СТАКСИ РНК | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | СТАКСИ |
Рфам | РФ01728 |
Другие данные | |
Тип РНК | мРНК |
Домены | Энтеробактерии |
Структуры PDB | ПДБе |
Мотив РНК Ssbp , топоизомеразы, антирестрикции, XerDC интегразы ( мотив РНК STAXI ) представляет собой консервативную РНК -подобную структуру, идентифицированную с помощью биоинформатики . [1] РНК STAXI расположены рядом с генами, кодирующими белки , которые взаимодействуют с ДНК ( Ssbp , топоизомераза , интеграза XerDC ) или связаны с такими белками (антирестриктные белки, которые ингибируют рестриктазы ). Это наблюдение повысило вероятность того, что примеры мотива STAXI функционируют как одноцепочечные молекулы ДНК, возможно, во время репликации ДНК или репарации ДНК . С другой стороны, мотивы STAXI часто содержат концевые петли, соответствующие стабильной тетрапетле UNCG , но версия ДНК этой тетрапетли (TNCG) не особенно стабильна. Мотив STAXI состоит из простой структуры псевдоузла , которая повторяется два или более раз (см. диаграмму).
В том же исследовании был идентифицирован ряд других РНК, в том числе: