РНК-компонент большой субъединицы эукариотической рибосомы
В этой статье отсутствует информация о Rfam LSU_rRNA_eukarya. Пожалуйста, расширьте статью, чтобы включить эту информацию. Дополнительные сведения могут быть на странице обсуждения . ( Декабрь 2020 г. )
28S рибосомальная РНК — это структурная рибосомальная РНК (рРНК) для большой субъединицы (LSU) эукариотических цитоплазматических рибосом, и, таким образом, один из основных компонентов всех эукариотических клеток. Она имеет размер 25S у растений и 28S у млекопитающих, отсюда и псевдоним 25S–28S рРНК . [1]
В сочетании с 5.8S рРНК на 5'-стороне он является эукариотическим ядерным гомологом прокариотических 23S и митохондриальных 16S рибосомальных РНК. [2] [3] [4]
^ Baroin, A.; Perasso, R.; Qu, LH; Brugerolle, G.; Bachellerie, JP; Adoutte, A. (1988-05-01). «Частичная филогения одноклеточных эукариот на основе быстрого секвенирования части 28S рибосомальной РНК». Труды Национальной академии наук . 85 (10): 3474– 3478. Bibcode : 1988PNAS...85.3474B. doi : 10.1073/pnas.85.10.3474 . ISSN 0027-8424. PMC 280234. PMID 3368456 .
^ Джеймс, Тимоти Ю.; Кауфф, Франк; Шох, Конрад Л.; Матени, П. Брэндон; Хофштеттер, Валери; Кокс, Саймон Дж.; Селио, Гейл; Гвейдан, Сесиль; Фрейкер, Эмили (2006). «Реконструкция ранней эволюции грибов с использованием филогении из шести генов». Nature . 443 (7113): 818– 822. Bibcode :2006Natur.443..818J. doi :10.1038/nature05110. PMID 17051209. S2CID 4302864.
^ Whiting, Michael F.; Carpenter, James C.; Wheeler, Quentin D.; Wheeler, Ward C. (1997-03-01). "Проблема Strepsiptera: филогения отрядов насекомых с полным превращением, выведенная из последовательностей и морфологии рибосомной ДНК 18S и 28S". Systematic Biology . 46 (1): 1– 68. doi : 10.1093/sysbio/46.1.1 . ISSN 1063-5157. PMID 11975347.
^ Хедин, Маршал К.; Мэддисон, Уэйн П. (март 2001 г.). «Комбинированный молекулярный подход к филогении подсемейства пауков-скакунов Dendryphantinae (Araneae: Salticidae)». Молекулярная филогенетика и эволюция . 18 (3): 386– 403. doi :10.1006/mpev.2000.0883. PMID 11277632.
^ Йоргенсен, Аслак; Фаурби, Сорен; Хансен, Йеспер Г.; Мёбьерг, Надя; Кристенсен, Рейнхардт М. (01 марта 2010 г.). «Молекулярная филогения Arthrotardigrada (Tardigrada)». Молекулярная филогенетика и эволюция . 54 (3): 1006–1015 . doi :10.1016/j.ympev.2009.10.006. ПМИД 19822216.
^ Le, Hoc Lanh Vân; Lecointre, Guillaume; Perasso, Roland (1993-03-01). "Филогения челюстноротых на основе 28S рРНК: первые шаги в анализе конфликта и соответствия с морфологически основанными кладограммами". Молекулярная филогенетика и эволюция . 2 (1): 31– 51. doi :10.1006/mpev.1993.1005. PMID 8081546.
^ Маллатт, Джон; Салливан, Джек (декабрь 1998 г.). «Последовательности рДНК 28S и 18S подтверждают монофилию миног и миксин». Молекулярная биология и эволюция . 15 (12): 1706– 1718. doi :10.1093/oxfordjournals.molbev.a025897. PMID 9866205.
^ ab Natsidis, Paschalis; Schiffer, Philipp H.; Salvador-Martínez, Irepan; Telford, Maximilian J. (декабрь 2019 г.). «Вычислительное обнаружение скрытых разрывов в 28S рибосомальных РНК у эукариот и последствия для чисел целостности РНК». Scientific Reports . 9 (1): 19477. Bibcode :2019NatSR...919477N. doi : 10.1038/s41598-019-55573-1 . PMC 6925239 . PMID 31863008.
^ "Ribosomal Database Project". RDP Release 11, Update 5. 30 сентября 2016 г. Архивировано из оригинала 2020-08-19 . Получено 2016-12-31 .
^ Коул, Джеймс Р.; Ван, Цюн; Фиш, Джордан А.; Чай, Бенли; МакГаррелл, Донна М.; Сан, Янни; Браун, К. Титус; Поррас-Альфаро, Андреа; Куске, Шерил Р. (2014-01-01). "Проект базы данных рибосом: данные и инструменты для высокопроизводительного анализа рРНК". Nucleic Acids Research . 42 (D1): D633 – D642 . doi :10.1093/nar/gkt1244. ISSN 0305-1048. PMC 3965039 . PMID 24288368.
^ Quast, C.; Pruesse, E.; Yilmaz, P.; Gerken, J.; Schweer, T.; Yarza, P.; Peplies, J.; Glockner, FO (2013-01-01). "Проект базы данных генов рибосомальной РНК SILVA: улучшенная обработка данных и веб-инструменты". Nucleic Acids Research . 41 (D1): D590 – D596 . doi :10.1093/nar/gks1219. ISSN 0305-1048. PMC 3531112. PMID 23193283 .