Археоглобовые
Семейство архей

Археоглобовые
Домен PIWI белка- аргонавта из A. fulgidus , связанный с коротким двухцепочечным фрагментом РНК и иллюстрирующий стабилизацию связанной конформации за счет спаривания оснований и ароматического стекирования.
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Археи
Королевство:Эвриархеоты
Сорт:Археоглобусы
Заказ:Археоглобальные
Семья:Archaeoglobaceae
Хубер и Штеттер 2002
Генера
Синонимы
  • "Archaeoglobaceae" Штеттер 1989

Archaeoglobaceae — это семейство Archaeoglobales . [ 1 ] Все известные роды Archaeoglobaceae являются гипертермофильными и могут быть найдены вблизи подводных гидротермальных источников . Archaeoglobaceae — единственное семейство в порядке Archaeoglobales , который является единственным порядком в классе Archaeoglobi .

Режим метаболизма

Хотя все роды в пределах Archaeoglobaceae связаны друг с другом филогенетически, способ метаболизма, используемый каждым из этих организмов, уникален. Archaeoglobus — это хемоорганотрофные сульфатредуцирующие археи, единственный известный представитель Archaea , обладающий этим типом метаболизма. Ferroglobus , напротив, являются хемолитотрофными организмами, которые сочетают окисление двухвалентного железа с восстановлением нитрата . Geoglobus — это железоредуцирующие археи, которые используют водородный газ или органические соединения в качестве источников энергии. [2]

Характеристика и роды

Archaeoglobaceae делится на три рода, и вот некоторые краткие различия между ними:

  • Archaeoglobus : Этот род содержит наиболее известных и изученных членов семейства Archaeoglobaceae. Это термофильные сульфатредуцирующие бактерии, которые встречаются в гидротермальных источниках и нефтяных резервуарах. Они могут расти при высоких температурах и использовать различные органические соединения в качестве доноров электронов. [3]
  • Ferroglobus : Этот род содержит единственный вид, Ferroglobus placidus, который встречается в гидротермальных источниках. Они термофильны и могут расти при высоких температурах, но отличаются от других членов семейства тем, что используют железо в качестве донора электронов вместо органических соединений. [3]
  • Geoglobus : Этот род содержит единственный вид, Geoglobus acetivorans, который встречается в гидротермальных источниках. Они термофильны и могут расти при высоких температурах, и они отличаются от других членов семейства тем, что используют ацетат в качестве донора электронов. [3]

Среда обитания

Виды Archaeoglobus встречаются в различных экстремальных средах, включая глубоководные гидротермальные источники, нефтяные резервуары и горячие источники. Эти среды характеризуются высокими температурами, высоким давлением и низкой концентрацией кислорода, что делает их негостеприимными для большинства других форм жизни (Topçuoğlu et al 2019). [4] Они способны процветать в этих средах, используя различные метаболические пути для получения энергии и производя ряд белков теплового шока и других механизмов реакции на стресс, которые помогают им выживать в этих экстремальных условиях. Они являются экстремофилами, что означает, что их также можно найти в средах с высоким содержанием соли, таких как солончаки или Соленое озеро. Archaeoglobaceae способны процветать в этих экстремальных средах, потому что они способны использовать различные минералы и газы для производства энергии. Например, некоторые виды Archaeoglobaceae способны использовать серу в процессе, называемом диссимиляционной сульфатредукцией , что позволяет им производить энергию без потребности в кислороде. Другие виды Archaeoglobaceae способны использовать углекислый газ или водород в качестве источника энергии (Topçuoğlu et al 2019). [4]

Помимо способности использовать различные источники энергии, некоторые виды Archaeoglobaceae также известны тем, что формируют симбиотические отношения с другими организмами. Например, некоторые виды Archaeoglobaceae были обнаружены живущими в ассоциации с трубчатыми червями, которые способны извлекать питательные вещества из среды гидротермальных источников и предоставлять их бактериям в обмен на энергию. Считается, что эти симбиотические отношения важны для выживания как бактерий, так и трубчатых червей в этих экстремальных условиях (Topçuoğlu et al 2019). [4]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [1]

LTP на основе 16S рРНК _06_2022 [6] [7] [8]53 маркерных белка на основе GTDB 09-RS220 [9] [10] [11]
Археоглобус

Archaeoglobus infectus Mori et al. 2008 год

Archaeoglobus sulfaticallidus Штейнсбу и др. 2010

Видовая группа 2
Геоглобус

G. acetivorans Слободкина и др. 2009 год

Г. ахангари Кашефи и др. 2002 г.

Археоглобус

A. fulgidus Stetter 1988 (тип sp.)

A. neptunius Слободкина и др. 2021 год

A. veneficus Huber et al. 1998 год

Ferroglobus placidus Hafenbradl et al. 1997 год

A. profundus Burggraf et al. 1990 год

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Sayers; et al. "Archaeoglobaceae". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 05.06.2021 .
  2. ^ Мэдиган, М. Т. и Мартинко, Дж. М. (2005). Биология микроорганизмов Брока (11-е изд.). Pearson Prentice Hall .
  3. ^ abc Brileya, Kristen; Reysenbach, Anna-Louise (2014). "Класс Archaeoglobi". Прокариоты . С.  15–23 . doi :10.1007/978-3-642-38954-2_323. ISBN 978-3-642-38953-5.
  4. ^ abc "Archaeoglobales - обзор | Темы ScienceDirect". www.sciencedirect.com . Получено 2023-04-27 .
  5. ^ JP Euzéby. "Archaeoglobaceae". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 17 ноября 2021 г.
  6. ^ "The LTP" . Получено 10 мая 2023 г. .
  7. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 10 мая 2023 г. .
  8. ^ "LTP_06_2022 Release Notes" (PDF) . Получено 10 мая 2023 г. .
  9. ^ "GTDB release 09-RS220". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  10. ^ "ar53_r220.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  11. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.

Дальнейшее чтение

  • Huber H; Stetter KO (2001). "Семейство I. Archaeoglobaceae fam. nov. Stetter 1989, 2216". В DR Boone; RW Castenholz (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . стр. 169. ISBN 978-0-387-98771-2.
  • Huber H; Stetter KO (2001). "Order I. Archaeoglobales ord. nov.". В DR Boone; RW Castenholz (ред.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deep branching and phototrophic Bacteria (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. стр. 169. ISBN 978-0-387-98771-2.
  • Stetter, KO (1989). "Группа II. Археобактериальные сульфатредукторы. Отряд Archaeoglobales". В JT Staley; MP Bryant; N Pfennig; JG Holt (ред.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Том 3 (1-е изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co., стр. 169.
  • Шайни, Рашми; Капур, Рупам; Кумар, Рита; Сиддики, ТО; Кумар, Анил (ноябрь 2011 г.). " КО
    2    использование микробов — всесторонний обзор». Biotechnology Advances . 29 (6): 949–960 . doi :10.1016/j.biotechadv.2011.08.009. PMID  21856405.
  • Мариету, Ангелики (2021). «Сульфатредуцирующие микроорганизмы в высокотемпературных нефтяных пластах». Достижения в прикладной микробиологии . Том 116. С.  99–131 . doi :10.1016/bs.aambs.2021.03.004. ISBN 978-0-12-824594-1. PMID  34353505. S2CID  235081283.
  • Топчуоглу, Бегюм Д.; Холден, Джеймс Ф. (2019). «Экстремофилы: жаркая среда». Справочный модуль по наукам о жизни . дои : 10.1016/B978-0-12-809633-8.90683-6. ISBN 978-0-12-809633-8.
  • Шайни, Рашми; Капур, Рупам; Кумар, Рита; Сиддики, ТО; Кумар, Анил (2011). " КО
    2    использование микробов – всесторонний обзор». Biotechnology Advances . 29 (6): 949–960 . doi :10.1016/j.biotechadv.2011.08.009. PMID  21856405.

Библиография

  • Хубер, Харальд; Хон, Михаэль Дж.; Рэйчел, Рейнхард; Фукс, Таня; Виммер, Верена К.; Штеттер, Карл О. (май 2002 г.). «Новый тип архей, представленный наноразмерным гипертермофильным симбионтом». Nature . 417 (6884): 63– 67. Bibcode :2002Natur.417...63H. doi :10.1038/417063a. PMID  11986665. S2CID  4395094.
  • Кленк, Ганс-Питер; Клейтон, Ребекка А.; Томб, Жан-Франсуа; Уайт, Оуэн; Нельсон, Карен Э.; Кетчум, Карен А.; Додсон, Роберт Дж.; Гвинн, Мишель; Хики, Эрин К.; Петерсон, Джереми Д.; Ричардсон, Делвуд Л.; Керлаваж, Энтони Р.; Грэм, Дэвид Э.; Кирпидес, Никос К.; Флейшманн, Роберт Д.; Квакенбуш, Джон; Ли, Норман Х.; Саттон, Грейнджер Г.; Джилл, Стивен; Киркнесс, Юэн Ф.; Догерти, Брайан А.; Маккенни, Кит; Адамс, Марк Д.; Лофтус, Брендан; Петерсон, Скотт; Рейх, Клаудия И.; Макнил, Лесли К.; Бэджер, Джонатан Х.; Glodek, Anna; Zhou, Lixin; Overbeek, Ross; Gocayne, Jeannine D.; Weidman, Janice F.; McDonald, Lisa; Utterback, Teresa; Cotton, Matthew D.; Spriggs, Tracy; Artiach, Patricia; Kaine, Brian P.; Sykes, Sean M.; Sadow, Paul W.; D'Andrea, Kurt P.; Bowman, Cheryl; Fujii, Claire; Garland, Stacey A.; Mason, Tanya M.; Olsen, Gary J.; Fraser, Claire M.; Smith, Hamilton O.; Woese, Carl R.; Venter, J. Craig (ноябрь 1997 г.). "Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей археи Archaeoglobus fulgidus". Nature . 390 (6658): 364– 370. Bibcode : 1997Natur.390..364K. doi : 10.1038/37052 . PMID  9389475. S2CID  83683005.
  • Слободкина, Галина; Аллиу, Максим; Меркель, Александр; Камбон-Бонавита, Мари-Анн; Ален, Карин; Джеббар, Мохамед; Слободкин, Александр (16 июля 2021 г.). "Физиологическая и геномная характеристика гипертермофильного археона Archaeoglobus neptunius sp. nov. Выделенного из глубоководного гидротермального источника, гарантирует реклассификацию рода Archaeoglobus". Frontiers in Microbiology . 12 : 679245. doi : 10.3389/fmicb.2021.679245 . PMC  8322695 . PMID  34335500.
  • Ким, Дэхён Д.; О'Фаррелл, Коринн; Тот, Кортни РА; Монтойя, Оскар; Гиг, Лиза М.; Квон, Тэ-Хёк; Юн, Сукхван (июль 2018 г.). «Анализ микробного сообщества добываемых вод из высокотемпературных нефтяных пластов выявил неожиданное сходство между географически удаленными нефтяными пластами». Микробная биотехнология . 11 (4): 788– 796. doi :10.1111 / 1751-7915.13281. PMC  6011920. PMID  29806176. S2CID  44082150.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Archaeoglobaceae&oldid=1262470731"