SIAH1

SIAH1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2А25, 4C9Z, 4CA1, 4I7B, 4I7C, 4I7D, 4X3G
Идентификаторы
Псевдонимы	SIAH1 , SIAH1A, siah E3 убиквитинпротеинлигаза 1, BURHAS
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602212; МГИ : 108064; гомологен : 20654; GeneCards : SIAH1; OMA :SIAH1 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 16 (человек)
Конец	48,448,402 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	87,472,562 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; эндотелиальная клетка; ; ганглионарное возвышение; ; амниотическая жидкость; ; кожа бедра; ; плацента; ; зародышевый эпителий; ; гонада; ; пигментный эпителий сетчатки; ; кожа бедра;
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; Ростральный миграционный поток; ; первичный ооцит; ; стволовая кора; ; волосяной фолликул; ; сперматоцит; ; пигментный эпителий сетчатки; ; половозрелый организм; ; зигота;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов металлов; идентичное связывание белков; активность убиквитин-протеинлигазы; связывание белков; связывание ионов цинка; трансферазная активность; активность убиквитин-протеинтрансферазы; связывание белка с С-концом; связывание фермента конъюгации убиквитина;
Клеточный компонент	комплекс разрушения бета-катенина; цитоплазма; ядро; ранняя эндосома; цитозоль; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	клеточный цикл; сперматогенез; аксонное руководство; развитие многоклеточного организма; анатомическая структура морфогенез; позитивная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути; апоптотический процесс; процесс катаболизма белка; позитивная регуляция процесса апоптоза; развитие нервной системы; убиквитинирование белка; дифференциация клеток; полиубиквитинирование белков; опосредованный протеасомой убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; дестабилизация белка; процесс апоптоза нейронов; убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; негативная регуляция нетрино-активируемого сигнального пути;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6477
	20437
	ENSG00000196470
	ENSMUSG00000036840
	Q8IUQ4
	Р61092
	НМ_001006610 ; НМ_003031 ; НМ_001006611
	NM_009172
	NP_001006611 ; NP_003022
	NP_033198
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Убиквитин-протеинлигаза E3 SIAH1 — это фермент , который у человека кодируется геном SIAH1 . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует полипептидную структуру, которая является членом семейства семи гомологов in missingia (SIAH). Белок является лигазой E3 и участвует в убиквитинировании и протеасомно -опосредованной деградации определенных белков. Активность этой убиквитинлигазы была вовлечена в развитие определенных форм болезни Паркинсона , регуляцию клеточного ответа на гипоксию и индукцию апоптоза . Альтернативный сплайсинг приводит к нескольким дополнительным вариантам транскриптов, некоторые из которых кодируют различные изоформы, а другие не были полностью охарактеризованы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что SIAH1 взаимодействует с:

БТР , ^[8]
БАГ1 , ^[9]
CACYBP , ^[10]
KHDRBS3 , ^[11]^[12]
КИФ22 , ^[13]
ЧИСЛО , ^[14]
ПЭГ10 , ^[15]
ПЭГ3 ^[16]
POU2AF1 , ^[17]
RBBP8 , ^[18] и
TRIB3 . ^[19]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000196470 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036840 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hu G, Chung YL, Glover T, Valentine V, Look AT, Fearon ER (ноябрь 1997 г.). «Характеристика человеческих гомологов гена Drosophila seven in missingia (sina)». Genomics . 46 (1): 103– 11. doi : 10.1006/geno.1997.4997 . PMID 9403064.
^ Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж.Л., Сюй Т., Фирон Э.Р. (октябрь 1997 г.). «Гомологи семи млекопитающих заочно регулируют DCC через путь убиквитин-протеасома». Гены и развитие . 11 (20): 2701– 14. doi :10.1101/gad.11.20.2701. ПМК 316613 . ПМИД 9334332.
^ "Ген Энтреза: SIAH1 семь отсутствующих гомологов 1 (дрозофила)".
^ Liu J, Stevens J, Rote CA, Yost HJ, Hu Y, Neufeld KL, White RL, Matsunami N (май 2001 г.). «Siah-1 опосредует новый путь деградации бета-катенина, связывающий p53 с белком аденоматозного полипоза кишечной палочки». Molecular Cell . 7 (5): 927–36 . doi : 10.1016/S1097-2765(01)00241-6 . PMID 11389840.
^ Мацудзава С., Такаяма С., Фрош Б.А., Сапата Дж.М., Рид Дж.К. (май 1998 г.). «p53-индуцируемый человеческий гомолог дрозофилы семь заочно (Siah) ингибирует рост клеток: подавление с помощью BAG-1». Журнал ЭМБО . 17 (10): 2736–47 . doi :10.1093/emboj/17.10.2736. ПМК 1170614 . ПМИД 9582267.
^ Matsuzawa SI, Reed JC (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53». Molecular Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . PMID 11389839.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т., Сетте С., Джонс К.Т., Эллиотт DJ (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34 . doi : 10.1093/hmg/ddh165 . ПМИД 15163637.
^ Джермани А, Брузцони-Джованелли Х, Феллоус А, Гиссельбрехт С, Варин-Бланк Н, Кальво Ф (декабрь 2000 г.). «SIAH-1 взаимодействует с альфа-тубулином и разрушает кинезин Кид протеасомным путем во время митоза». Онкоген . 19 (52): 5997–6006 . doi : 10.1038/sj.onc.1204002 . ПМИД 11146551.
^ Сусини Л. , Пассер Б.Дж., Амзаллаг-Эльбаз Н., Ювен-Гершон Т., Приер С., Приват Н., Тюндер М., Гендрон MC, Исраэль А., Амсон Р., Орен М., Телерман А. (декабрь 2001 г.). «Сиа-1 связывает и регулирует функцию Numb». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (26): 15067– 72. Бибкод : 2001PNAS...9815067S. дои : 10.1073/pnas.261571998 . ПМК 64984 . ПМИД 11752454.
^ Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасэгава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8 . PMID 12810624.
^ Relaix F, Wei Xj, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1/Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и сотрудничает с Siah1a в апоптозе, опосредованном p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (5): 2105– 10. Bibcode : 2000PNAS ...97.2105R. doi : 10.1073/pnas.040378897 . PMC 15761. PMID 10681424.
^ Tiedt R, Bartholdy BA, Matthias G, Newell JW, Matthias P (август 2001 г.). «Протеин RING finger Siah-1 регулирует уровень транскрипционного коактиватора OBF-1». The EMBO Journal . 20 (15): 4143– 52. doi :10.1093/emboj/20.15.4143. PMC 149178. PMID 11483517 .
^ Джермани А, Прабэль А, Мура С, Подгорняк М.П., Ди Карло А, Эрлих Р., Гиссельбрехт С., Варин-Бланк Н., Кальво Ф, Брузцони-Джованелли Х (декабрь 2003 г.). «SIAH-1 взаимодействует с CtIP и способствует его деградации по протеасомному пути». Онкоген . 22 (55): 8845– 51. doi : 10.1038/sj.onc.1206994 . ПМИД 14654780.
^ Zhou Y, Li L, Liu Q, Xing G, Kuai X, Sun J, Yin X, Wang J, Zhang L, He F (май 2008 г.). "E3 убиквитинлигаза SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3". Cellular Signalling . 20 (5): 942– 8. doi :10.1016/j.cellsig.2008.01.010. PMID 18276110.

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Немани М, Линарес-Круз Г, Брузцони-Джованелли Х, Роперч Дж.П., Тюндер М., Бугелере Л, Шериф Д., Медьюб М., Пастурауд П., Альваро В., дер Саркиссан Х., Казес Л., Ле Паслье Д., Ле Галл И., Израэль Д., Дауссе Дж., Сиго Ф., Чумаков И., Орен М., Кальво Ф., Амсон РБ, Коэн Д., Телерман А. (август 1996 г.). «Активация человеческого гомолога гена sina дрозофилы при апоптозе и подавлении опухоли». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9039– 42. Бибкод : 1996PNAS...93.9039N. doi : 10.1073/pnas.93.17.9039 . PMC 38591. PMID 8799150 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Block KL, Vornlocher HP, Hershey JW (ноябрь 1998 г.). "Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3". Журнал биологической химии . 273 (48): 31901– 8. doi : 10.1074/jbc.273.48.31901 . PMID 9822659.
Hu G, Fearon ER (январь 1999). "Siah-1 N-концевой RING-домен необходим для функции протеолиза, а C-концевые последовательности регулируют олигомеризацию и связывание с целевыми белками". Молекулярная и клеточная биология . 19 (1): 724– 32. doi :10.1128/mcb.19.1.724. PMC 83929. PMID 9858595.
Tanikawa J, Ichikawa-Iwata E, Kanei-Ishii C, Nakai A, Matsuzawa S, Reed JC, Ishii S (май 2000 г.). "p53 подавляет вызванную c-Myb активацию фактора транскрипции теплового шока 3". Журнал биологической химии . 275 (20): 15578– 85. doi : 10.1074/jbc.M000372200 . PMID 10747903.
Medhioub M, Vaury C, Hamelin R, Thomas G (сентябрь 2000 г.). «Отсутствие соматической мутации в кодирующей последовательности SIAH1 в опухолях, гемизиготных по этому кандидату на ген-супрессор опухолей». International Journal of Cancer . 87 (6): 794– 7. doi : 10.1002/1097-0215(20000915)87:6<794::AID-IJC5>3.0.CO;2-B . PMID 10956387.
Matsuzawa SI, Reed JC (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53». Molecular Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . PMID 11389839.
Boehm J, He Y, Greiner A, Staudt L, Wirth T (август 2001 г.). «Регулирование стабильности BOB.1/OBF.1 с помощью SIAH». The EMBO Journal . 20 (15): 4153– 62. doi :10.1093/emboj/20.15.4153. PMC 149152. PMID 11483518 .
Wheeler TC, Chin LS, Li Y, Roudabush FL, Li L (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина гомологами млекопитающих семи in missingia». Журнал биологической химии . 277 (12): 10273– 82. doi : 10.1074/jbc.M107857200 . PMID 11786535.
Maeda A, Yoshida T, Kusuzaki K, Sakai T (февраль 2002 г.). «Характеристика промотора человеческого Siah-1(1)». FEBS Letters . 512 ( 1– 3): 223– 6. doi : 10.1016/S0014-5793(02)02265-2 . PMID 11852084. S2CID 24436936.
Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (март 2002 г.). "Специфичный для антропоидов локус ферментов редактирования РНК сирот C до U на хромосоме 22". Genomics . 79 (3): 285–96 . doi :10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000196470 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036840 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9403064-5] Hu G, Chung YL, Glover T, Valentine V, Look AT, Fearon ER (ноябрь 1997 г.). «Характеристика человеческих гомологов гена Drosophila seven in missingia (sina)». Genomics . 46 (1): 103– 11. doi : 10.1006/geno.1997.4997 . PMID 9403064.

[pmid9334332-6] Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж.Л., Сюй Т., Фирон Э.Р. (октябрь 1997 г.). «Гомологи семи млекопитающих заочно регулируют DCC через путь убиквитин-протеасома». Гены и развитие . 11 (20): 2701– 14. doi :10.1101/gad.11.20.2701. ПМК 316613 . ПМИД 9334332.

[entrez-7] "Ген Энтреза: SIAH1 семь отсутствующих гомологов 1 (дрозофила)".

[pmid11389840-8] Liu J, Stevens J, Rote CA, Yost HJ, Hu Y, Neufeld KL, White RL, Matsunami N (май 2001 г.). «Siah-1 опосредует новый путь деградации бета-катенина, связывающий p53 с белком аденоматозного полипоза кишечной палочки». Molecular Cell . 7 (5): 927–36 . doi : 10.1016/S1097-2765(01)00241-6 . PMID 11389840.

[pmid9582267-9] Мацудзава С., Такаяма С., Фрош Б.А., Сапата Дж.М., Рид Дж.К. (май 1998 г.). «p53-индуцируемый человеческий гомолог дрозофилы семь заочно (Siah) ингибирует рост клеток: подавление с помощью BAG-1». Журнал ЭМБО . 17 (10): 2736–47 . doi :10.1093/emboj/17.10.2736. ПМК 1170614 . ПМИД 9582267.

[pmid11389839-10] Matsuzawa SI, Reed JC (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53». Molecular Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . PMID 11389839.

[pmid16189514-11] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid15163637-12] Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т., Сетте С., Джонс К.Т., Эллиотт DJ (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34 . doi : 10.1093/hmg/ddh165 . ПМИД 15163637.

[pmid11146551-13] Джермани А, Брузцони-Джованелли Х, Феллоус А, Гиссельбрехт С, Варин-Бланк Н, Кальво Ф (декабрь 2000 г.). «SIAH-1 взаимодействует с альфа-тубулином и разрушает кинезин Кид протеасомным путем во время митоза». Онкоген . 19 (52): 5997–6006 . doi : 10.1038/sj.onc.1204002 . ПМИД 11146551.

[pmid11752454-14] Сусини Л. , Пассер Б.Дж., Амзаллаг-Эльбаз Н., Ювен-Гершон Т., Приер С., Приват Н., Тюндер М., Гендрон MC, Исраэль А., Амсон Р., Орен М., Телерман А. (декабрь 2001 г.). «Сиа-1 связывает и регулирует функцию Numb». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (26): 15067– 72. Бибкод : 2001PNAS...9815067S. дои : 10.1073/pnas.261571998 . ПМК 64984 . ПМИД 11752454.

[pmid12810624-15] Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасэгава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8 . PMID 12810624.

[pmid10681424-16] Relaix F, Wei Xj, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1/Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и сотрудничает с Siah1a в апоптозе, опосредованном p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (5): 2105– 10. Bibcode : 2000PNAS ...97.2105R. doi : 10.1073/pnas.040378897 . PMC 15761. PMID 10681424.

[pmid11483517-17] Tiedt R, Bartholdy BA, Matthias G, Newell JW, Matthias P (август 2001 г.). «Протеин RING finger Siah-1 регулирует уровень транскрипционного коактиватора OBF-1». The EMBO Journal . 20 (15): 4143– 52. doi :10.1093/emboj/20.15.4143. PMC 149178. PMID 11483517 .

[pmid14654780-18] Джермани А, Прабэль А, Мура С, Подгорняк М.П., Ди Карло А, Эрлих Р., Гиссельбрехт С., Варин-Бланк Н., Кальво Ф, Брузцони-Джованелли Х (декабрь 2003 г.). «SIAH-1 взаимодействует с CtIP и способствует его деградации по протеасомному пути». Онкоген . 22 (55): 8845– 51. doi : 10.1038/sj.onc.1206994 . ПМИД 14654780.

[pmid18276110-19] Zhou Y, Li L, Liu Q, Xing G, Kuai X, Sun J, Yin X, Wang J, Zhang L, He F (май 2008 г.). "E3 убиквитинлигаза SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3". Cellular Signalling . 20 (5): 942– 8. doi :10.1016/j.cellsig.2008.01.010. PMID 18276110.