Мононегавирусы
Порядок вирусов

Мононегавирусы
Вирион вируса везикулярного стоматита (ВВС) и геномы Mononegavirales
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Орторнавирусы
Тип:Негарнавирикота
Сорт:Монхивирицеты
Заказ:Мононегавирусы
Семьи

см. текст

Mononegavirales — это отряд вирусов с отрицательной цепью РНК , которые имеют несегментированные геномы. Некоторые члены этого отряда, вызывающие заболевания человека, включают вирус Эбола , респираторно-синцитиальный вирус человека , вирус кори , вирус эпидемического паротита , вирус Нипах и вирус бешенства . Важные патогены животных и растений , не относящихся к человеку , также входят в эту группу. Отряд включает одиннадцатьсемейств вирусов : Artoviridae , Bornaviridae , Filoviridae , Lispiviridae , Mymonaviridae , Nyamiviridae , Paramyxoviridae , Pneumoviridae , Rhabdoviridae , Sunviridae и Xinmoviridae . [1]

Использование термина

Порядок Mononegavirales (произносится: / ˌ mɒ nə ˌ nɛ ɡ ə v i ˈ rɑː lɪ z / MON -ə- NEG -ə-vee- RAH -liz ) [примечание 1] [2] [3] — вирусологический таксон, созданный в 1991 году [ 4 ] [ 5] и измененный в 1995, [6] 1997, [7] 2000, [8] 2005, [9] 2011, [2] 2016, [10] 2017, [11] и 2018 годах. [1] Название Mononegavirales происходит от древнегреческого прилагательного μóνος monos (намекающего на однокомпонентные и одноцепочечные геномы большинства мононегавирусов), латинский глагол negare ( намекая на отрицательную полярность этих геномов) и таксономический суффикс -virales (обозначающий вирусный порядок). [3]

Критерии включения заказа

Организация генома и синтез РНК отряда Mononegavirales

Вирус является членом порядка Mononegavirales , если [2] [3]

  • его геном представляет собой линейную, обычно (но не всегда) несегментированную, одноцепочечную, неинфекционную РНК отрицательной полярности; имеет обратно-комплементарные 3' и 5' концы; и не связан ковалентно с белком ;
  • его геном имеет характерный порядок генов 3'-UTR – гены основных белков – гены белков оболочки – ген РНК-зависимой РНК-полимеразы – 5'-UTR (3'-NPMGL-5') (однако имеются некоторые исключения);
  • он производит 5–10 различных мРНК из своего генома посредством полярной последовательной транскрипции с одного промотора , расположенного на 3'-конце генома; мРНК имеют 5'-кэп и полиаденилированы ;
  • он размножается путем синтеза полных антигеномов;
  • он образует инфекционные спиральные рибонуклеокапсиды в качестве матриц для синтеза мРНК, антигеномов и геномов;
  • он кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp, L), которая высоко гомологична таковым других мононегавирусов; и/или
  • обычно (но не всегда) он производит оболочечные вирионы с молекулярной массой 300–1000 × 106 ; S 20W 550–>1045; и плавучая плотность в CsCl 1,18–1,22 г/см 3 .

Жизненный цикл

Жизненный цикл везикуловирусов

Жизненный цикл мононегавируса начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам клеточной поверхности , за которым следует слияние оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующее высвобождение нуклеокапсида вируса в цитозоль. Вирусный RdRp частично снимает оболочку с нуклеокапсида и транскрибирует гены в положительно-цепочечные мРНК , которые затем транслируются в структурные и неструктурные белки . [ 9]

RdRps мононегавируса связываются с одним промотором , расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо заканчивается после гена, либо продолжается до следующего гена ниже по течению. Это означает, что гены, близкие к 3'-концу генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены, близкие к 5'-концу, с наименьшей вероятностью будут транскрибироваться. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Наиболее распространенным продуцируемым белком является нуклеопротеин , концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. [9]

Репликация приводит к образованию полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые в свою очередь транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Недавно синтезированные структурные белки и геномы самоорганизуются и накапливаются вблизи внутренней части клеточной мембраны . Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки от клеточной мембраны, от которой они отпочковываются. Затем зрелые частицы потомства заражают другие клетки, чтобы повторить цикл. [9]

Палеовирусология

Мононегавирусы имеют историю, которая насчитывает несколько десятков миллионов лет. « Окаменелости » мононегавирусов были обнаружены в форме генов мононегавирусов или фрагментов генов, интегрированных в геномы млекопитающих . Например, «окаменелости» генов борнавирусов были обнаружены в геномах летучих мышей , рыб , даманов , сумчатых , приматов , грызунов , жвачных и слонов . [12] [13] [14] [15] [16] «Окаменелости» генов филовирусов были обнаружены в геномах летучих мышей, грызунов, землероек , тенреков и сумчатых . [13] [14] [17] [18] «Окаменелость» вируса Мидуэй была обнаружена в геноме данио-рерио . [13] Наконец, «окаменелости» рабдовируса были обнаружены в геномах ракообразных , комаров , клещей и растений . [19] [14] [20] [21]

Таксономия

Филогенетическое дерево Mononegavirales

Отряд насчитывает одиннадцать семейств, включающих многочисленные роды, которые состоят из множества различных видов: [ необходима ссылка ]

Таблица порядка, показывающая все семейства, роды, виды и их вирусы: [1]

Условные обозначения таблицы: «*» обозначает типовой вид.

Примечания

  1. ^ Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) , название Mononegavirales всегда пишется с заглавной буквы, курсивом и никогда не сокращается. Названия физических членов порядка («мононегавирусы» или «мононегавирады») пишутся строчными буквами, не выделяются курсивом и используются без артиклей.

Ссылки

  1. ^ abc Амарасингхе Г.К., Арешига Себальос Н.Г., Banyard AC, Basler CF, Bavari S, Bennett AJ и др. (апрель 2018 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2018». Архив вирусологии . 163 (8): 2283–2294 . doi : 10.1007/s00705-018-3814-x. ПМК  6076851 . ПМИД  29637429.
  2. ^ abc Easton A, Pringle CR (2011). «Отряд Mononegavirales». В King AM, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (ред.). Virus Taxonomy — Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses . London, UK: Elsevier/Academic Press. стр. 653–657. ISBN 978-0-12-384684-6.
  3. ^ abc Kuhn JH, Becker S, Ebihara H, Geisbert TW, Johnson KM, Kawaoka Y, et al. (декабрь 2010 г.). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также сокращения вирусов». Архивы вирусологии . 155 (12): 2083– 103. doi :10.1007/s00705-010-0814-x. PMC 3074192. PMID  21046175 . 
  4. ^ Pringle CR (1991). «Отряд Mononegavirales». Архивы вирусологии . 117 ( 1– 2): 137– 40. doi : 10.1007/BF01310499 . PMID  2006902. S2CID  312908.
  5. ^ Pringle CR (1991). "Order Mononegavirales". В Francki RI, Fauquet CM, Knudson DK, Brown F (ред.). Классификация и номенклатура вирусов — Пятый отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Приложение к Архивам вирусологии, т. 2. Вена, Австрия: Springer. стр.  239–41 . ISBN 978-0-387-82286-0.
  6. ^ Bishop DH, Pringle CR (1995). "Order Mononegavirales". В Murphy FA, ​​Fauquet CM, Bishop DH, Ghabrial SA, Jarvis AW, Martelli GP, Mayo MA, Summers DM (ред.). Virus Taxonomy — Sixth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Archives of Virology Supplement . Том 10. Вена, Австрия: Springer. С.  265–267 . ISBN 978-3-211-82594-5.
  7. ^ Pringle CR (1997). «Отряд Mononegavirales — текущий статус». Архивы вирусологии . 142 (11): 2321– 6. PMID  9672597.
  8. ^ Pringle CR (2000). «Отряд Mononegavirales». В van Regenmortel MK, Fauquet CM, Bishop DH, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, Maniloff J, Mayo MA, McGeoch DJ, Pringle CR, Wickner RB (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр.  525–530 . ISBN 978-0-12-370200-5.
  9. ^ abcd Pringle CR (2005). «Отряд Mononegavirales». В Fauquet CM, Mayo M, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов — Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier/Academic Press. стр.  609–614 . ISBN 978-0-12-370200-5.
  10. ^ Афонсо CL, Амарасингхе Г.К., Баньяй К., Бао Й., Баслер CF, Бавари С. и др. (август 2016 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2016 г.». Архив вирусологии . 161 (8): 2351–60 . Бибкод : 2016ArcV..161.2351A. дои : 10.1007/s00705-016-2880-1. ПМЦ 4947412 . ПМИД  27216929. 
  11. ^ Амарасингхе Г.К., Бао И., Баслер К.Ф., Бавари С., Бир М., Беджерман Н. и др. (август 2017 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2017 г.». Архив вирусологии . 162 (8): 2493–2504 . doi :10.1007/s00705-017-3311-7. ПМЦ 5831667 . ПМИД  28389807. 
  12. ^ Хори М., Хонда Т., Сузуки И., Кобаяши И., Дайто Т., Ошида Т. и др. (январь 2010 г.). «Эндогенные неретровирусные РНК-вирусные элементы в геномах млекопитающих». Nature . 463 (7277): 84– 7. Bibcode :2010Natur.463...84H. doi :10.1038/nature08695. PMC 2818285 . PMID  20054395. 
  13. ^ abc Белый ВА, Левин А.Дж., Скалка АМ (июль 2010 г.). Бухмайер М.Дж. (ред.). «Неожиданное наследование: множественные интеграции древних последовательностей борнавируса и эболавируса/марбургвируса в геномах позвоночных». PLOS Pathogens . 6 (7): e1001030. doi : 10.1371/journal.ppat.1001030 . PMC 2912400. PMID  20686665 . 
  14. ^ abc Katzourakis A, Gifford RJ (ноябрь 2010 г.). Malik HS (ред.). "Эндогенные вирусные элементы в геномах животных". PLOS Genetics . 6 (11): e1001191. doi : 10.1371/journal.pgen.1001191 . PMC 2987831. PMID  21124940 . 
  15. ^ Cui J, Wang LF (ноябрь 2015 г.). «Геномный майнинг раскрывает глубокие эволюционные связи между борнавирусами и летучими мышами». Вирусы . 7 (11): 5792– 800. doi : 10.3390/v7112906 . PMC 4664979. PMID  26569285 . 
  16. ^ Хори М., Томонага К. (апрель 2018 г.). «Палеовирусология борнавирусов: что можно узнать из молекулярных ископаемых борнавирусов». Virus Research . 262 : 2– 9. doi : 10.1016/j.virusres.2018.04.006. PMID  29630909. S2CID  4776419.
  17. ^ Taylor DJ, Leach RW, Bruenn J (июнь 2010 г.). «Филовирусы — древние и интегрированы в геномы млекопитающих». BMC Evolutionary Biology . 10 (1): 193. Bibcode : 2010BMCEE..10..193T. doi : 10.1186/1471-2148-10-193 . PMC 2906475. PMID  20569424 . 
  18. ^ Taylor DJ, Dittmar K, Ballinger MJ, Bruenn JA (ноябрь 2011 г.). «Эволюционное поддержание генов, подобных филовирусам, в геномах летучих мышей». BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 336. Bibcode : 2011BMCEE..11..336T. doi : 10.1186/1471-2148-11-336 . PMC 3229293. PMID  22093762 . 
  19. ^ Metegnier G, Becking T, Chebbi MA, Giraud I, Moumen B, Schaack S и др. (2015). «Сравнительный палеовирусологический анализ ракообразных выявляет несколько широко распространенных вирусных групп». Mobile DNA . 6 : 16. doi : 10.1186/s13100-015-0047-3 . PMC 4573495. PMID  26388953 . 
  20. ^ Chiba S, Kondo H, Tani A, Saisho D, Sakamoto W, Kanematsu S и др. (Июль 2011 г.). Nagy PD (ред.). «Широко распространенная эндогенизация геномных последовательностей неретровирусных РНК-вирусов в геномы растений». PLOS Pathogens . 7 (7): e1002146. doi : 10.1371/journal.ppat.1002146 . PMC 3136472. PMID  21779172 . 
  21. ^ Fort P, Albertini A, Van-Hua A, Berthomieu A, Roche S, Delsuc F и др. (январь 2012 г.). «Ископаемые рабдовирусные последовательности, интегрированные в геномы членистоногих: онтогенез, эволюция и потенциальная функциональность» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 29 (1): 381– 90. doi : 10.1093/molbev/msr226 . PMID  21917725.
  • Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mononegavirales&oldid=1253861718"