Онтология (информатика)
Спецификация концептуализации
Информационная наука
Общие аспекты
Связанные поля и подполя

В информационной науке онтология охватывает представление, формальное наименование и определения категорий, свойств и отношений между концепциями, данными или сущностями, которые относятся к одной, многим или всем областям дискурса . Проще говоря, онтология — это способ показать свойства предметной области и то, как они связаны, путем определения набора терминов и реляционных выражений, которые представляют сущности в этой предметной области. Область, которая изучает онтологии, задуманные таким образом, иногда называют прикладной онтологией . [1]

Каждая академическая дисциплина или область, создавая свою терминологию, тем самым закладывает основу для онтологии. Каждая использует онтологические предположения для формулирования явных теорий, исследований и приложений. Улучшенные онтологии могут улучшить решение проблем в этой области, взаимодействие систем данных и обнаруживаемость данных. Перевод исследовательских работ в каждой области — это проблема, которая упрощается, когда эксперты из разных стран поддерживают контролируемый словарь жаргона между каждым из своих языков. [2] Например, определение и онтология экономики являются основной проблемой в марксистской экономике , [3] но также и в других подотраслях экономики . [4] Пример экономики, полагающейся на информатику, возникает в случаях, когда моделирование или модель предназначены для принятия экономических решений, таких как определение того, какие капитальные активы подвержены риску и в какой степени (см. управление рисками ).

Общим для онтологий как в информатике, так и в философии является попытка представить сущности, включая как объекты, так и события, со всеми их взаимозависимыми свойствами и отношениями, в соответствии с системой категорий. В обеих областях существует значительная работа по проблемам инженерии онтологий (например, Куайн и Крипке в философии, Сова и Гуарино в информатике), [5] и дебаты относительно того, в какой степени возможна нормативная онтология (например, фундаментализм и когерентизм в философии, BFO и Cyc в искусственном интеллекте).

Некоторые считают прикладную онтологию преемницей предшествующих работ в философии. Однако многие текущие усилия больше связаны с установлением контролируемых словарей узких областей, чем с философскими первыми принципами , или с такими вопросами, как способ существования фиксированных сущностей или могут ли устойчивые объекты (например, пердурантизм и эндурантизм ) быть онтологически более первичными, чем процессы . Искусственный интеллект сохранил значительное внимание к прикладной онтологии в таких подобластях, как обработка естественного языка в машинном переводе и представлении знаний , но редакторы онтологий часто используются в ряде областей, включая биомедицинскую информатику, [6] промышленность. [7] Такие усилия часто используют инструменты редактирования онтологий, такие как Protégé . [8]

Онтология в философии

Онтология — это раздел философии , пересекающий такие области, как метафизика , эпистемология и философия языка , поскольку он рассматривает, как знание, язык и восприятие связаны с природой реальности. Метафизика занимается такими вопросами, как «что существует?» и «какова природа реальности?». Метафизика, одна из пяти традиционных ветвей философии, занимается исследованием существования через свойства, сущности и отношения, такие как отношения между частностями и универсалиями , внутренними и внешними свойствами или сущностью и существованием . Метафизика была постоянной темой для обсуждения с момента письменной истории.

Этимология

Сложное слово онтология объединяет онто- , от греческого ὄν, на ( род. ὄντος , онтос ), т. е. «бытие; то, что есть», которое является настоящим причастием глагола εἰμί, eimí , т. е. «быть, я есмь», и -λογία, -logia , т. е. «логический дискурс», см. классические соединения для этого типа словообразования. [9] [10]

Хотя этимология греческая, самая старая сохранившаяся запись самого слова, неолатинская форма ontologia , появилась в 1606 году в работе Ogdoas Scholastica Якоба Лорхарда ( Lorhardus ) и в 1613 году в Lexicon philosophicum Рудольфа Гёккеля ( Goclenius ). [11]

Первое упоминание слова «онтология» в английском языке , зафиксированное в Оксфордском словаре английского языка ( Oxford English Dictionary , электронное издание, 2008 г.), встречается в работе «Archeologia Philosophica Nova» или «Новые принципы философии» Гидеона Харви .

Формальная онтология

С середины 1970-х годов исследователи в области искусственного интеллекта (ИИ) признали, что инженерия знаний является ключом к созданию больших и мощных систем ИИ [ необходима ссылка ] . Исследователи ИИ утверждали, что они могут создавать новые онтологии как вычислительные модели , которые позволяют выполнять определенные виды автоматизированных рассуждений , что было лишь отчасти успешным . В 1980-х годах сообщество ИИ начало использовать термин онтология для обозначения как теории смоделированного мира, так и компонента систем, основанных на знаниях . В частности, Дэвид Пауэрс ввел слово онтология в ИИ для обозначения реального мира или роботизированного заземления, [12] [13] [14] опубликовав в 1990 году обзоры литературы, подчеркивающие обоснованную онтологию в связи с призывом к докладам для летнего симпозиума AAAI по машинному обучению естественному языку и онтологии, с расширенной версией, опубликованной в бюллетене SIGART и включенной в качестве предисловия к материалам. [15] Некоторые исследователи, черпая вдохновение из философских онтологий, рассматривали вычислительную онтологию как своего рода прикладную философию. [16]

В 1993 году широко цитируемая веб-страница и статья «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями» Тома Грубера [17] использовали онтологию как технический термин в компьютерной науке, тесно связанный с более ранней идеей семантических сетей и таксономий . Грубер ввел этот термин как спецификацию концептуализации :

Онтология — это описание (подобно формальной спецификации программы) концепций и отношений, которые могут формально существовать для агента или сообщества агентов. Это определение согласуется с использованием онтологии как набора определений концепций, но более общее. И это другой смысл слова, чем его использование в философии. [18]

Пытаясь дистанцировать онтологии от таксономий и аналогичных усилий по моделированию знаний , которые опираются на классы и наследование , Грубер заявил (1993):

Онтологии часто приравниваются к таксономическим иерархиям классов, определениям классов и отношению подчинения , но онтологии не обязательно должны ограничиваться этими формами. Онтологии также не ограничиваются консервативными определениями  , то есть определениями в традиционном логическом смысле, которые только вводят терминологию и не добавляют никаких знаний о мире. [19] Чтобы указать концептуализацию, нужно сформулировать аксиомы , которые ограничивают возможные интерпретации для определенных терминов. [20]

Файльмайр и Вёсс (2016) уточняют определение Грубера: «Онтология — это формальная, явная спецификация общей концептуализации, которая характеризуется высокой семантической выразительностью, необходимой для повышенной сложности» [21] .

Формальные компоненты онтологии

Современные онтологии имеют много структурных сходств, независимо от языка, на котором они выражены. Большинство онтологий описывают индивидов (экземпляры), классы (концепции), атрибуты и отношения.

Типы

Онтология домена

Онтология предметной области (или предметно-ориентированная онтология) представляет понятия, которые принадлежат к области мира, например биологии или политике. Каждая предметная онтология обычно моделирует предметно-ориентированные определения терминов. Например, слово карта имеет много разных значений. Онтология о предметной области покера будет моделировать значение слова « игральная карта », в то время как онтология о предметной области компьютерного оборудования будет моделировать значения « перфокарта » и « видеокарта ».

Поскольку онтологии доменов пишутся разными людьми, они представляют концепции очень специфическими и уникальными способами и часто несовместимы в рамках одного проекта. По мере расширения систем, которые полагаются на онтологии доменов, им часто приходится объединять онтологии доменов, вручную настраивая каждую сущность или используя комбинацию программного слияния и ручной настройки. Это представляет собой сложную задачу для разработчика онтологий. Различные онтологии в одном домене возникают из-за разных языков, разного предполагаемого использования онтологий и разного восприятия домена (на основе культурного фона, образования, идеологии и т. д.) [ требуется цитата ] .

В настоящее время объединение онтологий, которые не разрабатываются из общей верхней онтологии, является в значительной степени ручным процессом, а потому требует много времени и затрат. Доменные онтологии, которые используют одну и ту же верхнюю онтологию для предоставления набора базовых элементов, с помощью которых можно указать значения сущностей онтологии домена, могут быть объединены с меньшими усилиями. Существуют исследования обобщенных методов объединения онтологий, [22], но эта область исследований все еще продолжается, и недавнее событие — увидеть, как проблема была обойдена с помощью наличия нескольких онтологий домена, использующих одну и ту же верхнюю онтологию, как OBO Foundry .

Верхняя онтология

Верхняя онтология (или фундаментальная онтология) — это модель общих отношений и объектов, которые обычно применимы в широком диапазоне онтологий доменов. Обычно она использует базовый глоссарий , который охватывает термины и связанные описания объектов, используемые в различных соответствующих онтологиях доменов.

Стандартизированные верхние онтологии, доступные для использования, включают BFO , метод BORO , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL и DOLCE . [23] [24] WordNet некоторыми рассматривается как верхняя онтология и используется в качестве лингвистического инструмента для изучения онтологий предметной области. [25]

Гибридная онтология

Онтология Gellish является примером сочетания верхней и предметной онтологии.

Визуализация

detail of a Tree of Knowledge after Diderot & d'Alembert's Encyclopédie, by Chrétien Frédéric Guillaume Roth
Картографирование информации
Темы и области
Подходы «узел-связь»
See also

Обзор методов визуализации онтологий представлен Катифори и др. [26] Обновленный обзор методов и инструментов визуализации онтологий был опубликован Дудасом и др. [27] Наиболее известные методы визуализации онтологий, а именно визуализация с помощью отступов в виде дерева и графа, оцениваются Фу и др. [28] Визуальный язык для онтологий, представленных в OWL, определен Визуальной нотацией для онтологий OWL (VOWL) ​​[ 29]

Инженерное дело

Инженерия онтологии (также называемая построением онтологий) — это набор задач, связанных с разработкой онтологий для определенной области. [30] Это подраздел инженерии знаний , который изучает процесс разработки онтологий, жизненный цикл онтологии, методы и методологии построения онтологий, а также инструменты и языки, которые их поддерживают. [31] [32]

Онтологическая инженерия направлена ​​на то, чтобы сделать явными знания, содержащиеся в программных приложениях, и организационные процедуры для определенной области. Онтологическая инженерия предлагает направление для преодоления семантических препятствий, таких как те, которые связаны с определениями бизнес-терминов и классов программного обеспечения. Известные проблемы с онтологической инженерией включают:

  1. Обеспечение актуальности онтологии с учетом знаний предметной области и использования терминов
  2. Обеспечение достаточной конкретности и охвата концепций для интересующей области, что позволяет минимизировать проблему полноты контента
  3. Обеспечение поддержки онтологией вариантов ее использования

Редакторы

Редакторы онтологий — это приложения, разработанные для помощи в создании или манипулировании онтологиями. Обычно редакторы онтологий используют один или несколько языков онтологий .

Аспекты редакторов онтологий включают: возможности визуальной навигации в рамках модели знаний , механизмы вывода и извлечения информации ; поддержку модулей; импорт и экспорт иностранных языков представления знаний для сопоставления онтологий ; и поддержку метаонтологий, таких как OWL-S , Dublin Core и т. д. [33]

Обучение

Обучение онтологии — это автоматическое или полуавтоматическое создание онтологий, включая извлечение терминов домена из текста на естественном языке. Поскольку создание онтологий вручную является чрезвычайно трудоемким и занимает много времени, существует большая мотивация для автоматизации этого процесса. Извлечение информации и интеллектуальный анализ текста были исследованы для автоматического связывания онтологий с документами, например, в контексте задач BioCreative. [34]

Исследовать

Эпистемологические предположения, которые в исследовании спрашивают «Что вы знаете?» или «Откуда вы это знаете?», создают основу, которую исследователи используют при подходе к определенной теме или области для потенциального исследования. Поскольку эпистемология напрямую связана со знаниями и тем, как мы приходим к принятию определенных истин, люди, проводящие академические исследования, должны понимать, что позволяет им начать строить теории. Проще говоря, эпистемологические предположения заставляют исследователей задаваться вопросом, как они приходят к имеющимся у них знаниям. [ необходима цитата ]

Языки

Язык онтологии — это формальный язык, используемый для кодирования онтологии. Существует ряд таких языков для онтологий, как собственных, так и основанных на стандартах:

  • Common Algebraic Specification Language — это общий язык спецификаций на основе логики, разработанный в рабочей группе IFIP 1.3 «Основы системных спецификаций», и фактически являющийся стандартным языком для спецификаций программного обеспечения. В настоящее время он применяется к спецификациям онтологий для обеспечения модульности и механизмов структурирования.
  • Общей логикой является стандарт ISO 24707, спецификация семейства языков онтологий, которые могут быть точно переведены друг на друга.
  • Проект Cyc имеет собственный язык онтологии под названием CycL , основанный на исчислении предикатов первого порядка с некоторыми расширениями более высокого порядка.
  • DOGMA (Developing Ontology-Grounded Methods and Applications) использует подход моделирования, ориентированный на факты, для обеспечения более высокого уровня семантической стабильности.
  • Язык Gellish включает правила для своего собственного расширения и, таким образом, интегрирует онтологию с языком онтологии.
  • IDEF5 — это метод разработки программного обеспечения для разработки и поддержки удобных, точных онтологий предметной области.
  • KIF — это синтаксис для логики первого порядка , основанный на S-выражениях . SUO-KIF — это производная версия, поддерживающая рекомендуемую верхнюю объединенную онтологию .
  • MOF и UML являются стандартами OMG
  • Olog — это теоретико-категорный подход к онтологиям, делающий акцент на переводах между онтологиями с использованием функторов .
  • OBO — язык, используемый для биологических и биомедицинских онтологий.
  • OntoUML — это онтологически обоснованный профиль UML для концептуального моделирования онтологий предметных областей.
  • OWL — это язык для создания онтологических утверждений, разработанный как продолжение RDF и RDFS , а также более ранних проектов языков онтологий, включая OIL , DAML и DAML+OIL . OWL предназначен для использования во Всемирной паутине , и все его элементы (классы, свойства и индивиды) определяются как ресурсы RDF и идентифицируются с помощью URI .
  • Формат обмена правилами (RIF) и F-Logic объединяют онтологии и правила.
  • Язык семантического проектирования приложений (SADL) [35] охватывает подмножество выразительных возможностей OWL , используя язык, похожий на английский, вводимый через подключаемый модуль Eclipse .
  • SBVR (Семантика бизнес-словарей и правил) — это стандарт OMG, принятый в отрасли для построения онтологий.
  • Проект TOVE , проект виртуального предприятия TOronto

Опубликованные примеры

  • Арабская онтология , лингвистическая онтология для арабского языка, которая может использоваться как арабский Wordnet, но с онтологически чистым содержанием. [36]
  • AURUM – Информационная безопасность Онтология, [37] Онтология для обмена знаниями по информационной безопасности , позволяющая пользователям совместно понимать и расширять тело знаний домена. Она может служить основой для автоматизированного управления рисками информационной безопасности и соответствия.
  • BabelNet — очень большая многоязычная семантическая сеть и онтология, лексикализованная на многих языках
  • Базовая формальная онтология [ 38] — формальная верхняя онтология, предназначенная для поддержки научных исследований.
  • BioPAX, [39] онтология для обмена и взаимодействия данных биологических путей (клеточных процессов)
  • BMO, [40] онтология модели электронного бизнеса, основанная на обзоре корпоративных онтологий и литературы по бизнес-моделям.
  • SSBMO, [41] онтология строго устойчивой бизнес-модели, основанная на обзоре системной естественнонаучной и социальной научной литературы (включая бизнес). Включает критику и существенные расширения онтологии бизнес-модели (BMO).
  • CCO и GexKB, [42] Онтологии приложений (APO), которые интегрируют различные типы знаний с Онтологией клеточного цикла (CCO) и Базой знаний по экспрессии генов (GexKB)
  • CContology (онтология жалоб клиентов) [43] — онтология электронного бизнеса для поддержки управления жалобами клиентов в режиме онлайн.
  • Концептуальная эталонная модель CIDOC , онтология культурного наследия [44]
  • COSMO, [45] онтология Foundation (текущая версия в OWL), которая разработана для того, чтобы содержать представления всех примитивных концепций, необходимых для логического указания значений любой сущности домена. Она предназначена для использования в качестве базовой онтологии, которая может использоваться для перевода между представлениями в других онтологиях или базах данных. Она началась как слияние основных элементов онтологий OpenCyc и SUMO и была дополнена другими элементами онтологии (типами, отношениями), чтобы включить представления всех слов в словаре Longman, определяющем словарный запас .
  • Онтология компьютерных наук , автоматически сгенерированная онтология тем исследований в области компьютерных наук
  • Cyc , большая фундаментальная онтология для формального представления вселенной дискурса
  • Онтология заболеваний [46] , разработанная для облегчения сопоставления заболеваний и связанных с ними состояний с конкретными медицинскими кодами.
  • DOLCE , описательная онтология для лингвистической и когнитивной инженерии [23] [24]
  • Драма, онтология драмы [47]
  • Dublin Core , простая онтология для документов и публикаций
  • Financial Industry Business Ontology (FIBO), концептуальная онтология бизнеса для финансовой отрасли [48]
  • Основополагающие, основные и лингвистические онтологии [49]
  • Фундаментальная модель анатомии , [50] онтология анатомии человека
  • Друг друга , онтология для описания людей, их деятельности и их отношений с другими людьми и объектами
  • Генная онтология для геномики
  • Словарь английского языка Gellish — онтология, включающая словарь и таксономию, включающую верхнюю онтологию и нижнюю онтологию, ориентированную на промышленные и деловые приложения в области инжиниринга, технологий и закупок.
  • Геополитическая онтология — онтология, описывающая геополитическую информацию, созданная Продовольственной и сельскохозяйственной организацией (ФАО). Геополитическая онтология включает названия на нескольких языках (английский, французский, испанский, арабский, китайский, русский и итальянский); отображает стандартные системы кодирования (ООН, ИСО, FAOSTAT, AGROVOC и т. д.); обеспечивает отношения между территориями (сухопутные границы, членство в группах и т. д.); и отслеживает исторические изменения. Кроме того, ФАО предоставляет веб-сервисы геополитической онтологии и конструктор модулей для загрузки модулей геополитической онтологии в различные форматы (RDF, XML и EXCEL). Более подробную информацию см. в разделе Профили стран ФАО .
  • GAO (General Automotive Ontology) – онтология для автомобильной промышленности, включающая расширения «автомобиль» [51]
  • GOLD, [52] Общая онтология для лингвистического описания
  • GUM (Обобщенная верхняя модель) [53] лингвистически мотивированная онтология для посредничества между клиентскими системами и технологией естественного языка.
  • IDEAS Group [ 54] — формальная онтология для архитектуры предприятия, разрабатываемая министерствами обороны Австралии, Канады, Великобритании и США.
  • База ссылок [55] — формальное представление биомедицинской области, основанное на базовой формальной онтологии.
  • LPL, язык знаковых шаблонов [56]
  • NCBO Bioportal, [57] биологические и биомедицинские онтологии и связанные с ними инструменты для поиска, просмотра и визуализации
  • Онтологии NIFSTD из Neuroscience Information Framework : модульный набор онтологий для области нейронауки.
  • OBO-Edit, [58] браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий
  • OBO Foundry , [59] набор совместимых справочных онтологий в области биологии и биомедицины
  • Онтология OMNIBUS [60] онтология обучения, обучения и проектирования учебных материалов
  • Онтология для биомедицинских исследований , интегрированная онтология биологических и клинических исследований с открытым доступом
  • ONSTR, [61] Онтология для последующего наблюдения за новорожденными и трансляционных исследований, Совместная интеграция данных последующего наблюдения за новорожденными, Университет Эмори, Атланта.
  • Онтология растений [62] для структур растений, стадий роста/развития и т. д.
  • POPE, Purdue Ontology для фармацевтической инженерии
  • PRO, [63] Белковая онтология информационного ресурса по белкам, Джорджтаунский университет
  • ProbOnto , база знаний и онтология вероятностных распределений . [64] [65]
  • Таксономия абстракции программы [ необходима ссылка ]
  • Онтология белков [66] для протеомики
  • RXNO Ontology , для наименования реакций в химии
  • SCDO (онтология серповидноклеточной анемии) [67] облегчает обмен данными и сотрудничество в сообществе SDC, а также ряд других приложений (см. список на веб-сайте SCDO).
  • Schema.org — для встраивания структурированных данных в веб-страницы, в первую очередь для поисковых систем.
  • Онтология последовательностей [68] для представления типов геномных признаков, обнаруженных в биологических последовательностях
  • SNOMED CT (Систематизированная номенклатура медицинских препаратов – клинические термины)
  • Предложенная верхняя объединенная онтология , [69] формальная верхняя онтология
  • Системная биологическая онтология (SBO) для вычислительных моделей в биологии
  • SWEET, [70] Семантическая сеть для терминологии Земли и окружающей среды
  • SSN/SOSA, [71] Онтология семантической сенсорной сети (SSN) и онтология датчиков, наблюдений, образцов и исполнительных механизмов (SOSA) являются рекомендациями W3C и стандартами OGC для описания датчиков и их наблюдений.
  • Онтология ThoughtTreasure
  • TIME-ITEM , Темы для индексации медицинского образования
  • Уберон , [72] представляющий анатомические структуры животных
  • UMBEL , легкая справочная структура из 20 000 классов концепций субъектов и их взаимосвязей, полученных из OpenCyc
  • WordNet , лексическая справочная система
  • ЯМАТО, [73] Еще одна более продвинутая онтология верхнего уровня
  • YSO – Общая финская онтология

Проект сообщества W3C Linking Open Data координирует попытки объединить различные онтологии в мировую семантическую паутину .

Библиотеки

Развитие онтологий привело к появлению сервисов, предоставляющих списки или каталоги онтологий, называемых библиотеками онтологий.

Ниже приведены библиотеки онтологий, выбранных человеком.

  • COLORE [74] — открытый репозиторий онтологий первого порядка в Common Logic с формальными связями между онтологиями в репозитории.
  • Библиотека онтологий DAML [75] поддерживает наследие онтологий в DAML.
  • Портал Ontology Design Patterns [76] представляет собой вики-репозиторий повторно используемых компонентов и практик для проектирования онтологий, а также поддерживает список образцовых онтологий .
  • Библиотека онтологий Protégé [77] содержит набор онтологий OWL, Frame-based и других форматов.
  • SchemaWeb [78] — это каталог схем RDF, выраженных в RDFS, OWL и DAML+OIL.

Ниже приведены как каталоги, так и поисковые системы.

  • OBO Foundry — это набор совместимых справочных онтологий в области биологии и биомедицины. [59] [79]
  • Биопортал (хранилище онтологий NCBO) [6]
  • Связанные открытые словари
  • OntoSelect [80] Библиотека онтологий предлагает аналогичные услуги для онтологий RDF/S, DAML и OWL.
  • Ontaria [81] — это «доступный для поиска и просмотра каталог семантических веб-данных» с упором на словари RDF с онтологиями OWL. (Примечание: проект «приостановлен» с 2004 года).
  • Swoogle — это каталог и поисковая система для всех ресурсов RDF, доступных в Интернете, включая онтологии.
  • Инициатива Открытого Репозитория Онтологии [82]
  • ROMULUS — это репозиторий фундаментальных онтологий, нацеленный на улучшение семантической интероперабельности. В настоящее время в репозитории есть три фундаментальных онтологии: DOLCE , BFO и GFO . [83]

Примеры применения

В целом онтологии могут быть с пользой использованы в нескольких областях.

  • Корпоративные приложения. [84] Более конкретным примером является SAPPHIRE (здравоохранение) или Situational Awareness and Preparedness for Public Health Incidences and Reasoning Engines , которая представляет собой основанную на семантике информационную систему здравоохранения , способную отслеживать и оценивать ситуации и явления, которые могут повлиять на общественное здоровье .
  • Географические информационные системы объединяют данные из разных источников и поэтому извлекают пользу из онтологических метаданных, которые помогают связать семантику данных. [85]
  • Онтологии, специфичные для домена, чрезвычайно важны в биомедицинских исследованиях, которые требуют устранения неоднозначности именованных сущностей различных биомедицинских терминов и сокращений, которые имеют одинаковую строку символов, но представляют разные биомедицинские концепции. Например, CSF может представлять Colony Stimulating Factor или Cerebral Spinal Fluid, оба из которых представлены одним и тем же термином, CSF, в биомедицинской литературе. [86] Вот почему большое количество публичных онтологий связано с науками о жизни. Инструменты науки о данных в области естественных наук, которые не реализуют эти типы биомедицинских онтологий, не смогут точно определить причинно-следственные связи между концепциями. [87]

Смотрите также

Связанные философские концепции

Ссылки

  1. ^ Дейл Жакетт (2002-11-26). Онтология. McGill–Queen's University Press . стр. 4. ISBN 9780773582675. Прикладная онтология как дисциплина или область является научной в том смысле, что она применяет определение бытия для определения онтологических обязательств других дисциплин, в частности, но не исключительно, в естественных науках, во многом таким же образом, как прикладная математика в инженерии связана с чистой математикой.
  2. ^ Г. Будин (2005), «Управление переводами на основе онтологий», в Хелле В. Дам (редактор), « Системы знаний и перевод» , Ян Энгберг, Хайдрун Герзимиш-Арбогаст, Вальтер де Грюйтер, стр. 113, ISBN 978-3-11-018297-2
  3. ^ Палермо, Джулио (10 января 2007 г.). «Онтология экономической власти при капитализме: мейнстримная экономика и Маркс». Cambridge Journal of Economics . 31 (4): 539–561. doi :10.1093/cje/bel036 – через Oxford Journals.
  4. ^ Зунига, Глория Л. (1999-02-02). "Онтология экономических объектов". Mpra Paper . Исследовательский отдел Федерального резервного банка Сент-Луиса . Получено 2013-06-16 .
  5. ^ Sowa, JF (1995). «Онтологические категории верхнего уровня». International Journal of Human-Computer Studies . 43 (5–6 (ноябрь/декабрь)): 669–85. doi :10.1006/ijhc.1995.1068.
  6. ^ ab {Биопортал
  7. ^ Промышленные онтологии Foundry
  8. ^ Musen, Mark (2015). «Проект Protégé: взгляд назад и взгляд вперед». AI Matters . 1 (4): 4–12. doi :10.1145/2757001.2757003. PMC 4883684. PMID  27239556 . 
  9. ^ "онтология". Онлайн-словарь этимологии .
  10. ^ εἰμί. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  11. ^ Смит, Барри (2022). «Рождение онтологии». Журнал структур и систем знаний . 3 : 57–66.
  12. ^ Пауэрс, Дэвид (1983). «Интеллектуальные роботы». Electronics Today International .
  13. ^ Пауэрс, Дэвид (1984). «Естественный язык естественным образом». Computer Compacts . 2 (3–4): 100–109. doi :10.1016/0167-7136(84)90088-X.
  14. ^ Пауэрс, Дэвид; Турк, Крис (1989). Машинное обучение естественному языку . Springer-Verlag. ISBN 978-1-4471-1697-4.
  15. ^ Пауэрс, Дэвид (1991). Предисловие: Цели, проблемы и направления в машинном обучении естественному языку и онтологии . Весенний симпозиум AAAI по машинному обучению естественному языку и онтологии. DFKI.
  16. ^ Грубер, Т. (2008). «Онтология». В Лю, Лин ; Озсу, М. Тамер (ред.). Энциклопедия систем баз данных . Springer-Verlag. ISBN 978-0-387-49616-0.
  17. ^ Грубер, Т. (1993). «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями». Международный журнал исследований взаимодействия человека и компьютера . 43 (5–6): 907–928. doi : 10.1006/ijhc.1995.1081 . S2CID  1652449.
  18. ^ Грубер, Т. (2001). «Что такое онтология?». Стэнфордский университет . Архивировано из оригинала 2010-07-16 . Получено 2009-11-09 .
  19. ^ Эндертон, Х. Б. (1972-05-12). Математическое введение в логику (1-е изд.). Сан-Диего, Калифорния: Academic Press. стр. 295. ISBN 978-0-12-238450-9.2-е издание; 5 января 2001 г.
  20. ^ Грубер, Томас Р. (июнь 1993 г.). «Подход к переводу спецификаций переносимых онтологий» (PDF) . Приобретение знаний . 5 (2): 199–220. CiteSeerX 10.1.1.101.7493 . doi :10.1006/knac.1993.1008. S2CID  15709015. 
  21. ^ Файльмайр, Кристина; Вёсс, Вольфрам (2016). «Анализ онтологий и их факторов успеха для применения в бизнесе». Data & Knowledge Engineering . 101 : 1–23. doi :10.1016/j.datak.2015.11.003.
  22. ^ "Проект: Динамическое восстановление онтологии". Эдинбургский университет, кафедра информатики . Получено 2 января 2012 г.
  23. ^ ab "Лаборатория прикладной онтологии - DOLCE". Лаборатория прикладной онтологии (LOA) . Получено 10 февраля 2011 г.
  24. ^ ab "OWL-версия DOLCE+DnS". Semantic Technology Lab . Получено 21 февраля 2013 г.
  25. ^ Навильи, Роберто; Веларди, Паола (2004). «Изучение онтологий предметной области из хранилищ документов и специализированных веб-сайтов». Computational Linguistics . 30 (2). MIT Press: 151–179. CiteSeerX 10.1.1.329.6965 . doi :10.1162/089120104323093276. S2CID  2453822. 
  26. ^ Катифори, А.; Халацис, К.; Лепурас, Г.; Василакис, К.; Джаннопулу, Э. (2007). «Методы визуализации онтологий. Обзор» (PDF) . Обзоры вычислительной техники ACM . 39 (4): 10. CiteSeerX 10.1.1.330.3281 . дои : 10.1145/1287620.1287621. S2CID  14205872. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года. 
  27. ^ Дудас, М.; Ломанн, С.; Сватек, В.; Павлов, Д. (2018). «Методы и инструменты визуализации онтологий: обзор современного состояния дел». Обзор инженерии знаний . 33 (e10). doi :10.1017/S0269888918000073. S2CID  52965103.
  28. ^ Фу, Бо; Ной, Наталья Ф.; Стори, Маргарет-Энн (2013). «Отступы дерева или графа? Исследование удобства использования методов визуализации онтологий в контексте оценки отображения классов». Семантическая паутина – ISWC 2013: 12-я Международная конференция по семантической паутине, Сидней, Новый Южный Уэльс, Австралия, 21–25 октября 2013 г., Труды, часть I. Конспект лекций по информатике. Том 8218. Берлин: Springer. стр. 117–134. doi : 10.1007/978-3-642-41335-3_8 . ISBN 978-3-642-41335-3.
  29. ^ Негру, Стефан; Ломанн, Штеффен; Хааг, Флориан (7 апреля 2014 г.). "VOWL: Визуальная нотация для онтологий OWL: спецификация версии 2.0". Visual Data Web .
  30. ^ Пушар, Лайн; Ивезич, Ненад; Шленофф, Крейг (март 2000 г.). «Разработка онтологий для распределенного взаимодействия в производстве» (PDF) . Труды конференции AIS2000 .
  31. ^ Гомес-Перес, Аскуньон; Фернандес-Лопес, Мариано; Корчо, Оскар (2004). Онтологическая инженерия: с примерами из областей управления знаниями, электронной коммерции и семантической сети (1-е изд.). Спрингер. п. 403. ИСБН 978-1-85233-551-9.
  32. ^ Де Никола, Антонио; Миссикофф, Мишель; Навильи, Роберто (2009). «Подход к разработке программного обеспечения для построения онтологий» (PDF) . Информационные системы . 34 (2). Elsevier: 258–275. doi :10.1016/j.is.2008.07.002.
  33. ^ Алатриш, Эмхимед (2013). «Сравнение некоторых редакторов онтологий» (PDF) . Системы управления информацией . 8 (2): 18–24.
  34. ^ Krallinger, M; Leitner, F; Vazquez, M; Salgado, D; Marcelle, C; Tyers, M; Valencia, A; Chatr-Aryamontri, A (2012). «Как связать онтологии и белок-белковые взаимодействия с литературой: подходы к интеллектуальному анализу текста и опыт биотворчества». База данных . 2012 : bas017. doi :10.1093/database/bas017. PMC 3309177. PMID  22438567 . 
  35. ^ "SADL". SourceForge . Получено 10 февраля 2011 г. .
  36. ^ Джаррар, Мустафа (2021). «Арабская онтология — арабская сеть слов с онтологически чистым содержанием». Прикладная онтология . 16 : 1–26. arXiv : 2205.09664 . doi : 10.3233/AO-200241. S2CID  231886117.
  37. ^ "AURUM - Информационная безопасность Онтология" . Получено 29 января 2016 г.
  38. ^ "Базовая формальная онтология (BFO)". Институт формальной онтологии и медицинской информатики (IFOMIS).
  39. ^ "BioPAX". Архивировано из оригинала 25 июня 2011 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  40. ^ Остервальдер, Александр; Пиньёр, Ив (17–19 июня 2002 г.). Онтология модели электронного бизнеса для моделирования электронного бизнеса (PDF) . 15-я Бледская электронная конференция , Словения . Архивировано из оригинала (PDF) 2011-04-19.
  41. ^ Upward, Энтони; Джонс, Питер (2016). «Онтология для строго устойчивых бизнес-моделей: определение корпоративной структуры, совместимой с естественными и социальными науками». Организация и окружающая среда . 29 (1): 97–123. doi :10.1177/1086026615592933. S2CID  145089240.
  42. ^ "О CCO и GexKB". Семантическая системная биология. Архивировано из оригинала 2012-07-30.
  43. ^ "CContology" . Получено 10 февраля 2011 г.
  44. ^ "Концептуальная эталонная модель CIDOC (CRM)" . Получено 10 февраля 2011 г.
  45. ^ "COSMO". MICRA Inc. Получено 10 февраля 2011 г.
  46. ^ Osborne, JD; Flatow, J; Holko, M; Lin, SM; Kibbe, WA; Zhu, LJ; Danila, MI; Feng, G; Chisholm, RL (2009). «Аннотирование генома человека с помощью онтологии заболеваний». BMC Genomics . 10 (Suppl 1): S6. doi : 10.1186/1471-2164-10-S1-S6 . PMC 2709267. PMID  19594883 . 
  47. ^ Ломбардо, Винченцо; Дамиано, Россана; Пиццо, Антонио (2018). «Драма: всеобъемлющий онтологический ресурс по драме». Семантическая паутина — ISWC 2018. Конспект лекций по информатике. Том 11137. Springer. С. 103–118. doi :10.1007/978-3-030-00668-6_7. ISBN 978-3-030-00667-9. Получено 11 июля 2024 г. .
  48. ^ "Financial Industry Business Ontology (FIBO)" . Получено 15 марта 2017 г. .
  49. ^ "Основные, основные и лингвистические онтологии" . Получено 10 февраля 2011 г.
  50. ^ "Foundational Model of Anatomy" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  51. ^ "Car Extension". Архивировано из оригинала 8 декабря 2018 года . Получено 15 июня 2017 года .
  52. ^ "ЗОЛОТО: запись на FAIRsharing.org" . Получено 29 июля 2024 г. .
  53. ^ "Обобщенная верхняя модель" . Получено 10 февраля 2011 г.
  54. ^ "The IDEAS Group Website". Архивировано из оригинала 16 декабря 2018 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  55. ^ "Linkbase". Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  56. ^ Справочное руководство по консоли конфигурации: язык шаблонов Landmark (LPL) Архивировано 04.02.2020 на Wayback Machine . Получено 4 февраля 2020 г.
  57. ^ "Биопортал". Национальный центр биологической онтологии (NCBO). Архивировано из оригинала 2009-06-12 . Получено 2013-10-24 .
  58. ^ «Браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий». Проект Berkeley Bioinformatics Open Source (BBOP).
  59. ^ ab «Открытые биологические и биомедицинские онтологии». Проект Berkeley Bioinformatics Open Source (BBOP).
  60. ^ "OMNIBUS Ontology". Архивировано из оригинала 19 июля 2012 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  61. ^ "ONSTR". Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 года . Получено 16 апреля 2014 года .
  62. ^ "Plant Ontology" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  63. ^ "PRO". Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  64. ^ "ProbOnto" . Получено 1 июля 2017 г.
  65. ^ Swat, MJ; Grenon, P; Wimalaratne, S (2016). «ProbOnto: онтология и база знаний вероятностных распределений». Биоинформатика . 32 (17): 2719–21. doi :10.1093/bioinformatics/btw170. PMC 5013898. PMID  27153608 . 
  66. ^ "Protein Ontology". Архивировано из оригинала 10 марта 2011 г. Получено 10 февраля 2011 г.
  67. ^ Нембавер, Виктория; Мазанду, Гастон К.; Хочкисс, Джейд; Сафари Серуфури, Жан-Мишель; Кент, Джилл; Кенгне, Андре Паскаль; Ани, Кофи; Мунунг, Нчангви Синтия; Букини, Дайма; Битунги, Валентина Жозиан Нго; Мунубе, Деогратиас (01 октября 2020 г.). «Онтология серповидноклеточной болезни: обеспечение возможности совместных исследований и совместной разработки новых приложений для планетарного здравоохранения». OMICS: Журнал интегративной биологии . 24 (10): 559–567. дои : 10.1089/omi.2020.0153. ПМК 7549008 . ПМИД  33021900. 
  68. ^ Eilbeck K, Lewis SE , Mungall CJ, Yandell M, Stein L , Durbin R , Ashburner M (2005). «Онтология последовательностей: инструмент для объединения аннотаций генома». Genome Biology . 6 (5): R44. doi : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . PMC 1175956. PMID  15892872 . 
  69. ^ Найлз, И. и Пиз, А. (2001), На пути к стандартной верхней онтологии, в Трудах 2-й Международной конференции по формальной онтологии в информационных системах (FOIS-2001), под ред. Криса Уэлти и Барри Смита, стр. 2–9.
  70. ^ "SWEET" . Получено 11 марта 2022 г. .
  71. ^ "SSN" . Получено 10 ноября 2021 г.
  72. ^ Mungall, CJ; Torniai, C; Gkoutos, GV; Lewis, SE; Haendel, MA (2012). «Uberon, интегративная многовидовая анатомическая онтология». Genome Biol . 13 (1): R5. doi : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . PMC 3334586. PMID  22293552 . 
  73. ^ "YAMATO". Архивировано из оригинала 3 марта 2011 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  74. ^ "COLORE". Архивировано из оригинала 28 августа 2011 года . Получено 4 мая 2011 года .
  75. ^ "DAML Ontology Library" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  76. ^ "ODP Library". Архивировано из оригинала 13 октября 2015 года . Получено 21 февраля 2013 года .
  77. ^ "Protege Ontology Library" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  78. ^ "SchemaWeb". Архивировано из оригинала 10 августа 2011 г. Получено 10 февраля 2011 г.
  79. ^ Смит, Б .; Эшбёрнер, М .; Россе, К.; Бард, Дж.; Баг, В.; Кёстерс, В.; Голдберг, Л.Дж.; Эйлбек, К.; Айрленд, А.; Мангалл, К.Дж.; Леонтис, Н.; Рокка-Серра, П.; Руттенберг, А.; Сансоне, С.А.; Шейерманн, Р.Х.; Шах, Н.; Ветцель, ПЛ; Льюис, С. (2007). «OBO Foundry: Скоординированная эволюция онтологий для поддержки интеграции биомедицинских данных». Nature Biotechnology . 25 (11): 1251–1255. doi :10.1038/nbt1346. PMC 2814061. PMID  17989687 .  Значок открытого доступа
  80. ^ "OntoSelect". Архивировано из оригинала 11 ноября 2010 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  81. ^ "Онтария" . Получено 10 февраля 2011 г.
  82. ^ "OpenOntologyRepository - OntologPSMW". ontologforum.org . Получено 28.03.2019 .
  83. ^ Хан, Зубейда Касмод; Кит, С. Мария (2013). "Библиотека фундаментальных онтологий ROMULUS". Model and Data Engineering . Lecture Notes in Computer Science. Vol. 8216. pp. 200–211. doi :10.1007/978-3-642-41366-7_17. ISBN 978-3-642-41365-0. S2CID  1925510 . Получено 25 июня 2023 г. .
  84. ^ Оберле, Дэниел (2014). «Как онтологии приносят пользу корпоративным приложениям» (PDF) . Semantic Web . 5 (6). IOS Press: 473–491. doi :10.3233/SW-130114.
  85. ^ Фрэнк, Эндрю У. (2001). «Уровни онтологии и ограничения согласованности в географических информационных системах». Международный журнал географической информационной науки . 15 (7): 667–678. Bibcode : 2001IJGIS..15..667F. doi : 10.1080/13658810110061144. S2CID  6616354.
  86. ^ Стивенсон, Марк; Го, Икунь (2010). «Устранение неоднозначности неоднозначных биомедицинских терминов с использованием примеров, полученных из метатезауруса UMLS». Журнал биомедицинской информатики . 43 (5): 762–773. doi : 10.1016/j.jbi.2010.06.001 . PMID  20541624.
  87. ^ Боденрейдер, О.; Митчелл, JA; МакКрей, AT (2003). «Биомедицинские онтологии». Биокомпьютинг 2004. С. 164–165. doi :10.1142/9789812704856_0016. ISBN 978-981-238-598-7. PMC  4300097 . PMID  15759615.

Дальнейшее чтение

  • Оберле, Д.; Гуарино, Н.; Стааб, С. (2009). «Что такое онтология?» (PDF) . Справочник по онтологиям . стр. 1–17. дои : 10.1007/978-3-540-92673-3_0. ISBN 978-3-540-70999-2. S2CID  8522608.
  • Фенсель, Д.; ван Хармелен, Ф.; Хоррокс, И.; МакГиннесс, Д.Л.; Патель-Шнайдер, П.Ф. (2001). «OIL: онтологическая инфраструктура для семантической паутины». IEEE Intelligent Systems . 16 (2): 38–45. doi :10.1109/5254.920598.
  • Гангеми, А.; Пресутти, В. «Шаблоны проектирования онтологий» (PDF) . Стааб и Штудер 2009 .[ постоянная мертвая ссылка ‍ ]
  • Golemati, M.; Katifori, A.; Vassilakis, C.; Lepouras, G.; Halatsis, C. (2007). "Создание онтологии для метода и приложений профиля пользователя" (PDF) . Труды первой международной конференции IEEE по проблемам исследований в области информационной науки (RCIS), Марокко, 2007 г. . CiteSeerX  10.1.1.74.9399 . Архивировано из оригинала (PDF) 2008-12-17.
  • Mizoguchi, R. (2004). "Учебник по онтологической инженерии: Часть 3: Расширенный курс онтологической инженерии" (PDF) . New Gener Comput . 22 : 193–220. doi :10.1007/BF03040960. S2CID  23747079. Архивировано из оригинала (PDF) 2013-03-09 . Получено 2009-06-08 .
  • Gruber, TR (1993). "Подход к переводу спецификаций переносимых онтологий" (PDF) . Knowledge Acquisition . 5 (2): 199–220. CiteSeerX  10.1.1.101.7493 . doi :10.1006/knac.1993.1008. S2CID  15709015.
  • Maedche, A.; Staab, S. (2001). «Изучение онтологий для семантической паутины». IEEE Intelligent Systems . 16 (2): 72–79. doi :10.1109/5254.920602. S2CID  1411149.
  • Noy, Natalya F.; McGuinness, Deborah L. (март 2001 г.). "Ontology Development 101: A Guide to Creating Your First Ontology". Технический отчет Stanford Knowledge Systems Laboratory KSL-01-05, Технический отчет Stanford Medical Informatics SMI-2001-0880. Архивировано из оригинала 2010-07-14.
  • Чаминда Абейсиривардана, Прабат; Кодитувакку, Салука Р. (2012). «Извлечение информации на основе онтологии для изучения заболеваний». Международный журнал исследований в области компьютерных наук . 2 (6): 7–19. arXiv : 1211.3497 . Bibcode :2012arXiv1211.3497C. doi :10.7815/ijorcs.26.2012.051. S2CID  11297019.
  • Razmerita, L.; Angehrn, A.; Maedche, A. (2003). "Ontology-Based User Modeling for Knowledge Management Systems". User Modeling 2003. Lecture Notes in Computer Science. Vol. 2702. Springer. pp. 213–7. CiteSeerX  10.1.1.102.4591 . doi :10.1007/3-540-44963-9_29. ISBN 3-540-44963-9.
  • Soylu, A.; De Causmaecker, Patrick (2009). «Объединение подходов к разработке систем на основе моделей и онтологий с перспективой всепроникающих вычислений». Труды 24-го Международного симпозиума по компьютерным и информационным наукам . С. 730–5. doi :10.1109/ISCIS.2009.5291915. ISBN 978-1-4244-5021-3. S2CID  2267593.
  • Смит, Б. (2008). «Онтология (наука)». В Эшенбах, К.; Грунингер, М. (ред.). Формальная онтология в информационных системах, Труды FOIS 2008. ISO Press. стр. 21–35. CiteSeerX  10.1.1.681.2599 .
  • Staab, S.; Studer, R. , ред. (2009). «Что такое онтология?». Справочник по онтологиям (2-е изд.). Springer. стр. 1–17. doi :10.1007/978-3-540-92673-3_0. ISBN 978-3-540-92673-3. S2CID  8522608.
  • Uschold, Mike; Gruninger, M. (1996). «Онтологии: принципы, методы и приложения». Knowledge Engineering Review . 11 (2): 93–136. CiteSeerX  10.1.1.111.5903 . doi :10.1017/S0269888900007797. S2CID  2618234.
  • Пидкок, У. «В чем разница между словарем, таксономией, тезаурусом, онтологией и метамоделью?». Архивировано из оригинала 14.10.2009.
  • Юдельсон, М.; Гаврилова, Т.; Брусиловский, П. (2005). «К метаонтологии моделирования пользователей». Моделирование пользователей 2005. Конспект лекций по информатике. Том 3538. Springer. С. 448–452. CiteSeerX  10.1.1.86.7079 . doi :10.1007/11527886_62. ISBN 978-3-540-31878-1.
  • Мовшовиц-Аттиас, Дана; Коэн, Уильям У. (2012). «Самозагрузка биомедицинских онтологий для научного текста с использованием NELL» (PDF) . Труды семинара 2012 года по биомедицинской обработке естественного языка . Ассоциация компьютерной лингвистики. стр. 11–19. CiteSeerX  10.1.1.376.2874 .
На Викискладе есть медиафайлы по теме «Онтология» .
В Scholia имеется тематический профиль по онтологии (информатика) .
  • Представление знаний в проекте Open Directory
  • Библиотека онтологий (Архив, Не поддерживается)
  • GoPubMed использует онтологии для поиска
  • ONTOLOG (также известный как «Форум Онтологов») — открытое международное виртуальное сообщество специалистов по онтологии, онтологической инженерии и семантическим технологиям.
  • Использование онтологий в обработке естественного языка
  • Ontology Summit — ежегодная серия мероприятий (впервые стартовала в 2006 году), в которой участвуют онтологическое сообщество и сообщества, связанные с ежегодной темой, выбранной для саммита.
  • Стандартизация онтологий
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ontology_(information_science)&oldid=1252901600"