В клеточной биологии стрессовые гранулы представляют собой биомолекулярные конденсаты в цитозоле , состоящие из белков и РНК , которые собираются в безмембранные органеллы размером 0,1–2 мкм, когда клетка находится в состоянии стресса . [1] [2] Молекулы мРНК, обнаруженные в стрессовых гранулах, представляют собой остановленные комплексы преинициации трансляции , связанные с 40S рибосомными субъединицами, факторами инициации трансляции , поли(А)+ мРНК и РНК-связывающими белками (RBP) . Хотя они являются безмембранными органеллами, было предложено, что стрессовые гранулы связаны с эндоплазматическим ретикулумом . [3] Существуют также ядерные стрессовые гранулы. Эта статья о цитозольном варианте.
Функция стрессовых гранул остается в значительной степени неизвестной. Стрессовые гранулы давно предполагают, что они выполняют функцию защиты РНК от вредных условий, поэтому они появляются в условиях стресса. [4] Накопление РНК в плотные глобулы может предотвратить их реакцию с вредными химическими веществами и защитить информацию, закодированную в их последовательности РНК .
Стрессовые гранулы также могут функционировать как точка принятия решения для нетранслированной мРНК. Молекулы могут пойти по одному из трех путей: дальнейшее хранение, деградация или повторная инициация трансляции . [5] С другой стороны, также утверждалось, что стрессовые гранулы не являются важными участками для хранения мРНК и не служат промежуточным местом для мРНК при переходе между состоянием хранения и состоянием деградации. [6]
Попытки идентифицировать все РНК в стрессовых гранулах ( транскриптом стрессовых гранул ) беспристрастным способом путем секвенирования РНК из биохимически очищенных «ядер» стрессовых гранул показали, что РНК не рекрутируются в стрессовые гранулы специфичным для последовательности образом, а скорее обобщенно, с обогащением более длинных и/или менее оптимально транслируемых транскриптов. [7] Эти данные подразумевают, что транскриптом стрессовых гранул зависит от валентности РНК (для белков или других РНК) и скорости вытекания РНК из полисом . Последнее дополнительно подтверждается недавними исследованиями визуализации отдельных молекул . [8] Кроме того, было подсчитано, что только около 15% от общей мРНК в клетке локализовано в стрессовых гранулах, [7] предполагая, что стрессовые гранулы влияют только на меньшую часть мРНК в клетке и могут быть не столь важны для обработки мРНК, как считалось ранее. [7] [9] Тем не менее, эти исследования представляют собой лишь моментальный снимок во времени, и вполне вероятно, что большая часть мРНК в какой-то момент хранится в стрессовых гранулах из-за того, что эта РНК перемещается внутрь и наружу.
Стрессовые белки, которые являются основным компонентом стрессовых гранул в растительных клетках, являются молекулярными шаперонами , которые изолируют, защищают и, возможно, восстанавливают белки, которые разворачиваются во время нагревания и других типов стресса. [10] [11] Таким образом, любая ассоциация мРНК со стрессовыми гранулами может быть просто побочным эффектом ассоциации частично развернутых РНК-связывающих белков со стрессовыми гранулами, [12] аналогично ассоциации мРНК с протеасомами . [13]
Экологические стрессоры запускают клеточную сигнализацию, в конечном итоге приводя к образованию стрессовых гранул. In vitro эти стрессоры могут включать тепло, холод, окислительный стресс (арсенит натрия), стресс эндоплазматического ретикулума ( тапсигаргин ), ингибирование протеасом ( MG132 ), гиперосмотический стресс , ультрафиолетовое излучение , ингибирование eIF4A (патеамин A, хиппуристанол или RocA ), накопление оксида азота после обработки 3-морфолиносиднонимином (SIN-1) , [14] нарушение сплайсинга пре-мРНК , [15] и другие стрессоры, такие как пуромицин , которые приводят к разобранным полисомам . [16] Многие из этих стрессоров приводят к активации определенных стресс-ассоциированных киназ (HRI, PERK, PKR и GCN2), трансляционному ингибированию и образованию стрессовых гранул. [16] Стрессовые гранулы также будут образовываться при активации Gαq в механизме, который включает в себя высвобождение белков, связанных со стрессовыми гранулами, из цитозольной популяции эффекторной фосфолипазы C β Gαq. [17]
Формирование стрессовых гранул часто происходит ниже по течению от активируемого стрессом фосфорилирования эукариотического фактора инициации трансляции eIF2α ; это не относится ко всем типам стрессоров, которые вызывают стрессовые гранулы, [16] например, ингибирование eIF4A. Далее по течению, прионоподобная агрегация белка TIA-1 способствует образованию стрессовых гранул. Термин прионоподобный используется, потому что агрегация TIA-1 зависит от концентрации , ингибируется шаперонами и потому что агрегаты устойчивы к протеазам . [18] Также было высказано предположение, что микротрубочки играют роль в формировании стрессовых гранул, возможно, путем транспортировки компонентов гранул. Эта гипотеза основана на том факте, что разрушение микротрубочек химическим веществом нокодазолом блокирует появление гранул. [19] Кроме того, было показано, что многие сигнальные молекулы регулируют образование или динамику стрессовых гранул; К ним относятся «главный датчик энергии» AMP-активируемая протеинкиназа (AMPK) [ 20], фермент O-GlcNAc трансфераза (OGT) [ 21] и проапоптотическая киназа ROCK1 [22] .
Фазовые переходы РНК , частично обусловленные межмолекулярными взаимодействиями РНК-РНК, могут играть роль в формировании стрессовых гранул. Подобно внутренне неупорядоченным белкам, тотальные экстракты РНК способны подвергаться фазовому разделению в физиологических условиях in vitro . [23] Анализы РНК-секвенирования показывают, что эти сборки в значительной степени перекрывают транскриптом со стрессовыми гранулами, [23] [7] причем обогащение РНК в обоих случаях преимущественно основано на длине РНК. Кроме того, стрессовые гранулы содержат много РНК-хеликаз , [24] включая DEAD/H-box геликазы Ded1p/ DDX3 , eIF4A1 и RHAU . [25] У дрожжей мутантные аллели каталитического ded1 приводят к образованию конститутивных стрессовых гранул [26] Мутантные аллели DDX3X с дефицитом АТФазы (гомолог Ded1 у млекопитающих) обнаружены в детской медуллобластоме [27] , и они совпадают с конститутивными гранулярными сборками в клетках пациентов. [28] Эти мутантные белки DDX3 способствуют сборке стрессовых гранул в клетках HeLa . [28] В клетках млекопитающих мутанты RHAU приводят к снижению динамики стрессовых гранул. [25] Таким образом, некоторые предполагают, что агрегация РНК, облегчаемая межмолекулярными взаимодействиями РНК-РНК, играет роль в формировании стрессовых гранул, и что эта роль может регулироваться РНК- хеликазами . [29] Также имеются данные о том, что РНК внутри стрессовых гранул более компактна по сравнению с РНК в цитоплазме , и что РНК, как обнаружено, посттрансляционно модифицирована N6-метиладенозином (m 6 A) на ее 5' концах или ацетилированием РНК ac4C. [30] [31] [32] Недавние исследования показали, что фактор инициации трансляции и белок DEAD-box eIF4A, присутствующий в большом количестве, ограничивают образование стрессовых гранул. Он делает это благодаря своей способности связывать АТФ и РНК, действуя аналогично шаперонам белков, таким как Hsp70 . [33]
Стрессовые гранулы и P-тела (тела обработки) разделяют РНК и белковые компоненты, оба появляются в условиях стресса и могут физически связываться друг с другом. По состоянию на 2018 год из ~660 белков, идентифицированных как локализующиеся в стрессовых гранулах, ~11% также были идентифицированы как белки, локализованные в теле обработки (см. ниже). Белок G3BP1 необходим для правильной стыковки тел обработки и стрессовых гранул друг с другом, что может быть важно для сохранения полиаденилированной мРНК. [34]
Хотя некоторые белковые компоненты являются общими для стрессовых гранул и процессирующих телец, большинство белков в любой структуре уникально локализованы в любой из структур. [35] Хотя и стрессовые гранулы, и P-тела связаны с мРНК , процессирующие тельца давно предполагались как места деградации мРНК, поскольку они содержат ферменты, такие как DCP1/2 и XRN1 , которые, как известно, разрушают мРНК. [36] Однако другие продемонстрировали, что мРНК, связанная с процессирующими тельцами, в значительной степени трансляционно репрессируется, но не разрушается. [35] Также было предложено, что мРНК, выбранная для деградации, передается от стрессовых гранул к процессирующим тельцам, [36] хотя есть также данные, предполагающие, что процессирующие тельца предшествуют образованию стрессовых гранул и способствуют ему. [37]
Полный протеом стрессовых гранул до сих пор неизвестен, но были предприняты попытки каталогизировать все белки, которые, как было экспериментально продемонстрировано, переходят в стрессовые гранулы. [38] [39] [40] Важно отметить, что различные стрессоры могут приводить к образованию стрессовых гранул с различными белковыми компонентами. [16] Многие белки, связанные со стрессовыми гранулами, были идентифицированы путем кратковременного стрессирования культивируемых клеток и использования микроскопии для обнаружения локализации интересующего белка либо путем экспрессии этого белка, слитого с флуоресцентным белком (т. е. зеленым флуоресцентным белком (GFP)) и/или путем фиксации клеток и использования антител для обнаружения интересующего белка вместе с известными белковыми маркерами стрессовых гранул ( иммуноцитохимия ). [41]
В 2016 году были экспериментально идентифицированы и затем впервые очищены биохимическим путем «ядра» стрессовых гранул. Белки в ядрах были идентифицированы беспристрастным образом с помощью масс-спектрометрии . Этот технический прогресс привел к идентификации сотен новых белков, локализованных в стрессовых гранулах. [42] [24] [43]
Протеом стрессовых гранул также был экспериментально определен с использованием двух немного отличающихся подходов к маркировке близости . Одним из этих подходов к маркировке близости является метод аскорбатпероксидазы (APEX), в котором клетки конструируются для экспрессии известного белка стрессовых гранул, такого как G3BP1 , слитого с модифицированным ферментом аскорбатпероксидазы, называемым APEX. [38] [44] После инкубации клеток в биотине и обработки клеток перекисью водорода фермент APEX будет кратковременно активирован для биотинилирования всех белков в непосредственной близости от интересующего белка, в данном случае G3BP1 внутри стрессовых гранул. Биотинилированные белки затем могут быть выделены с помощью стрептавидина и идентифицированы с помощью масс-спектрометрии . Метод APEX использовался для идентификации ~260 белков, связанных со стрессовыми гранулами, в нескольких типах клеток, включая нейроны , и с различными стрессорами. Из 260 белков, идентифицированных в этом исследовании, около 143 ранее не были связаны со стрессовыми гранулами. [44]
Другой метод маркировки близости, используемый для определения протеома стрессовых гранул, — это BioID. [45] BioID похож на подход APEX, в котором биотинилирующий белок (BirA* вместо APEX) экспрессируется в клетках как белок слияния с несколькими известными белками, ассоциированными со стрессовыми гранулами. Белки, находящиеся в непосредственной близости от BirA*, будут биотинилированы и затем идентифицированы с помощью масс-спектрометрии . Youn et al. использовали этот метод для идентификации/предсказания 138 белков как ассоциированных со стрессовыми гранулами и 42 как ассоциированных с процессирующим телом. [45]
Подготовленную базу данных белков, связанных со стрессовыми гранулами, можно найти здесь [1]. [40]
Ниже приведен список белков, которые, как было показано, локализуются в стрессовых гранулах (составлено из [38] [39] [24] [44] [45] [46] ):
Генный идентификатор | Название белка | Описание | Ссылки | Также встречается в процессах обработки тел ? |
---|---|---|---|---|
ABCF1 | ABCF1 | Подсемейство F связывающих кассет АТФ, член 1 | [44] | |
АБРАКЛ | АБРАКЛ | ABRA C-терминал как | [44] | |
ACAP1 | ACAP1 | ArfGAP с доменами спиральной спирали, анкиринового повтора и PH 1 | [44] | |
ACBD5 | ACBD5 | Домен связывания ацил-КоА, содержащий 5 | [44] | |
ACTBL2 | ACTBL2 | Бета-актин-подобный белок 2 | [24] | да [35] |
ACTR1A | ACTR1A | Альфа-центрактин | [24] | |
АКТР1Б | АКТР1Б | Бета-центрактин | [24] | |
АДАР | АДАР1 | Аденозиндезаминаза, РНК-специфическая | [47] [24] | |
ДОБАВИТЬ1 | Аддуцин 1 | Аддуцин 1 | [44] | |
АГО1 | Аргонавт 1/EIF2C1 | Argonaute 1, RISC каталитический компонент | [44] [48] | да [35] |
АГО2 | Аргонавт 2 | Argonaute 2, каталитический компонент RISC | [44] [49] [48] [50] [24] [51] [46] | да [35] |
АКАП8 | АКАП8 | Белок 8, закрепляющий А-киназу | [46] | |
АКАП9 | АКАП350 | Белок 9, закрепляющий А-киназу | [52] | |
АКАП13 | АКАП13/ЛБК | Белок 13, закрепляющий А-киназу | [44] [46] | |
АЛДХ18А1 | АЛДХ18А1 | Дельта-1-пирролин-5-карбоксилатсинтаза | [24] | |
АЛГ13 | АЛГ13 | ALG13, субъединица UDP-N-ацетилглюкозаминилтрансферазы | [45] | |
АЛПК2 | ALPK2/HAK | Альфа-киназа 2 | [46] | |
АМОТЛ2 | AMOTL2/LCCP | Ангиомотин Лайк 2 | [46] | |
АНХД1 | АНХД1 | Повтор анкирина и домен KH, содержащий 1 | [45] | да [45] |
АНКРД17 | АНКРД17/МАСКА2/ГТАР | Домен повтора анкирина 17 | [44] [45] | да [45] |
АНГ | Ангиогенин | Ангиогенин | [53] | |
ANP32E | ANP32E | Член семейства E ядерного фосфопротеина 32, богатого кислым лейцином | [24] | |
АНКСА1 | АНКСА1 | Аннексин А1 | [24] | |
АНКСА11 | АНКСА11 | Аннексин 11 | [44] | |
АНКСА6 | АНКСА6 | Аннексин 6 | [24] | |
АНХА7 | АНХА7 | Аннексин 7 | [24] [44] | |
АПЕКС1 | АПЕКС1 | ДНК-(апуриновый или апиримидиновый сайт) лиаза | [24] | |
APOBEC3C | APOBEC3C | Аполипопротеин В мРНК редактирования фермента каталитическая субъединица 3C | [44] [46] | |
APOBEC3G | APOBEC3G | Аполипопротеин В мРНК редактирования фермента каталитическая субъединица 3G | [48] | |
АРИД2 | АРИД2/БАФ200 | AT-богатый домен взаимодействия 2 | [46] | |
ARPC1B | ARPC1B | Субъединица 1B комплекса 2/3 актин-родственного белка | [24] | |
AHSA1 | АНА1 | Активатор активности АТФазы HSP90 1 | [54] | |
АКР | AQR/IBP160 | Сплайсосомный фактор связывания интрона Aquarius | [44] | |
ARMC6 | ARMC6 | Повтор Armadillo, содержащий 6 | [44] | |
ASCC1 | ASCC1 | Активирующий сигнал коинтегратора 1 комплексной субъединицы 1 | [44] [45] | |
ASCC3 | ASCC3 | Активирующий сигнал коинтегратора 1 комплекса субъединицы 3 | [45] | |
АТАД2 | АТАД2 | Белок 2, содержащий домен AAA семейства АТФазы | [24] | |
АТАД3А | АТАД3А | Белок 3А, содержащий домен AAA семейства АТФазы | [24] | да [35] |
АТГ3 | АТГ3 | Аутофагия, связанная с 3 | [44] | |
АТП5А1 | АТП5А1 | Субъединица альфа АТФ-синтазы, митохондриальная | [24] | |
АТП6В1Г1 | АТП6В1Г1/АТП6Г | АТФаза H+ Транспортирует субъединицу V1 G1 | [44] | |
АТХН2 | Атаксин 2 | Атаксин 2 | [24] [44] [45] [46] [55] [56] [57] [58] [59] [60] | |
ATXN2L | Атаксин-2 как | Атаксин 2 Нравится | [24] [44] [45] [46] [57] [60] | |
БАГ3 | БАГ3 | Молекулярный шапероновый регулятор семейства BAG 3 | [24] | |
БАНФ1 | БАНФ1 | Фактор барьера к аутоинтеграции | [24] | |
БАЗ1Б | БАЗ1Б | Бромодомен, соседствующий с доменом цинкового пальца 1B | [46] | |
БАЗ2А | БАЗ2А | Бромодомен, соседствующий с доменом цинкового пальца 2A | [46] | |
БЦКИП | БЦКИП | Белок, взаимодействующий с BRCA2 и CDKN1A | [44] | |
BCLAF1 | BCLAF1 | Фактор транскрипции 1, ассоциированный с BCL2 | [44] | |
BICC1 | BICC1 | РНК-связывающий белок 1 семейства BicC | [45] | |
BIRC2 | BIRC2/CIAP1 | Бакуловирусный повтор IAP, содержащий 2 | [46] | |
БЛМ | БЛМ | BLM RecQ как Хеликаза | [46] | |
БПК1Л1 | БОД1Л1/FAM44A | Биоориентация хромосом в клеточном делении 1 Нравится 1 | [46] | |
БОЛЛ | БУЛЬ | Гомолог Буля, РНК-связывающий белок | [61] | |
БРАТ1 | БРАТ1 | BRCA1-ассоциированный активатор ATM 1 | [24] | |
БРФ1 | БРФ1 | BRF1, субъединица фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы III | [36] | |
БТГ3 | БТГ3 | BTG Фактор антипролиферации 3 | [45] | да [45] |
C9orf72 | C9orf72 | Неохарактеризованный белок C9orf72 | [62] [63] | |
C15orf52 | C15orf52 | Неохарактеризованный белок C15orf52 | [24] | |
C20orf27 | C20orf72 | Хромосома 20 Открытая рамка считывания 27 | [44] | |
C2CD3 | C2CD3 | C2 Кальций-зависимый домен, содержащий 3 | [44] | |
CALML5 | CALML5 | Кальмодулин-подобный белок 5 | [24] | |
CALR | Кальретикулин/CRT | Кальретикулин | [64] | |
CAMSAP1 | CAMSAP1 | Кальмодулин-регулируемый спектрин-ассоциированный белок 1 | [46] | |
КАП1 | КАП1 | Белок 1, ассоциированный с аденилатциклазой | [24] | |
КАПРИН1 | Каприн-1 | Белок 1, ассоциированный с клеточным циклом | [44] [45] [65] [52] [66] [24] [67] [34] [68] [60] [46] | |
КАПЗА2 | КАПЗА2 | F-актин-покрывающий белок субъединица альфа-2 | [24] | |
КАПЗБ | КАПЗБ | Покрывающий актиновый белок мышечной субъединицы Z-линии бета | [46] | |
CARHSP1 | CARHSP1 | Регулируемый кальцием термостабильный белок 1 | [24] | |
CASC3 | МЛН51/БТЗ | Восприимчивость к раку 3 | [44] [45] [46] [69] [70] | |
ЦБФБ | ЦБФБ | Субъединица бета-фактора связывания ядра | [24] | |
Си-Би-Эс | Си-Би-Эс | Цистатионин бета-синтаза | [46] | |
CBX1 | CBX1 | Гомолог белка хромобокса 1 | [24] [60] | |
CBX3 | CBX3 | Хромобоксный белок гомолог 3 | [46] | |
CCAR1 | КАРП-1 | Регулятор цикла клеточного деления и апоптоза 1 | [52] [46] | |
CCDC9 | CCDC9 | Спиральный домен, содержащий 9 | [46] | |
CCDC9B | CCDC9B | Спиральный домен, содержащий 9B | [46] | |
CCDC124 | CCDC124 | Домен спирально-спиральный, содержащий 124 | [44] | |
CCDC85C | CCDC85C | Спиральный домен, содержащий 85C | [44] | |
CCT3 | CCT3 | Т-комплекс белка 1 субъединица гамма | [24] | |
CCT6A | CCT6A | Т-комплекс белка 1 субъединица дзета | [24] | |
CDC20 | CDC20 | Цикл деления клеток 20 | [46] | |
CDC37 | CDC37 | Цикл деления клеток 37 | [54] | |
CDC5L | CDC5L | Белок, подобный 5-му циклу деления клеток | [24] | |
CDC73 | CDC73 | Парафибромин | [24] | |
CDK1 | CDK1 | Циклинзависимая киназа 1 | [24] | |
CDK2 | CDK2 | Циклинзависимая киназа 2 | [71] | |
CDV3 | CDV3 | Гомолог CDV3 | [44] | |
CELF1 | CUGBP1 | Член семейства CUGBP Elav-подобных препаратов 1 | [24] [44] [45] [46] [72] | |
CELF2 | CUGBP2/BRUNOL3 | Член семейства CUGBP Elav-подобных препаратов 2 | [44] | |
CELF3 | CUGBP3/BRUNOL1 | Член семейства CUGBP Elav-Like 3 | [44] | |
CENPB | CENPB | Главный аутоантиген центромеры B | [24] | |
ЦЕНПФ | ЦЕНПФ | Центромерный белок F | [46] | |
КЭП78 | CEP78/CRDHL | Центросомальный белок 78 | [44] | |
КЭП85 | CEP85/CCDC21 | Центросомальный белок 78 | [45] | |
ЦЕРКЛ | Церамид-киназа как | Церамидкиназа как | [73] | |
КЛЛ1 | Кофилин-1 | Кофилин-1 | [24] | |
ЧЧД3 | ЧЧД3 | Спирально-спиральный-спиральный-спиральный домен-содержащий белок 3, митохондриальный | [24] | |
CHORDC1 | CHORDC1/CHP1 | Белок 1, содержащий домен, богатый цистеином и гистидином | [24] | |
CIRBP | CIRP | Холодовой индуцируемый РНК-связывающий белок | [44] [46] [74] | |
КИТ | КИТ | Цитрон Rho-взаимодействующая киназа | [24] | |
КЛИК4 | КЛИК4 | Белок внутриклеточного хлоридного канала 4 | [24] | |
CLNS1A | CLNS1A | Канал 1А, чувствительный к нуклеотидам хлорида | [44] | |
КЛПП | КЛПП | Казеинолитическая митохондриальная матриксная пептидаза протеолитическая субъединица | [44] | |
КНБП | ЗНФ9 | Белок, связывающий нуклеиновую кислоту с цинковым пальцем типа CCHC | [46] [75] | |
CNN3 | CNN3 | Кальпонин-3 | [24] | |
CNOT1 | CNOT1/CCR4 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 1 | [24] [45] | да [45] [76] |
CNOT10 | CNOT10 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 10 | [45] | да [45] |
CNOT11 | CNOT11 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 11 | [45] | да [45] |
CNOT2 | CNOT2 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 2 | [45] | да [45] |
CNOT3 | CNOT3 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 3 | [45] | да [45] |
CNOT4 | CNOT4 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 4 | [45] | да [45] |
CNOT6 | CNOT6 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 6 | [45] | да [45] |
CNOT6L | CNOT6L | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 6L | [45] | да [45] |
CNOT7 | CNOT7 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 7 | [45] | да [45] |
CNOT8 | CNOT8 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 8 | [45] | да [45] |
CNOT9 | CNOT9 | CCR4-не транскрипционный комплекс субъединица 9 | [45] | |
КОРО1Б | КОРО1Б | Коронин-1Б | [24] | |
КПБ2 | Карбоксипептидаза B2 | Карбоксипептидаза B2 | [77] | |
CPEB1 | КПЕБ | Цитоплазматический белок, связывающий элемент полиаденилирования 1 | [78] | |
CPEB4 | CPEB4 | Цитоплазматический элемент полиаденилирования, связывающий белок 4 | [44] [45] [46] | да [45] |
CPSF3 | CPSF3 | Субъединица 3 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [24] | |
CPSF6 | CPSF6 | Субъединица 6 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [24] | |
CPSF7 | CPSF7 | Субъединица 7 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [24] | |
КПВЛ | КПВЛ | Карбоксипептидаза, вителлогенная подобная | [45] | да [45] |
КРКЛ | КРКЛ | CRK-подобный протоонкоген, адаптерный белок | [44] | |
КРОКК | КРОКК | Ресничный корешок спиральный, Rootletin | [44] | |
КРЯБ | КРЯБ | Цепь альфа-кристаллина B | [24] | |
CRYBG1 | CRYBG1 | Кристаллин Бета-Гамма Домен, Содержащий 1 | [46] | |
CSDE1 | CSDE1 | Белок E1, содержащий домен холодового шока | [24] [44] [45] [46] [60] | |
CSE1L | CSE1L/XPO2/Экспортин-2 | Экспортин-2 | [24] | |
CSNK2A1 | Казеинкиназа 2 альфа | Казеинкиназа 2 Альфа 1 | [79] | |
CSTB | Цистатин В | Цистатин В | [44] | |
CSTF1 | CSTF1 | Фактор стимуляции расщепления субъединица 1 | [24] | |
CTNNA2 | CTNNA2 | Катенин альфа-2 | [24] | |
CTNND1 | CTNND1 | Катенин дельта-1 | [24] | |
CTTNBP2NL | CTTNBP2NL | Белок CTTNBP2, подобный N-терминальному | [24] | |
CWC22 | CWC22 | Гомолог фактора пре-мРНК-сплайсинга CWC22 | [24] | |
DAZAP1 | DAZAP1 | DAZ-ассоциированный белок 1 | [24] [44] [45] [46] | |
DAZAP2 | ПРТБ | DAZ-ассоциированный белок 2 | [80] | |
ДАЗЛ | ДАЗЛ1 | Удалено в Азооспермия Нравится | [81] | |
ДКД | ДКД | Дермцидин | [24] | |
DCP1A | DCP1a | Декапирование мРНК 1а | [24] [44] [78] | да [35] |
DCP1B | DCP1b | Декапирование мРНК 1b | [44] [46] | да [35] |
ДКП2 | ДКП2 | Декапирование мРНК 2 | [45] | |
DCTN1 | DCTN1 | Субъединица 1 динактина | [24] | |
DDX1 | Белок DEAD-box 1 | DEAD-Box Хеликаза 1 | [24] [44] [45] [46] [82] | |
DDX11 | Белок DEAD box 11 | DEAD-Box Хеликаза 11 | [46] | |
DDX19A | DDX19A | АТФ-зависимая РНК-хеликаза DDX19A | [24] [60] | |
DDX21 | DDX21 | Ядрышковая РНК-хеликаза 2 | [24] | да [35] |
DDX3 | Белок DEAD box 3 | DEAD-Box Хеликаза 3 | [24] [83] [84] | |
DDX3X | DDX3X | DEAD-Box Хеликаза 3, Х-сцепленная | [44] [45] [46] [85] [86] [60] | |
DDX3Y | DDX3Y | DEAD-Box Хеликаза 3, Y-связанная | [44] | |
DDX31 | DDX31 | DEAD-Box Хеликаза 31 | [46] | |
DDX47 | DDX47 | Вероятная АТФ-зависимая РНК-хеликаза DDX47 | [24] | |
DDX50 | DDX50 | АТФ-зависимая РНК-хеликаза DDX50 | [24] | да [35] |
DDX58 | РИГ-I | DExD/H-Box Хеликаза 58 | [87] | |
DDX6 | Белок DEAD-box 6 | DEAD-Box Хеликаза 6 | [24] [44] [45] [56] [88] [78] [48] [89] [46] | да [35] [45] |
ДЕРА | ДЕРА | Дезоксирибозофосфатальдолаза | [90] | |
ДГКР8 | ДГКР8 | Субблок микропроцессорного комплекса DGCR8 | [46] | |
DHX30 | DHX30 | Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-хеликаза DHX30 | [24] [44] | да [35] |
DHX33 | DHX33 | DEAH-Box Хеликаза 33 | [44] | |
DHX36 | РХАУ | DEAH-Box Хеликаза 36 | [44] [45] [25] [46] | |
DHX57 | DHX57 | DExH-Box Хеликаза 57 | [45] [46] | |
DHX58 | ЛГП2 | DExH-Box Хеликаза 58 | [87] | |
ДИДО1 | ДИДО1 | Смертоносный-уничтожающий 1 | [46] | |
ДИС3Л2 | DIS3L2/FAM3A | DIS3 как 3'-5' экзорибонуклеаза 2 | [44] | |
ДИСК1 | Нарушенный при шизофрении 1 | Нарушенный шизофренией 1 | [91] | |
ДКС1 | ДКС1 | дискерин; субъединица 4 рибонуклеопротеинового комплекса H/ACA | [24] [92] | |
ДНКI1 | Промежуточная цепь аксонемального динеина 1 | Динеин Аксонемальная промежуточная цепь 1 | [93] | |
ДНКJA1 | ДНКJA1 | Гомолог подсемейства DnaJ A, член 1 | [24] | |
ДНКJC8 | ДНКJC8 | DnaJ гомолог подсемейства C член 8 | [24] | |
ДОК4 | ДОК4 | Посвятитель Цитокинеза 4 | [46] | |
DPYSL2 | DPYSL2 | Белок 2, связанный с дигидропиримидиназой | [24] | |
DPYSL3 | DPYSL3 | Белок 3, связанный с дигидропиримидиназой | [24] | |
ДРОША | ДРОША | Дроша Рибонуклеаза III | [44] | |
ЦСП | ЦСП | Десмоплакин | [24] [44] | |
летнее время | летнее время | Дистонин | [24] | |
DSTN | DSTN | Дестрин | [24] | |
ДТЛ | ДТЛ | Гомолог лигазы белка убиквитина E3 без зубцов | [46] | |
DTX3L | DTX3L | E3 убиквитин-протеинлигаза DTX3L | [24] | |
ДУСП12 | ДУСП12/YVH1 | Двойная специфичность фосфатазы 12 | [94] | |
DYNC1H1 | Цитоплазматический динеин, тяжелая цепь 1 | Динеин Цитоплазматический 1 Тяжелая цепь 1 | [93] | |
ДИНЛЛ1 | Цитоплазматический динеин легкий полипептид | Легкая цепь динеина LC8-тип 1 | [44] [95] | |
ДИНЛЛ2 | ДИНЛЛ2 | Легкая цепь динеина 2, цитоплазматическая | [24] | |
DYRK3 | DYRK3 | Двойная специфичность тирозинового фосфорилирования, регулируемого киназой 3 | [96] | |
ДЗИП1 | ДЗИП1 | DAZ взаимодействующий цинковый палец белок 1 | [97] | |
DZIP3 | DZIP3 | DAZ взаимодействующий цинковый палец белок 3 | [45] | |
EDC3 | EDC3 | Усилитель декэпирования мРНК 3 | [44] [45] [46] | да [45] |
EDC4 | EDC4 | Усилитель мРНК-декапирующего белка 4 | [24] [44] [46] | да [35] |
ЕИФ1 | ЕИФ1 | Фактор инициации трансляции эукариот 1 | [44] | |
ЭИФ2А | ЭИФ2А | Фактор инициации трансляции эукариот 2А | [36] [24] [52] [98] | |
ЭИФ2АК2 | Протеинкиназа R/PKR | Эукариотический фактор инициации трансляции 2 Альфа-киназа 2 | [68] [87] [99] | |
ЭИФ2Б1-5 | ЭИФ2Б | Фактор инициации трансляции эукариот 2B | [98] | |
ЭИФ2С1 | Субъединица 1 EIF2A | Субъединица альфа фактора инициации трансляции 2 эукариот | [24] | |
ЭИФ2С2 | Субъединица 2 EIF2A | Субъединица бета фактора инициации трансляции 2 эукариот | [24] | |
EIF3A | EIF3A | Субъединица А фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [49] [34] [100] [46] | |
EIF3B | EIF3B | Субъединица B фактора инициации трансляции 3 эукариот | [36] [24] [80] [101] [102] | |
EIF3C | EIF3C | Субъединица С фактора инициации трансляции 3 эукариот | [44] | |
EIF3D | EIF3D | Субъединица D фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [60] | |
EIF3E | EIF3E | Субъединица E фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [60] | |
EIF3F | EIF3F | Субъединица F фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] | |
EIF3G | EIF3G | Субъединица G фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [60] [46] | |
EIF3H | EIF3H | Субъединица H фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [46] | |
ЭИФ3И | ЭИФ3И | Субъединица I фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [46] | |
EIF3J | EIF3J | Субъединица J фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] | |
ЭИФ3К | ЭИФ3К | Субъединица К фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] | |
EIF3L | EIF3L | Субъединица L фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] [44] [60] | |
ЭИФ3М | ЭИФ3М | Субъединица М фактора инициации трансляции 3 эукариот | [24] | |
ЭИФ4А1 | ЭИФ4А1 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4A1 | [24] [44] [103] [46] | |
ЭИФ4А2 | ЭИФ4А2 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4A2 | [44] [104] [46] | |
ЭИФ4А3 | ЭИФ4А3 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4A3 | [44] | |
EIF4B | EIF4B | Фактор инициации эукариотической трансляции 4B | [24] [44] [46] | |
EIF4E | EIF4E | Фактор инициации эукариотической трансляции 4E | [100] [98] [3] [105] [70] [106] [107] [36] | да [36] |
ЭИФ4Э2 | ЭИФ4Э2 | Эукариотический фактор инициации трансляции 4E, член семейства 2 | [45] [107] | да [45] |
ЭИФ4Э3 | ЭИФ4Э3 | Эукариотический фактор инициации трансляции 4E, член семейства 3 | [107] | |
ЭИФ4ЕНИФ1 | ЭИФ4ЕНИФ1 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4E, фактор ядерного импорта 1 | [44] [45] | да [45] |
EIF4G1 | EIF4G1 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4G1 | [24] [44] [100] [98] [3] [105] [108] [109] [80] [110] [34] [46] | |
EIF4G2 | EIF4G2 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4G2 | [24] [45] | |
EIF4G3 | EIF4G3 | Фактор инициации эукариотической трансляции 4G3 | [44] | |
ЭИФ4Х | ЭИФ4Х | Фактор инициации эукариотической трансляции 4H | [24] [44] [46] | |
ЭИФ5А | ЭИФ5А | Фактор инициации эукариотической трансляции 5А | [101] | |
ЭЛАВЛ1 | ХуР | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 1 | [24] [34] [44] [111] [100 ] [112 ] [105] [106] [80] [95] [113] [114] [46] | да [35] |
ЭЛАВЛ2 | ЭЛАВЛ2 | ELAV-подобный белок 2 | [24] [44] | да [35] |
ЭЛАВЛ3 | ELAVL3/HuC | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 3 | [44] | |
ЭЛАВЛ4 | ХуД | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 4 | [44] [115] | |
ЭНК1 | ЭНК1 | Эктодермально-Нейральная Кора 1 | [46] | |
ЕНДОВ | Эндов | Эндонуклеаза V | [116] | |
ENTPD1 | ENTPD1 | Эктонуклеозидтрифосфатдифосфогидролаза 1 | [44] | |
ЭП400 | ЭП400 | E1A связывающий белок P400 | [46] | |
ЭППК1 | ЭППК1 | Эпиплакин | [24] | |
ETF1 | ETF1 | Субъединица 1 фактора высвобождения эукариотической пептидной цепи | [24] | |
EWSR1 | EWSR1 | EWS РНК-связывающий белок 1 | [117] [118] [46] | |
ФАБП5 | ФАБП5 | Белок, связывающий жирные кислоты 5 | [44] | |
ФАМ120А | FAM120A/ОССА | Конститутивный коактиватор PPAR-гамма-подобного белка 1 | [24] [44] [45] | да [35] |
FAM120C | FAM120C | Семья с последовательностью сходства 120C | [44] [45] | |
ФАМ168А | ФАМ168А | Семья с последовательностью сходства 168 Член А | [46] | |
ФАМ168Б | FAM168B/МАНИ | Семья с последовательностью сходства 168 Член B | [44] | |
FAM83H | FAM83H | Семья с последовательностью сходства 83 члена H | [46] | |
ФАМ98А | ФАМ98А | Семья с последовательностью сходства 98 Член А | [24] [44] [119] [46] | |
FAM98C | FAM98C | Семья с последовательностью сходства 98 Член C | [46] | |
FASTK | БЫСТРЫЙ | Fas-активированная серин/треониновая киназа | [36] | да [36] |
ФБЛ | ФБЛ | рРНК 2-О-метилтрансфераза фибрилларин | [24] | |
FBRSL1 | Фиброзин как 1 | Фиброзин как 1 | [45] | |
ФХЛ1 | ФХЛ1 | Четыре с половиной домена LIM белка 1 | [24] | |
FKBP1A | FKBP1A | FKBP Пролил Изомераза 1A | [46] | |
ФНБ | ФНБ | Филамин-Б | [24] | |
ФМР1 | ФМРП | Синдром ломкой X-хромосомы, умственная отсталость 1 | [22] [24] [44] [45] [69] [70] [105] [120] [121] [94] [60] [46] | |
FNDC3B | FNDC3B | Белок 3B, содержащий домен фибронектина типа III | [24] [45] [46] | |
FSCN1 | FSCN1 | Fascin | [24] | |
FTSJ3 | FTSJ3 | белок пре-рРНК-процессинга FTSJ3 | [24] | |
ФУБП1 | ФУБП1 | Белок связывания дальнего элемента вверх по течению 1 | [44] [46] | |
ФУБП3 | ФУБП3 | Дальний элемент-связывающий белок 3 | [24] [44] [45] [46] | |
ФУС | ФУС | FUS РНК-связывающий белок | [24] [44] [49] [117] [118] [122] [123] [124] [125] [126] [ 127] [128] [46] | |
FXR1 | FXR1 | FMR1 аутосомный гомолог 1 | [24] [44] [45] [120] [105] [106] [129] [46] | |
FXR2 | FXR2 | FMR1 аутосомный гомолог 2 | [24] [44] [45] [120] [105] [46] | |
Г3БП1 | Г3БП1 | Фактор сборки стрессовых гранул G3BP 1 | [24] [44] [45] [67] [99] [68 ] [130] [ 131] [36] [106] [ 132] [ 129] [133] [60] [46] | |
Г3БП2 | Г3БП2 | Фактор сборки стрессовых гранул G3BP 2 | [24] [44] [45] [134] [135] [60] [46] | |
ГАБАРАПЛ2 | ГАБАРАПЛ2/ГЭФ2/АТГ8 | Белок, ассоциированный с рецептором ГАМК типа А, как 2 | [44] | |
ГАК | ГАК | Циклин G-ассоциированная киназа | [46] | |
ГАР1 | ГАР1 | Субъединица 1 комплекса рибонуклеопротеина H/ACA | [92] | |
ГКА | Гранкальцин | Гранкальцин | [44] | |
GEMIN5 | Гемин-5 | Gem ядерный органелл ассоциированный белок 5 | [108] | |
ГФПТ1 | ГФПТ1 | Глутамин-фруктозо-6-фосфатаминотрансфераза [изомеризующая] 1 | [24] | |
GIGYF1 | GIGYF1/PERQ1 | GRB10, взаимодействующий с белком 1 GYF | [44] | |
GIGYF2 | GIGYF2/TNRC15/PARK11/PERQ2 | GRB10, взаимодействующий с белком GYF 2 | [44] [45] | да [45] |
ГЛЕ1 | ГЛЕ1 | GLE1, посредник экспорта РНК | [45] [136] [137] | |
ГЛО1 | Глиоксалаза | Глиоксалаза | [44] | |
GLRX3 | GLRX3/Глутаредоксин 3/TNLX2 | Глутаредоксин 3 | [44] | |
ГЛУД1 | ГЛУД1 | Глутаматдегидрогеназа 1 | [46] | |
ГНБ2 | ГНБ2 | Гуаниновый нуклеотид-связывающий белок G(I)/G(S)/G(T) субъединица бета-2 | [24] | |
ГОЛГА2 | Гольгин А2 | Гольгин А2 | [44] | |
ГПАТ3 | ГПАТ3 | Глицерол-3-фосфат ацилтрансфераза 3 | [46] | |
ГРБ2 | GRB2/ASH | Белок 2, связанный с рецептором фактора роста | [44] | |
ГРБ7 | ГРБ7 | Белок 7, связанный с рецептором фактора роста | [138] [139] | |
GRSF1 | GRSF1 | Фактор связывания последовательности РНК, богатой G-белком 1 | [44] [45] | |
ГСПТ1 | eRF3 | Переход фазы G1 в S 1 | [44] [140] | |
GTF2I | GTF2I | Общий фактор транскрипции IIi | [46] | |
GTF3C1 | GTF3C1 | Субъединица 1 общего фактора транскрипции IIIC | [46] | |
GTF3C4 | GTF3C4 | Субъединица 4 общего фактора транскрипции IIIC | [46] | |
H1F0 | H1F0 | Гистон H1.0 | [24] | |
H1FX | H1FX | Гистон H1x | [24] | |
H2AFV | H2AFV | Гистон H2A.V | [24] | |
HABP4 | Ки-1/57 | Гиалуронан-связывающий белок 4 | [141] | |
HDAC6 | HDAC6 | Гистондеацетилаза 6 | [86] [132] [60] | |
ЛПВП | ЛПВП-связывающий белок/ВГЛ/Вигилин | Белок, связывающий липопротеины высокой плотности | [44] | |
ХЕЛЗ | ХЕЛЗ | Вероятная хеликаза с доменом цинкового пальца | [24] [44] [45] | да [45] |
ХЕЛЗ2 | ХЕЛЗ2 | Хеликаза с доменом цинкового пальца 2 | [24] | |
HMGA1 | HMGA1 | Группа белков с высокой подвижностью HMG-I/HMG-Y | [24] | |
HMGB3 | HMGB3 | Группа высокомобильных белков B3 | [24] | |
HMGN1 | HMGN1 | Негистоновый хромосомный белок HMG-14 | [24] | |
HNRNPA1 | HnRNPA1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А1 | [24] [44] [49] [142] [143] [144] [145] | |
HNRNPA2B1 | HnRNPA2/B1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A2/B1 | [24] [44] [146] [60] | |
HNRNPA3 | HNRNPA3 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А3 | [24] [44] | |
HNRNPAB | HNRNPAB | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А/В | [24] [44] [45] | |
HNRNPD | HNRNPD | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D | [44] | |
HNRNPDL | HNRNPDL | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D-подобный | [44] | |
HNRNPF | HNRNPF | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин F | [44] | |
HNRNPH1 | HNRNPH1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 | [44] | |
HNRNPH2 | HNRNPH2 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H2 | [24] | |
HNRNPH3 | HNRNPH3 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3 | [44] | |
HNRNPK | HNRNPK | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин К | [24] [114] [147] | |
HNRNPUL1 | HNRNPUL1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U-подобный белок 2 | [24] | |
HSBP1 | HSBP1 | Белок 1, связывающий фактор теплового шока | [44] | |
HSP90AA1 | HSP90 | Белок теплового шока HSP 90-альфа | [24] | |
HSPA4 | HSP70 RY | Тепловой шок 70 кДа белок 4 | [24] | |
HSPA9 | HSP70 9Б | Белок стресса-70, митохондриальный | [24] | |
HSPB1 | HSP27 | Семейство белков теплового шока B (малые) Член 1 | [24] [148] | да [35] |
HSPB8 | HSPB8 | Семейство белков теплового шока B (малые), член 8 | [149] | |
HSPBP1 | HSPBP1 | Связывающий белок HSPA (Hsp70) 1 | [150] | |
HSPD1 | HSPD1 | 60 кДа белок теплового шока, митохондриальный | [24] [44] | |
ХТТ | Хантингтин | Хантингтин | [66] | |
ИБТК | ИБТК | Ингибитор тирозинкиназы Брутона | [45] | |
IFIH1 | МДА5 | Интерферон, индуцированный доменом 1 геликазы C | [87] | |
IGF2BP1 | IGF2BP1 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 1 | [24] [44] [45] | да [35] |
IGF2BP2 | IGF2BP2 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 2 | [24] [44] [45] | да [35] |
IGF2BP3 | IGF2BP3 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 3 | [24] [44] [45] [134] | да [35] |
ИК | ИК | Красный белок | [24] | |
ИЛФ3 | НФ90 | Фактор связывания усилителя интерлейкина 3 | [151] | да [35] |
ИПО7 | ИПО7 | Импортин-7 | [24] | |
ИППК | IP5K | Инозитол-пентакисфосфат-2-киназа | [152] | |
ITGB1 | ITGB1 | Интегрин бета-1 | [24] | |
JMJD6 | JMJD6 | Аргининдеметилаза и лизингидроксилаза | [133] | |
КАНК2 | КАНК2 | Белок 2, содержащий мотив KN и домен повтора анкирина | [24] | |
КЕАП1 | КЕАП1/КЛХЛ19 | Белок 1, ассоциированный с ECH, как у Кельча | [44] | |
KHDRBS1 | Сэм68 | KH РНК-связывающий домен, содержащий, связанный с передачей сигнала 1 | [24] [153] [154] [155] | |
KHDRBS3 | KHDRBS3 | Белок 3, содержащий домен KH, связывающий РНК и связанный с трансдукцией сигнала | [24] | |
КХСРП | КСРП/ФБП2 | Регуляторный белок сплайсинга типа KH | [24] [44] [156] | |
KIAA0232 | KIAA0232 | KIAA0232 | [45] | да [45] |
KIAA1524 | CIP2A | Белок CIP2A | [24] | |
КИФ1Б | КИФ1Б | Член семейства кинезинов 1B | [45] | |
КИФ13Б | КИФ13Б/ГАКИН | Член семейства кинезинов 13B | [44] | |
КИФ23 | КИФ23 | Кинезиноподобный белок KIF23 | [24] | да [35] |
КИФ2А | Кинезин Тяжелая Цепь Член 2 | Член семейства кинезинов 2A | [93] | |
КЛК1 | Легкая цепь кинезина 1 | Легкая цепь кинезина 1 | [93] | |
КПНА1 | Импортин-ɑ5 | Субъединица кариоферина альфа 1 | [24] [44] [157] | |
КПНА2 | Импортин-ɑ1 | Субъединица кариоферина альфа 2 | [24] [157] [158] [137] | |
КПНА3 | Импортин-ɑ4 | Субъединица кариоферина альфа 3 | [44] [157] | |
КПНА6 | Импортин-ɑ7 | Субъединица импортина альфа | [24] | |
КПНБ1 | Импортин-β1 | Субъединица кариоферина бета 1 | [24] [157] [137] [60] | |
Л1РЕ1 | LINE1 ORF1p | Белок ORF1 LINE1 | [24] [49] | |
LANCL1 | LanC Нравится 1 | LanC Нравится 1 | [44] | |
LARP1 | LARP1 | La-связанный белок 1 | [24] | |
LARP1B | LARP1B | La-связанный белок 1b | [45] | |
LARP4 | La-связанный белок 4 | Член семейства доменов рибонуклеопротеина La 4 | [24] [44] [45] [159] | |
LARP4B | LARP4B | Член семейства доменов рибонуклеопротеина La 4B | [44] [45] | |
LASP1 | LIM и SH3 белок 1/MLN50 | LIM и SH3 белок 1 | [44] | |
ЛБР | ЛБР | Рецептор ламина-B | [24] | |
LEMD3 | LEMD3 | Внутренний ядерный мембранный белок Man1 | [24] | |
ЛИГ3 | ДНК-лигаза 3 | ДНК-лигаза 3 | [44] | |
LIN28A | LIN28A | Гомолог А Lin-28 | [44] [160] | |
LIN28B | LIN28B | Lin-28 Гомолог B | [44] [160] | |
ЛМНА | ЛМНА | Преламин-А/С | [24] | |
ЛПП | ЛПП | Предпочитаемый липомой партнер | [24] | |
ЛСМ1 | ЛСМ1 | Гомолог LSM1, связанный с деградацией мРНК | [44] | да [161] |
ЛСМ12 | ЛСМ12 | Гомолог LSM12 | [44] [45] | |
ЛСМ14А | РАП55 | LSM14A, фактор сборки тела процессинга мРНК | [24] [44] [45] [162] [163] | да [35] [45] |
ЛСМ14Б | ЛСМ14Б | Гомолог белка LSM14 B | [24] [44] [45] | да [35] |
ЛСМ3 | ЛСМ3 | U6 snRNA-ассоциированный Sm-подобный белок LSm3 | [24] | да [161] |
ЛУК7Л | ЛУК7Л | Предполагаемый РНК-связывающий белок Luc7-подобный 1 | [24] | |
ЛУЗП1 | ЛУЗП1 | Лейциновый белок-молния 1 | [24] [45] | |
MACF1 | MACF1 | Фактор сшивания микротрубочек с актином 1, изоформы 1/2/3/5 | [24] [60] | |
МАЭЛЬ | МАЭЛЬ | Maelstrom Сперматогенный транспозонный глушитель | [164] | |
MAGEA4 | MAGEA4 | Меланома-ассоциированный антиген 4 | [24] | |
MAGED1 | MAGED1 | Меланома-ассоциированный антиген D1 | [24] [44] [45] | |
MAGED2 | MAGED2 | Меланома-ассоциированный антиген D2 | [24] | |
МАГОХБ | МАГОХБ | Белок mago nashi гомолог 2 | [24] | |
MAP1LC3A | LC3-I | Белок, ассоциированный с микротрубочками 1, легкая цепь 3 альфа | [165] [166] | |
КАРТА4 | КАРТА4 | Белок 4, ассоциированный с микротрубочками | [24] | |
MAPK1IP1L | MAPK1IP1L | Митоген-активируемая протеинкиназа 1 Взаимодействие с белком 1 Нравится | [44] | |
MAP4K4 | MAP4K4 | Митоген-активируемая протеинкиназа киназа киназа киназа киназа 4 | [24] | |
МАРК8 | JNK1 | Митоген-активируемая протеинкиназа 8 | [167] | |
МАПРЕ1 | МАПРЕ1 | Белок, ассоциированный с микротрубочками, член семейства RP/EB 1 | [24] | |
МАПРЕ2 | МАПРЕ2 | Белок, ассоциированный с микротрубочками, RP/EB, член семейства 2 | [44] | |
МАРФ1 | МАРФ1 | Регулятор мейоза и фактор стабильности мРНК 1 | [45] | да [45] |
МАРС | МАРС | Метионин—тРНК-лигаза, цитоплазматическая | [24] | |
МБНЛ1 | МБНЛ1 | Muscleblind, как регулятор сплайсинга 1 | [82] | |
МБНЛ2 | МБНЛ2 | Muscleblind, как регулятор сплайсинга 2 | [45] | |
МСМ4 | МСМ4 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM4 | [24] | |
МСМ5 | МСМ5 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM5 | [24] | |
МСМ7 | МСМ7 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM7 | [24] | да [35] |
МЕТАП1 | МЕТАП1 | Метионинаминопептидаза | [24] | |
МЕТАП2 | МЕТАП2 | Метиониламинопептидаза 2 | [44] | |
MCRIP1 | FAM195B/ГРАН2 | Гранулин-2 | [44] [45] [89] | |
MCRIP2 | FAM195A/ГРАН1 | Гранулин-1 | [45] [89] | |
МЕКС3А | МЕКС3А | РНК-связывающий белок MEX3A | [24] | да [35] |
MEX3B | MEX3B | Член семейства связывающих РНК Mex-3 B | [44] [168] | |
MEX3C | MEX3C | Член семейства связывающих РНК Mex-3 C | [44] [169] | |
MEX3D | MEX3D | Член семейства связывающих РНК Mex-3 D | [45] | |
МФАП1 | МФАП1 | Микрофибриллярно-ассоциированный белок 1 | [24] | |
МКИ67 | МКИ67 | Антиген KI-67 | [24] | |
МКРН2 | МКРН2 | Makorin Протеин для безымянного пальца 2 | [44] [45] | |
МОВ10 | МОВ-10 | Mov10 RISC Комплекс РНК-хеликаза | [24] [45] [48] | да [35] [45] |
МШ6 | МШ6 | Белок восстановления несоответствий ДНК Msh6 | [24] | |
МСИ1 | Мусаси-1 | Мусаши РНК-связывающий белок 1 | [44] [163] | да [35] |
МСИ2 | МСИ2 | РНК-связывающий белок Мусаши гомолог 2 | [24] [44] | |
MTHFD1 | MTHFD1 | C-1-тетрагидрофолатсинтаза, цитоплазматическая | [24] | |
МТФСД | МТФСД | Метилтетрагидрофолатсинтетаза домен, содержащий | [170] | |
МТОР | МТОР | Механистическая мишень рапамицина | [96] [171] | |
МИО6 | МИО6 | Нетрадиционный миозин-VI | [24] | |
NCOA3 | СРК-3 | Коактиватор ядерного рецептора 3 | [172] | |
NDEL1 | NUDEL/MITAP1/EOPA | NudE Нейроразвивающий белок 1 Нравится 1 | [44] | |
НЕЛЬФЕ | NELF-E/RD | Отрицательный фактор удлинения комплексного члена E | [44] | |
НЕКСН | НЕКСН | Нексилин | [24] | |
NXF1 | NXF1/MEX67/TAP | Фактор экспорта ядерной РНК 1 | [45] [60] | |
НКРФ | НРФ | Фактор подавления NFK-B | [44] | |
NOLC1 | Фосфопротеин ядрышка и спирального тельца 1/NOPP140 | Фосфопротеин 1 ядрышка и спирального тельца | [44] | |
НЕТ НЕТ | НеО | Не-POU домен, содержащий связывание октамера | [24] [173] | |
НОП58 | НОП58 | Ядрышковый белок 58 | [24] | да [35] |
НОСИП | НОСИП | Белок, взаимодействующий с синтазой оксида азота | [24] | |
НОВА2 | НОВА2 | Альтернативный регулятор сплайсинга NOVA 2 | [44] | |
НРГ2 | Нейрегулин-2 | Нейрегулин-2 | [102] | |
НСУН2 | НСУН2 | тРНК (цитозин(34)-C(5))-метилтрансфераза | [24] | |
НТМТ1 | НТМТ1 | N-концевая Xaa-Pro-Lys N-метилтрансфераза 1 | [24] | |
НУЦК | НУЦК | Белок ядерной миграции nudC | [24] | |
НУФИП1 | НУФИП | NUFIP1, FMR1 взаимодействующий белок 1 | [105] | |
НУФИП2 | НУФИП2 | Ядерный ломкий X-хромосомный белок, взаимодействующий с умственной отсталостью 2 | [24] [44] [45] [89] [60] | |
НУПЛ2 | НУПЛ2 | Нуклеопорин как 2 | [137] | |
НУП153 | НУП153 | Нуклеопорин 153 | [44] | |
НУП205 | НУП205 | Белок ядерного порового комплекса Nup205 | [24] [137] | |
НУП210 | НУП210/ГП210 | Нуклеопорин 210 | [137] | |
НУП214 | НУП214 | Нуклеопорин 214 | [137] | |
НУП50 | НУП50 | Нуклеопорин 50 | [137] | |
НУП58 | НУП58/НУПЛ1 | Нуклеопорин 58 | [137] | |
НУП85 | НУП85 | Нуклеопорин 85 | [137] | |
НУП88 | НУП88 | Нуклеопорин 88 | [137] | |
НУП98 | НУП98/НУП96 | Белок ядерного порового комплекса Nup98-Nup96 | [24] [137] [60] | |
ОАСЛ | ОАСЛ/ОАСЛ1 | 2'-5'-олигоаденилатсинтетаза, подобная | [174] | |
ОАС1 | ОАГ | 2′–5′ олигоаденилатсинтетаза | [87] | |
ОАС2 | ОАС2 | 2'-5'-Олигоаденилатсинтетаза 2 | [99] | |
ОГФОД1 | ТПА1 | 2-оксоглутарат и железозависимый домен оксигеназы, содержащий 1 | [175] | |
ОГГ1 | ОГГ1 | 8-оксогуанин ДНК-гликозилаза | [176] | |
ОСБПЛ9 | Оксистеролсвязывающий белок, как 9 | Оксистеролсвязывающий белок, как 9 | [44] | |
ОТУД4 | ОТУД4/ХИН1 | ОТЕ Деубиквитиназа 4 | [44] [45] [177] | |
П4ГБ | Субъединица бета пролил-4-гидроксилазы | Субъединица бета пролил-4-гидроксилазы | [44] | |
ПАБПК1 | ПАБП1 | Поли(А) связывающий белок цитоплазматический 1 | [24] [44] [45] [148] [112] [55] [120] [70] [105] [134] | |
ПАБПК4 | ПАБПК4 | Полиаденилат-связывающий белок 4 | [24] [44] [45] | |
ПАК4 | ПАК4 | Серин/треонин-протеинкиназа PAK 4 | [24] [44] | |
ПАЛЛД | Палладин | Палладин | [24] | |
ПАРГ | ПАРГ/ПАРГ99/ПАРГ102 | Поли(АДФ-рибоза)гликогидролаза | [178] | |
ПАРК7 | ПАРК7/DJ-1 | Дегликаза, ассоциированная с паркинсонизмом | [179] | да [179] |
ПАРН | ПАРН/ДАН | Поли(А)-специфическая рибонуклеаза | [44] | |
ПАРП12 | ПАРП-12/АРТД12 | Член семейства поли(АДФ-рибоза) полимераз 12 | [45] [178] [180] | |
ПАРП14 | ПАРП-14 | Член семейства поли(АДФ-рибоза) полимераз 14 | [178] | |
ПАРП15 | ПАРП-15 | Член семейства поли(АДФ-рибоза) полимераз 15 | [178] | |
ПАТЛ1 | ПАТЛ1 | PAT1 гомолог 1, фактор распада мРНК процессингового тела | [44] [45] | да [45] |
ПАВР | ПАВР | PRKC апоптоз WT1 регуляторный белок | [24] | |
ПКБП1 | PCBP1/HNRNPE1 | Поли(RC) связывающий белок 1 | [44] [45] | |
ПКБП2 | PCBP2/HNRNPE2 | Поли(RC) связывающий белок 2 | [24] [44] [45] [77] | |
ПКНА | ПКНА | Ядерный антиген пролиферирующих клеток | [24] | |
ПДАП1 | ПДАП1 | PDGFA-ассоциированный белок 1 | [44] | |
PDCD4 | PDCD4 | Запрограммированная гибель клеток 4 | [181] | |
PDCD6IP | PDCD6IP | Программируемая клеточная смерть 6-взаимодействующий белок | [24] | |
PDIA3 | PDIA3 | Семейство протеиндисульфидизомераз А, член 3 | [44] | |
PDLIM1 | PDLIM1 | Белок 1 домена PDZ и LIM | [24] | |
PDLIM4 | PDLIM4 | Белок домена PDZ и LIM 4 | [24] | |
PDLIM5 | PDLIM5 | Белок 5 домена PDZ и LIM | [24] | |
ПДС5Б | ПДС5Б | Белок сплочения сестринских хроматид PDS5 гомолог B | [24] | |
ПЭФ1 | ПЭФ1 | Домен Penta-EF-Hand, содержащий 1 | [44] | |
ПЭГ10 | ПЭГ10 | Отцовски выраженный 10 | [45] | |
ПЕЛО | ПЕЛО | Гомолог белка пелота | [24] | |
ПЕПД | Пептидаза D | Пептидаза D | [44] | |
ПЕКС11Б | ПЕКС11Б | Фактор пероксисомального биогенеза 11 бета | [44] | |
ПФДН4 | ПФДН4 | Субъединица префолдина 4 | [24] | |
ПФН1 | Профилин 1 | Профилин 1 | [24] [59] | |
ПФН2 | Профилин 2 | Профилин 2 | [24] [59] | |
ПГАМ5 | ПГАМ5 | Серин/треонин-протеинфосфатаза PGAM5, митохондриальная | [24] | |
ПГП | ПГП/Г3ПП | Фосфогликолатфосфатаза | [44] | |
ФГБ2 | Запрет 2 | Запрет 2 | [21] | |
PHLDB2 | PHLDB2 | Член 2 семейства доменов, подобных гомологии плекстрина | [24] | |
ПКП1 | Плакофилин 1 | Плакофилин 1 | [129] | |
ПКП2 | Плакофилин 2 | Плакофилин 2 | [24] | |
ПКП3 | Плакофилин 3 | Плакофилин 3 | [129] | |
ПНПТ1 | ПНФаза I | Полирибонуклеотид Нуклеотидилтрансфераза 1 | [44] | |
ПОЛР2Б | ПОЛР2Б | ДНК-направленная РНК-полимераза | [24] [60] | |
ПОМ121 | ПОМ121 | POM121 Трансмембранный нуклеопорин | [137] | |
ПОП7 | РПП20 | Гомолог POP7, субъединица рибонуклеазы P/MRP | [131] | |
ППМЕ1 | ППМЕ1 | Протеинфосфатаза метилэстераза 1 | [24] | |
ППП1Р8 | ППП1Р8 | Регуляторная субъединица 8 протеинфосфатазы 1 | [44] | |
ППП1Р10 | ППП1Р10 | Регуляторная субъединица 10 серин/треонин-протеинфосфатазы 1 | [24] [60] | |
ППП1Р18 | ППП1Р18 | Фостензин | [24] | |
ППП2Р1А | ППП2Р1А | Серин/треонин-протеинфосфатаза 2A 65 кДа регуляторная субъединица A альфа изоформа | [24] [60] | |
ППП2Р1Б | ППП2Р1Б | Серин/треонин-протеинфосфатаза 2A 65 кДа регуляторная субъединица A бета-изоформа | [44] | |
PQBP1 | ПКБП-1 | Полиглутаминсвязывающий белок 1 | [182] | |
PRDX1 | PRDX1 | Пероксиредоксин-1 | [24] [44] | |
PRDX6 | PRDX6 | Пероксиредоксин-6 | [24] | |
ПРКАА2 | AMPK-a2 | Протеинкиназа AMP-активируемая каталитическая субъединица альфа 2 | [20] | |
ПРККА | PKC-ɑ | Протеинкиназа C Альфа | [134] | |
ПРКРА | ПАКТ | Белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы EIF2AK2 | [24] [54] | |
ПРМТ1 | ПРМТ1 | Белок аргинин N-метилтрансфераза 1 | [24] | |
ПРМТ5 | ПРМТ5 | Белок аргинин N-метилтрансфераза 5 | [24] | |
PRRC2A | PRRC2A | Proline Rich Coiled-Coil 2A | [24] [44] [45] | |
PRRC2B | PRRC2B | Proline Rich Coiled-Coil 2B | [44] [45] | |
PRRC2C | PRRC2C | Proline Rich Coiled-Coil 2C | [24] [44] [45] [60] | |
PSMD2 | PSMD2 | 26S протеасома не-АТФаза регуляторная субъединица 2 | [24] [183] | |
PSPC1 | ПСП1 | Параспекл-компонент 1 | [44] | |
ПТБП1 | ПТБП1 | Белок 1, связывающий полипиримидиновый тракт | [44] | |
ПТБП3 | ПТБП3 | Белок 3, связывающий полипиримидиновый тракт | [24] [44] [45] | |
ПТГЕС3 | ПТГЕС3 | Простагландин E-синтаза 3 | [24] | |
ПТК2 | ФАК | Протеиновая тирозинкиназа 2 | [138] | |
ПУМ1 | Пумилио-1 | Гомолог 1 Пумилио | [24] [44] [45] | да [35] |
ПУМ2 | Пумилио-2 | Член РНК-связывающего семейства Pumilio 2 | [44] [45] [70] | |
ПУРА | ПУРА | Белок-активатор транскрипции Pur-альфа | [24] [44] [124] [126] | |
ПУРБ | ПУРБ | Белок-активатор транскрипции Pur-beta | [24] [44] | |
ПВП1 | ПВП1 | Гомолог PWP1, эндонуклеин | [44] | |
PXDNL | ПМР1 | Пероксидазин как | [184] | |
ПИКР1 | ПИКР1 | Пирролин-5-карбоксилатредуктаза | [24] | |
QKI | QKI/HQK | QKI, связывание домена KH, содержащего РНК | [44] | |
Р3ХДМ1 | Р3ХДМ1 | Домен R3H, содержащий 1 | [44] [45] | |
Р3ХДМ2 | Р3ХДМ2 | Домен R3H, содержащий 2 | [45] | |
РАБ1А | РАБ1А | Белок, связанный с Ras Rab-1A | [24] [60] | |
RACGAP1 | RACGAP1 | Белок 1, активирующий Rac GTPase | [24] | |
СТОЙКА1 | СТОЙКА1 | Рецептор для активированной С-киназы 1 | [21] [110] [185] | |
РАД21 | РАД21 | Гомолог белка репарации двухцепочечных разрывов rad21 | [24] | |
РАЕ1 | РАЕ1 | Экспорт рибонуклеиновой кислоты 1 | [137] | |
РАН | РАН | РАН, член РАН Онкоген Семейство | [158] [137] | |
RANBP1 | RANBP1 | Ran-специфический активирующий белок ГТФазы | [24] | |
RANBP2 | RANBP2/NUP358 | RAN-связывающий белок 2 | [137] | |
РББП4 | РББП4 | Гистон-связывающий белок RBBP4 | [24] | |
RBFOX1 | RBFOX1 | РНК-связывающий белок гомолог fox-1 | [24] [186] [187] | да [187] |
RBFOX2 | RBFOX2 | РНК-связывающий белок fox-1 гомолог 2 | [186] | |
RBFOX3 | RBFOX3 | РНК-связывающий белок fox-1 гомолог 3 | [186] | |
РБМ12Б | РБМ12Б | РНК-связывающий белок 12B | [24] | |
РБМ15 | РБМ15 | РНК-связывающий белок 15 | [44] | |
РБМ17 | РБМ17 | РНК-связывающий белок 17 | [44] | |
РБМ25 | РБМ25 | РНК-связывающий белок 25 | [44] | |
РБМ26 | РБМ26 | РНК-связывающий белок 26 | [24] | |
РБМ3 | РБМ3 | РНК-связывающий белок 3 | [44] | |
РБМ38 | РБМ38 | РНК-связывающий белок 38 | [44] | |
РБМ4 | РБМ4 | РНК-связывающий мотив белка 4 | [44] [188] | |
РБМ4Б | РБМ4Б | РНК-связывающий мотив белка 4B | [44] | |
РБМ42 | РБМ42 | РНК-связывающий мотив белка 42 | [147] | |
РБМ45 | РБМ45 | РНК-связывающий мотив белка 45 | [189] [190] | |
РБМ47 | РБМ47 | РНК-связывающий мотив белка 47 | [45] | |
РБМС1 | РБМС1 | РНК-связывающий мотив, белок 1, взаимодействующий с одноцепочечной структурой | [24] [44] [45] | |
РБМС2 | РБМС2 | РНК-связывающий мотив, белок 2, взаимодействующий с одноцепочечной структурой | [24] [44] [45] | |
RBMX | RBMX | Белок РНК-связывающего мотива, X-сцепленный | [45] | |
RBPMS | RBPMS | РНК-связывающий белок с множественным сплайсингом | [191] | |
RC3H1 | Рокин-1 | Домены типа Ring Finger и CCCH 1 | [44] [45] [192] | |
RC3H2 | МНАБ | Домены типа Ring Finger и CCCH 2 | [45] [192] | |
РСС1 | РСС1 | Регулятор конденсации хромосом | [24] | |
РСС2 | РСС2 | Белок RCC2 | [24] | |
RECQL | RECQL1 | RecQ как Хеликаза | [44] | |
RFC3 | RFC3 | Фактор репликации С субъединица 3 | [24] | |
RFC4 | RFC4 | Фактор репликации С субъединица 4 | [24] | |
РГПД3 | РГПД3 | Белок 3, содержащий домен RanBP2 и GRIP | [24] | |
РОА | RhoA | Ras Гомолог, член семейства А | [22] | |
РНК-СЭЛ | РНКаза L | Рибонуклеаза L | [87] [68] | |
РНФ214 | РНФ214 | белок пальца RING 214 | [24] [44] | |
РНФ219 | РНФ219 | белок пальца RING 219 | [45] | да [45] |
РНФ25 | РНФ25 | Белок безымянного пальца 25 | [44] | |
РНХ1 | РНХ1 | Ингибитор рибонуклеазы | [24] [53] | |
РОК1 | РОК1 | Rho-ассоциированная спирально-спиральная содержащая протеинкиназу 1 | [22] | |
РПС19 | Рибосомальный белок S19 | Рибосомальный белок S19 | [100] | |
РПС3 | 40S рибосомальный белок S3 | 40S рибосомальный белок S3 | [98] [100] | да [35] |
РПС6 | Рибосомальный белок S6 | Рибосомальный белок S6 | [67] [98] [3] [105] [171] | |
РПС11 | Рибосомальный белок S11 | Рибосомальный белок S11 | [44] | |
РПС24 | Рибосомальный белок S24 | Рибосомальный белок S24 | [44] | |
РПС6КА3 | РСК2 | Рибосомальная протеинкиназа S6 A3 | [193] | |
РПС6КБ1 | С6К1 | Рибосомальный белок S6 киназа B1 | [171] | |
РПС6КБ2 | С6К2 | Рибосомальный белок S6 киназа B2 | [171] | |
РПТОР | РАПТОР | Регуляторный ассоциированный белок комплекса mTOR 1 | [88] [96] [171] | |
РСЛ1Д1 | РСЛ1Д1 | Белок 1, содержащий рибосомальный домен L1 | [24] | |
РТКБ | РТКБ | гомолог лигазы сплайсинга тРНК RtcB, ранее C22orf28 | [24] [44] | |
РТРЭФ | RTRAF (ранее C14orf166) | Фактор транскрипции, трансляции и транспорта РНК | [44] | |
С100А7А | С100А7А | Белок S100-A7A | [24] | |
С100А9 | С100А9 | Белок S100-A9 | [24] | да [35] |
САФБ2 | САФБ2 | Коэффициент крепления лесов B2 | [24] [44] | да [35] |
SAMD4A | СМАУГ1 | Стерильный домен мотива альфа, содержащий 4А | [194] | |
SAMD4B | СМАУГ2 | Стерильный домен мотива альфа, содержащий 4B | [44] | |
СКЕЙПЕР | СКЕЙПЕР | S-фаза циклина А ассоциированный белок в ЭР | [45] | |
SEC24C | SEC24C | Белок-транспортер белка Sec24C | [24] [44] | |
SECISBP2 | Белок связывания SECIS 2 | Белок связывания SECIS 2 | [44] [45] | |
SERBP1 | ПАИ-RBP1/SERBP1 | Белок связывания мРНК SERPINE1 1 | [49] [195] [84] | |
СЕРПИН1 | ПАИ-1/Серпин Е1 | Семья Змеи E Член 1 | [196] | |
СФ1 | СФ1 | Фактор сплайсинга 1 | [44] | |
SFN | SFN | 14-3-3 белок сигма | [24] | |
SFPQ | ПСФ | Фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином | [24] [173] | |
SFRS3 | SFRS3 | Фактор сплайсинга 3, богатый серином/аргинином | [24] | |
СИПА1Л1 | СИПА1Л1 | Сигнал-индуцированный пролиферативный ассоциированный 1-подобный белок 1 | [24] | |
SIRT6 | Сиртуин 6 | Сиртуин 6 | [197] | |
SLBP | Белок, связывающий петлю со стеблем | Белок, связывающий петлю со стеблем | [44] | |
СМАП2 | СМАП2 | Маленький ArfGAP2 | [45] | |
СМАРКА1 | SMARCA1/SNF2L1 | Вероятный глобальный активатор транскрипции SNF2L1 | [24] | |
SMC4 | SMC4 | Структурное поддержание хромосомного белка | [24] | |
СМГ1 | СМГ-1 | SMG1, опосредованная бессмысленным распадом мРНК, связанная с PI3K-связанной киназой | [194] [198] | |
СМГ6 | СМГ6 | SMG6, фактор распада мРНК, опосредованный нонсенсом | [45] | |
СМГ7 | СМГ7 | SMG7, фактор распада мРНК, опосредованный нонсенсом | [45] | да [45] |
СМН1 | Выживание двигательного нейрона | Выживание двигательного нейрона 1, теломерного | [131] [199] [200] | |
СМУ1 | СМУ1 | Белок SMU1, содержащий повтор WD40 | [24] | |
СМИД5 | СМИД5 | Член семьи SMYD 5 | [44] | |
СНД1 | Тюдор-SN | Стафилококковая нуклеаза и домен Тюдора, содержащий 1 | [44] [45] [47] [201] | |
СНРПФ | СНРПФ | Малый ядерный рибонуклеопротеин F | [24] | |
СНТБ2 | СНТБ2 | Бета-2-синтрофин | [24] | |
СОГА3 | СОГА3 | Член семьи SOGA 3 | [44] | |
СОРБС1 | СОРБС1 | Белок 1, содержащий домен сорбина и SH3 | [24] | |
СОРБС3 | Винексин | Сорбин и домен SH3, содержащий 3 | [202] | |
SOX3 | SOX3 | SRY-Box 3 | [44] | |
СПАГ5 | Астрин | Сперматозоидный ассоциированный антиген 5 | [88] [171] | |
СПАТС2 | SPATS2/SPATA10/SCR59 | Сперматогенез, связанный с богатым серином 2 | [44] | |
SPATS2L | СГНП | Сперматогенез Ассоциированный Серин Богатый 2 Нравится | [24] [203] | |
SPECC1L | SPECC1L | Цитоспин-А | [24] | |
SQSTM1 | SQSTM1/p62 | Секвестосома 1 | [63] | |
СРИ | СРИ | Сорцин | [24] [44] | |
СРП68 | Частица распознавания сигнала 68 | Частица распознавания сигнала 68 | [44] [48] | |
СРП9 | СРП9 | Частица распознавания сигнала 9 | [204] | |
СРРТ | СРРТ | Гомолог молекулы эффектора серратной РНК | [24] | |
SRSF1 | АЧС/СФ2 | Фактор сплайсинга 1, богатый серином и аргинином | [44] [205] | |
SRSF3 | SRp20 | Фактор сплайсинга 3, богатый серином и аргинином | [206] [207] [208] [60] | |
SRSF4 | SRSF4 | Фактор сплайсинга 4, богатый серином/аргинином | [24] | |
SRSF5 | SRSF5/SRP40 | Фактор сплайсинга 5, богатый серином/аргинином | [44] | |
SRSF7 | 9G8 | Фактор сплайсинга 7, богатый серином и аргинином | [49] | |
SRSF9 | SRSF9/SRP30C | Фактор сплайсинга 9, богатый серином/аргинином | [44] | |
СС18Л1 | SS18L1/КРЕСТ | SS18L1, субъединица комплекса ремоделирования хроматина nBAF | [209] | |
СТ7 | ST7/FAM4A1/HELG/RAY1/TSG7 | Подавление опухолеобразования 7 | [45] | да [45] |
СТАТ1 | СТАТ1 | Передатчик сигнала и активатор транскрипции 1-альфа/бета | [24] | |
СТАУ1 | Штауфен 1 | Двухцепочечный РНК-связывающий белок Штауфена 1 | [24] [44] [112] [70] [210] | |
СТАУ2 | Штауфен 2 | Двухцепочечный РНК-связывающий белок Штауфена 2 | [24] [44] [45] [112] | да [35] |
СТИП1 | СТИП1/ХОП | Стресс-индуцированный-фосфопротеин 1 | [24] [54] | |
РЕМЕНЬ | РЕМЕНЬ | Белок, ассоциированный с рецептором серин-треониновой киназы | [24] [44] | |
СУГП2 | СУГП2 | Белок 2, содержащий домены SURP и G-patch | [24] | |
СУГТ1 | СУГТ1 | Гомолог SGT1, сборка комплекса кинетохоры MIS12 Кошаперон | [45] | |
ВС1 | ВС1 | Белок 1, содержащий домен SUN | [24] | |
SYCP3 | SYCP3 | Синаптонемный комплексный белок 3 | [24] | |
СИК | СИК | Связанная с селезенкой тирозинкиназа | [139] | |
СИНКРИП | СИНКРИП | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин Q | [24] [44] [45] [211] | да [35] |
TAGLN3 | Трансгелин 3 | Трансгелин 3 | [44] | |
TAF15 | TAF15 | Фактор 15, ассоциированный с белком связывания TATA-Box | [24] [44] [117] [118] [122] [60] | |
ТАРДБП | ТДП-43 | ДНК-связывающий белок TAR | [24] [113] [212] [213] [143] [146] [103] [190] [214] [215] | |
ТБРГ1 | ТБРГ1 | Трансформирующий фактор роста бета-регулятор 1 | [44] | |
TCEA1 | TCEA1 | Фактор удлинения транскрипции А белок 1 | [24] | |
TCP1 | TCP1 | T-комплекс белка 1 субъединица альфа | [24] | |
TDRD3 | Домен Тюдоров, содержащий 3 | Домен Тюдоров, содержащий 3 | [44] [45] [84] [216] [217] [218] | |
TDRD7 | Домен Тюдоров, содержащий 7 | Домен Тюдоров, содержащий 7 | [45] | |
ТЕРТ | ТЕРТ | Обратная транскриптаза теломераза | [219] | |
THOC2 | THOC2 | Комплекс ТХО 2 | [137] | |
THRAP3 | THRAP3 | Белок 3, ассоциированный с рецептором тиреоидного гормона | [44] | |
TIA1 | ТИА-1 | TIA1 Цитотоксический гранулярный РНК-связывающий белок | [3] [24] [44] [49] [56] [34] [70] [80] [95] [121] [132] [142] [148] [199] [214] [220] [60] ] | |
ТИАЛ1 | ТИАР | TIA1 Цитотоксические гранулы ассоциированные РНК связывающий белок как 1 | [24] [44] [45] [70] [105] [112] [113] [148] [189] [199] [209] | |
ТМЕМ131 | ТМЕМ131 | Трансмембранный белок 131 | [45] | да [45] |
ТМОД3 | ТМОД3 | Тропомодулин-3 | [24] | |
ТНК | ПАРП-5а | Танкираса | [178] | |
ТНКС1БП1 | ТНКС1БП1 | 182 кДа танкираза-1-связывающий белок | [24] [45] | да [45] |
ТНПО1 | Транспортин-1 | Транспортин-1/кариоферин (импортин) бета 2 | [24] [44] [137] [221] [222] | |
ТНПО2 | Транспортин-2 | Транспортин-2 | [24] [45] | |
TNRC6A | TNRC6A | Белок гена 6А, содержащий тринуклеотидный повтор | [44] [45] | да [45] |
TNRC6B | TNRC6B | Ген 6B, содержащий тринуклеотидный повтор, белок | [24] [44] [45] | да [45] |
TNRC6C | TNRC6C | Ген 6С белка, содержащий тринуклеотидный повтор | [44] [45] | да [45] |
ТОММ34 | ТОММ34 | Субъединица рецептора митохондриального импорта TOM34 | [24] | |
ТОП3Б | Топоизомераза (ДНК) III Бета | Топоизомераза (ДНК) III Бета | [45] [217] [223] | |
ТРМ1 | ТРМ1 | Цепь тропомиозина альфа-1 | [24] | |
ТРМ2 | ТРМ2 | Бета-цепь тропомиозина | [24] | |
ТПР | ТПР | Транслоцированная область промотора, белок ядерной корзины | [137] | |
ТРА2Б | ТРА2Б | Трансформер 2 Бета Гомолог | [45] | |
ТРАФ2 | ТРАФ2 | Фактор 2, ассоциированный с рецептором ФНО | [109] | |
ТРДМТ1 | DNMT2 | тРНК аспарагиновая кислота метилтрансфераза 1 | [224] | |
ТРИМ21 | ТРИМ21 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM21 | [24] | |
ТРИМ25 | ТРИМ25 | E3 убиквитин/ISG15 лигаза TRIM25 | [24] [44] [60] | |
ТРИМ56 | ТРИМ56 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM56 | [24] [45] [60] | |
ТРИМ71 | ТРИМ71 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM71 | [44] | |
ПОЕЗДКА6 | ПОЕЗДКА6 | Белок 6, взаимодействующий с рецептором щитовидной железы | [24] [44] | |
TROVE2 | РОРНП | Член семейства доменов TROVE 2 | [44] | |
ТТС17 | ТТС17 | Тетратрикопептидный повторный домен 17 | [45] | да [45] |
TUBA1C | TUBA1C | Цепь тубулина альфа-1С | [24] | |
TUBA3C | TUBA3C | Цепь тубулина альфа-3C/D | [24] | |
ТУБА4А | ТУБА4А | Цепь тубулина альфа-4А | [24] | |
TUBB3 | TUBB3 | Цепь тубулина бета-3 | [24] | |
TUBB8 | TUBB8 | Цепь тубулина бета-8 | [24] | |
ТУФМ | ТУФМ | Фактор удлинения Tu, митохондриальный | [24] | |
TXN | TXN | Тиоредоксин | [24] | |
TXNDC17 | TXNDC17 | Домен тиоредоксина, содержащий 17 | [44] | |
U2AF1 | U2AF1 | Фактор сплайсинга U2AF 35 кДа субъединица | [24] | |
УБА1 | УБА1 | Убиквитин-подобный модификатор-активирующий фермент 1 | [24] | |
УБАП2 | УБАП2 | Убиквитин-ассоциированный белок 2 | [24] [44] [45] [60] | |
UBAP2L | UBAP2L | Убиквитин-ассоциированный белок 2-подобный | [24] [44] [45] [225] [226] [60] | |
УББ | Убиквитин | Убиквитин | [114] [132] | |
УБЛ5 | Убиквитин Нравится 5 | Убиквитин Нравится 5 | [44] | |
UBQLN2 | Убиквилин 2 | Убиквилин 2 | [227] | |
УЛК1 | УЛК1 | Unc-51, как аутофагия, активирующая киназу 1 | [228] | |
УЛК2 | УЛК2 | Unc-51, как аутофагия, активирующая киназу 2 | [228] | |
УПФ1 | УПФ1 | UPF1, РНК-хеликаза и АТФаза | [24] [44] [45] [198] [60] | да [35] |
УПФ2 | УПФ2 | UPF2, РНК-хеликаза и АТФаза | [198] | |
UPF3B | UPF3B | UPF3B, регулятор бессмысленного опосредованного распада мРНК | [44] | |
USP10 | USP10 | Убиквитин-специфическая пептидаза 10 | [24] [44] [45] [67] [34] [185] [60] | |
USP11 | USP11 | Убиквитин-специфическая пептидаза 11 | [44] | |
USP13 | USP13 | Убиквитин-специфическая пептидаза 13 | [229] | |
USP5 | USP5 | Убиквитин карбоксильно-концевая гидролаза 5 | [24] [229] | |
USP9X | USP9X | Убиквитин-специфическая пептидаза 9, X-связанная | [218] | |
УТП18 | УТП18 | UTP18, компонент малой субъединицы процессома | [44] | |
ВАСП | ВАСП | Фосфопротеин, стимулируемый вазодилататорами | [24] | |
ВБП1 | ВБП1 | VHL-связывающий белок 1 | [44] | |
ПДК | ПДК | Валозинсодержащий белок | [24] [230] [183] [228] | |
WBP2 | WBP2 | Белок связывания домена WW 2 | [44] | |
WDR47 | WDR47 | Повторяющийся домен WD 47 | [44] | |
WDR62 | WDR62 | Повторяющийся домен WD 62 | [167] | |
XPO1 | XPO1/CRM1 | Экспортин 1 | [137] | |
XRN1 | XRN1 | 5'-3' Экзорибонуклеаза 1 | [36] [44] [45] | да [36] [45] |
XRN2 | XRN2 | 5'-3' Экзорибонуклеаза 2 | [44] | |
ЯРС | ЯРС | Тирозин—тРНК-лигаза, цитоплазматическая | [24] | |
YBX1 | YB-1 | Y-Box связывающий белок 1 | [24] [44] [49] [48] [82] [94] [231] | |
YBX3 | YBX3/ЗОНАБ | Y-box-связывающий белок 3 | [24] [44] [45] | |
ДА1 | ДА1 | Тирозин-протеинкиназа Да | [24] | |
YLPM1 | YLPM1 | Мотив YLP, содержащий 1 | [44] | |
YTHDF1 | YTHDF1 | Белок семейства доменов YTH 1 | [24] [44] [45] [232] [233] | |
YTHDF2 | YTHDF2 | Белок семейства доменов YTH 2 | [24] [44] [45] [232] [233] | да [232] [233] |
YTHDF3 | YTHDF3 | Белок семейства доменов YTH 3 | [24] [234] [44] [45] [232] [233] | |
YWHAB | 14-3-3 | Активационный белок тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы бета | [24] [168] | |
YWHAH | 14-3-3 | 14-3-3 белок эта | [24] | |
YWHAQ | 14-3-3 | 14-3-3 белок тета | [24] | |
ЗБП1 | ЗБП1 | Z-ДНК-связывающий белок 1 | [235] [236] | |
ZCCHC11 | ZCCHC11 | Белок 11, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [45] | |
ZCCHC14 | ZCCHC14 | Белок 14, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [45] | |
ZC3H11A | ZC3H11A | Белок 11a, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [44] | |
ZC3H14 | ZC3H14 | Белок 14, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [24] | |
ZCCHC2 | ZCCHC2 | Белок 2, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [45] | |
ZCCHC3 | ZCCHC3 | Белок 3, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [45] | |
ZC3H7A | ZC3H7A | Белок 7А, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [24] | |
ZC3H7B | ZC3H7B | Белок 7B, содержащий домен цинкового пальца CCCH | [24] [44] | |
ZC3HAV1 | ПАРП-13.1/ПАРП-13.2/АРТД13 | Цинк-пальцевый CCCH-тип, содержащий противовирусный 1 | [24] [45] [178] | да [35] |
ZFAND1 | ZFAND1 | Цинк-пальчик типа AN1, содержащий 1 | [183] | |
ZFP36 | ТТП/ТИС11 | ZFP36 белок безымянного пальца/трисетраполин | [36] [44] [167] [237] [238] [239] | да [36] |
ZNF598 | ZNF598 | Цинковый палец белка 598 | [45] | |
ZNF638 | ZNF638 | Цинковый палец белка 638 | [24] |
Лаборатории: