вирус Лловиу Куева | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирус |
Королевство: | Орторнавирусы |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Монхивирицеты |
Заказ: | Мононегавирусы |
Семья: | Филовирусы |
Род: | Куевавирус |
Разновидность: | вирус Лловиу Куева |
Вирус участника | |
Вирус Лловиу (LLOV) |
Вид Lloviu cuevavirus ( / ˈ j ɒ v j uː ˌ k w ɛ v ə ˈ v aɪ r ə s / YOV -ew KWEV -ə- VY -rəs ) является таксономическим домом вируса, который образует нитевидный вирион, вируса Lloviu (LLOV). Вид включен в род Cuevavirus . [1] [2] LLOV является дальним родственником общеизвестных вирусов Эбола и Марбурга .
Вид Lloviu cuevavirus является вирусологическим таксоном (т. е. искусственно созданной концепцией ), включенным в род Cuevavirus , семейство Filoviridae , отряд Mononegavirales . [1] Вид имеет единственного члена вируса , вирус Lloviu. [1] Вирус Lloviu является единственным членом вида Lloviu cuevavirus , который включен в род Cuevavirus , семейство Filoviridae , отряд Mononegavirales . [1] [2] Название вируса Lloviu происходит от Cueva del Lloviu (название испанской пещеры , в которой он был впервые обнаружен [1] ) и таксономического суффикса virus (который обозначает вид вируса). [1]
В 2010 году вид и род cuevavirus были предложены как независимые вид и род. [1] В июле 2013 года вид и род cuevavirus были ратифицированы Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) для включения в его отчет, поэтому название теперь выделено курсивом. [3]
Вирус, который соответствует критериям принадлежности к роду « Cuevavirus », является представителем вида «Lloviu cuevavirus», если он обладает свойствами « cuevaviruses » (потому что в настоящее время существует только вид « cuevavirus ») и если его геном отличается от генома вируса Lloviu (вариант Bat86) на <30% на уровне нуклеотидов. [1]
Вирус Лловиу ( / ˈ j ɒ v j uː / YOV -yoo ; [1] LLOV ) — вирус, отдаленно родственный известным возбудителям вируса Эбола и вируса Марбург . [1] [2]
Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), название вируса Лловиу всегда пишется с заглавной буквы (поскольку «Лловиу» — имя собственное), но никогда не пишется курсивом и может быть сокращено (официальным сокращением является LLOV). [ необходима цитата ]
LLOV был обнаружен в 2011 году у летучих мышей Шрайберса (вид Miniopterus schreibersii ), которые были найдены мертвыми в Куэва-дель-Льовиу в 2002 году, Астурия , Испания , а также в пещерах в испанской Кантабрии и в пещерах во Франции и Португалии . [2] Пока не доказано, что вирус является этиологическим агентом нового заболевания летучих мышей, но у здоровых летучих мышей Шрайберса не было обнаружено следов вирусов, что, по крайней мере, предполагает, что вирус может быть патогенным для определенных летучих мышей. Вскрытие мертвых летучих мышей не выявило макроскопической патологии , но микроскопическое исследование показало вирусную пневмонию . [2] Нет информации о том, заражает ли LLOV людей. [4] Однако Куэва-дель-Льовиу часто посещается туристами , и никаких случаев заражения или заболевания людей пока не наблюдалось, что позволяет предположить, что LLOV может быть вторым филовирусом , который не является патогенным для людей (первым является вирус Рестона (RESTV) ). [ необходима цитата ]
Серореактивность дополнительных летучих мышей Шрайберса с длинными пальцами была зарегистрирована в Северной Испании с 2015 года, что предполагает циркуляцию вируса среди этих колоний летучих мышей. Однако животных с положительным результатом ПЦР обнаружено не было. [5]
Дополнительные случаи гибели летучих мышей Шрайберса были зарегистрированы в Венгрии в 2013, 2016 и 2017 годах. Присутствие LLOV было подтверждено в тушах летучих мышей с 2016 года, проявляя геморрагические симптомы. [6] Обновленные данные генома были получены из венгерских образцов в 2020 году с использованием метода секвенирования Nanopore . [7] Инфекционный вирус был выделен из летучих мышей Шрайберса в Венгрии, что делает его всего лишь третьим филовирусом наряду с вирусами Марбурга и Равна , когда-либо выделенным из летучих мышей. [8]
Хотя LLOV был выделен в культуре тканей , его геном был определен полностью, за исключением 3' и 5' НТО . [2] [8] Как и все мононегавирусы , вирионы LLOV содержат неинфекционный, линейный несегментированный, одноцепочечный РНК - геном отрицательной полярности, который, скорее всего, обладает обратно-комплементарными 3' и 5' концами, не обладает 5'-кэпом , не полиаденилирован и не связан ковалентно с белком . [9] Геном LLOV, вероятно, имеет длину приблизительно 19 кб и содержит семь генов в порядке 3'-НТО - NP - VP35 - VP40 - GP - VP30 - VP24 - L - 5'-НТО . В отличие от вирусов Эбола и Марбурга , которые синтезируют семь мРНК для экспрессии семи структурных белков, LLOV, по-видимому, производит только шесть мРНК , то есть одна мРНК ( VP24 / L ) считается бицистронной . Геномные сайты терминации транскрипции LLOV идентичны сайтам геномов вирусов Эбола , но отличаются от сайтов геномов вирусов Марбурга . Сайты инициации транскрипции LLOV уникальны. [2]
Структура вирионов LLOV пока не описана. Как и все другие филовирусы , вирионы LLOV, как ожидается, будут нитевидными частицами, которые могут иметь форму пастушьего посоха или в форме «U» или «6», и они могут быть спиральными, тороидальными или разветвленными. Ожидается, что их диаметр составит 80 нм в ширину , но они будут различаться по длине. [10] Геном LLOV предполагает, что частицы LLOV состоят из семи структурных белков. В центре будет спиральный рибонуклеокапсид , который будет состоять из геномной РНК, обернутой вокруг полимера нуклеопротеинов ( NP ). С рибонуклеопротеином будет связана РНК-зависимая РНК-полимераза (L) с кофактором полимеразы (VP35) и активатором транскрипции (VP30). Рибонуклеопротеин будет встроен в матрицу, образованную основными (VP40) и второстепенными (VP24) белками матрицы. Эти частицы будут окружены липидной мембраной, полученной из мембраны клетки-хозяина. Мембрана будет закреплять гликопротеин (GP 1,2 ), который выступает на 7–10 нм шипами от своей поверхности. Хотя по структуре они почти идентичны эболавирионам и марбургвиронам, льовиувирионы могут антигенно отличаться от обоих (так же, как и друг от друга). [ оригинальное исследование? ]
Предполагается, что жизненный цикл LLOV начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам клеточной поверхности , за которым следует интернализация, слияние оболочки вириона с эндосомальными мембранами и сопутствующее высвобождение вирусного нуклеокапсида в цитозоль . Гликопротеин LLOV (GP) расщепляется эндосомальными цистеиновыми протеазами ( катепсинами ), а расщепленный гликопротеин взаимодействует с внутриклеточным рецептором входа, Ниманна-Пика C1 ( NPC1 ). [11] Вирусный RdRp частично оголяет нуклеокапсид и транскрибирует гены в положительно-цепочечные мРНК , которые затем транслируются в структурные и неструктурные белки . LLOV L связывается с одним промотором, расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо заканчивается после гена , либо продолжается до следующего гена ниже по течению. Это означает, что гены, близкие к 3'-концу генома, будут транскрибироваться в наибольшем количестве, тогда как гены, близкие к 5'-концу, будут транскрибироваться с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов будет простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Наиболее распространенным продуцируемым белком будет нуклеопротеин , концентрация которого в клетке будет определять, когда L переключается с транскрипции гена на репликацию генома. Репликация приведет к полноразмерным антигеномам с положительной цепью, которые, в свою очередь, будут транскрибироваться в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Недавно синтезированные структурные белки и геномы будут самоорганизовываться и накапливаться вблизи внутренней части клеточной мембраны . Вирионы будут отпочковываться от клетки, получая свои оболочки от клеточной мембраны, от которой они отпочковываются. Зрелые частицы потомства затем будут инфицировать другие клетки, чтобы повторить цикл. [9]