KHDRBS3

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
KHDRBS3
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыKHDRBS3 , Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, содержащий домен KH, связывание РНК, связанное с передачей сигнала 3, содержащий домен связывания РНК KH, связанный с передачей сигнала 3
Внешние идентификаторыОМИМ : 610421; МГИ : 1313312; гомологен : 4780; GeneCards : KHDRBS3; OMA :KHDRBS3 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_006558

NM_010158

RefSeq (белок)

NP_006549

NP_034288

Местоположение (UCSC)н/дХр 15: 68,8 – 68,97 Мб
Поиск в PubMed[2][3]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 3, содержащий домен KH, связывающий РНК и связанный с трансдукцией сигнала, представляет собой белок , который у людей кодируется геном KHDRBS3 . [ 4] [5] [6]

Взаимодействия

Было показано, что KHDRBS3 взаимодействует с SIAH1 . [7] [8]

KHDRBS3 взаимодействует с белком сплайсинга Sam68 и онкогеном метадгерином в клетках рака предстательной железы. [9]

Клиническое значение

Было показано, что экспрессия KHDRBS3 (T-STAR) увеличивается в ткани рака простаты по сравнению с окружающей доброкачественной тканью. [9] Экспрессия KHDRBS3 коррелирует с сигналом mpMRI, измеренным с помощью шкалы Лайкерта — системы, аналогичной PI-RADS . [9] Хотя этот вопрос все еще является предметом дискуссий, сигнал mpMRI коррелирует с более высокой степенью Глисона и размером опухоли, а также с гистопатологическими признаками, связанными с клинически агрессивным раком простаты. [10] [11] Экспрессия KHDRBS3 была увеличена в человеческом миокарде с сердечной недостаточностью , здесь белок KHDRBS3 взаимодействовал с несколькими важными мРНК, кодирующими компоненты саркомера, такие как актин гамма 1 ( ACTG1 ), легкая цепь миозина 2 ( MYL2 ), рианодиновый рецептор 2 ( RYR2 ), тропонин I3 ( TNNI3 ), тропонин T2 ( TNNT2 ), тропомиозин 1 ( TPM1 ), тропомиозин 2 ( TPM2 ) и титин ( TTN ) . [12]

В линиях клеток рака предстательной железы KHDRBS3, по-видимому, регулируется андрогенами, при этом снижение экспрессии мРНК происходит после добавления к клеткам синтетического андрогена R1881 . [9]

Функция

KHDRBS3 регулирует альтернативный сплайсинг мРНК белка сакромера титина ( TTN ), что приводит к удержанию интрона . Сверхэкспрессия KHDRBS3 в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках -производных кардиомиоцитах (iPSC-CMs) увеличила амплитуду переходного процесса Ca 2+ и привела к увеличению F max . [12]

Ссылки

  1. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022332 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, et al. (Июнь 1999). "T-STAR/ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе". Human Molecular Genetics . 8 (6): 959–69. doi : 10.1093/hmg/8.6.959 . PMID  10332027.
  5. ^ Ли Дж., Берр Дж. Г. (ноябрь 1999 г.). «Salpalpha и Salpbeta, гомологи Sam68, задерживающие рост». Gene . 240 (1): 133–47. doi :10.1016/S0378-1119(99)00421-7. PMID  10564820.
  6. ^ "Ген Entrez: содержащий домен KHDRBS3 KH, связывание РНК, связанная с трансдукцией сигнала 3".
  7. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  8. ^ Венейблс Дж. П., Далглиш С., Паронетто М. П., Скитт Л., Торнтон Дж. К., Сондерс П. Т. и др. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34. дои : 10.1093/hmg/ddh165. ПМИД  15163637.
  9. ^ abcd Luxton HJ, Simpson BS, Mills IG, Brindle NR, Ahmed Z, Stavrinides V и др. (август 2019 г.). «Онкоген метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК». Cancers . 11 (9): 1233. doi : 10.3390/cancers11091233 . PMC 6770463 . PMID  31450747. 
  10. ^ Norris JM, Carmona Echeverria LM, Bott SR, Brown LC, Burns-Cox N, Dudderidge T и др. (Май 2020 г.). «Какой тип рака простаты систематически игнорируется многопараметрической магнитно-резонансной томографией? Анализ когорты PROMIS». Европейская урология . 78 (2): 163–170. doi : 10.1016/j.eururo.2020.04.029 . PMC 7397509. PMID  32370911 . 
  11. ^ Norris JM, Carmona Echeverria LM, Simpson BS, Allen C, Ball R, Freeman A и др. (апрель 2020 г.). «Видимость рака простаты на многопараметрической магнитно-резонансной томографии: высокая степень Глисона и увеличенный объем опухоли — не единственные важные гистопатологические признаки». BJU International . 126 (2): 237–239. doi : 10.1111/bju.15085 . PMID  32319152.
  12. ^ ab Boeckel, Jes-Niels; Möbius-Winkler, Maximilian; Müller, Marion; Rebs, Sabine; Eger, Nicole; Schoppe, Laura; Tappu, Rewati; Kokot, Karoline E.; Kneuer, Jasmin M.; Gaul, Susanne; Bordalo, Diana M. (2021-07-15). "SLM2 — новый сердечный фактор сплайсинга, участвующий в сердечной недостаточности из-за дилатационной кардиомиопатии". Genomics, Proteomics & Bioinformatics . 20 (1): 129–146. doi : 10.1016/j.gpb.2021.01.006 . ISSN  1672-0229. PMC 9510876 . PMID  34273561. 

Дальнейшее чтение

  • Di Fruscio M, Chen T, Richard S (март 1999). «Характеристика белков млекопитающих SLM-1 и SLM-2, подобных Sam68: SLM-1 является субстратом Src во время митоза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 2710–5. Bibcode : 1999PNAS...96.2710D. doi : 10.1073 /pnas.96.6.2710 . PMC  15834. PMID  10077576.
  • Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV, Makarov EM, Cooke HJ, Eperon IC (март 2000 г.). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг». Human Molecular Genetics . 9 (5): 685–94. doi : 10.1093/hmg/9.5.685 . PMID  10749975.
  • Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM, Konig H, Memmott J, Andreadis A, Stamm S (март 2001 г.). «Белок семейства STAR/GSG rSLM-2 регулирует выбор альтернативных сайтов сплайсинга». Журнал биологической химии . 276 (12): 8665–73. doi : 10.1074/jbc.M006851200 . PMID  11118435.
  • Sugimoto Y, Morita R, Amano K, Shah PU, Pascual-Castroviejo I, Khan S и др. (август 2001 г.). «Ген T-STAR: точное картирование в регионе-кандидате на детскую абсансную эпилепсию на участке 8q24 и мутационный анализ у пациентов». Epilepsy Research . 46 (2): 139–44. doi :10.1016/S0920-1211(01)00274-1. PMID  11463515. S2CID  28713407.
  • Kool J, van Zaane W, van der Eb AJ, Terleth C (ноябрь 2001 г.). «Понижение регуляции T-STAR, белка, ингибирующего рост, после иммортализации, опосредованной SV40». Cell Growth & Differentiation . 12 (11): 535–41. PMID  11714634.
  • Reddy TR, Suhasini M, Xu W, Yeh LY, Yang JP, Wu J и др. (февраль 2002 г.). «Роль белков домена KH (белков млекопитающих, подобных Sam68, и белков дрожания) в посттранскрипционной регуляции репликации ВИЧ». Журнал биологической химии . 277 (8): 5778–84. doi : 10.1074/jbc.M106836200 . PMID  11741900.
  • Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (январь 2003 г.). «Sam68 РНК-связывающий белок является субстратом in vivo для белка аргинин N-метилтрансферазы 1». Молекулярная биология клетки . 14 (1): 274–87. doi :10.1091/mbc.E02-08-0484. PMC  140244. PMID  12529443 .
  • Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., ​​Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т. и др. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34. дои : 10.1093/hmg/ddh165. ПМИД  15163637.
  • Cohen CD, Doran PP, Blattner SM, Merkle M, Wang GQ, Schmid H и др. (июль 2005 г.). "Sam68-подобный белок млекопитающих 2, идентифицированный с помощью цифрового дифференциального отображения по экспрессии подоцитами, индуцируется при протеинурии и участвует в выборе места сплайсинга фактора роста эндотелия сосудов". Журнал Американского общества нефрологии . 16 (7): 1958–65. doi : 10.1681/ASN.2005020204 . PMID  15901763.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Zhang L, Guo L, Peng Y, Chen B (июль 2006 г.). «Экспрессия гена T-STAR связана с регуляцией активности теломеразы в клеточной линии рака толстой кишки человека HCT-116». World Journal of Gastroenterology . 12 (25): 4056–60. doi : 10.3748/wjg.v12.i25.4056 . PMC  4087721 . PMID  16810759.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=KHDRBS3&oldid=1174165565"