Домен суши

Белковый домен
Белковый домен
Домен суши (SCR/CCP)
Идентификаторы
СимволСуши
ПфамПФ00084
ИнтерПроIPR000436
КАТ1г4г
СКОП21hfi / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00033
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ПДБ1hfh : 870-926 1hfi : 870-926 1ckl F: 99-157

1y8e A:86-143 1g40 A:86-143 1g44 C:86-143 1rid B:86-143 1e5g A:86-143 1h2q P:163-220 1ok2 A:163-220 1ojy B:163-220 1h03 P:163-220 1h04 P:163-220 1ok1 B:163-220 1h2p P:163-220 1upn E: 163-220 1ojw B:163-220 1ojv A:163-220 1ok3 A:163-220 1ok9 B:163-220 1nwv A:163-220 1uot P:163-220 2a55 A:113-170 1gkg A:1004-1061 1gkn A:1004-1061 1gop A:1004-1061 1ppq A:1004-1061 1srz A:99-156 1ss2 A:99-156 1qub A:84-137 1c1z A:84-137 1fhc A:1109-1163 1hr4 A:162-223 1vvd :148-201 1vvc :148-201 1vve :148-201 1hcc :931-984 1ghq C:23-82 1ly2 A:23-82 1ков А:389-442 1зжк А:300-361 1гпз Б:309-371 1q3x А:366-430 1мд7 А:376-447 1мд8 А:376-447 1элв А:359-421 1з92 Б:24-82 1илн А:24-82

1илм А:24-82 2б5и Д:24-82

Домен суши — это эволюционно консервативный домен белка . Он также известен как модули белка контроля комплемента (CCP) или короткие консенсусные повторы (SCR). Название происходит от визуального сходства домена с нигири-суши , когда первичная структура нарисована с петлями, созданными дисульфидными связями. [1]

Домены суши существуют в широком спектре комплементарных и адгезионных белков. Структура этого домена известна; она основана на расположении бета-сэндвича — одна грань состоит из трех β-нитей, связанных водородными связями, образуя трехцепочечную область в ее центре, а другая грань образована из двух отдельных β-нитей. [2]

CD21 (также называемый рецептором C3d, CR2, рецептором вируса Эпштейна–Барр или EBV-R) является рецептором для EBV и для C3d, C3dg и iC3b. Компоненты комплемента могут активировать В-клетки через CD21. CD21 является частью большого комплекса передачи сигнала, который также включает CD19, CD81 и Leu13.

Некоторые из белков этой группы отвечают за молекулярную основу антигенов групп крови, поверхностных маркеров на внешней стороне мембраны эритроцитов. Большинство этих маркеров являются белками, но некоторые представляют собой углеводы, прикрепленные к липидам или белкам. [3] Фактор, ускоряющий распад комплемента (антиген CD55), относится к системе групп крови Кромера и связан с антигенами Cr(a), Dr(a), Es(a), Tc(a/b/c), Wd(a), WES(a/b), IFC и UMC. Рецептор комплемента типа 1 (рецептор C3b/C4b) (антиген CD35) относится к системе групп крови Кнопса и связан с антигенами Kn(a/b), McC(a), Sl(a) и Yk(a).

Подсемейства

Примеры

Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

Ссылки

  1. ^ Ичиносе, Акитада; Боттенус, Ральф Э.; Дэви, Эрл В. «Структура трансглутаминаз». Журнал биологической химии . 265 : 13411– 13414. PMID  1974250.
  2. ^ Кэмпбелл ID, Барон M, Дэй AJ, Сим RB, Норман DG, Барлоу PN (1991). "Трехмерная структура модуля белка контроля комплемента в растворе". J. Mol. Biol . 219 (4): 717– 725. doi :10.1016/0022-2836(91)90666-T. PMID  1829116.
  3. ^ Ломас-Фрэнсис, Кристин; Рид, Мэрион Э. (2004). Антиген группы крови: справочник . Бостон: Academic Press. ISBN 0-12-586585-6.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000436
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Sushi_domain&oldid=1215919770"