Мотив РНК STAXI

РНК-семейство
СТАКСИ РНК
Консенсусная вторичная структура РНК STAXI
Идентификаторы
СимволСТАКСИ
РфамРФ01728
Другие данные
Тип РНКмРНК
ДоменыЭнтеробактерии
Структуры PDBПДБе

Мотив РНК Ssbp , топоизомеразы, антирестрикции, XerDC интегразы ( мотив РНК STAXI ) представляет собой консервативную РНК -подобную структуру, идентифицированную с помощью биоинформатики . [1] РНК STAXI расположены рядом с генами, кодирующими белки , которые взаимодействуют с ДНК ( Ssbp , топоизомераза , интеграза XerDC ) или связаны с такими белками (антирестриктные белки, которые ингибируют рестриктазы ). Это наблюдение повысило вероятность того, что примеры мотива STAXI функционируют как одноцепочечные молекулы ДНК, возможно, во время репликации ДНК или репарации ДНК . С другой стороны, мотивы STAXI часто содержат концевые петли, соответствующие стабильной тетрапетле UNCG , но версия ДНК этой тетрапетли (TNCG) не особенно стабильна. Мотив STAXI состоит из простой структуры псевдоузла , которая повторяется два или более раз (см. диаграмму).

В том же исследовании был идентифицирован ряд других РНК, в том числе:

Ссылки

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата на структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC  2864571. PMID  20230605 .
  • Страница STAXI RNA в Rfam


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=STAXI_RNA_motif&oldid=1187749538"