Х-хромосома

Половая хромосома присутствует у обоих полов в системах определения пола XY и X0
Х-хромосома человека
Х-хромосома человека (после G-бэндинга )
Х-хромосома в мужской кариограмме человека
Функции
Длина ( п.н. )154,259,566 п.н.
(CHM13)
Количество генов804 ( CCDS )
ТипАллосома
Положение центромерыСубметацентрический [1]
(61,0 Мбит/с) [2]
Полные списки генов
CCDSСписок генов
HGNCСписок генов
UniProtСписок генов
NCBIСписок генов
Внешние просмотрщики карт
АнсамбльХромосома X
ЭнтрезХромосома X
NCBIХромосома X
UCSCХромосома X
Полные последовательности ДНК
РефСекNC_000023 ( ФАСТА )
ГенБанкCM000685 ( ФАСТА )

X -хромосома — одна из двух половых хромосом во многих организмах, включая млекопитающих, и встречается как у самцов, так и у самок. Она является частью системы определения пола XY и системы определения пола XO . Хромосома X была названа за свои уникальные свойства ранними исследователями, что привело к названию ее аналога Y-хромосомы , по следующей букве в алфавите, после ее последующего открытия. [3]

Открытие

Впервые то, что X-хромосома является особенной, было отмечено в 1890 году Германом Хенкингом в Лейпциге. Хенкинг изучал яички Pyrrhocoris и заметил, что одна хромосома не принимает участия в мейозе . Хромосомы так названы из-за их способности окрашиваться ( по -гречески chroma означает цвет ). Хотя X-хромосому можно было окрашивать так же хорошо, как и другие, Хенкинг не был уверен, является ли она другим классом объекта, и поэтому назвал ее X-элементом , [4] который позже стал X-хромосомой после того, как было установлено, что это действительно хромосома. [5]

Идея о том, что X-хромосома была названа из-за ее сходства с буквой «X», ошибочна. Все хромосомы обычно выглядят как аморфный сгусток под микроскопом и принимают четко определенную форму только во время митоза. Эта форма смутно напоминает X для всех хромосом. Совершенно случайно, что Y-хромосома во время митоза имеет две очень короткие ветви, которые могут выглядеть слитыми под микроскопом и выглядеть как нисходящая часть Y-образной формы. [6]

Впервые предположение о том, что Х-хромосома участвует в определении пола, высказал Кларенс Эрвин МакКланг в 1901 году. Сравнив свою работу по саранче с работой Хенкинга и других, МакКланг отметил, что только половина сперматозоидов получила Х-хромосому. Он назвал эту хромосому дополнительной хромосомой и настаивал (правильно), что это была настоящая хромосома, и предположил (ошибочно), что это была хромосома, определяющая пол самца. [4]

Модель наследования

Число возможных предков на линии наследования Х-хромосомы в данном предковом поколении следует последовательности Фибоначчи. (По Хатчисону, Л. «Выращивание генеалогического древа: сила ДНК в реконструкции семейных отношений». [7] )

Люк Хатчисон заметил, что ряд возможных предков на линии наследования Х-хромосомы в данном предковом поколении следует последовательности Фибоначчи . [7] У мужчины есть Х-хромосома, которую он получил от своей матери, и Y-хромосома , которую он получил от своего отца. Мужчина считается «источником» своей собственной Х-хромосомы ( ), а в поколении его родителей его Х-хромосома произошла от одного родителя ( ). Мать мужчины получила одну Х-хромосому от своей матери (бабушки сына по материнской линии) и одну от своего отца (дедушки сына по материнской линии), поэтому двое бабушек и дедушек внесли свой вклад в Х-хромосому потомка мужского пола ( ). Дедушка по материнской линии получил свою Х-хромосому от своей матери, а бабушка по материнской линии получила Х-хромосому от обоих своих родителей, поэтому три прабабушки и прадедушки внесли свой вклад в Х-хромосому потомка мужского пола ( ). Пять прапрапрадедушки и прабабушки внесли свой вклад в X-хромосому потомка мужского пола ( ) и т. д. (Обратите внимание, что это предполагает, что все предки данного потомка независимы, но если проследить генеалогию достаточно далеко назад во времени, предки начнут появляться в нескольких линиях генеалогии, пока в конечном итоге основатель популяции не появится во всех линиях генеалогии.) F 1 = 1 {\displaystyle F_{1}=1} F 2 = 1 {\displaystyle F_{2}=1} F 3 = 2 {\displaystyle F_{3}=2} F 4 = 3 {\displaystyle F_{4}=3} F 5 = 5 {\displaystyle F_{5}=5}

Люди

Функция

Ядро клетки женской амниотической жидкости. Вверху: обе территории X-хромосомы обнаружены с помощью FISH . Показан один оптический срез, сделанный с помощью конфокального микроскопа . Внизу: то же ядро, окрашенное DAPI и записанное с помощью ПЗС-камеры . Тельца Барра обозначены стрелкой, они идентифицируют неактивную X (Xi).

X-хромосома у людей охватывает более 153 миллионов пар оснований (строительный материал ДНК ). Она представляет собой около 800 генов, кодирующих белки, по сравнению с Y-хромосомой, содержащей около 70 генов, из 20 000–25 000 общих генов в геноме человека. Обычно у каждого человека есть одна пара половых хромосом в каждой клетке. У женщин обычно есть две X-хромосомы, тогда как у мужчин обычно есть одна X- и одна Y-хромосома . И мужчины, и женщины сохраняют одну из X-хромосом своей матери, а женщины сохраняют свою вторую X-хромосому от отца. Поскольку отец сохраняет свою X-хромосому от своей матери, у женщины есть одна X-хромосома от ее бабушки по отцовской линии (со стороны отца) и одна X-хромосома от ее матери. Эта схема наследования следует числам Фибоначчи на заданной глубине предков. [ необходима цитата ]

Генетические нарушения , вызванные мутациями в генах на Х-хромосоме, описываются как Х-сцепленные . Если Х-хромосома имеет ген генетического заболевания, это всегда вызывает заболевание у пациентов мужского пола, поскольку у мужчин есть только одна Х-хромосома и, следовательно, только одна копия каждого гена. Женщинам, напротив, требуются обе Х-хромосомы для заболевания, и в результате они могут быть только носителями генетического заболевания, поскольку их вторая Х-хромосома перекрывает первую. Например, гемофилия А и В и врожденная красно-зеленая цветовая слепота передаются по семьям таким образом.

X-хромосома несет сотни генов, но лишь немногие из них, если таковые вообще имеются, имеют непосредственное отношение к определению пола. На ранних стадиях эмбрионального развития у самок одна из двух X-хромосом постоянно инактивируется почти во всех соматических клетках (клетках, отличных от яйцеклеток и сперматозоидов ). Это явление называется X-инактивацией или Лионизацией и создает тельце Барра . Если бы X-инактивация в соматической клетке означала полную дефункционализацию одной из X-хромосом, это гарантировало бы, что у самок, как и у самцов, будет только одна функциональная копия X-хромосомы в каждой соматической клетке. Ранее предполагалось, что это так. Однако недавние исследования показывают, что тельце Барра может быть более биологически активным, чем предполагалось ранее. [8]

Частичная инактивация Х-хромосомы происходит из-за репрессивного гетерохроматина , который уплотняет ДНК и предотвращает экспрессию большинства генов. Уплотнение гетерохроматина регулируется Polycomb Repressive Complex 2 ( PRC2 ). [9]

Гены

Количество генов

Ниже приведены некоторые оценки количества генов человеческой Х-хромосомы. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их прогнозы количества генов на каждой хромосоме различаются (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов проект по совместной консенсусной кодирующей последовательности ( CCDS ) придерживается крайне консервативной стратегии. Таким образом, прогноз количества генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих человеческие белки. [10]

ОцененоГены, кодирующие белкиГены некодирующей РНКПсевдогеныИсточникДата выпуска
CCDS804[11]2016-09-08
HGNC825260606[12]2017-05-12
Ансамбль841639871[13]2017-03-29
UniProt839[14]2018-02-28
NCBI874494879[15] [16] [17]2017-05-19

Список генов

Ниже приведен частичный список генов человеческой хромосомы X. Полный список можно посмотреть по ссылке в информационном поле справа.

  • AD16 : кодирующий белок болезни Альцгеймера 16
  • AIC : кодирующий белок AIC
  • APOO : кодирующий белок аполипопротеин O
  • ARMCX6 : кодирующий белок Armadillo повтор, содержащий X-связанный 6
  • BEX1 : кодирующий белок, экспрессируемый в мозге, Х-сцепленный белок 1
  • BEX2 : кодирующий белок, экспрессируемый в мозге, Х-сцепленный белок 2
  • BEX4 : кодирующий белок, экспрессируемый в мозге, сцепленный с Х-хромосомой 4
  • CCDC120 : кодирующий белок Спиральный домен, содержащий белок 120
  • CCDC22 : кодирующий белок, домен спиральной спирали, содержащий 22
  • CD99L2 : белок 2, подобный антигену CD99
  • CDR1-AS : кодирующая белок CDR1 антисмысловая РНК
  • CFAP47 : кодирующий белок Белок 47, ассоциированный с ресничками и жгутиками
  • CHRDL1 : кодирующий белок Chordin-like 1
  • CMTX2 кодирует белок нейропатии Шарко-Мари-Тута, сцепленный с Х-хромосомой 2 (рецессивный)
  • CMTX3 кодирует белок нейропатии Шарко-Мари-Тута, сцепленный с Х-хромосомой 3 (доминантный)
  • CT45A5 : кодирующий белок семейства раковых/тестикулярных антигенов 45, член A5
  • CT55 : кодирующий белок антиген рака/яичек 55
  • CXorf36 : кодирующий белок гипотетический белок LOC79742
  • CXorf57 : кодирующий белок Хромосома X открытая рамка считывания 57
  • CXorf40A : Открытая рамка считывания 40 хромосомы X
  • CXorf49 : открытая рамка считывания хромосомы X 49. кодирующий белок
  • CXorf66 : кодирующий белок Хромосома X Открытая рамка считывания 66
  • CXorf67 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок CXorf67
  • DACH2 : кодирующий белок Dachshund гомолог 2
  • EFHC2 : кодирующий белок EF-hand домен (C-конец), содержащий 2
  • ERCC6L кодирующий белок ERCC эксцизионная репарация 6 подобный, веретенообразная сборка контрольной точки геликаза
  • FAAH2 : Гидролаза амида жирных кислот 2
  • F8A1 : белок интрона 22 фактора VIII
  • FAM104B : кодирующий белок Семейство с последовательностью, схожей с 104 членом B
  • FAM120C : кодирующий белок Семейство с последовательностью, схожей с 120C
  • FAM122B : Семья со сходством последовательностей 122 члена B
  • FAM122C : кодирующий белок семейства с последовательностью, схожей с 122C
  • FAM127A : белок CAAX-бокса 1
  • FAM155B : кодирующий белок семейства с последовательностью, схожей с 155, член B
  • FAM50A : Семья со сходством последовательностей 50 членов A
  • FATE1 : Транскрипт белка, экспрессируемого в яичках плода и взрослого человека
  • FMR1-AS1 : кодирование длинной некодирующей РНК FMR1 антисмысловая РНК 1
  • FRMPD3 : кодирующий белок FERM и домен PDZ, содержащий 3
  • FRMPD4 : кодирующий белок FERM и домен PDZ, содержащий 4
  • FUNDC1 : кодирующий белок FUN14 домен, содержащий 1
  • FUNDC2 : белок 2, содержащий домен FUN14
  • GAGE12F : кодирующий белок G-антигена 12F
  • GAGE2A : кодирующий белок G-антигена 2A
  • GATA1 : кодирующий фактор транскрипции GATA1
  • GNL3L кодирующий белок G белок ядрышковый 3 подобный
  • GPRASP2 : сортировочный белок 2, связанный с рецептором G-белка
  • GRIPAP1 : кодирующий белок GRIP1-ассоциированный белок 1
  • GRDX : кодирующий белок болезнь Грейвса, восприимчивость к, сцепленный с Х-хромосомой
  • HDHD1A : кодирующий фермент, содержащий домен гидролазы, подобный дегалогеназе галокислоты, белок 1A
  • HS6ST2 : кодирующий белок гепарансульфат 6-О-сульфотрансфераза 2
  • ITM2A : кодирующий белок Интегральный мембранный белок 2A
  • LAS1L : кодирующий белок LAS1-подобный белок
  • LOC101059915 : кодирование белка *LOC101059915
  • MAGEA2 : кодирующий белок меланомоассоциированный антиген 2
  • MAGEA5 : кодирующий белок семейства антигенов меланомы A, 5
  • MAGEA8 : кодирующий белок семейства антигенов меланомы A, 8
  • MAGED4B : кодирующий белок меланомоассоциированный антиген D4
  • MAGT1 : кодирующий белок Белок-переносчик магния 1
  • MAGED4 : кодирующий белок семейства MAGE D4
  • МАО-А : Моноаминоксидаза А
  • МАО-Б : моноаминоксидаза B
  • MAP3K15 : кодирующий белок Митоген-активируемая протеинкиназа киназа киназа 15
  • MBNL3 : кодирующий белок Muscleblind-подобный белок 3
  • MBTPS2 : кодирующий фермент мембраносвязанный фактор транскрипции сайта 2 протеаза
  • MCT-1 : кодирующий белок MCTS1, фактор повторной инициации и высвобождения
  • MIR106A : кодирование микроРНК МикроРНК 106
  • MIR222 : кодирование микроРНК МикроРНК 222
  • MIR223 : кодирующий белок MicroRNA 223
  • MIR361 : кодирование микроРНК МикроРНК 361
  • MIR503 : кодирование микроРНК МикроРНК 503
  • MIR6087 : кодирование микроРНК МикроРНК 6087
  • MIR660 : кодирование микроРНК МикроРНК 660
  • MIRLET7F2 : кодирующий белок MicroRNA let-7f-2
  • MORF4L2 : кодирующий белок, белок 2, подобный фактору смертности 4
  • MOSPD1 : кодирующий белок Домен подвижных сперматозоидов, содержащий 1
  • MOSPD2 : кодирующий белок Домен подвижных сперматозоидов, содержащий 2
  • NAP1L3 : кодирующий белок, белок сборки нуклеосомы 1, как 3
  • NBDY : кодирующий белок Отрицательный регулятор ассоциации P-телец
  • NKRF : кодирующий белок NF-kappa-B-репрессорный фактор
  • NRK : кодирующий фермент Nik-родственная протеинкиназа
  • OPN1LW : опсин, чувствительный к длинным волнам (красным колбочкам)
  • OPN1MW : опсин, чувствительный к средним волнам (зеленые колбочки)
  • OTUD5 : кодирующий белок деубиквитиназу 5 OTU.
  • PASD1 : кодирующий белок PAS-домен, содержащий белок 1
  • PAGE1 : кодирующий белок, член семейства PAGE 1
  • PAGE2B : кодирующий белок 2B семейства PAGE
  • PBDC1 : кодирует белок с неустановленной функцией
  • PCYT1B : кодирующий фермент холинфосфатцитидилилтрансферазу B
  • PIN4 : кодирующий фермент пептидил-пролил цис-транс-изомераза, взаимодействующий с NIMA 4
  • PLAC1 : кодирующий белок Плацентарный специфичный белок 1
  • PLP2 : кодирующий белок Протеолипидный белок 2
  • PRR32 : кодирующий белок PRR32
  • RPA4 : кодирующий белок репликационный белок A субъединица 30 кДа
  • RPS6KA6 : кодирующий белок рибосомальная протеинкиназа S6, 90 кДа, полипептид 6
  • RRAGB : кодирующий белок Ras-родственный ГТФ-связывающий белок B
  • RTL3 : кодирующий белок ретротранспозон Gag like 3
  • SFRS17A : кодирующий белок фактор сплайсинга, богатый аргинином/серином 17A
  • SLC38A5 : кодирующий белок, семейство переносчиков растворенного вещества 38, член 5
  • SLITRK2 : кодирующий белок SLIT и NTRK-подобный белок 2
  • SMARCA1 : кодирующий белок Вероятный глобальный активатор транскрипции SNF2L1
  • СМС : кодирующий фермент сперминсинтазу
  • SPANXN1 : кодирующий белок семейства SPANX N1
  • SPANXN5 : кодирующий белок семейства SPANX N5
  • SPG16 : кодирующий белок спастическая параплегия 16 (сложный, сцепленный с Х-хромосомой рецессивный)
  • SSR4 : кодирующий белок, транслокон-ассоциированная белковая субъединица дельта
  • TAF7L : кодирующий белок TATA-box, связывающий белок, ассоциированный с фактором 7
  • TCEAL1 : кодирующий белок фактор элонгации транскрипции А, подобный белку 1
  • TCEAL4 : кодирующий белок фактор элонгации транскрипции А, подобный белку 4
  • TENT5D : кодирующий белок терминальной нуклеотидилтрансферазы 5D
  • TEX11 : кодирующий белок, экспрессируемый в яичках 11
  • THOC2 : кодирующий белок THO комплекс субъединица 2
  • TMEM29 : кодирующий белок Белок FAM156A
  • TMEM47 : кодирующий белок Трансмембранный белок 47
  • TMLHE : кодирующий фермент триметиллизиндиоксигеназу, митохондриальный
  • TNMD, кодирующий белок Теномодулин (также называемый тендином, миодулином, Tnmd и TeM)
  • TRAPPC2P1 кодирующий белок Транспортный белок частица комплекс субъединица 2
  • TREX2 : кодирующий фермент трехосновную экзонуклеазу 2 для репарации
  • TRO : кодирующий белок трофинин
  • TSPYL2 : кодирующий белок, специфичный для яичек, Y-кодируемый белок 2
  • TTC3P1 : кодирующий белок тетратрикопептидный повтор домена 3 псевдоген 1
  • USP51 : кодирующий фермент убиквитин-карбоксильно-концевую гидролазу 51
  • VSIG1 : кодирующий белок V-set и домен иммуноглобулина, содержащий 1
  • YIPF6 : кодирующий белок Белок YIPF6
  • ZC3H12B : кодирующий белок ZC3H12B
  • ZC4H2 : кодирующий белок ZC4H2 Дефицит
  • ZCCHC18 : кодирующий белок цинковый палец CCHC-типа, содержащий 18
  • ZFP92 : кодирующий белок ZFP92 белок цинкового пальца
  • ZMYM3 : кодирующий белок цинковый палец MYM-типа белка 3
  • ZNF157 : кодирующий белок Цинковый палец белка 157
  • ZNF182 кодирующий белок Цинковый палец белок 182
  • ZNF275 : кодирующий белок Цинковый палец белка 275
  • ZNF674 : кодирующий белок Цинковый палец белка 674

Структура

Росс и др. (2005) и Оно (1967) выдвинули теорию, что Х-хромосома, по крайней мере, частично произошла от аутосомного (не связанного с полом) генома других млекопитающих, о чем свидетельствуют результаты межвидового выравнивания геномных последовательностей.

X-хромосома заметно больше и имеет более активную эухроматиновую область, чем ее аналог Y-хромосомы . Дальнейшее сравнение X и Y выявляет области гомологии между ними. Однако соответствующая область в Y выглядит намного короче и не имеет областей, которые сохраняются в X у всех видов приматов, что подразумевает генетическую дегенерацию Y в этой области. Поскольку у самцов только одна X-хромосома, у них больше шансов иметь заболевание, связанное с X-хромосомой.

По оценкам, около 10% генов, кодируемых Х-хромосомой, связаны с семейством генов «CT», названных так потому, что они кодируют маркеры, обнаруженные как в опухолевых клетках (у больных раком), так и в яичках человека (у здоровых пациентов). [18]

Роль в заболевании

Числовые аномалии

Синдром Клайнфельтера :

  • Синдром Клайнфельтера вызван наличием одной или нескольких дополнительных копий Х-хромосомы в клетках мужчины.
  • Мужчины с синдромом Клайнфельтера обычно имеют одну дополнительную копию X-хромосомы в каждой клетке, в общей сложности две X-хромосомы и одну Y-хромосому (47,XXY). Реже у мужчин с этим синдромом встречаются две или три дополнительных X-хромосомы (48,XXXY или 49,XXXXY) или дополнительные копии как X, так и Y-хромосом (48,XXYY) в каждой клетке. Дополнительный генетический материал может привести к высокому росту, трудностям в обучении и чтении, а также другим медицинским проблемам. Каждая дополнительная X-хромосома снижает IQ ребенка примерно на 15 пунктов [19] [20] , что означает, что средний IQ при синдроме Клайнфельтера в целом находится в пределах нормы, хотя и ниже среднего. Когда дополнительные X и/или Y-хромосомы присутствуют в 48,XXXY, 48,XXYY или 49,XXXXY, задержки развития и когнитивные трудности могут быть более серьезными, а также может присутствовать легкая умственная отсталость .
  • Синдром Клайнфельтера может также быть результатом дополнительной Х-хромосомы только в некоторых клетках организма. Такие случаи называются мозаикой 46,XY/47,XXY.

Трисомия X

  • Этот синдром возникает из-за дополнительной копии X-хромосомы в каждой из женских клеток. Женщины с трисомией X имеют три X-хромосомы, в общей сложности 47 хромосом на клетку. Средний IQ женщин с этим синдромом составляет 90, тогда как средний IQ здоровых братьев и сестер составляет 100. [21] Их рост в среднем выше, чем у нормальных женщин. Они фертильны, и их дети не наследуют это состояние. [22]
  • Были выявлены женщины с более чем одной дополнительной копией Х-хромосомы (48, тетрасомия X или 49, пентасомия X ), но эти состояния встречаются редко.

Синдром Тернера :

  • Это происходит, когда каждая из женских клеток имеет одну нормальную X-хромосому, а другая половая хромосома отсутствует или изменена. Отсутствующий генетический материал влияет на развитие и вызывает признаки состояния, включая низкий рост и бесплодие.
  • Около половины людей с синдромом Тернера имеют моносомию X (45,X), что означает, что каждая клетка в организме женщины имеет только одну копию X-хромосомы вместо обычных двух копий. Синдром Тернера может также возникнуть, если одна из половых хромосом частично отсутствует или перестроена, а не отсутствует полностью. У некоторых женщин с синдромом Тернера есть хромосомные изменения только в некоторых из их клеток. Эти случаи называются мозаиками синдрома Тернера (45,X/46,XX).

Х-сцепленные рецессивные заболевания

Сцепление с полом было впервые обнаружено у насекомых, например, в 1910 году, когда Т. Х. Морган открыл закономерности наследования мутации белых глаз у Drosophila melanogaster . [23] Такие открытия помогли объяснить сцепленные с Х-хромосомой заболевания у людей, например, гемофилию А и В, адренолейкодистрофию и дальтонизм на красный и зеленый цвета .

Другие расстройства

Синдром XX-самца — редкое заболевание, при котором область SRY хромосомы Y рекомбинирует и располагается на одной из хромосом X. В результате комбинация XX после оплодотворения имеет тот же эффект, что и комбинация XY, в результате чего получается мужчина. Однако другие гены X-хромосомы также вызывают феминизацию.

X-сцепленная эндотелиальная дистрофия роговицы — крайне редкое заболевание роговицы, связанное с регионом Xq25. Эпителиальная дистрофия роговицы Лиша связана с Xp22.3.

Мегалокорнеа 1 связана с Xq21.3-q22 [ необходима медицинская ссылка ]

Адренолейкодистрофия — редкое и смертельное заболевание, которое передается по материнской линии на Х-клетке. Оно поражает только мальчиков в возрасте от 5 до 10 лет и разрушает защитную клетку, окружающую нервы, миелин в мозге. У женщины-носителя почти не проявляется никаких симптомов, поскольку у женщин есть копия Х-клетки. Это заболевание приводит к тому, что когда-то здоровый мальчик теряет все способности ходить, говорить, видеть, слышать и даже глотать. В течение 2 лет после постановки диагноза большинство мальчиков с адренолейкодистрофией умирают.

Цитогенетическая полоса

Идеограмма G-бэндинга человеческой X-хромосомы в разрешении 850 bphs. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в геномных браузерах (например, Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Модели G-бэндинга человеческой Х-хромосомы в трех различных разрешениях (400, [24] 550 [25] и 850 [2] Длина полосы на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). [26] Этот тип идеограммы представляет собой фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в различные моменты митотического процесса . [27]
G-полосы человеческой Х-хромосомы с разрешением 850 bphs [2]
Хр.Рука [28]Группа [29]
Начало ISCN [30]

Остановка ISCN [30]

Начало пары оснований

Остановка пар оснований
Пятно [31]Плотность
Хп22.33032314,400,000гнег
Хп22.323235044,400,0016,100,000gpos50
Хп22.315048666,100,0019,600,000гнег
Хп22.286610349,600,00117,400,000gpos50
Хп22.131034134517,400,00119,200,000гнег
Хп22.121345144819,200,00121,900,000gpos50
Хп22.111448157721,900,00124,900,000гнег
Хп21.31577178424,900,00129,300,000gpos100
Хп21.21784186229,300,00131,500,000гнег
Хп21.11862212031,500,00137,800,000gpos100
Хп11.42120243037,800,00142,500,000гнег
Хп11.32430262442,500,00147,600,000gpos75
Хп11.232624294847,600,00150,100,000гнег
Хп11.222948312950,100,00154,800,000gpos25
Хп11.213129320654,800,00158,100,000гнег
Хп11.13206329758,100,00161,000,000асен
Хд11.13297349161,000,00163,800,000асен
Хд11.23491362063,800,00165,400,000гнег
Хд123620382765,400,00168,500,000gpos50
Хд13.13827413768,500,00173,000,000гнег
Хд13.24137429273,000,00174,700,000gpos50
Хд13.34292444774,700,00176,800,000гнег
Хд21.14447473276,800,00185,400,000gpos100
Хд21.24732480985,400,00187,000,000гнег
Хд21.314809510787,000,00192,700,000gpos100
Хд21.325107518492,700,00194,300,000гнег
Хд21.335184543094,300,00199,100,000gpos75
Хд22.15430570199,100,001103,300,000гнег
Хд22.257015843103,300,001104,500,000gpos50
Хд22.358436050104,500,001109,400,000гнег
Хд2360506322109,400,001117,400,000gpos75
Хд2463226619117,400,001121,800,000гнег
Хд2566197059121,800,001129,500,000gpos100
Хд26.170597253129,500,001131,300,000гнег
Хд26.272537395131,300,001134,500,000gpos25
Хд26.373957602134,500,001138,900,000гнег
Хд27.176027808138,900,001141,200,000gpos75
Хд27.278087886141,200,001143,000,000гнег
Хд27.378868145143,000,001148,000,000gpos100
Хд2881458610148,000,001156,040,895гнег

Исследовать

В июле 2020 года ученые сообщили о первой полной и без пробелов сборке человеческой Х-хромосомы . [ 32] [33]

Смотрите также

Ссылки

  • Более ранние версии этой статьи содержат материалы из Национальной медицинской библиотеки, входящей в состав Национальных институтов здравоохранения (США), которые, являясь изданием правительства США, находятся в открытом доступе.
  1. ^ Том Страхан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека. Garland Science. стр. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  2. ^ Страница оформления генома abc , NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2014-06-03. Получено 2017-04-26.
  3. ^ Энджер, Натали (2007-05-01). «Для материнской X-хромосомы пол — это только начало». The New York Times . Получено 2007-05-01 .
  4. ^ Джеймс Шварц, В погоне за геном: от Дарвина до ДНК , страницы 155-158, Издательство Гарвардского университета, 2009 ISBN 0674034910 
  5. Дэвид Бейнбридж, «X в сексе: как X-хромосома управляет нашей жизнью» , страницы 3–5, Издательство Гарвардского университета, 2003 ISBN 0674016211 . 
  6. ^ Бейнбридж, страницы 65-66
  7. ^ ab Hutchison, Luke (сентябрь 2004 г.). "Выращивание генеалогического древа: сила ДНК в восстановлении семейных отношений" (PDF) . Труды Первого симпозиума по биоинформатике и биотехнологии (BIOT-04) . Получено 03.09.2016 .
  8. ^ Carrel L, Willard H (2005). «Профиль инактивации X выявляет обширную изменчивость в экспрессии генов, сцепленных с X-хромосомой, у женщин». Nature . 434 (7031): 400– 4. Bibcode :2005Natur.434..400C. doi :10.1038/nature03479. PMID  15772666. S2CID  4358447.
  9. ^ Veneti Z, Gkouskou KK, Eliopoulos AG (июль 2017 г.). «Комплекс репрессора Polycomb 2 в геномной нестабильности и раке». Int J Mol Sci . 18 (8): 1657. doi : 10.3390/ijms18081657 . PMC 5578047. PMID  28758948 . 
  10. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества человеческих генов». Genome Biol . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . PMC 2898077. PMID  20441615 . 
  11. ^ "Результаты поиска - X[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("has ccds"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . Выпуск 20 CCDS для Homo sapiens . 2016-09-08 . Получено 2017-05-28 .
  12. ^ "Статистика и загрузки для хромосомы X". Комитет по номенклатуре генов HUGO . 2017-05-12. Архивировано из оригинала 2017-06-29 . Получено 2017-05-19 .
  13. ^ "Хромосома X: Сводка по хромосомам - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29 . Получено 2017-05-19 .
  14. ^ "Хромосома человека X: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM". UniProt . 2018-02-28 . Получено 2018-03-16 .
  15. ^ "Результаты поиска - X[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("генотип кодирование белка"[Свойства] И живой[свойство]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
  16. ^ "Результаты поиска - X[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ( ("genetype miscrna"[Свойства] ИЛИ "genetype ncrna"[Свойства] ИЛИ "genetype rrna"[Свойства] ИЛИ "genetype trna"[Свойства] ИЛИ "genetype scrna"[Свойства] ИЛИ "genetype snrna"[Свойства] ИЛИ "genetype snorna"[Свойства]) НЕ "genetype protein coding"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
  17. ^ "Результаты поиска - X[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("genetype pseudo"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
  18. ^ Росс М. и др. (2005). «Последовательность ДНК человеческой Х-хромосомы». Nature . 434 (7031): 325–37 . Bibcode :2005Natur.434..325R. doi :10.1038/nature03440. PMC 2665286 . PMID  15772651. 
  19. ^ Гарольд Чен; Ян Кранц; Мэри Л. Уиндл; Маргарет М. Макговерн; Пол Д. Петри; Брюс Бюлер (2013-02-22). "Патофизиология синдрома Клайнфельтера". Medscape . Получено 18 июля 2014 г.
  20. ^ Висотсак Дж., Грэм Дж. М. (2006). «Синдром Клайнфельтера и другие анеуплоидии половых хромосом». Orphanet J Rare Dis . 1 : 42. doi : 10.1186/1750-1172-1-42 . PMC 1634840. PMID  17062147 . 
  21. ^ Бендер Б., Пак М., Салбенблатт Дж., Робинсон А. (1986). Смит С. (ред.). Когнитивное развитие детей с аномалиями половых хромосом . Сан-Диего: College Hill Press. С.  175–201 .
  22. ^ "Синдром тройной Х-хромосомы". Genetics Home Reference . 2014-07-14 . Получено 2014-07-18 .
  23. ^ Морган, TH (1910). «Ограниченное полом наследование у дрозофилы». Science . 32 (812): 120– 122. Bibcode :1910Sci....32..120M. doi :10.1126/science.32.812.120. PMID  17759620.
  24. ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (400 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2014-03-04. Получено 2017-04-26.
  25. ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (550 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2015-08-11. Получено 2017-04-26.
  26. ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
  27. ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). «Оценка разрешений на уровне полос изображений хромосом человека». 2012 Девятая международная конференция по компьютерным наукам и программной инженерии (JCSSE). стр.  276–282 . doi :10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID  16666470.
  28. ^ " p ": Короткое плечо; " q ": Длинное плечо.
  29. ^ Для номенклатуры цитогенетического распределения см. статью locus .
  30. ^ ab Эти значения (старт/стоп ISCN) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN «Международная система цитогенетической номенклатуры человека» (2013). Произвольная единица .
  31. ^ gpos : Область, которая положительно окрашивается G-бэндингом , как правило, богата AT и бедна генами; gneg : Область, которая отрицательно окрашивается G-бэндингом, как правило, богата CG и богата генами; acen Центромера . var : Вариабельная область; stem : Стебель.
  32. ^ "Ученые впервые получили полную сборку человеческой Х-хромосомы". phys.org . Получено 16 августа 2020 г. .
  33. ^ Мига, Карен Х .; Корень, Сергей; Ри, Аран; Фоллгер, Митчелл Р.; Гершман, Ариэль; Бзикадзе, Андрей; Брукс, Шелис; Хау, Эдмунд; Порубский, Дэвид; Логсдон, Гленнис А.; Шнайдер, Валери А.; Потапова Тамара; Вуд, Джонатан; Чоу, Уильям; Армстронг, Джоэл; Фредриксон, Жанна; Пак, Евгения; Тиги, Кристоф; Кремицкий, Милинн; Маркович, Кристофер; Мадуро, Валери; Дутра, Амалия; Буффар, Жерар Г.; Чанг, Александр М.; Хансен, Нэнси Ф.; Уилферт, Эми Б.; Тибо-Ниссен, Франсуаза; Шмитт, Энтони Д.; Белтон, Джон-Мэтью; Сельварадж, Сиддарт; Деннис, Меган Й.; Сото, Даниэла С.; Сахасрабудхе, Рута; Кая, Гульхан; Квик, Джош; Ломан, Николас Дж.; Холмс, Надин; Луз, Мэтью; Сурти, Урваши; Рискес, Роза Ана; Линдси, Тина А. Грейвс; Фултон, Роберт; Холл, Айра; Пейтен, Бенедикт; Хоу, Керстин; Тимп, Уинстон; Янг, Элис; Малликин, Джеймс К.; Певзнер, Павел А.; Гертон, Дженнифер Л.; Салливан, Бет А. .; Эйхлер, Эван Э.; Филлиппи, Адам М. (14 июля 2020 г.). «Сборка теломеры-теломеры полной человеческой Х-хромосомы». Nature . 585 (7823): 79– 84. Bibcode : 2020Natur.585...79M. doi : 10.1038/s41586-020-2547-7 . ISSN  1476-4687. PMC 7484160. PMID 32663838  . 
  • Национальные институты здравоохранения. "X-хромосома". Genetics Home Reference . Архивировано из оригинала 2007-07-08 . Получено 2017-05-06 .
  • «X-хромосома». Архив информации о проекте «Геном человека» 1990–2003 гг . Получено 06.05.2017 г.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=X_chromosome&oldid=1264682791"