Мотив РНК Whalefall-1
| Мотив РНК Whalefall-1 | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура РНК Whalefall-1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | вф-1 |
| Рфам | РФ01762 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | мРНК |
| Домены | Метагеном падения китов |
| Структуры PDB | ПДБе |
Мотив РНК Whalefall-1 (также называемый wf-1 ) относится к консервативной структуре РНК , которая была обнаружена с помощью биоинформатики . [1] [2] Структурно мотив состоит из двух стебель-петлей (см. диаграмму), вторая из которых часто заканчивается тетрапетлей CUUG , которая является энергетически выгодной последовательностью РНК. РНК Whalefall-1 обнаружены только в ДНК, извлеченной из некультивируемых бактерий, найденных на whale fall , т. е. туше кита . По состоянию на 2010 год РНК Whalefall-1 не были обнаружены ни в одном известном культивируемом виде бактерий и, таким образом, являются одной из нескольких РНК, присутствующих в образцах окружающей среды .
Ссылки
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата на структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571. PMID 20230605 .
- ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Nature . 462 (7273): 656– 9. Bibcode :2009Natur.462..656W. doi :10.1038/nature08586. PMC 4140389 . PMID 19956260.
Внешние ссылки
- Страница для Whalefall-1 РНК в Rfam
 | Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
