Мотив РНК Lacto-usp

РНК-семейство
Лакто- usp РНК
Консенсусная вторичная структура РНК Lacto- usp
Идентификаторы
СимволЛакто- usp РНК
РфамРФ01710
Другие данные
Тип РНКмРНК
ДоменыМолочнокислые бактерии
Структуры PDBПДБе

Мотив РНК Lacto- usp представляет собой консервативную структуру РНК , идентифицированную в бактериях биоинформатикой . [1] РНК Lacto - usp обнаружены исключительно в молочнокислых бактериях и исключительно в возможных 5′ нетранслируемых областях (5′ UTR) оперонов , которые содержат гипотетический ген и ген usp . Ген usp кодирует универсальный стрессовый белок . Было высказано предположение, что Lacto- usp может соответствовать 6S РНК соответствующих видов, поскольку у четырех из пяти этих видов отсутствует предсказанная 6S РНК, а 6S РНК обычно встречаются в 5′ UTR генов usp . Однако, учитывая, что мотив РНК Lacto- usp намного короче стандартной структуры 6S РНК, функция РНК Lacto- usp остается неясной.

Ссылки

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата на структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC  2864571. PMID  20230605 .
  • Страница для Lacto-usp РНК в Rfam


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Lacto-usp_RNA_motif&oldid=1188153865"