H, Schilstra M, Shapiro B, Snoep JL, Hucka M (2006). "База данных BioModels: бесплатная централизованная база данных курируемых, опубликованных количественных кинетических моделей биохимических и клеточных систем". Nucleic Acids Research . 34 (90001): D689 – D691 . doi :10.1093/nar/gkj092. PMC 1347454 . PMID  16381960.  
  19. ^ Juty N, Le Novère N, Laibe C (2012). «Identifiers.org и реестр MIRIAM: ресурсы сообщества для обеспечения постоянной идентификации». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D580 – D586 . doi : 10.1093/nar/gkr1097. PMC 3245029. PMID  22140103.  
  20. ^ «Ученый заснял видеозапись насилия над восьмилетним ребенком». BBC News . 4 сентября 2018 г.
  21. ^ Pilgrim, Tom (4 сентября 2018 г.). «Ведущий ученый Кембриджа признался в загрузке видеороликов о насилии над детьми». Cambridge News .
  22. ^ "Setting things straight". nlenov.wordpress.com . 20 сентября 2018 г. . Получено 24 октября 2018 г. .
  • Страница Николя Ле Новера в Google Scholar
  • База данных биомоделей
  • URI-идентификаторы Identifiers.org и система разрешения
  • Инициатива COMBINE
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Николя_Ле_Новэр&oldid=1268428628"