Щелочногалобациллы

Щелочногалобациллы
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бациллота
Сорт:	Бациллы
Заказ:	Бациллы
Семья:	Бациллы
Род:	Щелочногалобациллы Патель и Гупта 2020
Виды [1]
См. текст

Alkalihalobacillus — род грамположительных или грамвариабельных палочковидных бактерий семейства Bacillaceae из порядка Bacillales . ^{[2] [3]} Типовым видом этого рода является Alkalihalobacillus alcalophilus . ^[4]

Этот род включает виды, ранее принадлежавшие к роду Bacillus , роду, который был признан демонстрирующим обширную полифилию и филогенетическую гетерогенность из-за нечетких критериев ^[5] (таких как способность образовывать эндоспоры в присутствии кислорода) ^[6], ранее использовавшихся для отнесения видов к этой кладе. Было опубликовано множество исследований с использованием сравнительного филогенетического анализа в попытке прояснить эволюционные отношения между видами Bacillus , что привело к установлению многочисленных новых родов, таких как Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus и Virgibacillus . ^{[2] [7] [8] [9] [10]} Род Bacillus в настоящее время ограничен видами, тесно связанными с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . ^{[2] [11]}

Название Alkalihalobacillus состоит из префикса «alkali-» (от арабского артикля и существительного al galiy, что переводится как «пепел солянки»), префикса «halo-» (от греческого существительного hals/halos, что означает соль) и суффикса «-bacillus» (от латинского существительного bacillus, что относится к «небольшому посоху или стержню» и Bacillus, роду бактерий). Вместе название относится к бациллам, живущим в соленых или щелочных условиях, или в соленых и щелочных условиях. ^[2]

Этот род, по состоянию на май 2021 года, содержит в общей сложности 44 вида, 39 из которых были опубликованы и имеют установленные названия. ^[4] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связан с другими видами Bacillus в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри Bacillus . ^[2] Эта схема ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома (GTDB). ^[12]

Обнаружено, что два дополнительных вида Bacillus ( Bacillus alcaliphilum и Bacillus alkalisoli ) группируются с другими членами Alkalihalobacillus в филогенетических деревьях, а также имеют одни и те же молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI). ^[11] Однако их перенос официально не предлагался из-за отсутствия информации о штаммах культур. Требуется дальнейший пересмотр этого рода, поскольку открываются и определяются дополнительные геномы и новые виды.

Большинство представителей этого рода являются аэробными или факультативно анаэробными и встречаются в различных местах, таких как гиперсоленые озера, прибрежные районы и почва. Все виды, за исключением Alkalihalobacillus okhensis , ^[13] способны производить эндоспоры . Подвижность изменчива, некоторые виды обладают перитрихиальными жгутиками . Большинство видов этого рода являются алкалофильными и галофильными /толерантными, и, таким образом, они способны расти в щелочных условиях, при этом оптимальная скорость роста находится в диапазоне pH 9–10 с 1–5% NaCl. ^[2] Некоторые виды являются облигатно алкалофильными и требуют очень щелочных условий для выживания. Широкий диапазон температур (4–45 °C) может способствовать росту; однако оптимальный рост происходит в диапазоне 25–37 °C. Некоторые виды способны вырабатывать ферменты, такие как целлюлазы и протеазы, которые используются в производстве стиральных порошков, ксиланазы для сектора целлюлозно-бумажной промышленности ^{[ необходимо дополнительное объяснение ]} и циклодекстринглюканотрансферазу для обработки крахмала. ^[2] Кроме того, A. clausii является диазотрофом и способен преобразовывать атмосферный азот в аммиак ^[14] , а также способен вырабатывать антимикробные соединения для производства пробиотиков. ^{[15] [ неудачная проверка ]}

В ходе геномного анализа для этого рода было идентифицировано десять CSI в следующих белках: адаптер РНКазы RapZ, белок M-кольца жгутикового базального тельца FliF, 7-карбокси-7-деазагуанинсинтаза QueE, фактор высвобождения пептидной цепи 3, лигаза глутамат-аммония типа I, тРНК треонил-карбамоиладенозиндегидратаза, фактор сопряжения транскрипции и репарации , фермент синтеза тРНК уридин-5-карбоксиметиламинометил (34) MnmG, 50S рибосомальный белок L11 метилтрансфераза и гомосеринкиназа . ^[2] Эти CSI специфичны для Alkalihalobacillus и предоставляют новый способ молекулярной дифференциации этого рода от других родов и бактерий Bacillaceae .