Белок PEG10, полученный из ретротранспозона, представляет собой белок , который у людей кодируется геном PEG10 . [5] [6] [7] [8]
Функция
Этот ген включает две перекрывающиеся рамки считывания одного и того же транскрипта, кодирующие различные изоформы. Более короткая изоформа имеет мотив цинкового пальца типа CCHC, содержащий последовательность, характерную для белков gag большинства ретровирусов и некоторых ретротранспозонов, и она функционирует частично, взаимодействуя с членами семейства рецепторов TGF-бета. Более длинная изоформа имеет консенсусную последовательность DSG активного сайта домена протеазы белков pol. Более длинная изоформа является результатом трансляционного сдвига рамки -1, который также наблюдается у некоторых ретровирусов. Экспрессия этих двух изоформ происходит только из отцовского аллеля из-за импринтинга. Повышенная экспрессия гена (наблюдаемая по увеличению уровней мРНК) связана с гепатоцеллюлярными карциномами. [8]
PEG10 — это отцовски экспрессируемый импринтированный ген, который экспрессируется во взрослых и эмбриональных тканях. [9] Наиболее заметная экспрессия происходит в плаценте. Этот ген высококонсервативен среди видов млекопитающих и сохраняет гептануклеотид (GGGAAAC). Сообщалось, что этот ген играет роль в пролиферации клеток, дифференцировке и апоптозе. Повышенная экспрессия этого гена была связана с несколькими злокачественными новообразованиями, такими как гепатоцеллюлярная карцинома и В-клеточный лимфоцитарный лейкоз. Нокаутные мыши, у которых отсутствовал этот ген, показали раннюю эмбриональную летальность с дефектами плаценты, что указывает на важность этого гена в эмбриональном развитии. В плацентарной ткани преэклампсии было показано, что PEG10 снижается [10] и повышается [11], что предполагает его возможную причинную роль в возникновении преэклампсии.
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000242265 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000092035 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Оно Р., Кобаяши С., Вагацума Х., Айсака К., Кода Т., Канеко-Исино Т., Исино Ф. (апрель 2001 г.). «Ген, происходящий из ретротранспозона, PEG10, представляет собой новый импринтированный ген, расположенный на хромосоме 7q21 человека». Геномика . 73 (2): 232–7. дои : 10.1006/geno.2001.6494. ПМИД 11318613.
^ Brandt J, Schrauth S, Veith AM, Froschauer A, Haneke T, Schultheis C, Gessler M, Leimeister C, Volff JN (январь 2005 г.). «Транспозируемые элементы как источник генетических инноваций: экспрессия и эволюция семейства неогенов, полученных из ретротранспозонов, у млекопитающих». Gene . 345 (1): 101–11. doi :10.1016/j.gene.2004.11.022. PMID 15716091.
^ Brandt J, Veith AM, Volff JN (август 2005 г.). «Семейство неофункционализированных генов ретротранспозона Ty3/gypsy в геномах млекопитающих». Cytogenetic and Genome Research . 110 (1–4): 307–17. doi :10.1159/000084963. PMID 16093683. S2CID 38398479.
^ ab "Ген Энтреза: PEG10, экспрессируемый по отцовской линии 10".
^ "PEG10 отцовски выражен 10 [ Homo sapiens (человек) ]". Pubmed . Получено 14 апреля 2015 г.
^ Liang XY, Chen X, Jin YZ, Chen XO, Chen QZ (18 декабря 2014 г.). «Экспрессия и значение импринтированного гена PEG10 в плаценте пациентов с преэклампсией». Genetics and Molecular Research . 13 (4): 10607–14. doi : 10.4238/2014.December.18.2 . PMID 25526181.
^ Chen H, Sun M, Zhao G, Liu J, Gao W, Si S, Meng T (октябрь 2012 г.). «Повышенная экспрессия PEG10 в плацентах человека при преэклампсии». Acta Histochemica . 114 (6): 589–93. doi :10.1016/j.acthis.2011.11.003. PMID 22137777.
^ аб Окабе Х, Сато С, Фурукава Ю, Като Т, Хасегава С, Накадзима Ю, Ямаока Ю, Накамура Ю (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8. ПМИД 12810624.
Дальнейшее чтение
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (апрель 1997 г.). "Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК". Genome Research . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID 9110174.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (июнь 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных человеческих генов. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 6 (3): 197–205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851.
Volff J, Körting C, Schartl M (февраль 2001 г.). «Окаменелости ретротранспозона Ty3/Gypsy в геномах млекопитающих: эволюционировали ли они в новые клеточные функции?». Молекулярная биология и эволюция . 18 (2): 266–70. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003801 . PMID 11158386.
Shigemoto K, Brennan J, Walls E, Watson CJ, Stott D, Rigby PW, Reith AD (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика гена млекопитающих, регулируемого развитием, который использует -1 запрограммированный рибосомный сдвиг рамки». Nucleic Acids Research . 29 (19): 4079–88. doi :10.1093/nar/29.19.4079. PMC 60235. PMID 11574691 .
Smallwood A, Papageorghiou A, Nicolaides K, Alley MK, Jim A, Nargund G, Ojha K, Campbell S, Banerjee S (июль 2003 г.). «Временная регуляция экспрессии синцитина (HERV-W), матерински импринтированного PEG10 и SGCE в плаценте человека». Biology of Reproduction . 69 (1): 286–93. doi : 10.1095/biolreprod.102.013078 . PMID 12620933.
Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8. ПМИД 12810624.
Tsou AP, Chuang YC, Su JY, Yang CW, Liao YL, Liu WK, Chiu JH, Chou CK (2004). «Сверхэкспрессия нового импринтированного гена PEG10 в гепатоцеллюлярной карциноме человека и в регенерирующей печени мышей». Журнал биомедицинской науки . 10 (6 Pt 1): 625–35. doi :10.1159/000073528. PMID 14576465. S2CID 202655065.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (сентябрь 2004 г.). "Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных регионах". Genome Research . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316 . PMID 15342556.
Lux A, Beil C, Majety M, Barron S, Gallione CJ, Kuhn HM, Berg JN, Kioschis P, Marchuk DA, Hafner M (март 2005 г.). «Человеческие ретровирусные белки gag- и gag-pol-подобные взаимодействуют с киназой 1, подобной трансформирующему фактору роста бета-рецептору активин-рецептор-подобной киназе 1». Журнал биологической химии . 280 (9): 8482–93. doi : 10.1074/jbc.M409197200 . PMID 15611116.
Manktelow E, Shigemoto K, Brierley I (2005). "Характеристика сигнала сдвига рамки Edr, примера запрограммированного -1 рибосомного сдвига рамки у млекопитающих". Nucleic Acids Research . 33 (5): 1553–63. doi :10.1093/nar/gki299. PMC 1065257 . PMID 15767280.
He H, Olesnanik K, Nagy R, Liyanarachchi S, Prasad ML, Stratakis CA, Kloos RT, de la Chapelle A (июль 2005 г.). «Аллельная вариация экспрессии генов в ткани щитовидной железы». Thyroid . 15 (7): 660–7. doi :10.1089/thy.2005.15.660. PMID 16053381.
Hu C, Xiong J, Zhang L, Huang B, Zhang Q, Li Q, Yang M, Wu Y, Wu Q, Shen Q, Gao Q, Zhang K, Sun Z, Liu J, Jin Y, Tan J (август 2004 г.). «Активация PEG10 путем костимуляции CXCR5 и CCR7 существенно способствует устойчивости к апоптозу в CD19+CD34+ B-клетках у пациентов с острым и хроническим лимфоцитарным лейкозом B-клеточной линии». Клеточная и молекулярная иммунология . 1 (4): 280–94. PMID 16225771.
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Ли СМ, Марголин А.А., Салас М., Мемео Л., Мансухани М., Хибшуш Х., Саболч М., Клинакис А., Тыко Б (январь 2006 г.). «PEG10 представляет собой ген-мишень c-MYC в раковых клетках». Исследования рака . 66 (2): 665–72. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1553 . ПМИД 16423995.
Эта статья о гене на человеческой хромосоме 7 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.
