мотив РНК potC

РНК-семейство
мотив РНК potC
Консенсусная вторичная структура РНК potC
Идентификаторы
СимволРНК potC
РфамРФ01751
Другие данные
Тип РНКЦис -регуляторный элемент
Структуры PDBПДБе

Мотив potC РНК представляет собой консервативную структуру РНК , обнаруженную с помощью биоинформатики . [1] РНК обнаруживается только в последовательностях генома, полученных из ДНК , которая была извлечена из некультивируемых морских бактерий . Таким образом, эта РНК присутствует в образцах окружающей среды , но пока не обнаружена ни в одном культивируемом организме. РНК potC расположены в предполагаемых 5'-нетранслируемых областях генов, которые , как предполагается, кодируют либо мембранные транспортные белки , либо пероксиредоксины . Поэтому была выдвинута гипотеза, что РНК potC являются цис-регуляторными элементами , но их детальная функция неизвестна.

В том же исследовании был идентифицирован ряд других РНК, в том числе:

Ссылки

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата на структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC  2864571. PMID  20230605 .
  • Страница potC RNA в Rfam


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PotC_RNA_motif&oldid=1188073280"