Clostridium — род анаэробныхграмположительных бактерий . Виды Clostridium обитают в почве и кишечном тракте животных, включая человека. [1] Этот род включает несколько значимых человеческих патогенов , включая возбудителей ботулизма и столбняка . Ранее он также включал важную причину диареи, Clostridioides difficile , которая была переклассифицирована в род Clostridioides в 2016 году. [2]
История
В конце 1700-х годов Германия пережила несколько вспышек болезни, связанной с употреблением определенных видов колбасы. В 1817 году немецкий невролог Юстинус Кернер обнаружил палочковидные клетки в своих исследованиях этого так называемого отравления колбасой. В 1897 году бельгийский профессор биологии Эмиль ван Эрменгем опубликовал свое открытие эндоспорообразующего организма, который он выделил из испорченной ветчины. Биологи классифицировали открытие ван Эрменгема вместе с другими известными грамположительными спорообразователями в роде Bacillus . Однако эта классификация представляла проблемы, поскольку изолят рос только в анаэробных условиях, а Bacillus хорошо росли в кислороде. [1]
Около 1880 года, в ходе изучения брожения и синтеза масляной кислоты , ученый по фамилии Празмовский впервые дал биномиальное название Clostridium butyricum . [3] Механизмы анаэробного дыхания в то время еще не были хорошо изучены, поэтому таксономия анаэробов все еще развивалась. [3]
В 1924 году Ида А. Бенгтсон отделила микроорганизмы ван Эрменгема от группы Bacillus и отнесла их к роду Clostridium . Согласно схеме классификации Бенгтсона, Clostridium содержал все анаэробные эндоспорообразующие палочковидные бактерии, за исключением рода Desulfotomaculum . [1]
Таксономия
По состоянию на октябрь 2022 года в роде Clostridium имеется 164 валидно опубликованных вида . [4]
Род, как его традиционно определяют, содержит множество организмов, не тесно связанных с его типовым видом . Первоначально эта проблема была подробно проиллюстрирована филогенией рРНК из Collins 1994, которая разделила традиционный род (теперь соответствующий большой части Clostridia ) на двадцать кластеров, причем кластер I содержал типовой вид Clostridium butyricum и его близких родственников. [5] С годами это привело к выделению многих новых родов с конечной целью ограничить Clostridium кластером I. [6]
Кластер «Clostridium» XIVa (теперь Lachnospiraceae ) [7] и кластер «Clostridium» IV (теперь Ruminococcaceae ) [7] эффективно ферментируют растительные полисахариды, составляющие пищевые волокна, [8] что делает их важными и многочисленными таксонами в рубце и толстом кишечнике человека. [9] Как упоминалось ранее, эти кластеры не являются частью текущего Clostridium , [5] [10] и использования этих терминов следует избегать из-за неоднозначного или непоследовательного использования. [7]
Биохимия
Виды Clostridium являются облигатными анаэробами и способны производить эндоспоры . Они обычно окрашиваются грамположительно , но, как и Bacillus , часто описываются как грамвариабельные, потому что они показывают увеличивающееся количество грамотрицательных клеток по мере старения культуры. [11]
Нормальные, воспроизводящиеся клетки Clostridium , называемые вегетативной формой, имеют форму палочек , что и дало им их название, от греческого κλωστήρ или веретено. Эндоспоры Clostridium имеют отчетливую форму кегли или бутылки, отличающую их от других бактериальных эндоспор, которые обычно имеют яйцевидную форму. [ необходима цитата ] Окраска Шеффера -Фултона (0,5% малахитового зеленого в воде) может использоваться для различения эндоспор Bacillus и Clostridium от других микроорганизмов. [12]
Существует коммерчески доступный набор для полимеразной цепной реакции (ПЦР) (Bactotype) для обнаружения C. perfringens и других патогенных бактерий. [13]
Биология и патогенез
Виды Clostridium легко обнаруживаются в почве и кишечном тракте. Виды Clostridium также являются нормальными обитателями здорового нижнего репродуктивного тракта самок. [14]
Основными видами, вызывающими заболевания у людей, являются: [15]
Clostridium sordellii , теперь отнесенный к Paraclostridium , может вызывать смертельную инфекцию в исключительно редких случаях после медицинских абортов. [18]
Вегетативные клетки клостридий термолабильны и погибают при кратковременном нагревании при температурах выше 72–75 °C (162–167 °F). Термическое разрушение спор Clostridium требует более высоких температур (выше 121,1 °C (250,0 °F), например, в автоклаве ) и более длительного времени приготовления (20 мин, с несколькими исключительными случаями более 50 мин, зарегистрированными в литературе). Клостридии и бациллы довольно устойчивы к радиации, требуя доз около 30 кГр, что является серьезным препятствием для разработки облученных продуктов длительного хранения для общего использования на розничном рынке. [22] Добавление лизоцима , нитрата , нитрита и солей пропионовой кислоты подавляет клостридии в различных продуктах питания. [23] [24] [25]
Clostridium thermocellum может использовать лигноцеллюлозные отходы и генерировать этанол, что делает его возможным кандидатом для использования в производстве этанолового топлива . Он также не нуждается в кислороде и является термофильным , что снижает затраты на охлаждение. [ необходима цитата ]
Clostridium botulinum производит потенциально смертельный нейротоксин , используемый в разбавленной форме в препарате Botox , который осторожно вводится в нервы на лице, что предотвращает движение выразительных мышц лба, чтобы отсрочить эффект морщин, возникающий при старении. Он также используется для лечения спастической кривошеи и обеспечивает облегчение примерно на 12–16 недель. [27]
Непатогенные штаммы Clostridium могут помочь в лечении таких заболеваний, как рак . Исследования показывают, что Clostridium может избирательно воздействовать на раковые клетки. Некоторые штаммы могут проникать в солидные опухоли и размножаться в них . Поэтому Clostridium можно использовать для доставки терапевтических белков в опухоли. Такое использование Clostridium было продемонстрировано в различных доклинических моделях. [31]
^ abcde Maczulak A (2011), «Clostridium», Энциклопедия микробиологии , Факты в деле, стр. 168–173, ISBN978-0-8160-7364-1
^ Дитерле, Майкл Г.; Рао, Кришна; Янг, Винсент Б. (2019). «Новые методы лечения и профилактические стратегии при первичных и рецидивирующих инфекциях Clostridium difficile». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1435 (1): 110–138. Bibcode : 2019NYASA1435..110D. doi : 10.1111/nyas.13958. ISSN 1749-6632. PMC 6312459. PMID 30238983 .
^ ab Newman, Sir George (1904). Бактериология и общественное здравоохранение . Филадельфия, Пенсильвания: P. Blakiston's Son and Co. стр. 107–108. ISBN9781345750270.
^ ab Collins, MD; Lawson, PA; Willems, A; Cordoba, JJ; Fernandez-Garayzabal, J; Garcia, P; Cai, J; Hippe, H; Farrow, JA (октябрь 1994 г.). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых комбинаций видов». International Journal of Systematic Bacteriology . 44 (4): 812–26. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . PMID 7981107.
^ ab Lawson, PA; Rainey, FA (февраль 2016 г.). «Предложение ограничить род Clostridium Prazmowski до Clostridium butyricum и родственных видов». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (2): 1009–1016. doi : 10.1099/ijsem.0.000824 . PMID 26643615.
^ abc О, Хёнсок (18 сентября 2018 г.). «Таксономия кластеров клостридий XIVa и IV». eMedicine . EzBioCloud . Получено 04.06.2021 .
^ Boutard M, Cerisy T, Nogue PY, Alberti A, Weissenbach J, Salanoubat M, Tolonen AC (ноябрь 2014 г.). «Функциональное разнообразие углеводно-активных ферментов, позволяющих бактериям ферментировать растительную биомассу». PLOS Genetics . 10 (11): e1004773. doi : 10.1371/journal.pgen.1004773 . PMC 4230839. PMID 25393313 .
^ Lopetuso LR, Scaldaferri F, Petito V, Gasbarrini A (август 2013 г.). «Комменсальные клостридии: ведущие игроки в поддержании гомеостаза кишечника». Gut Pathogens . 5 (1): 23. doi : 10.1186/1757-4749-5-23 . PMC 3751348. PMID 23941657 .
^ Lopetuso LR, Scaldaferri F, PetitoV, Gasbarrini A (2013). «Комменсальные клостридии: ведущие игроки в поддержании гомеостаза кишечника». Gut Pathogens . 5 (1): 23. doi : 10.1186 / 1757-4749-5-23 . PMC 3751348. PMID 23941657.
^ abc Tortora GJ, Funke BR, Case CL (2010), Микробиология: Введение (10-е изд.), Benjamin Cummings, стр. 87, 134, 433, ISBN978-0-321-55007-1
^ Maczulak A (2011), "пятно", Энциклопедия микробиологии , Факты в деле, стр. 726–729, ISBN978-0-8160-7364-1
^ Уэллс CL, Уилкинс TD, Барон S (1996). "Clostridia: Sporeforming Anaerobic Bacilli". В Baron S, et al. (ред.). Медицинская микробиология Барона (4-е изд.). Медицинское отделение Техасского университета. ISBN978-0-9631172-1-2. PMID 21413315.
^ Киу Р., Холл Л. Дж. (август 2018 г.). «Обновленная информация о кишечном патогене человека и животных Clostridium perfringens». Emerging Microbes & Infections . 7 (1): 141. doi :10.1038/s41426-018-0144-8. PMC 6079034. PMID 30082713.
^ Киу Р., Браун Дж., Бедвелл Х., Леклер К., Кайм С., Пикард Д. и др. (октябрь 2019 г.). «Штаммов Clostridium perfringens и разведывательного исследования микробиома слепой кишки выявляют ключевые факторы, связанные с некротическим энтеритом у птиц». Микробиом животных . 1 (1): 12. doi : 10.1186/s42523-019-0015-1 . PMC 7000242. PMID 32021965.
^ Meites E, Zane S, Gould C (сентябрь 2010 г.). «Смертельные инфекции Clostridium sordellii после медицинских абортов». The New England Journal of Medicine . 363 (14): 1382–3. doi : 10.1056/NEJMc1001014 . PMID 20879895.
^ Лейкин Дж. Б., Палоучек Ф. П., ред. (2008), « Отравление Clostridium perfringens », Справочник по отравлениям и токсикологии (4-е изд.), Informa, стр. 892–893, ISBN978-1-4200-4479-9
^ Величкович М., Бенабу Р., Брин М.Ф. (2001). «Патофизиология и варианты лечения цервикальной дистонии». Drugs . 61 (13): 1921–43. doi :10.2165/00003495-200161130-00004. PMID 11708764. S2CID 46954613.
^ Doherty GM, ред. (2005), «Воспаление, инфекция и антимикробная терапия», Текущая диагностика и лечение: хирургия , McGraw-Hill, ISBN978-0-07-159087-7
^ "Обеспечение устойчивого энергетического будущего". Bioengineering Resources, inc . Получено 21 мая 2007 г.
^ Saint-Amans S, Perlot P, Goma G, Soucaille P (август 1994). "Высокое производство 1,3-пропандиола из глицерина клостридией butyricum VPI 3266 в просто контролируемой системе с подпиткой". Biotechnology Letters . 16 (8): 831–836. doi :10.1007/BF00133962. S2CID 2896050.
^ Менгеша А., Дюбуа Л., Паесманс К., Воутерс Б., Ламбин П., Тейс Дж. (2009). « Клостридии в противоопухолевой терапии». В Брюггеманн Х, Готшальк Г (ред.). Клостридии: молекулярная биология в постгеномную эпоху . Кайстер Академик Пресс. ISBN978-1-904455-38-7.
^ Chou CH, Han CL, Chang JJ, Lay JJ (октябрь 2011 г.). «Совместное культивирование Clostridium beijerinckii L9, Clostridium butyricum M1 и Bacillus thermoamylovorans B5 для преобразования отходов дрожжей в водород». Международный журнал водородной энергетики . 36 (21): 13972–13983. doi :10.1016/j.ijhydene.2011.03.067.
Внешние ссылки
Геномы Clostridium и связанная с ними информация в PATRIC, Центре биоинформатических ресурсов, финансируемом NIAID
Электронный учебник бактериологии Тодара
Группа поддержки Clostridium difficile в Великобритании