Солибакциллы
| Солибакциллы | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Солибакциллы Кришнамурти 2009 |
| Разновидность | |
| |
Solibacillus — род грамположительных палочковидных спорообразующих бактерий.
Первый представитель рода Solibacillus был впервые выделен в 1999 году и первоначально назывался Bacillus silvestris . Однако дальнейшие исследования B. silvestris показали, что этот организм принадлежит к отдельному роду. Было предложено название Solibacillus silvestris , ссылаясь на его первоначальное обозначение как представителя рода Bacillus и на тот факт, что вид был впервые выделен из почвы. [1] [2] Позднее Bacillus isronensis был переклассифицирован как Solibacillus isronensis . [3] S. isronensis был выделен из криопробирок, которые использовались для сбора образцов воздуха с больших высот, а S. kalamii был обнаружен в воздушном фильтре с Международной космической станции . [4]
В 2020 году семейство Planococcaceae было объединено с семейством Caryophanaceae из-за правил номенклатуры в соответствии с Международным кодексом номенклатуры прокариот . [5] Кроме того, семейство Caryophanaceae претерпело несколько таксономических изменений, чтобы учесть большое количество филогенетически неродственных видов, которые были неправильно классифицированы. [5] Используя сравнительный геномный анализ, исследование выявило несколько уникальных молекулярных маркеров (в частности, консервативные сигнатурные индели), которые могут служить надежным средством для различения родов, таких как Solibacillus, внутри семейства. [5]
Молекулярные сигнатуры
12 консервативных сигнатурных инделей (CSI) были идентифицированы с помощью геномных анализов для этого рода в следующих белках: белок жгутикового крючка-базального тельца, аминодезоксихоризматлиаза , белок семейства VOC, субъединица A ДНК-топоизомеразы IV , белок семейства DegV, субъединица AddAB геликазы-экзонуклеазы AddB, белок семейства транспортеров множественной лекарственной устойчивости, гем-зависимая пероксидаза , АТФ-связывающий белок транспортера метионина ABC, тРНК 4-тиоуридин(8) синтаза ThiI и АТФаза семейства AAA . [5] Эти CSI обеспечивают надежный молекулярный метод для различения видов Solibacillus от других родов в пределах семейства Caryophanaceae и всех других бактерий. [ необходима цитата ]
Ссылки
- ^ Кришнамурти С., Чакрабарти Т., Стакебрандт Э. Пересмотр таксономического положения Bacillus silvestris Rheims et al. 1999 и предложение перенести его в Solibacillus gen. nov. как Solibacillus silvestris comb. nov. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 2009 1 мая;59(5):1054-8.
- ^ Реймс Х., Фрюлинг А., Шуманн П., Роде М., Штакебрандт Э. Bacillus silvestris sp. nov., новый представитель рода Bacillus, содержащий лизин в своей клеточной стенке. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 1 апреля 1999 г.;49(2):795-802.
- ^ Mual P, Singh NK, Verma A, Schumann P, Krishnamurthi S, Dastager S, Mayilraj S. Реклассификация Bacillus isronensisShivaji et al. 2009 как Solibacillus isronensis comb. nov. и исправленное описание рода Solibacillus Krishnamurthi et al. 2009. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 2016 1 мая;66(5):2113-20.
- ^ Sielaff AC, Kumar RM, Pal D, Mayilraj S, Venkateswaran K. Solibacillus kalamii sp. nov., выделенный из высокоэффективной системы фильтрации частиц, используемой на Международной космической станции. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 2017 5 мая;67(4):896-901.
- ^ abcd Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip (2020-01-14). "Надежная демаркация семейства Caryophanaceae (Planococcaceae) и его различных родов, включая три новых рода, на основе филогеномики и высокоспецифичных молекулярных сигнатур". Frontiers in Microbiology . 10 : 2821. doi : 10.3389 /fmicb.2019.02821 . ISSN 1664-302X. PMC 6971209. PMID 32010063.
