Лабиринтуломицеты
Класс простейших, которые образуют нитевидную сеть.

Лабиринтуломицеты
Клетка с сетью эктоплазматических нитей ( Aplanochytrium sp.)
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Эукариоты
Клад :Диафоретики
Клад :САР
Клад :Страменопилы
Тип:Бигира
Подтип:Сагениста
Сорт:Лабиринтуломицеты
Arx, 1970, Дик, 2001
Заказы [1]
Синонимы
  • Labyrinthulomycota Уиттакер, 1969
  • Labyrinthomorpha Страница в Levine et al., 1980
  • Labyrinthulea Olive, 1975
    бывший Cavalier-Smith, 1989

Labyrinthulomycetes ( ICBN ) или Labyrinthulea [2] ( ICZN ) — это класс простейших , которые производят сеть нитей или трубок, [3] которые служат дорожками для скольжения клеток и поглощения ими питательных веществ . Две основные группы — это лабиринтулиды (или слизистые сети) и траустохитриды . Они в основном морские , обычно встречаются как паразиты на водорослях и морских травах или как редуценты на мертвом растительном материале. Они также включают некоторых паразитов морских беспозвоночных и миксотрофные виды, которые живут в симбиотических отношениях с зоохлореллой . [4] [5] [6]

Характеристики

Хотя они находятся снаружи клеток, нити Labyrinthulomycetes окружены мембраной . Они образованы и связаны с цитоплазмой уникальной органеллой, называемой сагеногеном или ботросомой. Клетки не имеют ядра и, как правило, имеют яйцевидную форму, движутся вперед и назад по аморфной сети со скоростью от 5 до 150 мкм в минуту. У лабиринтулид клетки заключены внутри трубок, а у траустохитрид они прикреплены к их бокам.

Эволюция

Эволюционное происхождение

Labyrinthulomycetes не являются грибами , а монофилетической группой эукариот в пределах Stramenopiles . Они принадлежат к типу Bigyra , который содержит другие гетеротрофные микроорганизмы, такие как бикозоециды . Учитывая, что пластиды Stramenopiles , возможно, являются результатом эндосимбиоза у их последнего общего предка , бикозоециды и labyrinthulomycetes могли произойти от миксотрофного водорослевого общего предка, который вторично утратил свои пластиды. [3]

Некоторые характеристики лабиринтуломицетов можно объяснить их происхождением от предковых пластид. Они производят омега-3 полиненасыщенные жирные кислоты, используя десатуразу, обычно присутствующую в хлоропластах . Зооспоры лабиринтулид имеют глазное пятно, состоящее из связанных с мембраной гранул, которое напоминает глазные пятна фотосинтетических страменопил, которые либо находятся внутри пластиды, либо, как полагают, происходят от пластиды. [3]

В пределах Bigyra , labyrinthulomycetes являются сестринской группой для Eogyrea , класса, содержащего вид Pseudophyllomitus vesiculosus и экологическую кладу, называемую MAST-4. Вместе они составляют подтип Sagenista . [7] [8]

Страменопилы

Классификация

Labyrinthulomycetes или Labyrinthulea раньше составляли несуществующий грибковый тип Labyrinthulomycota. [9] Первоначально их считали необычными слизевиками , хотя они не очень похожи на другие виды. Структура их зооспор и генетические исследования показывают, что они являются примитивной группой гетероконтов , но их классификация и трактовка остаются несколько неопределенными.

Этот класс обычно включал два отряда, Labyrinthulales и Thraustochytriales (ICBN), или Labyrinthulida и Thraustochytrida (ICZN), но недавно была предложена другая классификация. [6] [10] [11] [1] [9]

  • Отряд Labyrinthulales/ Labyrinthulida EA Bessey 1950/Doffein 1901
    • Семейство Aplanochytriaceae/Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
      • Aplanochytrium Bahnweg & Sparrow 1972 [= Labyrinthuloides Perkins 1973 ]
    • Семейство Labyrinthulaceae/Labyrinthulidae Haeckel 1868/Cinekowksa 1867.
    • Клада на уровне семейства «Stellarchytriaceae/Stellarchytriidae» – эта группа условно отнесена к Labyrinthulida [9] [1], но, согласно филогенетическому анализу, расходится раньше остальных клад лабиринтовых. [11]
      • Stellarchytrium FioRito & Leander 2016
  • Отряд Oblongichytriales/Oblongichytrida.
    • Семейство Oblongichytriaceae/Oblongichytriidae Кавалер-Смит 2012
      • Oblongichytrium Йокояма и Хонда 2007
  • Отряд Thraustochytriales / Thraustochytrida Sparrow 1973
    • Пирросор Июль 1901
    • Танатострея Франк и Арви 1969
    • Семейство Althornidiaceae/Althorniidae Джонс и Олдерман 1972
      • Олторния Джонс и Олдерман 1972
    • Семейство Thraustochytriacae/ Thraustochytriidae Воробей ex Cejp 1959
      • Japanochytrium Кобаяси и Окубо, 1953 г.
      • Моноризохитриум Дои и Хонда 2017
      • Sicyoidochytrium Yokoy., Саллех и Хонда 2007
      • Аурантиохитриум Йокой. и Хонда 2007 г.
      • Улькения Гартн. 1977
      • Parietichytrium Yokoy., Саллех и Хонда 2007
      • Botryochytrium Yokoy., Саллех и Хонда 2007
      • Schizochytrium Goldst. & Belsky emend. Booth & Mill.
      • Thraustochytrium Sparrow 1936
      • Hondaea Amato & Cagnac 2018
      • Labyrinthulochytrium Хассетт и Грейдингер 2018 [12]
  • Отряд «Amphitremidales»/ Amphitremida Gomaa et al. 2013 год
    • Семейство «Амфитремидиевые»/Amphitremidae Poch 1913
      • Парамфитрема Валканов 1970
      • Арчерелла Лёблих и Таппан 1961
      • Амфитрема Арчер 1867
    • Семейство "Diplophrydaceae"/Diplophryidae Кавалер-Смит 2012
      • Диплофрис Баркер 1868
  • Заказ "Amphifilales"/Amphifilida Кавалер Смит 2012
    • Семейство Sorodiplophryidae Кавалер-Смит 2012
      • Сородиплофрис Оливка и Дикстра 1975 г.
      • Фиброфрис Такахаши и др. 2016
    • Семейство Amphifilidae Кавалер-Смит 2012
      • Род Amphifila Кавалер-Смит 2012

Генетический код

Лабиринтуломицет Thraustochytrium aureum примечателен альтернативным генетическим кодом своих митохондрий , которые используют TTA в качестве стоп-кодона вместо кодирования лейцина . [13] Этот код представлен таблицей трансляции NCBI 23, митохондриальный код Thraustochytrium . [14]

Генетический код
Таблица перевода		ДНК-кодонРНК-кодонПеревод
с этим кодом		Стандартный код
(таблица перевода 1)
Thraustochytrium митохондриальный23ТТАУУАСТОП = Тер (*)Лей (Л)

Ссылки

  1. ^ abc Адл С.М., Басс Д., Лейн CE, Лукеш Дж., Шох К.Л., Смирнов А., Агата С., Берни С., Браун М.В., Бурки Ф., Карденас П., Чепичка I, Чистякова Л., дель Кампо Дж., Данторн М., Эдвардсен Б. , Эглит Ю, Гийу Л, Хампл В, Хейсс А.А., Хоппенрат М, Джеймс Тай, Карнковска А, Карпов С, Ким Е, Колиско М, Кудрявцев А, Лар DJG, Лара Е, Ле Галл Л, Линн Д.Х., Манн Д.Г., Массана Р., Митчелл И.А.Д., Морроу С., Парк Дж.С., Павловски Дж.В., Пауэлл М.Дж., Рихтер Дж.Д., Рюкерт С., Шедвик Л., Шимано С., Шпигель Ф.В., Торруэлла Дж., Юсеф Н., Златогурский В., Чжан Цюй (2019). «Пересмотр классификации, номенклатуры и разнообразия эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. doi : 10.1111/jeu.12691. PMC  6492006. PMID  30257078 .
  2. ^ Кавалер-Смит, Т. (1997). «Сагениста и бигира, два типа гетеротрофных гетероконтных хромистов». Архив для защиты . 148 (3): 253–267. дои : 10.1016/S0003-9365(97)80006-1.
  3. ^ abc Tsui, Clement KM; Marshall, Wyth; Yokoyama, Rinka; Honda, Daiske; Lippmeier, J Casey; Craven, Kelly D; Peterson, Paul D; Berbee, Mary L (январь 2009 г.). «Филогения Labyrinthulomycetes и ее влияние на эволюционную потерю хлоропластов и приобретение эктоплазматического скольжения». Молекулярная филогенетика и эволюция . 50 (1): 129–40. doi :10.1016/j.ympev.2008.09.027. PMID  18977305.
  4. ^ Шерер, Л.; Кнофлах, Д.; Визосо, ДБ; Ригер, Г.; Пейнтнер, У. (2007). "Thraustochytrids как новые паразитические простейшие морских свободноживущих плоских червей: Thraustochytrium caudivorum sp. nov. Паразитирует на Macrostomum lignano" (PDF) . Морская биология . 152 (5): 1095. doi :10.1007/s00227-007-0755-4. S2CID  4836350.
  5. ^ Pan, Jingwen (2016). Метаанализ разнообразия Labyrinthulomycetes (магистр наук). Университет Британской Колумбии. doi : 10.14288/1.0223199.
  6. ^ ab Gomaa, Fatma; Mitchell, Edward AD; Lara, Enrique (2013). "Amphitremida (poche, 1913) — это новая крупная, повсеместно распространенная клада лабиринтуломицетов". PLoS One . 8 (1): e53046. Bibcode : 2013PLoSO ... 853046G. doi : 10.1371/journal.pone.0053046 . PMC 3544814. PMID  23341921. 
  7. ^ Кавальер-Смит, Томас (2017). «Царство Chromista и его восемь типов: новый синтез, подчеркивающий нацеливание на перипластидные белки, эволюцию цитоскелета и перипластид и древние расхождения». Protoplasma . 255 (1): 297–357. doi :10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292 . PMID  28875267. 
  8. ^ Такур, Рабиндра; Ширатори, Такаши; Ишида, Кен-ичиро (2019). «Мультигенный филогенетический анализ таксонов, богатых таксонами, разрешает филогенетическую связь между глубоко ветвящимися страменопилами». Protist . 170 (5): 125682. doi :10.1016/j.protis.2019.125682. ISSN  1434-4610. PMID  31568885. S2CID  202865459.
  9. ^ abc Bennett, Reuel M.; Honda, D.; Beakes, Gordon W.; Thines, Marco (2017). "Глава 14. Labyrinthulomycota". В Archibald, John M.; Simpson, Alastair GB; Slamovits, Claudio H. (ред.). Handbook of the Protists . Springer. стр. 507–542. doi :10.1007/978-3-319-28149-0_25. ISBN 978-3-319-28147-6.
  10. ^ Андерсон, О. Роджер; Кавальер-Смит, Томас (2012). «Ультраструктура Diplophrys parva, нового мелкого пресноводного вида и пересмотренный анализ Labyrinthulea (Heterokonta)». Acta Protozoologica . 8 (1): 291–304. doi :10.4467/16890027AP.12.023.0783.
  11. ^ ab FioRito, Rebecca; Leander, Celeste; Leander, Brian (2016). «Характеристика трех новых видов Labyrinthulomycota, выделенных из морских звезд цвета охры (Pisaster ochraceus)». Marine Biology . 163 (8): 170. doi :10.1007/s00227-016-2944-5. S2CID  43399688.
  12. ^ Хассетт, Брэндон Т.; Грейдингер, Рольф (2018). «Новые виды сапробных Labyrinthulea (=Labyrinthulomycota) и возведение гена nov. для разрешения молекулярной полифилии в пределах апланохитрид». Журнал эукариотической микробиологии . 65 (4): 475–483. doi : 10.1111/jeu.12494. hdl : 10037/13570 . ISSN  1550-7408. PMID  29265676. S2CID  46820836.
  13. ^ Wideman, Jeremy G.; Monier, Adam; Rodríguez-Martínez, Raquel; Leonard, Guy; Cook, Emily; Poirier, Camille; Maguire, Finlay; Milner, David S.; Irwin, Nicholas AT; Moore, Karen; Santoro, Alyson E. (2019-11-25). «Неожиданное разнообразие митохондриального генома, выявленное с помощью целевой геномики отдельных клеток гетеротрофных жгутиконосцев». Nature Microbiology . 5 (1): 154–165. doi :10.1038/s41564-019-0605-4. hdl : 10871/39819 . ISSN  2058-5276. PMID  31768028. S2CID  208279678.
  14. ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Получено 11 августа 2016 г.
  15. ^ Циенковский, Л. (1867). Ueber den Bau und die Entwicklung der Labyrinthuleen. Арх. микр. Анат. , 3:274, [1].
В Wikisource есть текст статьи « Labyrinthulidea » из Британской энциклопедии 1911 года .
  • Labyrinthulomycota
Wikispecies содержит информацию, связанную с Labyrinthulomycetes .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Labyrinthulomycetes&oldid=1252810124"