МРПС35

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
МРПС35
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMRPS35 , MDS023, MRP-S28, MRPS28, HDCMD11P, митохондриальный рибосомальный белок S35
Внешние идентификаторыОМИМ : 611995; МГИ : 2385255; гомологен : 11048; Генные карты : MRPS35; OMA :MRPS35 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_021821
NM_001190864

NM_145573

RefSeq (белок)

NP_001177793
NP_068593

NP_663548

Местоположение (UCSC)Хр 12: 27.71 – 27.76 МбХр 6: 146.94 – 146.98 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

28S рибосомальный белок S35, митохондриальный — это белок , который у людей кодируется геном MRPS35 . [5] [6]

Митохондриальные рибосомальные белки млекопитающих кодируются ядерными генами и помогают в синтезе белка в митохондрии . Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой субъединицы 28S и большой субъединицы 39S. По оценкам, они содержат 75% белка в составе рРНК по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Другое различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами заключается в том, что последние содержат 5S рРНК . Среди разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию по гомологии последовательностей . Этот ген кодирует белок субъединицы 28S, который имеет запутанную номенклатуру в литературе. Псевдогены , соответствующие этому гену, обнаружены на хромосомах 3p, 5q и 10q. [6]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000061794 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000040112 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (май 2001 г.). «Малая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомальных белков». J Biol Chem . 276 (22): 19363–74 . doi : 10.1074/jbc.M100727200 . PMID  11279123.
  6. ^ ab "Ген Энтреза: митохондриальный рибосомальный белок S35 MRPS35".

Дальнейшее чтение

  • Otsuki T, Ota T, Nishikawa T и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для выбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго-кэпом». DNA Res . 12 (2): 117– 26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID  16303743.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Ishiguchi H, Izumi H, Torigoe T и др. (2004). «ZNF143 активирует экспрессию генов в ответ на повреждение ДНК и связывается с ДНК, модифицированной цисплатином». Int. J. Cancer . 111 (6): 900– 9. doi :10.1002/ijc.20358. PMID  15300802. S2CID  37308382.
  • Чжан З., Герштейн М. (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомальных белков в геноме человека». Геномика . 81 (5): 468– 80. doi :10.1016/S0888-7543(03)00004-1. PMID  12706105.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомальных белков человека: картирование 54 генов на хромосомах и их влияние на человеческие расстройства». Genomics . 77 ( 1– 2): 65– 70. doi :10.1006/geno.2001.6622. PMID  11543634.
  • Koc EC, Burkhart W, Blackburn K и др. (2001). «Идентификация четырех белков из малой субъединицы митохондриальной рибосомы млекопитающих с использованием протеомного подхода». Protein Sci . 10 (3): 471– 81. doi :10.1110/ps.35301. PMC  2374141. PMID  11344316 .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P82673 (28S рибосомальный белок S35, митохондриальный) на сайте PDBe-KB .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MRPS35&oldid=1142723211"