Ниаллиа

Niallia — род грамположительных палочковидных бактерий семейства Bacillaceae из порядка Bacillales . ^{[1] [2]} Типовым видом этого рода является Niallia circulans. ^[3]

Члены Niallia ранее были видами, принадлежащими к Bacillus , роду, который давно признан научным сообществом как демонстрирующий обширную полифилию и филогенетическую гетерогенность из-за нечетких критериев ^{[4] [5],} ранее использовавшихся для отнесения видов к этой кладе. Было опубликовано множество исследований с использованием сравнительного филогенетического анализа в попытке прояснить эволюционные отношения между видами Bacillus , что привело к установлению многочисленных новых родов, таких как Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus , Virgibacillus и Evansella . ^{[6] [7] [8] [9] [10] [1]} Кроме того, род Bacillus был ограничен и включал только виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . ^{[6] [1]}

Название Niallia было дано в честь британского микробиолога профессора Ниалла А. Логана (Университет Глазго Каледониан) за его большой вклад в систематику и использование представителей рода Bacillus . ^[1]

Представители этого рода являются факультативно анаэробными и встречаются в различных местах, таких как почва, сточные воды, продукты питания и человеческий стул. Все представители подвижны и производят эндоспоры. Оптимальная температура роста для Niallia находится в диапазоне 30-37 °C. Niallia circulans — важная бактерия, используемая в аквакультуре, биоремедиации, очистке воды и производстве ферментов. Это также условно-патогенный микроорганизм, способный вызывать сепсис у пациентов с ослабленным иммунитетом. Были идентифицированы две консервативные сигнатурные индели (CSI) как уникальные для этого рода в белках, содержащих домен GAF, и ДНК-лигазе D , которые в большинстве случаев являются исключительно общими либо для всех, либо для большинства представителей этого рода. ^[1] Эти CSI были идентифицированы с помощью анализа последовательностей генома видов Niallia и предоставляют надежный способ отличить Niallia от других родов и бактерий семейства Bacillaceae на молекулярном уровне.

Niallia , по состоянию на май 2021 года, содержит в общей сложности 5 видов с валидно опубликованными названиями. ^[3] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связан с другими видами Bacillus в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри Bacillus . ^[1] Эта схема ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома (GTDB). ^[11]

Невалидно опубликованный вид "Bacillus tuaregi" также обнаруживается в группе с другими членами Niallia в филогенетических деревьях, а также разделяет те же молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI). ^[1] Однако его перенос официально не предлагался из-за отсутствия информации о штамме культуры. Требуется дальнейший пересмотр этого рода, поскольку открываются и определяются дополнительные геномы и новые виды.