CNOT8

CNOT8
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT8 , CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, субъединица 8 транскрипционного комплекса CCR4-NOT
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603731; МГИ : 1916375; гомологен : 48304; Генные карты : CNOT8; OMA :CNOT8 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 5 (человек)
Конец	154,876,792 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	58,009,420 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; моноцит; ; сперма; ; правое легкое; ; ганглионарное возвышение; ; Ахиллово сухожилие; ; гранулоцит; ; прямая кишка; ; верхняя доля левого легкого; ; желудочковая зона;
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; нервный слой сетчатки; ; тимус; ; зигота; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; гранулоцит; ; желудочковая зона; ; первичный ооцит; ; нервная трубка; ; морула;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	поли(А)-специфическая рибонуклеазная активность; 3'-5'-экзорибонуклеазная активность; Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; связывание ионов металлов; связывание белков; Связывание РНК; связывание нуклеиновых кислот; активность нуклеазы; экзонуклеазная активность; гидролазная активность;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; Комплекс CCR4-NOT; внутриклеточная анатомическая структура; ядро; P-тело; Комплекс ядра CCR4-NOT;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты; позитивная регуляция катаболического процесса мРНК; транскрипция, ДНК-шаблон; подавление генов с помощью miRNA; позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции; экзонуклеолитический катаболизм деаденилированной мРНК; подавление гена; регулирование перевода; негативная регуляция пролиферации клеточной популяции; Реакция на повреждение ДНК, передача сигнала медиаторами класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла; Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический; укорочение хвоста поли(А) ядерной транскрибированной мРНК; негативная регуляция трансляции;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	9337
	69125
	ENSG00000155508
	ENSMUSG00000020515
	Q9UFF9
	Q9D8X5
NM_001301073 ; NM_001301074 ; NM_001301075 ; NM_001301077 ; NM_001301080;
	NM_001301082 ; NM_001301083 ; NM_001301086 ; NM_004779
	NM_026949 ; NM_001356477 ; NM_001363084 ; NM_001363085 ; NM_001363086
NP_001288002 ; NP_001288003 ; NP_001288004 ; NP_001288006 ; NP_001288009;
	NP_001288011 ; NP_001288012 ; NP_001288015 ; NP_004770
	NP_081225 ; NP_001343406 ; NP_001350013 ; NP_001350014 ; NP_001350015
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица 8 транскрипционного комплекса CCR4-NOT — это белок , который у человека кодируется геном CNOT8 . [ ^5]^[6]^[7] Это субъединица комплекса деаденилазы CCR4-NOT .

Взаимодействия

Было показано, что CNOT8 взаимодействует с BTG2 , ^[8] BTG1 , ^[8]^[9] CNOT1 ^[6]^[10] и CNOT3 . ^[6]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000155508 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020515 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Fidler C, Wainscoat JS, Boultwood J (май 1999). "Человеческий ген POP2: идентификация, секвенирование и картирование критической области синдрома 5q-". Genomics . 56 (1): 134– 6. doi :10.1006/geno.1998.5687. PMID 10036195.
^ abc Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (март 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц комплекса CCR4-NOT дрожжей». Nucleic Acids Res . 28 (3): 809– 17. doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334 .
^ "Ген Энтреза: комплекс транскрипции CNOT8 CCR4-NOT, субъединица 8".
^ ab Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (март 2001 г.). «Связь антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента транскрипционного комплекса дрожжей CCR4: участие в сигнальном пути эстрогенового рецептора альфа». J. Biol. Chem . 276 (13): 9640– 8. doi : 10.1074/jbc.M008201200 . PMID 11136725.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал. М (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .

Дальнейшее чтение

Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (1998). "Человеческий белок-репрессор катаболитов углерода (CCR4)-ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с транслокационным белком B-клеток BTG1". Biochem. J . 336 (Pt 2): 471– 81. doi :10.1042/bj3360471. PMC 1219893 . PMID 9820826.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (2001). «Связь антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента транскрипционного комплекса дрожжей CCR4: участие в сигнальном пути эстрогенового рецептора альфа». J. Biol. Chem . 276 (13): 9640– 8. doi : 10.1074/jbc.M008201200 . PMID 11136725.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геном Рез . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . ПМИД 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .
Morel AP, Sentis S, Bianchin C, Le Romancer M, Jonard L, Rostan MC, Rimokh R, Corbo L (2003). «Антипролиферативный белок BTG2 взаимодействует с комплексом CCR4 человека, существующим in vivo в трех формах, регулируемых клеточным циклом». J. Cell Sci . 116 (Pt 14): 2929–36 . doi : 10.1242/jcs.00480 . PMID 12771185.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бехтель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геном Рез . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК 528930 . ПМИД 15489336.
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139. ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901.
Dorfleutner A, Bryan NB, Talbott SJ, Funya KN, Rellick SL, Reed JC, Shi X, Rojanasakul Y, Flynn DC, Stehlik C (2007). «Клеточный белок 2, содержащий только пириновый домен, является кандидатом на роль регулятора активации инфламмасомы». Infect. Immun . 75 (3): 1484– 92. doi :10.1128/IAI.01315-06. PMC 1828547. PMID 17178784 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека CNOT8 и страница с подробностями гена CNOT8 в браузере геномов UCSC .

Эта статья о гене на 5-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000155508 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020515 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10036195-5] Fidler C, Wainscoat JS, Boultwood J (май 1999). "Человеческий ген POP2: идентификация, секвенирование и картирование критической области синдрома 5q-". Genomics . 56 (1): 134– 6. doi :10.1006/geno.1998.5687. PMID 10036195.

[pmid10637334-6] Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (март 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц комплекса CCR4-NOT дрожжей». Nucleic Acids Res . 28 (3): 809– 17. doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334 .

[entrez-7] "Ген Энтреза: комплекс транскрипции CNOT8 CCR4-NOT, субъединица 8".

[pmid11136725-8] Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (март 2001 г.). «Связь антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента транскрипционного комплекса дрожжей CCR4: участие в сигнальном пути эстрогенового рецептора альфа». J. Biol. Chem . 276 (13): 9640– 8. doi : 10.1074/jbc.M008201200 . PMID 11136725.

[pmid16189514-9] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал. М (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid17353931-10] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .